Heatmap: Cluster_210 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_11721.1	0.77	0.78	0.68	0.51	0.75	0.98	0.99	0.88	0.75	0.73	0.8	0.63	0.67	1.0	0.95	0.71	0.72	0.37	0.75	0.68	0.71	0.77	0.35	0.62	0.65	0.85	0.83	0.7	0.9	0.83	0.73
Lsat_1_v5_gn_1_106241.1	0.95	0.8	0.65	0.59	0.77	0.76	0.84	0.92	0.8	0.77	0.81	0.76	0.77	1.0	0.95	0.74	0.76	0.39	0.75	0.74	0.69	0.76	0.41	0.74	0.75	0.73	0.74	0.76	0.79	0.81	0.75
Lsat_1_v5_gn_1_114861.1 (LNK2)	0.45	0.5	0.54	0.58	0.42	0.45	1.0	0.92	0.66	0.72	0.65	0.58	0.51	0.43	0.65	0.57	0.59	0.3	0.54	0.6	0.55	0.55	0.36	0.5	0.51	0.58	0.57	0.51	0.55	0.55	0.42
Lsat_1_v5_gn_1_15221.1 (SULT202E1)	0.19	1.0	0.18	0.1	0.51	0.52	0.48	0.77	0.1	0.1	0.11	0.11	0.1	0.49	0.4	0.15	0.12	0.18	0.31	0.12	0.15	0.18	0.04	0.16	0.13	0.15	0.15	0.11	0.51	0.2	0.27
Lsat_1_v5_gn_1_50041.1 (TET3)	0.7	0.8	0.57	0.36	0.93	0.71	0.8	1.0	0.5	0.48	0.49	0.48	0.34	0.9	0.77	0.49	0.49	0.44	0.66	0.47	0.43	0.48	0.44	0.48	0.46	0.53	0.51	0.47	0.77	0.6	0.37
Lsat_1_v5_gn_1_69561.1 (PIN3)	0.08	0.05	0.05	0.07	0.12	0.24	0.77	1.0	0.44	0.42	0.43	0.47	0.21	0.06	0.25	0.56	0.46	0.03	0.37	0.58	0.47	0.53	0.0	0.46	0.61	0.52	0.47	0.27	0.71	0.7	0.37
Lsat_1_v5_gn_1_81601.1	0.59	0.61	0.42	0.31	0.7	0.81	0.99	0.8	0.74	0.63	0.71	0.51	0.42	0.79	1.0	0.81	0.69	0.14	0.79	0.66	0.67	0.66	0.34	0.59	0.64	0.69	0.65	0.69	0.75	0.71	0.59
Lsat_1_v5_gn_2_129041.1 (TPPA)	0.86	1.0	0.4	0.14	0.33	0.28	0.65	0.92	0.34	0.36	0.38	0.43	0.75	0.3	0.36	0.59	0.77	0.92	0.43	0.58	0.58	0.55	0.4	0.51	0.51	0.57	0.5	0.57	0.44	0.41	0.29
Lsat_1_v5_gn_2_134740.1	0.59	0.68	0.53	0.41	0.44	0.56	0.83	1.0	0.53	0.48	0.57	0.51	0.44	0.71	0.64	0.5	0.48	0.25	0.47	0.44	0.42	0.46	0.27	0.45	0.46	0.48	0.49	0.4	0.56	0.57	0.57
Lsat_1_v5_gn_2_20640.1 (RPS12)	1.0	0.75	0.6	0.69	0.42	0.52	0.73	0.7	0.49	0.46	0.55	0.48	0.51	0.32	0.43	0.42	0.41	0.39	0.42	0.5	0.5	0.62	0.07	0.45	0.44	0.5	0.6	0.68	0.4	0.39	0.2
