Heatmap: Cluster_137 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_11921.1 (PHB3)	-0.57	-0.84	-1.42	-1.05	-0.27	-0.25	-0.43	0.08	-0.48	-0.49	-0.47	-0.04	0.85	0.17	0.04	-0.01	0.12	0.66	-0.2	-0.17	-0.05	-0.11	0.83	0.39	0.19	0.04	-0.05	0.06	0.05	0.19	0.69
Lsat_1_v5_gn_0_13201.1	-0.99	-0.72	-1.02	-1.01	0.04	0.15	-0.11	0.08	-0.47	-0.16	-0.3	-0.13	0.7	0.32	0.07	-0.03	0.05	0.92	-0.17	-0.11	-0.22	-0.1	0.24	0.07	0.06	-0.11	-0.02	0.06	0.1	0.12	0.69
Lsat_1_v5_gn_0_4860.1	-0.56	-0.68	-0.81	-0.53	0.27	0.56	-0.09	0.06	-0.39	-0.46	-0.14	-0.27	0.57	0.63	0.28	-0.06	-0.06	-0.05	-0.33	-0.04	0.02	-0.15	0.5	-0.07	-0.07	0.12	-0.04	-0.09	0.02	-0.07	0.55
Lsat_1_v5_gn_1_104961.1	-0.96	-1.13	-0.97	-1.09	-0.15	0.13	0.04	0.27	-0.51	-0.43	-0.65	-0.53	0.86	0.51	-0.02	-0.42	0.02	0.55	-0.57	-0.19	0.02	0.13	0.64	0.29	0.07	0.04	-0.16	0.17	0.18	0.19	0.83
Lsat_1_v5_gn_1_128621.1 (MED21)	-0.81	-0.68	-0.74	-0.52	-0.38	-0.15	-0.26	-0.1	-0.62	-0.47	-0.0	-0.29	0.65	0.88	0.49	-0.02	-0.11	0.56	-0.0	-0.01	-0.31	-0.1	0.28	-0.05	0.02	0.05	-0.15	-0.45	0.06	0.01	1.01
Lsat_1_v5_gn_1_14420.1 (bbx23)	-0.64	-0.85	-0.77	-0.96	-0.1	0.0	-0.37	-0.17	-0.47	-0.76	-0.55	-0.49	0.7	0.51	-0.07	-0.63	-0.28	0.7	-0.18	-0.18	-0.05	0.02	0.65	0.4	0.18	-0.06	-0.08	0.09	0.37	0.3	1.01
Lsat_1_v5_gn_1_41381.1 (PYK)	-0.43	-0.74	-0.66	-0.77	0.25	0.43	0.12	0.28	-0.36	-0.41	-0.35	-0.1	0.58	0.54	0.29	0.04	0.06	0.06	-0.27	-0.22	-0.17	-0.17	0.18	0.09	0.11	0.04	-0.14	0.05	0.14	-0.06	0.38
Lsat_1_v5_gn_1_43921.1	-0.94	-1.09	-1.1	-0.62	-0.14	0.2	0.01	0.4	-0.82	-0.59	-0.61	-0.34	0.82	0.13	-0.3	-0.36	-0.13	0.34	-0.53	-0.08	0.03	0.08	0.07	0.51	0.38	0.22	0.17	0.2	0.0	0.07	1.14
Lsat_1_v5_gn_1_49060.1	-0.42	-0.55	-1.0	-0.78	-0.03	0.15	-0.06	0.34	-0.53	-0.42	-0.31	-0.14	0.65	0.31	0.06	-0.16	0.13	0.47	-0.15	-0.2	0.02	-0.06	0.51	0.09	-0.0	-0.09	-0.21	0.15	-0.04	0.1	0.67
