Heatmap: Cluster_210 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_11721.1	0.06	0.07	-0.13	-0.53	0.02	0.4	0.42	0.25	0.02	-0.03	0.1	-0.25	-0.15	0.43	0.35	-0.06	-0.05	-1.01	0.01	-0.14	-0.07	0.05	-1.09	-0.26	-0.2	0.19	0.16	-0.08	0.27	0.16	-0.03
Lsat_1_v5_gn_1_106241.1	0.33	0.08	-0.22	-0.36	0.02	0.01	0.15	0.29	0.07	0.02	0.1	0.01	0.03	0.4	0.33	-0.04	0.0	-0.97	-0.0	-0.03	-0.13	0.01	-0.89	-0.04	-0.02	-0.04	-0.02	0.01	0.07	0.1	-0.01
Lsat_1_v5_gn_1_114861.1 (LNK2)	-0.3	-0.15	-0.04	0.05	-0.42	-0.32	0.84	0.72	0.24	0.37	0.22	0.06	-0.12	-0.38	0.22	0.04	0.09	-0.91	-0.05	0.1	-0.03	-0.02	-0.64	-0.17	-0.13	0.05	0.04	-0.13	-0.03	-0.02	-0.41
Lsat_1_v5_gn_1_15221.1 (SULT202E1)	-0.46	1.93	-0.55	-1.44	0.97	0.99	0.87	1.56	-1.37	-1.33	-1.21	-1.23	-1.38	0.91	0.61	-0.79	-1.11	-0.52	0.23	-1.11	-0.8	-0.57	-2.6	-0.67	-1.03	-0.8	-0.76	-1.3	0.96	-0.4	0.07
Lsat_1_v5_gn_1_50041.1 (TET3)	0.28	0.46	-0.02	-0.68	0.69	0.29	0.47	0.79	-0.21	-0.28	-0.24	-0.26	-0.75	0.64	0.41	-0.25	-0.24	-0.41	0.19	-0.31	-0.41	-0.27	-0.39	-0.27	-0.32	-0.13	-0.17	-0.29	0.42	0.06	-0.66
Lsat_1_v5_gn_1_69561.1 (PIN3)	-2.28	-2.96	-3.08	-2.51	-1.61	-0.69	1.03	1.4	0.21	0.16	0.2	0.3	-0.88	-2.63	-0.6	0.56	0.28	-3.48	-0.05	0.61	0.32	0.49	-	0.28	0.69	0.46	0.31	-0.52	0.89	0.88	-0.04
Lsat_1_v5_gn_1_81601.1	-0.13	-0.08	-0.63	-1.07	0.11	0.31	0.62	0.31	0.19	-0.05	0.12	-0.34	-0.64	0.28	0.62	0.32	0.1	-2.18	0.28	0.03	0.05	0.02	-0.94	-0.14	-0.01	0.09	-0.0	0.09	0.21	0.14	-0.14
Lsat_1_v5_gn_2_129041.1 (TPPA)	0.72	0.94	-0.39	-1.85	-0.66	-0.89	0.33	0.82	-0.59	-0.55	-0.46	-0.27	0.52	-0.77	-0.51	0.19	0.56	0.82	-0.28	0.16	0.16	0.08	-0.39	-0.02	-0.04	0.14	-0.07	0.13	-0.23	-0.36	-0.87
Lsat_1_v5_gn_2_134740.1	0.17	0.38	0.01	-0.35	-0.26	0.1	0.68	0.94	0.03	-0.13	0.13	-0.04	-0.26	0.44	0.3	-0.07	-0.12	-1.06	-0.16	-0.26	-0.31	-0.18	-0.95	-0.2	-0.17	-0.13	-0.1	-0.38	0.11	0.13	0.12