Lsat_1_v5_gn_2_2740.1	1.0	0.85	0.75	0.67	0.65	0.56	0.78	0.84	0.78	0.73	0.75	0.8	0.65	0.92	0.84	0.62	0.72	0.25	0.72	0.74	0.68	0.68	0.33	0.69	0.65	0.64	0.65	0.63	0.62	0.66	0.61
Lsat_1_v5_gn_2_40021.1 (FIB4)	1.0	0.82	0.63	0.52	0.53	0.51	0.77	0.94	0.6	0.57	0.58	0.58	0.48	0.41	0.45	0.5	0.54	0.09	0.61	0.58	0.58	0.59	0.52	0.59	0.58	0.56	0.57	0.63	0.58	0.56	0.5
Lsat_1_v5_gn_2_4580.1 (AtNPC1 - 1)	0.63	0.85	0.58	0.48	0.49	0.53	1.0	0.96	0.63	0.64	0.61	0.6	0.4	0.46	0.56	0.59	0.69	0.18	0.61	0.61	0.58	0.6	0.32	0.57	0.56	0.59	0.61	0.62	0.62	0.61	0.64
Lsat_1_v5_gn_2_79721.1	0.75	0.84	0.56	0.49	0.55	0.71	0.88	1.0	0.73	0.72	0.77	0.64	0.35	0.2	0.36	0.58	0.55	0.08	0.55	0.56	0.61	0.63	0.06	0.55	0.54	0.63	0.63	0.53	0.69	0.68	0.63
Lsat_1_v5_gn_2_87860.1	1.0	0.96	0.81	0.74	0.83	0.65	0.93	0.91	0.84	0.79	0.84	0.81	0.61	0.77	0.92	0.76	0.76	0.3	0.95	0.83	0.79	0.72	0.44	0.76	0.71	0.76	0.77	0.73	0.82	0.76	0.65
Lsat_1_v5_gn_2_91600.1 (PPT2)	0.92	0.84	0.69	0.58	0.46	0.32	0.92	1.0	0.65	0.61	0.61	0.58	0.48	0.26	0.5	0.47	0.55	0.03	0.52	0.55	0.58	0.53	0.01	0.59	0.52	0.52	0.51	0.54	0.6	0.62	0.51
Lsat_1_v5_gn_2_9581.1	0.74	0.92	0.4	0.21	0.49	0.73	0.8	1.0	0.4	0.36	0.34	0.32	0.31	0.64	0.55	0.39	0.36	0.24	0.48	0.41	0.44	0.47	0.12	0.42	0.33	0.4	0.47	0.49	0.6	0.5	0.41
Lsat_1_v5_gn_2_99021.1 (SCPL51)	0.66	0.77	0.43	0.27	0.55	0.62	0.95	1.0	0.53	0.57	0.51	0.48	0.45	0.6	0.54	0.53	0.5	0.08	0.65	0.48	0.49	0.48	0.13	0.56	0.51	0.48	0.51	0.36	0.58	0.71	0.64
Lsat_1_v5_gn_3_10220.1 (MOAT1)	0.71	0.85	0.63	0.47	0.47	0.47	1.0	0.94	0.69	0.67	0.56	0.65	0.46	0.42	0.67	0.59	0.69	0.12	0.72	0.75	0.6	0.63	0.02	0.7	0.69	0.65	0.66	0.59	0.55	0.64	0.48
Lsat_1_v5_gn_3_140060.1	0.26	0.36	0.18	0.12	0.5	0.8	0.78	1.0	0.41	0.39	0.41	0.39	0.26	0.87	0.68	0.47	0.4	0.06	0.45	0.41	0.54	0.52	0.07	0.43	0.44	0.42	0.46	0.35	0.64	0.65	0.72
Lsat_1_v5_gn_3_16681.1	0.81	0.8	0.57	0.32	0.16	0.2	0.65	1.0	0.31	0.23	0.26	0.32	0.28	0.08	0.13	0.29	0.31	0.02	0.17	0.26	0.25	0.25	0.0	0.17	0.24	0.3	0.32	0.43	0.27	0.25	0.16