Lsat_1_v5_gn_1_89320.1 (SWIB4)	-1.51	-1.6	-1.78	-0.8	-0.32	-0.07	-0.26	0.01	-0.39	-0.53	-0.13	-0.13	0.95	0.78	0.48	0.09	0.03	0.77	-0.23	0.08	0.05	-0.03	0.07	0.13	0.07	-0.16	-0.11	-0.35	-0.09	0.13	0.99
Lsat_1_v5_gn_1_90341.1 (GSL6)	-1.2	-1.12	-1.92	-2.09	-0.24	0.36	0.23	0.37	-0.88	-0.82	-0.36	-0.89	0.77	1.33	0.72	-0.14	-0.02	0.81	0.14	-0.29	-0.23	-0.17	0.47	-0.19	-0.23	-0.18	-0.18	-0.08	0.34	0.25	0.19
Lsat_1_v5_gn_2_136121.1 (LYM3)	-0.88	-0.98	-0.93	-0.9	0.05	0.17	-0.14	0.15	-0.35	-0.35	-0.4	-0.32	0.84	0.86	0.67	0.02	0.03	0.3	0.01	-0.07	-0.2	-0.2	0.05	-0.09	-0.04	-0.06	-0.27	-0.23	0.16	0.13	0.68
Lsat_1_v5_gn_2_46320.1	-0.31	-0.68	-0.71	-0.58	-0.2	-0.03	-0.33	-0.35	-0.37	-0.38	-0.23	-0.06	0.91	0.29	0.13	0.07	0.08	0.39	-0.33	-0.06	-0.0	-0.1	0.28	0.2	0.14	0.05	-0.13	0.02	0.04	0.15	0.7
Lsat_1_v5_gn_2_64400.1	-0.51	-0.64	-1.25	-1.24	0.05	0.0	0.07	0.41	-0.72	-0.43	-0.3	-0.0	0.64	0.1	-0.03	-0.11	0.06	0.37	-0.01	0.02	-0.07	0.0	0.64	0.26	0.04	0.04	-0.17	0.17	-0.01	0.01	0.66
Lsat_1_v5_gn_2_7120.1	-1.43	-1.1	-1.56	-1.19	-0.21	-0.03	-0.07	0.19	-0.56	-0.22	-0.34	-0.15	0.81	0.3	0.14	-0.01	-0.02	0.67	0.03	-0.09	-0.05	-0.22	0.24	0.3	0.03	0.07	0.12	-0.04	0.27	0.2	0.91
Lsat_1_v5_gn_2_94600.1	-0.92	-1.12	-1.43	-1.45	-0.18	0.16	0.28	0.56	-0.26	-0.39	-0.26	-0.09	1.06	0.49	0.22	0.21	-0.06	0.58	-0.32	0.02	-0.16	-0.05	0.04	0.27	-0.1	-0.03	-0.08	-0.11	-0.31	-0.18	0.64
Lsat_1_v5_gn_2_97900.1 (PNET1)	-0.79	-1.06	-1.01	-1.03	-0.02	0.22	-0.04	0.19	-0.65	-0.24	-0.42	-0.2	0.63	0.65	0.25	0.21	0.06	0.61	-0.02	-0.16	-0.11	0.14	0.12	-0.08	-0.14	-0.04	-0.35	-0.15	0.04	0.11	0.96
Lsat_1_v5_gn_3_11180.1	-0.91	-1.19	-1.24	-1.2	-0.27	-0.08	-0.25	0.47	-0.9	-0.97	-0.74	-0.19	1.02	0.41	-0.08	-0.12	-0.03	0.44	-0.38	-0.05	-0.14	0.12	0.42	0.39	0.27	0.25	-0.14	0.27	0.22	0.08	0.99
Lsat_1_v5_gn_3_114641.1	-0.36	-0.81	-0.84	-0.69	0.27	0.42	0.05	0.37	-0.58	-0.39	-0.29	-0.26	0.56	0.48	0.26	-0.02	-0.02	0.12	-0.04	-0.19	-0.11	0.11	0.36	0.09	0.03	-0.02	-0.11	0.27	0.05	-0.14	0.16