Lsat_1_v5_gn_2_20640.1 (RPS12)	0.99	0.57	0.26	0.46	-0.25	0.05	0.52	0.47	-0.04	-0.13	0.13	-0.07	0.02	-0.66	-0.21	-0.28	-0.31	-0.39	-0.25	-0.03	-0.0	0.3	-2.8	-0.18	-0.21	-0.01	0.24	0.43	-0.33	-0.36	-1.35
Lsat_1_v5_gn_2_2740.1	0.53	0.3	0.11	-0.05	-0.09	-0.31	0.18	0.28	0.16	0.08	0.11	0.21	-0.1	0.41	0.27	-0.17	0.06	-1.46	0.06	0.1	-0.02	-0.02	-1.06	-0.0	-0.09	-0.11	-0.09	-0.13	-0.15	-0.07	-0.19
Lsat_1_v5_gn_2_40021.1 (FIB4)	0.79	0.5	0.11	-0.16	-0.13	-0.18	0.42	0.7	0.05	-0.03	-0.0	-0.0	-0.28	-0.49	-0.38	-0.23	-0.1	-2.65	0.08	0.01	0.01	0.03	-0.16	0.02	-0.01	-0.05	-0.02	0.13	-0.01	-0.05	-0.2
Lsat_1_v5_gn_2_4580.1 (AtNPC1 - 1)	0.09	0.52	-0.04	-0.32	-0.28	-0.15	0.75	0.69	0.08	0.11	0.05	0.01	-0.57	-0.36	-0.09	-0.02	0.21	-1.75	0.03	0.04	-0.04	0.02	-0.87	-0.06	-0.08	0.0	0.03	0.06	0.07	0.04	0.1
Lsat_1_v5_gn_2_79721.1	0.37	0.53	-0.06	-0.24	-0.08	0.29	0.6	0.78	0.33	0.31	0.4	0.13	-0.74	-1.57	-0.68	-0.01	-0.07	-2.88	-0.08	-0.07	0.06	0.12	-3.34	-0.09	-0.12	0.11	0.12	-0.15	0.24	0.22	0.12
Lsat_1_v5_gn_2_87860.1	0.37	0.32	0.07	-0.05	0.1	-0.25	0.28	0.24	0.12	0.03	0.11	0.06	-0.35	0.01	0.25	-0.02	-0.02	-1.36	0.3	0.1	0.04	-0.1	-0.81	-0.02	-0.13	-0.02	-0.01	-0.07	0.09	-0.03	-0.25
Lsat_1_v5_gn_2_91600.1 (PPT2)	0.74	0.61	0.33	0.08	-0.26	-0.77	0.75	0.86	0.25	0.14	0.15	0.07	-0.19	-1.08	-0.15	-0.23	-0.0	-4.21	-0.09	0.01	0.08	-0.04	-6.4	0.09	-0.08	-0.07	-0.12	-0.03	0.12	0.16	-0.1
Lsat_1_v5_gn_2_9581.1	0.64	0.95	-0.27	-1.18	0.05	0.62	0.76	1.07	-0.25	-0.42	-0.5	-0.56	-0.61	0.42	0.2	-0.3	-0.39	-0.99	0.01	-0.21	-0.12	-0.02	-2.0	-0.19	-0.52	-0.26	-0.0	0.05	0.35	0.08	-0.22
Lsat_1_v5_gn_2_99021.1 (SCPL51)	0.3	0.52	-0.33	-1.0	0.05	0.21	0.82	0.9	-0.02	0.09	-0.07	-0.16	-0.25	0.16	0.02	-0.02	-0.09	-2.78	0.27	-0.16	-0.12	-0.15	-2.0	0.05	-0.08	-0.16	-0.06	-0.57	0.12	0.4	0.25
Lsat_1_v5_gn_3_10220.1 (MOAT1)	0.22	0.49	0.06	-0.36	-0.36	-0.38	0.73	0.63	0.18	0.16	-0.1	0.11	-0.39	-0.51	0.14	-0.02	0.18	-2.39	0.25	0.3	-0.01	0.06	-4.62	0.22	0.19	0.11	0.13	-0.03	-0.12	0.08	-0.34