Lsat_1_v5_gn_3_28040.1	0.71	0.73	0.59	0.58	0.77	0.93	0.86	0.85	0.78	0.76	0.85	0.71	0.45	1.0	0.99	0.69	0.66	0.21	0.72	0.71	0.67	0.78	0.38	0.57	0.72	0.78	0.76	0.79	0.7	0.67	0.55
Lsat_1_v5_gn_3_30600.1 (NPY8)	0.26	0.29	0.23	0.31	0.35	0.34	0.73	1.0	0.51	0.54	0.54	0.5	0.31	0.11	0.24	0.47	0.45	0.02	0.31	0.47	0.43	0.45	0.09	0.48	0.46	0.5	0.48	0.42	0.51	0.57	0.29
Lsat_1_v5_gn_3_49081.1 (PRIN2)	0.44	0.29	0.33	0.46	0.25	0.28	0.64	1.0	0.5	0.4	0.49	0.59	0.76	0.34	0.41	0.36	0.46	0.49	0.39	0.49	0.5	0.54	0.53	0.52	0.47	0.51	0.52	0.5	0.29	0.29	0.55
Lsat_1_v5_gn_3_54000.1 (PGA2)	0.88	0.78	0.7	0.64	0.74	0.69	0.71	1.0	0.65	0.65	0.69	0.7	0.56	0.96	0.74	0.55	0.54	0.17	0.65	0.57	0.6	0.59	0.28	0.63	0.62	0.57	0.58	0.63	0.68	0.64	0.58
Lsat_1_v5_gn_4_14360.1 (PIN3)	0.38	0.4	0.52	0.64	0.78	0.81	0.98	1.0	0.78	0.77	0.76	0.75	0.64	0.53	0.73	0.99	0.99	0.15	0.63	0.78	0.76	0.79	0.13	0.77	0.86	0.96	0.97	0.77	0.91	0.97	0.88
Lsat_1_v5_gn_4_162120.1 (KAI2)	0.67	0.64	0.64	0.64	0.68	0.81	1.0	0.96	0.8	0.81	0.74	0.67	0.68	0.76	0.92	0.81	0.78	0.3	0.71	0.68	0.71	0.69	0.33	0.67	0.68	0.72	0.69	0.66	0.75	0.75	0.69
Lsat_1_v5_gn_4_31200.1	0.79	0.6	1.0	0.37	0.12	0.09	0.29	0.83	0.27	0.24	0.28	0.59	0.74	0.06	0.06	0.5	0.75	0.5	0.13	0.42	0.47	0.38	0.55	0.92	0.62	0.42	0.33	0.71	0.18	0.29	0.35
Lsat_1_v5_gn_4_34101.1 (SDR2)	0.35	0.43	0.39	0.39	0.35	0.49	0.88	1.0	0.53	0.48	0.63	0.47	0.32	0.48	0.33	0.48	0.65	0.0	0.45	0.46	0.5	0.56	0.0	0.61	0.58	0.52	0.6	0.45	0.45	0.42	0.39
Lsat_1_v5_gn_4_72700.1 (DCC1)	1.0	0.65	0.49	0.32	0.48	0.35	0.64	0.73	0.44	0.43	0.4	0.42	0.38	0.41	0.41	0.34	0.39	0.14	0.49	0.52	0.47	0.51	0.36	0.43	0.45	0.41	0.46	0.57	0.37	0.31	0.19
Lsat_1_v5_gn_4_89381.1 (PDS)	0.87	0.76	0.74	0.78	0.77	0.75	0.85	1.0	0.78	0.78	0.81	0.82	0.82	0.78	0.73	0.71	0.71	0.34	0.88	0.73	0.69	0.71	0.66	0.71	0.69	0.66	0.65	0.77	0.69	0.73	0.73
Lsat_1_v5_gn_5_121081.1 (GSTU25)	0.63	0.6	0.56	0.41	0.65	0.72	0.96	1.0	0.67	0.7	0.64	0.65	0.48	0.45	0.64	0.73	0.73	0.22	0.72	0.76	0.69	0.65	0.12	0.69	0.62	0.63	0.62	0.71	0.72	0.73	0.46