Lsat_1_v5_gn_3_22520.1	-1.04	-1.1	-1.32	-0.91	-1.0	-0.65	-0.35	0.29	-0.57	-0.48	-0.31	0.02	1.14	-0.31	-0.6	-0.42	-0.22	0.63	-0.66	0.17	0.22	0.28	0.27	0.74	0.44	0.36	0.16	0.45	-0.16	-0.08	0.97
Lsat_1_v5_gn_3_27620.1 (SG1)	-0.13	-0.56	-0.71	-0.91	-0.06	-0.1	-0.31	-0.03	-0.52	-0.39	-0.27	0.09	0.48	0.12	-0.04	0.04	0.07	0.18	0.02	-0.19	-0.06	0.08	0.96	0.32	0.22	0.01	-0.14	0.18	-0.07	0.01	0.36
Lsat_1_v5_gn_3_35380.1 (CLPP2)	0.12	-0.49	-0.5	-0.48	-0.14	-0.11	-0.23	-0.11	-0.34	-0.16	-0.16	0.05	0.67	0.09	-0.02	-0.17	-0.02	0.15	-0.3	-0.0	-0.06	-0.09	0.94	0.05	0.03	-0.04	-0.07	0.25	-0.08	-0.09	0.31
Lsat_1_v5_gn_3_56980.1 (GGL20)	-1.6	-2.05	-2.71	-2.83	-0.81	0.06	-0.07	0.2	-0.58	-0.84	-0.48	-0.62	0.95	1.31	0.85	0.16	0.15	0.68	0.21	-0.39	-0.17	0.06	0.43	0.02	-0.18	-0.37	-0.27	-0.39	0.08	0.3	1.04
Lsat_1_v5_gn_4_10781.1	-1.16	-1.1	-1.93	-0.85	-0.25	-0.32	0.06	0.46	-0.88	-0.7	-0.2	-0.03	1.3	0.02	-0.33	-0.03	0.05	1.07	-0.63	-0.05	-0.07	-0.04	0.39	0.38	0.33	0.06	-0.5	-0.04	-0.21	-0.09	0.91
Lsat_1_v5_gn_4_185480.1	-0.29	-0.48	-0.72	-0.67	-0.01	-0.0	-0.29	-0.04	-0.35	-0.36	-0.25	-0.1	0.31	0.48	0.23	-0.04	-0.04	0.21	0.15	-0.09	-0.06	0.17	0.1	0.14	0.07	0.14	0.02	-0.02	0.21	0.19	0.54
Lsat_1_v5_gn_4_27640.1 (PRMT6)	-0.66	-0.81	-1.23	-0.92	-0.23	0.28	0.08	0.35	-0.37	-0.56	-0.4	-0.34	0.54	0.9	0.62	0.01	0.13	0.21	0.16	-0.07	-0.08	-0.0	0.13	-0.34	-0.14	-0.05	-0.09	-0.14	0.25	0.08	0.56
Lsat_1_v5_gn_5_104280.1 (NES1)	-0.75	-0.85	-1.53	-1.38	-0.01	0.04	-0.2	-0.18	-0.68	-0.83	-0.7	-0.62	0.9	0.56	0.06	-0.27	-0.66	0.36	0.01	-0.13	-0.12	0.12	0.96	-0.06	0.18	0.15	0.22	-0.07	0.37	0.26	1.06
Lsat_1_v5_gn_5_104560.1	-0.49	-0.7	-0.91	-0.84	0.15	0.51	-0.05	0.08	-0.6	-0.49	-0.49	-0.34	0.3	0.69	0.42	0.1	-0.0	0.61	0.28	-0.08	-0.09	0.03	0.35	-0.06	-0.07	-0.08	-0.19	0.11	0.15	-0.11	0.15
Lsat_1_v5_gn_5_135041.1 (SGS3)	-0.94	-0.79	-0.94	-0.83	-0.25	-0.02	-0.24	0.03	-0.49	-0.58	-0.3	-0.26	0.78	0.49	0.16	-0.09	-0.04	0.96	-0.26	-0.18	-0.22	0.03	0.29	0.24	0.22	-0.13	-0.14	-0.31	0.2	0.21	0.93
