Heatmap: Cluster_103 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_1_122420.1	1.0	0.6	0.52	0.92	0.83	0.87	0.93	0.91	0.39	0.54	0.5	0.38	0.47	0.54	0.43	0.31	0.45	0.29	0.48	0.46	0.47	0.6	0.35	0.56	0.51	0.68	0.7	0.76	0.74	0.53	0.62
Lsat_1_v5_gn_1_33101.1	0.87	1.0	0.93	0.8	0.9	0.75	0.53	0.99	0.41	0.31	0.41	0.43	0.21	0.6	0.32	0.29	0.24	0.13	0.36	0.22	0.26	0.34	0.12	0.35	0.4	0.34	0.38	0.36	0.42	0.36	0.33
Lsat_1_v5_gn_1_38720.1 (PETA)	1.0	0.77	0.67	0.59	0.61	0.64	0.62	0.57	0.43	0.47	0.46	0.44	0.32	0.47	0.59	0.49	0.42	0.13	0.56	0.48	0.53	0.54	0.03	0.4	0.39	0.48	0.5	0.56	0.36	0.29	0.14
Lsat_1_v5_gn_1_54820.1	1.0	0.6	0.52	0.92	0.83	0.87	0.93	0.91	0.39	0.54	0.5	0.38	0.47	0.54	0.43	0.31	0.45	0.29	0.48	0.46	0.47	0.6	0.35	0.56	0.51	0.68	0.7	0.76	0.74	0.53	0.62
Lsat_1_v5_gn_1_55500.1 (CHX20)	0.78	0.99	1.0	0.82	0.66	0.53	0.66	0.63	0.58	0.5	0.58	0.5	0.15	0.96	0.61	0.44	0.4	0.08	0.55	0.46	0.45	0.49	0.02	0.26	0.39	0.63	0.67	0.39	0.33	0.3	0.39
Lsat_1_v5_gn_1_56381.1 (USP)	1.0	0.94	0.84	0.79	0.8	0.71	0.76	0.7	0.66	0.63	0.66	0.65	0.42	0.9	0.84	0.63	0.64	0.47	0.63	0.58	0.59	0.59	0.08	0.69	0.67	0.61	0.62	0.49	0.5	0.54	0.53
Lsat_1_v5_gn_1_58461.1 (NDHA)	0.65	0.81	0.64	1.0	0.15	0.13	0.28	0.12	0.14	0.1	0.2	0.06	0.07	0.02	0.1	0.17	0.22	0.43	0.16	0.23	0.11	0.15	0.06	0.08	0.15	0.17	0.09	0.17	0.25	0.09	0.1
Lsat_1_v5_gn_1_89461.1 (XIG)	0.55	0.54	1.0	0.68	0.3	0.62	0.32	0.25	0.23	0.22	0.32	0.2	0.3	0.1	0.13	0.35	0.21	0.37	0.27	0.14	0.3	0.29	0.07	0.21	0.24	0.22	0.32	0.3	0.32	0.26	0.47
Lsat_1_v5_gn_2_51240.1 (INT1)	0.87	1.0	0.78	0.53	0.22	0.22	0.32	0.25	0.38	0.39	0.36	0.33	0.34	0.16	0.2	0.25	0.26	0.16	0.18	0.27	0.22	0.26	0.31	0.23	0.26	0.31	0.28	0.21	0.34	0.38	0.41
Lsat_1_v5_gn_2_53921.1	1.0	0.6	0.52	0.92	0.83	0.87	0.93	0.91	0.39	0.54	0.5	0.38	0.47	0.54	0.43	0.31	0.45	0.29	0.48	0.46	0.47	0.6	0.35	0.56	0.51	0.68	0.7	0.76	0.74	0.53	0.62
Lsat_1_v5_gn_2_5601.1 (NdhK)	1.0	0.7	0.71	0.64	0.52	0.51	0.54	0.35	0.46	0.42	0.34	0.44	0.26	0.36	0.39	0.57	0.41	0.54	0.61	0.4	0.64	0.6	0.02	0.41	0.52	0.5	0.59	0.46	0.34	0.2	0.14
Lsat_1_v5_gn_2_63900.1 (ATAF2)	0.39	0.35	1.0	0.69	0.3	0.35	0.25	0.04	0.16	0.19	0.2	0.13	0.05	0.18	0.31	0.17	0.1	0.02	0.4	0.15	0.16	0.11	0.04	0.11	0.17	0.26	0.14	0.15	0.07	0.06	0.06
