1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_197 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.03 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0 0.14 0.18 0.18 0.04 0.0 0.0 1.0 0.08 0.06 0.16 0.03 0.0 0.4 0.21 0.06 0.18 0.0 0.07 0.48 0.03
0.0 0.0 0.0 0.03 0.11 0.04 0.03 0.02 0.06 0.13 0.07 0.16 0.36 0.01 0.0 0.09 0.17 1.0 0.01 0.06 0.06 0.05 0.33 0.07 0.09 0.03 0.02 0.02 0.56 0.82 0.69
0.13 0.12 0.23 0.17 0.08 0.16 0.16 0.2 0.12 0.12 0.06 0.07 0.29 0.07 0.07 0.17 0.12 0.62 0.07 0.06 0.08 0.17 0.43 0.18 0.17 0.08 0.12 0.09 0.16 0.77 1.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.04 0.05 0.03 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.21 0.29 0.02 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.12 0.15 1.0
0.06 0.12 0.08 0.2 0.22 0.35 0.33 0.42 0.39 0.26 0.44 0.21 0.23 0.6 0.68 0.51 0.26 0.21 0.25 0.32 0.26 0.18 0.69 0.36 0.29 0.37 0.21 0.11 0.74 1.0 0.97
0.0 0.24 0.15 0.26 0.07 0.04 0.07 0.06 0.07 0.05 0.06 0.1 0.2 0.06 0.13 0.04 0.23 1.0 0.1 0.06 0.12 0.0 0.0 0.09 0.16 0.16 0.09 0.05 0.41 0.44 0.88
0.04 0.05 0.05 0.01 0.25 0.22 0.07 0.12 0.15 0.13 0.11 0.11 0.66 0.17 0.16 0.18 0.12 0.29 0.14 0.12 0.06 0.16 0.79 0.18 0.18 0.17 0.08 0.11 0.18 0.51 1.0
0.22 0.35 0.23 0.2 0.3 0.28 0.48 0.54 0.38 0.32 0.41 0.37 0.34 0.66 0.68 0.47 0.42 0.48 0.35 0.31 0.35 0.29 1.0 0.45 0.46 0.44 0.45 0.28 0.55 0.97 0.7
0.27 0.27 0.27 0.56 0.28 0.22 0.13 0.39 0.26 0.34 0.3 0.35 0.46 0.16 0.2 0.2 0.2 1.0 0.16 0.19 0.19 0.21 0.44 0.21 0.28 0.31 0.3 0.22 0.25 0.51 0.81
0.24 0.32 0.08 0.04 0.21 0.29 0.19 0.29 0.02 0.04 0.08 0.02 0.14 1.0 0.64 0.07 0.04 0.27 0.14 0.01 0.06 0.03 0.07 0.07 0.08 0.16 0.1 0.15 0.43 0.68 0.42
0.05 0.07 0.01 0.0 0.24 0.29 0.03 0.11 0.0 0.0 0.0 0.01 0.26 0.38 0.15 0.06 0.01 0.35 0.0 0.05 0.03 0.01 1.0 0.04 0.09 0.08 0.03 0.05 0.13 0.53 0.08
0.07 0.1 0.09 0.07 0.09 0.09 0.1 0.07 0.04 0.06 0.04 0.18 0.73 0.05 0.07 0.04 0.07 0.5 0.01 0.03 0.1 0.14 0.65 0.13 0.1 0.06 0.08 0.06 0.17 0.55 1.0
0.1 0.06 0.18 0.01 0.07 0.08 0.12 0.08 0.14 0.09 0.19 0.12 0.26 0.21 0.13 0.08 0.22 0.27 0.03 0.11 0.17 0.08 0.2 0.18 0.11 0.16 0.16 0.11 0.16 0.28 1.0
0.1 0.06 0.18 0.01 0.07 0.08 0.12 0.08 0.14 0.09 0.19 0.12 0.26 0.21 0.13 0.08 0.22 0.27 0.03 0.11 0.17 0.08 0.2 0.18 0.11 0.16 0.16 0.11 0.16 0.28 1.0
0.1 0.21 0.12 0.15 0.43 0.38 0.32 0.52 0.17 0.22 0.21 0.21 0.51 0.6 0.5 0.26 0.35 0.35 0.25 0.23 0.22 0.37 0.74 0.28 0.28 0.27 0.26 0.27 0.47 0.47 1.0
