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Heatmap: Cluster_103 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.76 0.02 -0.18 0.64 0.49 0.56 0.65 0.63 -0.58 -0.14 -0.25 -0.65 -0.34 -0.14 -0.45 -0.92 -0.4 -1.02 -0.29 -0.36 -0.34 0.03 -0.74 -0.09 -0.22 0.21 0.25 0.36 0.33 -0.17 0.06
0.91 1.11 1.0 0.78 0.95 0.7 0.2 1.1 -0.18 -0.58 -0.17 -0.1 -1.13 0.36 -0.52 -0.69 -0.98 -1.88 -0.35 -1.07 -0.82 -0.44 -1.99 -0.41 -0.22 -0.46 -0.27 -0.36 -0.13 -0.36 -0.47
1.05 0.67 0.47 0.29 0.34 0.41 0.36 0.25 -0.15 -0.02 -0.06 -0.13 -0.6 -0.03 0.28 0.03 -0.2 -1.84 0.2 -0.02 0.15 0.17 -3.89 -0.28 -0.3 0.0 0.04 0.21 -0.43 -0.76 -1.81
0.76 0.02 -0.18 0.64 0.49 0.56 0.65 0.63 -0.58 -0.14 -0.25 -0.65 -0.34 -0.14 -0.45 -0.92 -0.4 -1.02 -0.29 -0.36 -0.34 0.03 -0.74 -0.09 -0.22 0.21 0.25 0.36 0.33 -0.17 0.06
0.58 0.92 0.94 0.65 0.34 0.02 0.33 0.27 0.15 -0.07 0.15 -0.06 -1.81 0.87 0.23 -0.24 -0.39 -2.75 0.09 -0.17 -0.21 -0.09 -4.95 -0.98 -0.43 0.26 0.37 -0.43 -0.66 -0.8 -0.43
0.62 0.53 0.36 0.28 0.31 0.12 0.22 0.1 0.02 -0.05 0.03 -0.01 -0.63 0.47 0.37 -0.04 -0.01 -0.47 -0.04 -0.17 -0.14 -0.13 -3.05 0.1 0.04 -0.09 -0.07 -0.42 -0.38 -0.27 -0.3
1.5 1.81 1.49 2.12 -0.58 -0.84 0.3 -0.91 -0.73 -1.15 -0.19 -2.05 -1.7 -3.21 -1.23 -0.43 -0.07 0.91 -0.48 0.03 -1.02 -0.65 -1.91 -1.49 -0.61 -0.43 -1.3 -0.44 0.11 -1.43 -1.19
0.74 0.72 1.62 1.06 -0.12 0.94 -0.02 -0.41 -0.48 -0.56 -0.04 -0.67 -0.14 -1.71 -1.35 0.11 -0.63 0.2 -0.26 -1.18 -0.14 -0.18 -2.14 -0.6 -0.43 -0.55 -0.02 -0.13 -0.04 -0.35 0.53
1.34 1.53 1.17 0.61 -0.62 -0.67 -0.1 -0.48 0.13 0.18 0.07 -0.07 -0.01 -1.09 -0.79 -0.46 -0.39 -1.14 -0.95 -0.33 -0.62 -0.38 -0.16 -0.6 -0.43 -0.16 -0.3 -0.71 -0.01 0.15 0.26
0.76 0.02 -0.18 0.64 0.49 0.56 0.65 0.63 -0.58 -0.14 -0.25 -0.65 -0.34 -0.14 -0.45 -0.92 -0.4 -1.02 -0.29 -0.36 -0.34 0.03 -0.74 -0.09 -0.22 0.21 0.25 0.36 0.33 -0.17 0.06
1.09 0.57 0.6 0.44 0.13 0.12 0.19 -0.42 -0.03 -0.18 -0.47 -0.1 -0.86 -0.38 -0.27 0.27 -0.2 0.2 0.39 -0.22 0.44 0.35 -4.86 -0.21 0.15 0.09 0.33 -0.02 -0.48 -1.21 -1.75
0.84 0.68 2.2 1.67 0.46 0.68 0.21 -2.47 -0.42 -0.23 -0.1 -0.79 -2.21 -0.25 0.51 -0.33 -1.18 -3.17 0.87 -0.52 -0.47 -1.0 -2.58 -1.0 -0.35 0.27 -0.62 -0.52 -1.67 -1.85 -1.97