Lsat_1_v5_gn_2_72320.1 (AAE5)	0.76	1.0	0.81	0.72	0.57	0.44	0.46	0.22	0.43	0.41	0.39	0.44	0.23	0.09	0.17	0.48	0.45	0.18	0.3	0.3	0.43	0.38	0.03	0.29	0.41	0.45	0.43	0.33	0.45	0.46	0.35
Lsat_1_v5_gn_2_79341.1	0.7	0.55	1.0	0.9	0.38	0.42	0.45	0.5	0.31	0.31	0.3	0.29	0.28	0.43	0.44	0.35	0.36	0.21	0.35	0.36	0.32	0.34	0.22	0.32	0.32	0.34	0.38	0.39	0.29	0.27	0.22
Lsat_1_v5_gn_2_92160.1	0.91	0.34	0.18	0.12	0.49	0.56	0.92	0.37	0.58	0.33	0.14	0.37	0.37	0.5	0.21	0.3	0.28	0.09	0.39	0.43	0.38	0.43	0.55	0.18	0.16	0.23	1.0	0.66	0.02	0.04	0.06
Lsat_1_v5_gn_3_10281.1	0.76	1.0	0.92	0.68	0.55	0.54	0.49	0.41	0.32	0.27	0.32	0.26	0.16	0.28	0.36	0.28	0.23	0.16	0.21	0.24	0.31	0.33	0.03	0.3	0.32	0.3	0.36	0.29	0.29	0.26	0.25
Lsat_1_v5_gn_3_140581.1	1.0	0.6	0.52	0.92	0.83	0.87	0.93	0.91	0.39	0.54	0.5	0.38	0.47	0.54	0.43	0.31	0.45	0.29	0.48	0.46	0.47	0.6	0.35	0.56	0.51	0.68	0.7	0.76	0.74	0.53	0.62
Lsat_1_v5_gn_3_28580.1 (KFB)	0.75	1.0	0.59	0.56	0.34	0.3	0.28	0.15	0.33	0.33	0.35	0.27	0.19	0.04	0.09	0.26	0.19	0.05	0.11	0.15	0.22	0.2	0.12	0.14	0.19	0.26	0.23	0.17	0.26	0.31	0.18
Lsat_1_v5_gn_3_72820.1 (DJC24)	0.8	0.67	1.0	0.98	0.6	0.69	0.28	0.18	0.4	0.32	0.39	0.29	0.32	0.26	0.31	0.45	0.28	0.15	0.27	0.23	0.41	0.35	0.23	0.33	0.36	0.39	0.39	0.28	0.47	0.41	0.32
Lsat_1_v5_gn_3_99221.1 (NDHJ)	1.0	0.68	0.52	0.56	0.54	0.52	0.59	0.42	0.35	0.37	0.48	0.31	0.21	0.3	0.29	0.38	0.31	0.34	0.38	0.41	0.48	0.46	0.02	0.32	0.37	0.42	0.49	0.52	0.35	0.25	0.16
Lsat_1_v5_gn_3_99300.1 (NDHJ)	1.0	0.68	0.52	0.56	0.54	0.52	0.59	0.42	0.35	0.37	0.48	0.31	0.21	0.3	0.29	0.38	0.31	0.34	0.38	0.41	0.48	0.46	0.02	0.32	0.37	0.42	0.49	0.52	0.35	0.25	0.16
Lsat_1_v5_gn_4_118101.1 (NDHI)	0.53	0.83	0.64	1.0	0.2	0.24	0.35	0.22	0.27	0.4	0.09	0.19	0.19	0.07	0.31	0.34	0.32	0.43	0.16	0.16	0.31	0.34	0.03	0.15	0.24	0.24	0.23	0.28	0.28	0.24	0.09
Lsat_1_v5_gn_4_118121.1 (NDHA)	0.62	1.0	1.0	0.97	0.22	0.26	0.33	0.29	0.17	0.13	0.19	0.16	0.16	0.11	0.19	0.2	0.17	0.28	0.25	0.32	0.23	0.19	0.02	0.17	0.19	0.28	0.16	0.22	0.23	0.21	0.11
Lsat_1_v5_gn_4_124821.1 (SUP)	0.7	1.0	0.93	0.73	0.71	0.52	0.55	0.49	0.41	0.44	0.3	0.38	0.17	0.45	0.62	0.41	0.38	0.1	0.52	0.39	0.48	0.51	0.13	0.45	0.32	0.48	0.49	0.23	0.33	0.39	0.28