Lsat_1_v5_gn_5_126281.1 (SPS2)	0.85	0.55	0.41	0.29	0.32	0.4	0.72	1.0	0.35	0.33	0.34	0.33	0.43	0.48	0.41	0.4	0.44	0.1	0.47	0.43	0.46	0.5	0.71	0.44	0.45	0.45	0.46	0.53	0.33	0.29	0.21
Lsat_1_v5_gn_5_149261.1 (MDL2)	0.91	0.88	0.81	0.68	0.82	0.88	1.0	1.0	0.82	0.8	0.82	0.76	0.69	0.97	0.91	0.77	0.8	0.48	0.78	0.81	0.83	0.87	0.5	0.86	0.85	0.86	0.86	0.85	0.85	0.83	0.83
Lsat_1_v5_gn_5_155280.1 (BAM3)	0.53	0.59	0.54	0.61	0.52	0.64	0.87	1.0	0.71	0.67	0.71	0.6	0.47	0.57	0.69	0.61	0.57	0.14	0.6	0.61	0.62	0.56	0.13	0.54	0.6	0.61	0.6	0.54	0.71	0.7	0.59
Lsat_1_v5_gn_5_20140.1	0.77	0.62	0.61	0.55	0.44	0.36	0.67	1.0	0.55	0.52	0.57	0.61	0.56	0.46	0.47	0.4	0.49	0.21	0.59	0.52	0.49	0.48	0.48	0.58	0.61	0.44	0.46	0.57	0.47	0.49	0.47
Lsat_1_v5_gn_5_45900.1 (GLDP1)	1.0	0.76	0.63	0.59	0.74	0.59	0.87	0.73	0.72	0.7	0.74	0.72	0.71	0.76	0.84	0.7	0.68	0.13	0.56	0.66	0.68	0.65	0.38	0.63	0.63	0.64	0.61	0.74	0.57	0.56	0.56
Lsat_1_v5_gn_5_67480.1 (PEC2)	0.86	0.91	0.89	0.69	0.52	0.53	0.98	1.0	0.77	0.8	0.78	0.76	0.43	0.98	0.75	0.56	0.64	0.09	0.74	0.66	0.61	0.63	0.13	0.64	0.66	0.61	0.64	0.69	0.78	0.79	0.75
Lsat_1_v5_gn_5_8060.1 (mTERF9)	0.54	0.59	0.37	0.27	0.15	0.3	0.66	1.0	0.28	0.3	0.32	0.42	0.6	0.29	0.25	0.37	0.42	0.09	0.19	0.35	0.37	0.39	0.3	0.38	0.39	0.4	0.36	0.46	0.26	0.27	0.27
Lsat_1_v5_gn_6_41981.1 (SCPL51)	0.2	0.26	0.22	0.14	0.19	0.45	1.0	0.66	0.37	0.34	0.37	0.3	0.35	0.43	0.65	0.5	0.44	0.11	0.54	0.55	0.41	0.46	0.0	0.32	0.33	0.48	0.44	0.38	0.47	0.44	0.45
Lsat_1_v5_gn_6_57280.1 (FRS6)	0.31	0.54	0.28	0.25	0.26	0.61	1.0	0.91	0.62	0.49	0.59	0.44	0.4	0.4	0.78	0.81	0.76	0.1	0.68	0.67	0.63	0.54	0.04	0.55	0.61	0.88	0.74	0.48	0.76	0.85	0.79
Lsat_1_v5_gn_6_58420.1 (CIL2)	0.59	0.54	0.57	0.62	0.6	0.85	0.86	1.0	0.75	0.72	0.8	0.79	0.77	0.38	0.47	0.88	0.79	0.22	0.57	0.68	0.69	0.79	0.47	0.78	0.81	0.88	0.84	0.77	0.89	0.97	0.85