0.87 1.27 0.96 0.78 0.47 0.09 0.16 -0.89 0.06 -0.02 -0.09 0.08 -0.85 -2.22 -1.33 0.22 0.11 -1.21 -0.45 -0.45 0.04 -0.12 -3.62 -0.53 -0.03 0.13 0.04 -0.35 0.13 0.14 -0.23
0.81 0.47 1.33 1.18 -0.08 0.08 0.19 0.33 -0.34 -0.36 -0.38 -0.44 -0.52 0.11 0.15 -0.17 -0.16 -0.91 -0.16 -0.15 -0.33 -0.24 -0.87 -0.32 -0.32 -0.21 -0.05 -0.01 -0.46 -0.55 -0.82
1.29 -0.12 -1.07 -1.7 0.39 0.6 1.3 -0.02 0.63 -0.19 -1.39 0.0 -0.03 0.42 -0.84 -0.31 -0.42 -2.03 0.08 0.19 0.01 0.2 0.56 -1.06 -1.22 -0.7 1.42 0.83 -4.35 -3.18 -2.7
1.03 1.43 1.32 0.87 0.56 0.53 0.41 0.15 -0.2 -0.47 -0.2 -0.49 -1.18 -0.38 -0.04 -0.43 -0.71 -1.21 -0.83 -0.6 -0.24 -0.19 -3.58 -0.28 -0.2 -0.33 -0.04 -0.36 -0.33 -0.5 -0.56
0.76 0.02 -0.18 0.64 0.49 0.56 0.65 0.63 -0.58 -0.14 -0.25 -0.65 -0.34 -0.14 -0.45 -0.92 -0.4 -1.02 -0.29 -0.36 -0.34 0.03 -0.74 -0.09 -0.22 0.21 0.25 0.36 0.33 -0.17 0.06
1.44 1.85 1.08 1.01 0.29 0.11 0.03 -0.94 0.27 0.26 0.33 -0.04 -0.55 -2.75 -1.6 -0.1 -0.54 -2.5 -1.36 -0.93 -0.33 -0.46 -1.17 -0.98 -0.53 -0.11 -0.3 -0.67 -0.11 0.16 -0.66
0.96 0.68 1.27 1.24 0.53 0.74 -0.56 -1.19 -0.04 -0.37 -0.08 -0.51 -0.39 -0.65 -0.4 0.13 -0.58 -1.44 -0.61 -0.82 -0.02 -0.23 -0.85 -0.31 -0.21 -0.08 -0.1 -0.57 0.17 -0.01 -0.35
1.28 0.71 0.33 0.43 0.38 0.35 0.52 0.04 -0.24 -0.17 0.21 -0.43 -0.98 -0.45 -0.49 -0.11 -0.41 -0.28 -0.12 -0.01 0.22 0.15 -4.31 -0.38 -0.15 0.01 0.24 0.33 -0.22 -0.72 -1.35
1.28 0.71 0.33 0.43 0.38 0.35 0.52 0.04 -0.24 -0.17 0.21 -0.43 -0.98 -0.45 -0.49 -0.11 -0.41 -0.28 -0.12 -0.01 0.22 0.15 -4.31 -0.38 -0.15 0.01 0.24 0.33 -0.22 -0.72 -1.35
0.8 1.45 1.09 1.73 -0.6 -0.33 0.21 -0.45 -0.18 0.39 -1.73 -0.65 -0.68 -2.11 0.06 0.17 0.09 0.52 -0.89 -0.94 0.02 0.19 -3.37 -1.04 -0.32 -0.3 -0.42 -0.1 -0.12 -0.34 -1.75
1.1 1.78 1.78 1.74 -0.39 -0.18 0.16 -0.01 -0.81 -1.18 -0.58 -0.87 -0.86 -1.41 -0.61 -0.51 -0.77 -0.04 -0.21 0.14 -0.33 -0.65 -4.0 -0.76 -0.65 -0.07 -0.9 -0.4 -0.34 -0.46 -1.36
0.6 1.12 1.01 0.67 0.62 0.18 0.25 0.09 -0.18 -0.05 -0.63 -0.28 -1.47 -0.02 0.43 -0.18 -0.27 -2.14 0.17 -0.23 0.06 0.15 -1.8 -0.04 -0.54 0.05 0.08 -1.02 -0.47 -0.25 -0.73