Lsat_1_v5_gn_4_124841.1 (scpl40)	0.91	0.99	0.88	1.0	0.83	0.73	0.72	0.58	0.48	0.5	0.61	0.62	0.23	0.67	0.87	0.63	0.41	0.14	0.68	0.51	0.56	0.45	0.12	0.53	0.57	0.48	0.65	0.49	0.45	0.6	0.3
Lsat_1_v5_gn_4_124880.1 (scpl40)	0.87	1.0	0.95	0.87	0.87	0.7	0.63	0.52	0.54	0.5	0.63	0.46	0.22	0.43	0.65	0.56	0.47	0.57	0.64	0.48	0.48	0.46	0.09	0.43	0.5	0.5	0.45	0.43	0.55	0.53	0.42
Lsat_1_v5_gn_4_129461.1 (ARA12)	0.71	0.7	1.0	0.81	0.63	0.46	0.35	0.39	0.39	0.34	0.34	0.32	0.21	0.45	0.47	0.36	0.3	0.17	0.32	0.27	0.28	0.27	0.03	0.26	0.26	0.27	0.34	0.24	0.41	0.33	0.27
Lsat_1_v5_gn_4_1480.1 (ASR3)	0.72	0.71	0.95	1.0	0.62	0.68	0.42	0.33	0.5	0.5	0.58	0.42	0.37	0.62	0.61	0.58	0.49	0.46	0.52	0.4	0.47	0.44	0.41	0.39	0.47	0.57	0.5	0.38	0.64	0.56	0.46
Lsat_1_v5_gn_4_162340.1	0.77	0.86	1.0	0.58	0.5	0.53	0.27	0.29	0.16	0.16	0.23	0.21	0.16	0.4	0.22	0.22	0.12	0.13	0.06	0.09	0.13	0.16	0.13	0.09	0.11	0.16	0.14	0.14	0.21	0.17	0.18
Lsat_1_v5_gn_4_182341.1	1.0	0.88	0.33	0.11	0.5	0.6	0.53	0.14	0.26	0.17	0.11	0.21	0.09	0.18	0.06	0.03	0.05	0.0	0.53	0.45	0.09	0.3	0.01	0.11	0.07	0.13	0.52	0.32	0.0	0.0	0.06
Lsat_1_v5_gn_4_40440.1 (NDHJ)	1.0	0.68	0.52	0.56	0.54	0.52	0.59	0.42	0.35	0.37	0.48	0.31	0.21	0.3	0.29	0.38	0.31	0.34	0.38	0.41	0.48	0.46	0.02	0.32	0.37	0.42	0.49	0.52	0.35	0.25	0.16
Lsat_1_v5_gn_5_123860.1	0.61	1.0	0.61	0.79	0.49	0.39	0.46	0.51	0.23	0.29	0.32	0.32	0.28	0.21	0.25	0.42	0.31	0.11	0.29	0.3	0.32	0.35	0.12	0.25	0.3	0.33	0.3	0.37	0.31	0.25	0.21
Lsat_1_v5_gn_5_126060.1 (GLY3)	0.83	0.81	1.0	0.81	0.68	0.6	0.46	0.46	0.53	0.54	0.51	0.46	0.43	0.63	0.61	0.47	0.49	0.29	0.53	0.46	0.44	0.49	0.52	0.46	0.45	0.45	0.46	0.51	0.61	0.54	0.45
Lsat_1_v5_gn_5_129800.1 (CDI)	0.58	0.49	1.0	0.75	0.39	0.19	0.15	0.14	0.2	0.23	0.24	0.28	0.29	0.43	0.29	0.24	0.32	0.21	0.22	0.18	0.23	0.18	0.02	0.18	0.24	0.14	0.27	0.22	0.4	0.49	0.32
Lsat_1_v5_gn_5_1301.1	1.0	0.85	0.95	0.88	0.73	0.75	0.69	0.71	0.56	0.58	0.65	0.55	0.58	0.74	0.68	0.71	0.72	0.55	0.65	0.6	0.65	0.67	0.48	0.57	0.65	0.67	0.7	0.72	0.71	0.69	0.6
Lsat_1_v5_gn_5_136021.1 (VICTL)	0.73	0.79	0.84	0.77	0.82	0.6	0.5	0.47	0.46	0.51	0.63	0.46	0.24	0.99	1.0	0.49	0.37	0.41	0.91	0.39	0.41	0.52	0.34	0.41	0.42	0.58	0.58	0.46	0.61	0.49	0.28
Lsat_1_v5_gn_5_164281.1	0.74	1.0	0.94	0.89	0.45	0.52	0.8	0.51	0.46	0.45	0.54	0.42	0.41	0.71	0.5	0.52	0.5	0.25	0.42	0.4	0.47	0.42	0.34	0.33	0.43	0.65	0.54	0.57	0.52	0.49	0.39