Lsat_1_v5_gn_6_7721.1 (PFK7)	0.95	0.93	0.6	0.26	0.27	0.23	0.94	1.0	0.54	0.48	0.5	0.43	0.23	0.02	0.15	0.4	0.43	0.0	0.33	0.51	0.43	0.48	0.02	0.41	0.46	0.4	0.37	0.45	0.25	0.33	0.35
Lsat_1_v5_gn_6_78800.1 (PGRL1B)	0.9	0.94	0.95	0.92	0.75	0.66	1.0	0.96	0.84	0.85	0.86	0.79	0.49	0.54	0.57	0.55	0.61	0.15	0.68	0.67	0.65	0.66	0.57	0.7	0.67	0.67	0.65	0.61	0.83	0.87	0.77
Lsat_1_v5_gn_6_86700.1 (iqd17)	0.22	0.37	0.38	0.55	0.37	0.67	0.88	1.0	0.5	0.49	0.63	0.52	0.51	0.35	0.5	0.74	0.62	0.11	0.56	0.63	0.53	0.59	0.06	0.5	0.61	0.68	0.63	0.49	0.6	0.64	0.48
Lsat_1_v5_gn_7_109340.1 (TSB2)	0.94	0.97	0.97	0.86	0.72	0.8	0.98	1.0	0.79	0.79	0.81	0.84	0.86	0.86	0.8	0.79	0.8	0.31	0.83	0.77	0.72	0.77	0.46	0.78	0.76	0.76	0.71	0.78	0.75	0.8	0.85
Lsat_1_v5_gn_7_59561.1	0.35	0.45	0.39	0.37	0.46	0.58	1.0	0.86	0.62	0.73	0.56	0.56	0.55	0.34	0.62	0.61	0.72	0.05	0.65	0.71	0.7	0.71	0.11	0.52	0.68	0.67	0.71	0.69	0.77	0.62	0.53
Lsat_1_v5_gn_7_59581.1	0.37	0.54	0.46	0.36	0.43	0.67	1.0	0.9	0.67	0.66	0.69	0.6	0.65	0.46	0.72	0.91	0.92	0.03	0.59	0.72	0.7	0.8	0.16	0.55	0.79	0.79	0.78	0.68	0.8	0.78	0.63
Lsat_1_v5_gn_7_75180.1	1.0	0.8	0.59	0.48	0.73	0.7	0.75	0.74	0.59	0.57	0.68	0.6	0.58	0.78	0.7	0.56	0.6	0.13	0.65	0.62	0.64	0.64	0.19	0.72	0.64	0.68	0.64	0.68	0.69	0.66	0.76
Lsat_1_v5_gn_7_76780.1	0.82	0.59	0.51	0.47	0.48	0.37	0.7	1.0	0.57	0.56	0.6	0.64	0.73	0.57	0.56	0.46	0.53	0.35	0.54	0.61	0.55	0.56	0.32	0.64	0.6	0.52	0.54	0.65	0.5	0.51	0.46
Lsat_1_v5_gn_7_8081.1 (VPT1)	0.65	0.69	0.42	0.27	0.5	0.66	1.0	0.84	0.59	0.57	0.62	0.45	0.47	0.66	0.77	0.69	0.59	0.05	0.46	0.52	0.62	0.64	0.01	0.49	0.56	0.71	0.68	0.62	0.69	0.67	0.49
Lsat_1_v5_gn_7_83220.1 (KEA3)	0.92	0.68	0.57	0.47	0.29	0.36	0.81	1.0	0.55	0.57	0.57	0.62	0.51	0.23	0.28	0.41	0.48	0.09	0.44	0.52	0.52	0.52	0.28	0.54	0.52	0.54	0.51	0.57	0.38	0.41	0.31
Lsat_1_v5_gn_8_112280.1 (cPT1)	0.5	0.51	0.23	0.08	0.39	0.8	0.8	1.0	0.38	0.3	0.35	0.25	0.31	0.65	0.57	0.51	0.44	0.03	0.49	0.36	0.47	0.52	0.07	0.49	0.47	0.45	0.47	0.31	0.56	0.57	0.78