0.63 0.76 0.58 0.77 0.5 0.32 0.29 -0.02 -0.3 -0.22 0.06 0.08 -1.35 0.2 0.57 0.1 -0.53 -2.05 0.22 -0.2 -0.08 -0.38 -2.33 -0.16 -0.04 -0.29 0.14 -0.26 -0.37 0.02 -0.98
0.63 0.83 0.76 0.64 0.64 0.33 0.18 -0.12 -0.06 -0.16 0.17 -0.28 -1.38 -0.37 0.21 -0.01 -0.26 0.01 0.19 -0.24 -0.22 -0.3 -2.72 -0.37 -0.18 -0.17 -0.32 -0.37 -0.03 -0.07 -0.42
0.89 0.85 1.38 1.06 0.72 0.26 -0.16 0.04 0.0 -0.18 -0.2 -0.27 -0.85 0.23 0.27 -0.09 -0.37 -1.18 -0.25 -0.52 -0.47 -0.54 -3.6 -0.57 -0.57 -0.49 -0.19 -0.65 0.08 -0.23 -0.52
0.42 0.39 0.82 0.89 0.19 0.32 -0.38 -0.72 -0.1 -0.1 0.1 -0.37 -0.53 0.2 0.18 0.09 -0.15 -0.23 -0.07 -0.43 -0.2 -0.29 -0.41 -0.48 -0.2 0.08 -0.12 -0.51 0.25 0.05 -0.23
1.48 1.64 1.85 1.07 0.85 0.92 -0.05 0.07 -0.79 -0.8 -0.26 -0.4 -0.82 0.53 -0.35 -0.35 -1.16 -1.06 -2.12 -1.59 -1.08 -0.76 -1.09 -1.63 -1.3 -0.79 -1.01 -0.98 -0.43 -0.7 -0.59
1.99 1.8 0.37 -1.22 0.99 1.24 1.07 -0.85 0.04 -0.55 -1.24 -0.28 -1.53 -0.5 -2.01 -3.15 -2.35 -6.33 1.07 0.83 -1.51 0.27 -5.61 -1.22 -1.88 -0.97 1.04 0.33 - -5.83 -2.08
1.28 0.71 0.33 0.43 0.38 0.35 0.52 0.04 -0.24 -0.17 0.21 -0.43 -0.98 -0.45 -0.49 -0.11 -0.41 -0.28 -0.12 -0.01 0.22 0.15 -4.31 -0.38 -0.15 0.01 0.24 0.33 -0.22 -0.72 -1.35
0.73 1.45 0.73 1.11 0.41 0.1 0.35 0.48 -0.67 -0.33 -0.18 -0.18 -0.4 -0.79 -0.53 0.2 -0.22 -1.75 -0.35 -0.3 -0.17 -0.05 -1.64 -0.52 -0.28 -0.13 -0.28 0.02 -0.22 -0.53 -0.77
0.61 0.57 0.87 0.57 0.32 0.13 -0.24 -0.26 -0.04 -0.02 -0.11 -0.24 -0.35 0.21 0.16 -0.21 -0.15 -0.93 -0.06 -0.25 -0.33 -0.17 -0.08 -0.25 -0.29 -0.28 -0.24 -0.11 0.15 -0.03 -0.29
0.93 0.67 1.71 1.3 0.33 -0.66 -1.08 -1.13 -0.6 -0.42 -0.35 -0.14 -0.08 0.5 -0.08 -0.33 0.06 -0.52 -0.45 -0.76 -0.43 -0.76 -4.33 -0.79 -0.36 -1.11 -0.2 -0.5 0.37 0.67 0.06
0.55 0.31 0.47 0.37 0.1 0.14 0.01 0.05 -0.3 -0.25 -0.09 -0.32 -0.23 0.12 -0.02 0.05 0.06 -0.32 -0.08 -0.2 -0.07 -0.03 -0.52 -0.27 -0.07 -0.04 0.03 0.08 0.06 0.01 -0.19
0.38 0.49 0.57 0.45 0.54 0.08 -0.16 -0.27 -0.3 -0.15 0.15 -0.29 -1.24 0.81 0.83 -0.22 -0.61 -0.46 0.69 -0.55 -0.45 -0.11 -0.74 -0.46 -0.41 0.05 0.04 -0.28 0.12 -0.19 -0.99