Lsat_1_v5_gn_5_183301.1	0.93	1.0	0.84	0.43	0.45	0.54	0.52	0.58	0.37	0.34	0.4	0.33	0.24	0.3	0.39	0.3	0.29	0.08	0.47	0.35	0.37	0.42	0.0	0.28	0.41	0.43	0.46	0.43	0.43	0.33	0.25
Lsat_1_v5_gn_5_86540.1 (COL4)	0.98	1.0	0.65	0.55	0.33	0.16	0.23	0.35	0.29	0.34	0.34	0.42	0.34	0.22	0.18	0.18	0.22	0.15	0.14	0.19	0.16	0.15	0.11	0.19	0.16	0.19	0.18	0.23	0.26	0.29	0.21
Lsat_1_v5_gn_5_92181.1	0.69	0.77	1.0	0.77	0.68	0.57	0.25	0.13	0.35	0.37	0.4	0.43	0.26	0.63	0.48	0.52	0.37	0.4	0.36	0.36	0.39	0.41	0.31	0.28	0.35	0.39	0.51	0.32	0.38	0.43	0.56
Lsat_1_v5_gn_6_112000.1 (CYP707A4)	1.0	0.43	0.43	0.25	0.56	0.55	0.37	0.24	0.21	0.27	0.29	0.2	0.06	0.28	0.38	0.3	0.16	0.02	0.15	0.19	0.22	0.27	0.01	0.12	0.19	0.19	0.21	0.28	0.15	0.1	0.03
Lsat_1_v5_gn_6_13661.1 (ROXY10)	0.79	1.0	0.69	0.44	0.32	0.16	0.32	0.24	0.34	0.35	0.31	0.39	0.07	0.01	0.02	0.14	0.13	0.01	0.13	0.23	0.27	0.28	0.07	0.25	0.25	0.32	0.29	0.23	0.25	0.26	0.23
Lsat_1_v5_gn_6_13680.1 (GRXS7)	0.8	1.0	0.67	0.51	0.4	0.24	0.44	0.32	0.47	0.44	0.47	0.46	0.13	0.03	0.06	0.22	0.24	0.02	0.23	0.34	0.37	0.39	0.07	0.32	0.33	0.34	0.41	0.36	0.33	0.35	0.31
Lsat_1_v5_gn_6_13941.1 (ROXY10)	0.68	0.9	1.0	0.45	0.21	0.07	0.2	0.11	0.18	0.31	0.24	0.34	0.03	0.0	0.0	0.06	0.11	0.02	0.02	0.06	0.13	0.11	0.54	0.35	0.31	0.17	0.1	0.2	0.14	0.22	0.27
Lsat_1_v5_gn_6_17160.1 (CDC20.2)	0.61	0.77	1.0	0.88	0.35	0.48	0.33	0.34	0.22	0.23	0.25	0.18	0.28	0.47	0.58	0.49	0.39	0.19	0.26	0.24	0.26	0.21	0.11	0.21	0.25	0.28	0.29	0.2	0.51	0.44	0.25
Lsat_1_v5_gn_6_29941.1 (iqd2)	0.86	0.95	1.0	0.93	0.92	0.72	0.45	0.4	0.57	0.56	0.61	0.61	0.61	0.57	0.55	0.65	0.62	0.52	0.54	0.53	0.56	0.56	0.37	0.53	0.6	0.57	0.66	0.64	0.73	0.67	0.62
Lsat_1_v5_gn_6_98401.1	1.0	0.6	0.52	0.92	0.83	0.87	0.93	0.91	0.39	0.54	0.5	0.38	0.47	0.54	0.43	0.31	0.45	0.29	0.48	0.46	0.47	0.6	0.35	0.56	0.51	0.68	0.7	0.76	0.74	0.53	0.62
Lsat_1_v5_gn_7_100200.1 (SWEET2)	0.83	0.96	1.0	0.91	0.52	0.44	0.45	0.54	0.27	0.31	0.34	0.4	0.39	0.3	0.32	0.51	0.6	0.27	0.41	0.34	0.45	0.54	0.3	0.37	0.44	0.47	0.54	0.68	0.44	0.34	0.26
Lsat_1_v5_gn_7_102800.1 (GAL2)	0.85	1.0	0.64	0.51	0.5	0.46	0.42	0.46	0.23	0.27	0.29	0.28	0.23	0.1	0.19	0.34	0.33	0.45	0.47	0.33	0.35	0.35	0.34	0.23	0.29	0.35	0.31	0.42	0.29	0.21	0.12