Lsat_1_v5_gn_8_11680.1 (FAD7)	0.86	0.86	0.62	0.51	0.43	0.44	0.81	1.0	0.54	0.51	0.54	0.57	0.55	0.31	0.38	0.54	0.61	0.58	0.48	0.58	0.57	0.57	0.22	0.57	0.57	0.56	0.54	0.6	0.43	0.45	0.35
Lsat_1_v5_gn_8_129860.1 (BMY5)	0.41	0.61	0.32	0.18	0.56	0.83	0.87	1.0	0.45	0.46	0.46	0.4	0.37	0.9	0.81	0.63	0.53	0.05	0.62	0.4	0.47	0.52	0.13	0.5	0.52	0.5	0.49	0.4	0.66	0.62	0.51
Lsat_1_v5_gn_8_142340.1 (VAR2)	0.95	0.68	0.57	0.51	0.55	0.51	0.76	1.0	0.51	0.49	0.53	0.55	0.64	0.69	0.53	0.5	0.55	0.21	0.59	0.54	0.56	0.56	0.79	0.64	0.59	0.52	0.53	0.65	0.51	0.47	0.37
Lsat_1_v5_gn_8_19240.1 (PIP2)	0.51	0.6	0.58	0.63	0.54	0.71	1.0	0.99	0.74	0.72	0.73	0.65	0.61	0.66	0.9	0.92	0.83	0.36	0.71	0.75	0.78	0.8	0.3	0.61	0.73	0.83	0.82	0.68	0.77	0.75	0.62
Lsat_1_v5_gn_8_22880.1 (GINT1)	1.0	0.98	0.36	0.35	0.26	0.25	0.61	0.74	0.39	0.42	0.45	0.59	1.0	0.11	0.17	0.46	0.61	0.39	0.5	0.5	0.4	0.44	0.35	0.71	0.62	0.51	0.41	0.63	0.26	0.46	0.48
Lsat_1_v5_gn_8_26460.1 (CAT2)	1.0	0.88	0.73	0.54	0.49	0.54	0.82	0.82	0.64	0.58	0.6	0.56	0.47	0.5	0.53	0.63	0.68	0.08	0.71	0.69	0.7	0.72	0.52	0.64	0.65	0.69	0.62	0.66	0.79	0.83	0.59
Lsat_1_v5_gn_8_43001.1 (RSW10)	0.51	0.67	0.35	0.24	0.53	0.81	0.81	1.0	0.57	0.46	0.46	0.53	0.5	0.87	0.69	0.65	0.62	0.42	0.72	0.58	0.68	0.71	0.21	0.58	0.6	0.74	0.77	0.52	0.81	0.73	0.68
Lsat_1_v5_gn_8_6240.1 (MAKR6)	0.06	0.1	0.05	0.14	0.25	0.43	0.79	1.0	0.67	0.58	0.52	0.41	0.27	0.12	0.4	0.47	0.45	0.01	0.49	0.54	0.57	0.54	0.01	0.53	0.57	0.55	0.62	0.48	0.7	0.73	0.33
Lsat_1_v5_gn_9_109300.1 (HDR)	0.81	0.83	0.63	0.47	0.74	0.67	1.0	0.98	0.65	0.62	0.66	0.52	0.45	0.64	0.79	0.69	0.63	0.1	0.81	0.62	0.68	0.68	0.28	0.62	0.63	0.64	0.63	0.55	0.83	0.81	0.75
Lsat_1_v5_gn_9_63660.1 (SAG13)	0.45	0.35	0.34	0.45	0.21	0.16	0.57	1.0	0.29	0.34	0.3	0.4	0.53	0.19	0.24	0.25	0.26	0.28	0.21	0.37	0.31	0.31	0.49	0.38	0.3	0.28	0.28	0.36	0.22	0.26	0.13

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)