0.47 0.9 0.81 0.74 -0.25 -0.04 0.58 -0.08 -0.21 -0.24 0.02 -0.34 -0.37 0.41 -0.11 -0.04 -0.09 -1.08 -0.33 -0.43 -0.19 -0.35 -0.67 -0.68 -0.32 0.27 0.02 0.09 -0.04 -0.13 -0.47
1.16 1.26 1.0 0.03 0.11 0.37 0.32 0.47 -0.16 -0.29 -0.07 -0.35 -0.78 -0.49 -0.1 -0.49 -0.53 -2.47 0.16 -0.24 -0.16 0.02 - -0.58 -0.02 0.04 0.15 0.03 0.06 -0.34 -0.74
1.7 1.72 1.1 0.86 0.11 -0.92 -0.4 0.22 -0.07 0.15 0.18 0.49 0.15 -0.48 -0.73 -0.76 -0.43 -1.02 -1.16 -0.68 -0.88 -0.98 -1.4 -0.71 -0.89 -0.68 -0.76 -0.4 -0.24 -0.06 -0.53
0.6 0.77 1.14 0.75 0.59 0.33 -0.89 -1.81 -0.39 -0.3 -0.18 -0.09 -0.83 0.46 0.08 0.19 -0.29 -0.19 -0.33 -0.35 -0.23 -0.14 -0.57 -0.68 -0.4 -0.22 0.16 -0.52 -0.26 -0.07 0.29
1.94 0.71 0.72 -0.06 1.1 1.07 0.49 -0.12 -0.32 0.05 0.13 -0.36 -2.05 0.11 0.53 0.21 -0.74 -4.09 -0.84 -0.49 -0.24 0.04 -4.42 -1.11 -0.45 -0.48 -0.31 0.11 -0.77 -1.36 -3.22
1.48 1.82 1.29 0.65 0.19 -0.86 0.16 -0.23 0.25 0.29 0.15 0.45 -2.02 -5.6 -3.75 -1.03 -1.08 -4.67 -1.17 -0.29 -0.05 -0.02 -1.93 -0.21 -0.21 0.17 0.04 -0.3 -0.17 -0.15 -0.28
1.17 1.49 0.9 0.53 0.16 -0.58 0.29 -0.15 0.39 0.31 0.39 0.37 -1.41 -3.79 -2.65 -0.69 -0.59 -4.26 -0.61 -0.06 0.04 0.15 -2.29 -0.15 -0.13 -0.08 0.19 0.01 -0.11 -0.03 -0.22
1.5 1.88 2.04 0.88 -0.21 -1.78 -0.3 -1.13 -0.42 0.37 -0.04 0.48 -2.88 - - -1.9 -1.2 -3.81 -3.41 -2.07 -0.85 -1.1 1.16 0.54 0.35 -0.55 -1.32 -0.31 -0.78 -0.14 0.14
0.72 1.05 1.42 1.24 -0.11 0.38 -0.17 -0.13 -0.74 -0.72 -0.56 -1.02 -0.4 0.33 0.65 0.39 0.06 -0.94 -0.53 -0.66 -0.5 -0.83 -1.81 -0.84 -0.6 -0.39 -0.36 -0.9 0.46 0.23 -0.59
0.43 0.59 0.65 0.55 0.53 0.17 -0.5 -0.65 -0.16 -0.18 -0.06 -0.06 -0.06 -0.16 -0.2 0.04 -0.04 -0.29 -0.22 -0.25 -0.17 -0.18 -0.78 -0.25 -0.09 -0.15 0.04 0.01 0.2 0.08 -0.02
0.76 0.02 -0.18 0.64 0.49 0.56 0.65 0.63 -0.58 -0.14 -0.25 -0.65 -0.34 -0.14 -0.45 -0.92 -0.4 -1.02 -0.29 -0.36 -0.34 0.03 -0.74 -0.09 -0.22 0.21 0.25 0.36 0.33 -0.17 0.06
0.79 1.0 1.05 0.92 0.11 -0.12 -0.1 0.16 -0.85 -0.65 -0.52 -0.26 -0.3 -0.69 -0.59 0.08 0.31 -0.81 -0.24 -0.49 -0.09 0.17 -0.69 -0.38 -0.14 -0.04 0.15 0.5 -0.15 -0.51 -0.87
1.18 1.42 0.77 0.45 0.42 0.31 0.17 0.29 -0.69 -0.49 -0.38 -0.41 -0.68 -1.91 -1.0 -0.16 -0.18 0.26 0.34 -0.19 -0.1 -0.11 -0.15 -0.68 -0.38 -0.1 -0.27 0.17 -0.37 -0.82 -1.65