Lsat_1_v5_gn_3_140060.1	-0.84	-0.37	-1.4	-2.01	0.09	0.78	0.74	1.1	-0.17	-0.25	-0.17	-0.27	-0.87	0.91	0.55	0.01	-0.21	-2.94	-0.04	-0.17	0.22	0.16	-2.83	-0.13	-0.08	-0.15	-0.01	-0.42	0.46	0.48	0.63
Lsat_1_v5_gn_3_16681.1	1.35	1.33	0.85	0.02	-0.99	-0.64	1.04	1.66	-0.05	-0.45	-0.28	0.01	-0.2	-2.03	-1.24	-0.12	-0.03	-3.69	-0.87	-0.3	-0.35	-0.32	-	-0.91	-0.39	-0.07	-0.0	0.43	-0.21	-0.34	-1.01
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Lsat_1_v5_gn_3_30600.1 (NPY8)	-0.63	-0.51	-0.85	-0.42	-0.22	-0.26	0.84	1.29	0.32	0.41	0.4	0.29	-0.39	-1.93	-0.74	0.21	0.15	-4.16	-0.42	0.2	0.08	0.13	-2.21	0.24	0.18	0.29	0.24	0.04	0.31	0.47	-0.5
Lsat_1_v5_gn_3_49081.1 (PRIN2)	-0.1	-0.71	-0.5	-0.03	-0.93	-0.75	0.44	1.09	0.09	-0.22	0.06	0.34	0.69	-0.47	-0.21	-0.4	-0.04	0.06	-0.29	0.06	0.1	0.21	0.18	0.14	-0.01	0.11	0.15	0.08	-0.7	-0.69	0.23
Lsat_1_v5_gn_3_54000.1 (PGA2)	0.46	0.28	0.12	-0.02	0.2	0.09	0.14	0.64	0.02	0.01	0.1	0.11	-0.19	0.57	0.2	-0.22	-0.25	-1.96	0.01	-0.18	-0.11	-0.12	-1.19	-0.03	-0.05	-0.17	-0.16	-0.04	0.08	-0.0	-0.14
Lsat_1_v5_gn_4_14360.1 (PIN3)	-0.95	-0.86	-0.51	-0.21	0.08	0.13	0.41	0.44	0.09	0.07	0.06	0.03	-0.2	-0.47	-0.0	0.43	0.43	-2.3	-0.22	0.08	0.05	0.1	-2.53	0.07	0.23	0.38	0.41	0.07	0.31	0.4	0.26
Lsat_1_v5_gn_4_162120.1 (KAI2)	-0.09	-0.15	-0.16	-0.14	-0.06	0.18	0.49	0.43	0.17	0.19	0.06	-0.08	-0.07	0.09	0.38	0.2	0.13	-1.25	-0.01	-0.05	0.0	-0.05	-1.12	-0.08	-0.07	0.02	-0.04	-0.11	0.08	0.07	-0.05
Lsat_1_v5_gn_4_31200.1	0.81	0.42	1.16	-0.28	-1.92	-2.33	-0.65	0.89	-0.71	-0.9	-0.65	0.39	0.72	-2.83	-2.96	0.17	0.75	0.16	-1.82	-0.08	0.08	-0.22	0.29	1.05	0.48	-0.08	-0.43	0.67	-1.29	-0.63	-0.36
Lsat_1_v5_gn_4_34101.1 (SDR2)	-0.42	-0.14	-0.26	-0.29	-0.45	0.04	0.9	1.08	0.16	0.02	0.41	0.0	-0.55	0.04	-0.52	0.01	0.45	-	-0.08	-0.03	0.07	0.25	-	0.37	0.31	0.13	0.34	-0.06	-0.07	-0.16	-0.26
Lsat_1_v5_gn_4_72700.1 (DCC1)	1.15	0.53	0.11	-0.51	0.08	-0.38	0.51	0.71	-0.02	-0.08	-0.17	-0.11	-0.24	-0.12	-0.12	-0.39	-0.21	-1.69	0.13	0.2	0.05	0.17	-0.33	-0.08	0.0	-0.12	0.02	0.35	-0.28	-0.56	-1.25