Lsat_1_v5_gn_7_110220.1 (PETA)	1.0	0.77	0.67	0.59	0.61	0.64	0.62	0.57	0.43	0.47	0.46	0.44	0.32	0.47	0.59	0.49	0.42	0.13	0.56	0.48	0.53	0.54	0.03	0.4	0.39	0.48	0.5	0.56	0.36	0.29	0.14
Lsat_1_v5_gn_7_43960.1	1.0	0.6	0.52	0.92	0.83	0.87	0.93	0.91	0.39	0.54	0.5	0.38	0.47	0.54	0.43	0.31	0.45	0.29	0.48	0.46	0.47	0.6	0.35	0.56	0.51	0.68	0.7	0.76	0.74	0.53	0.62
Lsat_1_v5_gn_7_52220.1	1.0	0.6	0.52	0.92	0.83	0.87	0.93	0.91	0.39	0.54	0.5	0.38	0.47	0.54	0.43	0.31	0.45	0.29	0.48	0.46	0.47	0.6	0.35	0.56	0.51	0.68	0.7	0.76	0.74	0.53	0.62
Lsat_1_v5_gn_7_58441.1 (TPI)	0.91	0.92	0.43	0.64	0.7	1.0	0.51	0.41	0.17	0.12	0.17	0.06	0.14	0.38	0.04	0.24	0.06	0.17	0.24	0.2	0.11	0.23	0.11	0.1	0.16	0.24	0.35	0.66	0.16	0.33	0.15
Lsat_1_v5_gn_7_71780.1	1.0	0.8	0.91	0.81	0.66	0.76	0.28	0.15	0.43	0.4	0.45	0.34	0.34	0.76	0.67	0.55	0.38	0.43	0.57	0.37	0.43	0.43	0.36	0.38	0.4	0.47	0.49	0.42	0.58	0.53	0.56
Lsat_1_v5_gn_8_140640.1 (CGL160)	0.86	0.8	0.75	0.66	1.0	0.74	0.39	0.68	0.55	0.52	0.6	0.62	0.47	0.78	0.47	0.41	0.41	0.21	0.47	0.44	0.41	0.46	0.32	0.56	0.51	0.43	0.51	0.57	0.5	0.49	0.46
Lsat_1_v5_gn_8_38760.1	1.0	0.43	0.56	0.21	0.53	0.57	0.29	0.11	0.14	0.16	0.13	0.23	0.11	0.18	0.18	0.06	0.12	0.1	0.4	0.06	0.15	0.2	0.09	0.12	0.1	0.15	0.09	0.4	0.06	0.01	0.12
Lsat_1_v5_gn_8_44900.1	0.78	1.0	0.74	0.75	0.54	0.56	0.45	0.39	0.23	0.3	0.37	0.28	0.16	0.62	0.96	0.33	0.22	0.04	0.62	0.47	0.37	0.31	0.0	0.16	0.25	0.27	0.26	0.23	0.53	0.32	0.1
Lsat_1_v5_gn_9_114801.1 (ADK1)	0.8	1.0	0.72	0.49	0.38	0.35	0.59	0.39	0.39	0.35	0.29	0.37	0.19	0.36	0.19	0.26	0.3	0.18	0.3	0.26	0.35	0.5	0.24	0.19	0.4	0.52	0.34	0.38	0.4	0.4	0.45
Lsat_1_v5_gn_9_115661.1 (FH13)	0.91	1.0	0.14	0.17	0.57	0.59	0.33	0.58	0.42	0.25	0.37	0.29	0.1	0.61	0.26	0.51	0.23	0.0	0.19	0.18	0.55	0.66	0.04	0.31	0.11	0.33	0.68	0.62	0.21	0.24	0.15
Lsat_1_v5_gn_9_49240.1 (NDHH)	0.53	0.69	0.78	1.0	0.09	0.16	0.21	0.19	0.19	0.13	0.08	0.13	0.09	0.08	0.11	0.16	0.16	0.18	0.18	0.21	0.19	0.2	0.01	0.21	0.13	0.19	0.18	0.16	0.19	0.11	0.06
Lsat_1_v5_gn_9_85561.1 (DREB2)	0.73	0.69	0.67	0.75	0.61	0.58	0.53	0.48	0.51	0.56	0.44	0.49	0.26	0.86	1.0	0.44	0.38	0.34	0.83	0.57	0.44	0.56	0.3	0.47	0.47	0.55	0.61	0.47	0.49	0.38	0.25

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)