1.05 0.67 0.47 0.29 0.34 0.41 0.36 0.25 -0.15 -0.02 -0.06 -0.13 -0.6 -0.03 0.28 0.03 -0.2 -1.84 0.2 -0.02 0.15 0.17 -3.89 -0.28 -0.3 0.0 0.04 0.21 -0.43 -0.76 -1.81
0.76 0.02 -0.18 0.64 0.49 0.56 0.65 0.63 -0.58 -0.14 -0.25 -0.65 -0.34 -0.14 -0.45 -0.92 -0.4 -1.02 -0.29 -0.36 -0.34 0.03 -0.74 -0.09 -0.22 0.21 0.25 0.36 0.33 -0.17 0.06
0.76 0.02 -0.18 0.64 0.49 0.56 0.65 0.63 -0.58 -0.14 -0.25 -0.65 -0.34 -0.14 -0.45 -0.92 -0.4 -1.02 -0.29 -0.36 -0.34 0.03 -0.74 -0.09 -0.22 0.21 0.25 0.36 0.33 -0.17 0.06
1.48 1.49 0.39 0.97 1.09 1.62 0.64 0.34 -0.95 -1.46 -0.93 -2.39 -1.22 0.24 -3.21 -0.47 -2.38 -0.9 -0.45 -0.74 -1.53 -0.53 -1.56 -1.64 -1.0 -0.44 0.12 1.02 -0.98 0.02 -1.14
0.94 0.62 0.8 0.64 0.35 0.54 -0.91 -1.83 -0.28 -0.36 -0.2 -0.6 -0.61 0.54 0.36 0.08 -0.44 -0.28 0.12 -0.48 -0.28 -0.26 -0.52 -0.45 -0.38 -0.13 -0.08 -0.31 0.15 0.02 0.11
0.65 0.53 0.45 0.27 0.86 0.42 -0.5 0.3 0.0 -0.08 0.14 0.17 -0.23 0.5 -0.24 -0.41 -0.44 -1.42 -0.22 -0.34 -0.42 -0.25 -0.78 0.03 -0.12 -0.36 -0.11 0.06 -0.13 -0.16 -0.24
2.14 0.92 1.29 -0.14 1.22 1.32 0.37 -1.04 -0.74 -0.5 -0.85 0.01 -0.99 -0.32 -0.35 -1.96 -0.96 -1.24 0.83 -1.99 -0.59 -0.22 -1.3 -0.87 -1.18 -0.64 -1.38 0.8 -1.96 -4.03 -0.87
0.93 1.3 0.87 0.88 0.4 0.47 0.14 -0.07 -0.81 -0.43 -0.15 -0.51 -1.32 0.61 1.23 -0.31 -0.88 -3.4 0.61 0.19 -0.15 -0.4 -7.24 -1.34 -0.7 -0.58 -0.64 -0.81 0.38 -0.35 -1.97
1.01 1.33 0.85 0.29 -0.09 -0.17 0.57 -0.02 -0.02 -0.21 -0.48 -0.11 -1.07 -0.14 -1.06 -0.62 -0.39 -1.18 -0.39 -0.6 -0.19 0.32 -0.72 -1.04 0.01 0.39 -0.23 -0.06 0.02 0.02 0.19
1.28 1.42 -1.43 -1.11 0.6 0.67 -0.17 0.62 0.16 -0.58 -0.02 -0.36 -1.95 0.71 -0.5 0.46 -0.69 - -1.01 -1.04 0.57 0.81 -3.16 -0.29 -1.73 -0.19 0.86 0.72 -0.86 -0.67 -1.29
1.23 1.61 1.79 2.15 -1.32 -0.52 -0.12 -0.21 -0.27 -0.78 -1.53 -0.81 -1.28 -1.44 -1.02 -0.51 -0.45 -0.3 -0.3 -0.12 -0.24 -0.18 -4.73 -0.1 -0.82 -0.22 -0.33 -0.52 -0.23 -1.06 -1.9
0.44 0.35 0.32 0.47 0.18 0.12 -0.04 -0.17 -0.09 0.05 -0.29 -0.15 -1.07 0.68 0.89 -0.3 -0.51 -0.67 0.62 0.09 -0.29 0.05 -0.84 -0.2 -0.2 0.03 0.19 -0.18 -0.13 -0.5 -1.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.