Lsat_1_v5_gn_4_89381.1 (PDS)	0.23	0.02	-0.02	0.07	0.05	0.01	0.18	0.42	0.06	0.06	0.12	0.14	0.14	0.07	-0.02	-0.06	-0.06	-1.13	0.24	-0.02	-0.1	-0.07	-0.18	-0.07	-0.12	-0.17	-0.21	0.05	-0.12	-0.04	-0.02
Lsat_1_v5_gn_5_121081.1 (GSTU25)	-0.01	-0.07	-0.17	-0.61	0.05	0.2	0.61	0.66	0.09	0.14	0.03	0.05	-0.39	-0.49	0.01	0.22	0.2	-1.54	0.19	0.26	0.13	0.04	-2.44	0.13	-0.01	0.0	-0.03	0.17	0.18	0.21	-0.44
Lsat_1_v5_gn_5_126281.1 (SPS2)	0.92	0.31	-0.13	-0.62	-0.48	-0.17	0.69	1.16	-0.37	-0.45	-0.41	-0.43	-0.07	0.11	-0.11	-0.18	-0.03	-2.16	0.07	-0.07	0.05	0.17	0.66	-0.01	-0.0	0.02	0.05	0.24	-0.44	-0.61	-1.12
Lsat_1_v5_gn_5_149261.1 (MDL2)	0.15	0.1	-0.01	-0.26	0.01	0.11	0.29	0.28	-0.0	-0.03	0.01	-0.12	-0.24	0.24	0.15	-0.09	-0.03	-0.78	-0.06	-0.02	0.02	0.09	-0.72	0.07	0.05	0.07	0.06	0.05	0.06	0.02	0.02
Lsat_1_v5_gn_5_155280.1 (BAM3)	-0.17	-0.02	-0.15	0.03	-0.21	0.09	0.55	0.75	0.26	0.17	0.26	0.02	-0.33	-0.05	0.22	0.04	-0.07	-2.08	0.02	0.04	0.05	-0.09	-2.21	-0.13	0.01	0.05	0.01	-0.15	0.26	0.22	-0.02
Lsat_1_v5_gn_5_20140.1	0.53	0.23	0.2	0.04	-0.29	-0.58	0.32	0.91	0.04	-0.03	0.09	0.2	0.09	-0.21	-0.17	-0.41	-0.12	-1.37	0.14	-0.02	-0.12	-0.15	-0.16	0.13	0.21	-0.26	-0.22	0.1	-0.18	-0.13	-0.17
Lsat_1_v5_gn_5_45900.1 (GLDP1)	0.6	0.2	-0.06	-0.16	0.17	-0.15	0.39	0.14	0.12	0.08	0.17	0.12	0.1	0.2	0.35	0.08	0.05	-2.32	-0.23	-0.0	0.04	-0.03	-0.8	-0.06	-0.07	-0.05	-0.12	0.16	-0.2	-0.23	-0.24
Lsat_1_v5_gn_5_67480.1 (PEC2)	0.32	0.4	0.38	0.0	-0.4	-0.38	0.52	0.54	0.16	0.22	0.19	0.15	-0.68	0.52	0.12	-0.29	-0.09	-2.93	0.1	-0.06	-0.18	-0.12	-2.41	-0.09	-0.06	-0.16	-0.11	0.01	0.19	0.2	0.13
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Lsat_1_v5_gn_6_41981.1 (SCPL51)	-1.0	-0.61	-0.83	-1.46	-1.04	0.18	1.34	0.75	-0.11	-0.21	-0.12	-0.4	-0.16	0.11	0.72	0.35	0.16	-1.9	0.44	0.47	0.07	0.23	-9.5	-0.32	-0.25	0.29	0.14	-0.04	0.24	0.14	0.2
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.