Lsat_1_v5_gn_5_137520.1 (SME2)	-0.56	-0.78	-0.89	-0.81	0.02	0.07	-0.17	0.35	-0.38	-0.31	-0.27	-0.18	0.74	0.22	0.22	0.13	0.11	0.36	-0.12	-0.02	-0.0	0.13	0.31	0.01	0.06	0.13	0.09	0.03	-0.07	-0.05	0.34
Lsat_1_v5_gn_5_146160.1 (RPS30A)	-0.81	-0.8	-0.88	-0.73	-0.12	0.17	-0.14	0.18	-0.63	-0.53	-0.39	-0.2	0.74	0.33	-0.01	-0.18	-0.16	0.64	-0.29	-0.11	0.04	0.14	0.19	0.41	0.31	0.3	0.07	0.2	-0.08	-0.12	0.59
Lsat_1_v5_gn_5_14700.1	-0.6	-0.73	-0.81	-0.72	0.02	0.11	-0.06	0.21	-0.48	-0.33	-0.33	-0.16	0.58	0.39	0.19	0.05	0.2	0.32	-0.19	-0.13	0.01	0.1	0.39	0.06	0.01	0.08	-0.09	0.18	0.02	-0.02	0.48
Lsat_1_v5_gn_5_147260.1 (TPX1)	0.09	-0.41	-0.59	-0.72	-0.24	0.04	-0.15	-0.06	-0.24	-0.2	-0.25	-0.07	0.46	0.04	-0.24	-0.11	-0.0	0.1	0.01	0.07	0.02	0.11	0.86	0.17	0.21	0.13	0.15	0.32	-0.19	-0.2	-0.02
Lsat_1_v5_gn_5_150700.1	-0.97	-0.79	-1.19	-0.61	-0.29	0.09	-0.27	-0.03	-0.62	-0.5	-0.2	-0.34	0.8	0.75	0.52	0.19	0.09	0.45	0.02	-0.08	-0.11	-0.04	0.44	0.14	-0.06	-0.02	-0.06	0.1	0.05	0.03	0.41
Lsat_1_v5_gn_5_65320.1 (UBA2A)	-0.5	-0.55	-0.91	-0.74	0.13	0.3	0.11	0.34	-0.4	-0.41	-0.35	-0.35	0.37	0.8	0.57	0.13	-0.01	0.46	0.21	-0.05	-0.17	-0.07	0.16	-0.06	-0.06	-0.08	-0.12	-0.06	-0.05	-0.2	0.13
Lsat_1_v5_gn_5_80980.1 (PFD1)	-0.48	-0.53	-0.62	-0.68	-0.16	0.13	0.04	0.44	-0.42	-0.38	-0.22	-0.1	0.58	0.2	0.1	-0.25	-0.2	0.12	0.01	-0.02	0.1	0.07	0.37	0.1	0.04	0.1	0.09	0.26	-0.01	-0.13	0.46
Lsat_1_v5_gn_6_114300.1	-0.46	-0.65	-0.87	-0.35	-0.27	0.04	-0.14	0.22	-0.7	-0.67	-0.42	-0.16	0.84	0.28	-0.25	-0.33	-0.12	0.05	-0.77	-0.14	-0.05	0.04	-0.04	0.69	0.46	0.18	0.18	0.47	0.04	0.11	0.75
Lsat_1_v5_gn_6_117381.1 (EMB2786)	-0.84	-0.78	-0.77	-0.91	-0.03	0.25	-0.08	0.1	-0.35	-0.37	-0.3	-0.29	0.58	0.78	0.59	0.24	-0.02	0.3	-0.09	-0.04	0.03	-0.1	0.0	0.02	-0.07	-0.05	-0.15	0.12	0.05	0.11	0.42
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.