0.42 0.27 0.23 0.15 0.41 0.43 0.31 0.41 0.23 0.18 0.24 0.31 0.64 0.85 0.49 0.23 0.22 0.66 0.31 0.25 0.3 0.23 1.0 0.34 0.39 0.24 0.23 0.21 0.51 0.69 0.92
0.08 0.1 0.05 0.07 0.09 0.1 0.07 0.06 0.09 0.15 0.24 0.09 0.88 0.15 0.14 0.12 0.16 0.53 0.1 0.21 0.08 0.07 0.35 0.19 0.14 0.15 0.08 0.15 0.15 0.51 1.0
0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.26 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.52
0.45 0.21 0.13 0.06 0.22 0.15 0.16 0.15 0.12 0.1 0.12 0.1 0.1 0.2 0.21 0.13 0.08 1.0 0.1 0.08 0.09 0.1 0.28 0.15 0.16 0.08 0.12 0.12 0.48 0.5 0.2
0.02 0.07 0.16 0.07 0.04 0.08 0.06 0.02 0.06 0.08 0.04 0.08 0.59 0.15 0.11 0.1 0.11 0.68 0.05 0.1 0.09 0.05 1.0 0.13 0.1 0.08 0.05 0.09 0.14 0.5 0.84
0.4 0.36 0.34 0.33 0.5 0.52 0.51 0.62 0.42 0.45 0.43 0.46 0.58 0.79 0.66 0.54 0.51 0.66 0.48 0.4 0.4 0.43 0.95 0.46 0.47 0.47 0.44 0.44 0.61 0.65 1.0
0.21 0.21 0.15 0.14 0.28 0.3 0.2 0.13 0.2 0.2 0.22 0.17 0.47 0.51 0.37 0.17 0.17 0.42 0.22 0.17 0.14 0.21 1.0 0.26 0.22 0.26 0.21 0.17 0.35 0.65 0.82
0.25 0.47 0.38 0.34 0.21 0.15 0.2 0.19 0.19 0.22 0.22 0.23 0.36 0.23 0.24 0.27 0.36 1.0 0.19 0.19 0.17 0.16 0.29 0.26 0.25 0.18 0.24 0.16 0.41 0.59 0.9
0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.17 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 1.0
0.31 0.3 0.3 0.34 0.5 0.54 0.45 0.53 0.35 0.35 0.42 0.39 0.53 0.64 0.52 0.48 0.46 0.64 0.42 0.42 0.41 0.44 1.0 0.42 0.43 0.42 0.39 0.33 0.61 0.59 0.93
0.16 0.08 0.08 0.0 0.11 0.0 0.24 0.0 0.0 0.17 0.14 0.0 0.46 0.0 0.07 0.07 0.13 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.12 1.0
0.07 0.28 0.19 0.15 0.31 0.39 0.25 0.31 0.32 0.37 0.4 0.43 0.53 0.29 0.37 0.31 0.33 1.0 0.19 0.42 0.35 0.34 0.48 0.21 0.28 0.52 0.48 0.23 0.74 0.83 0.92
0.06 0.11 0.0 0.05 0.19 0.14 0.05 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.63 1.0 0.7 0.0 0.16 0.2 0.17 0.16 0.1 0.18 0.89 0.0 0.1 0.0 0.06 0.16 0.21 0.82 0.47
0.37 0.38 0.34 0.32 0.6 0.72 0.63 0.69 0.46 0.52 0.4 0.49 0.84 0.76 0.7 0.57 0.56 0.89 0.45 0.52 0.52 0.51 1.0 0.57 0.53 0.55 0.56 0.52 0.71 0.6 0.98
0.24 0.19 0.18 0.19 0.33 0.34 0.26 0.25 0.3 0.3 0.31 0.3 0.42 0.6 0.45 0.28 0.29 0.24 0.3 0.29 0.28 0.34 0.97 0.32 0.33 0.35 0.32 0.32 0.33 1.0 0.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0
0.27 0.66 0.39 0.26 0.26 0.07 0.09 0.08 0.07 0.08 0.11 0.11 0.33 0.1 0.08 0.12 0.19 0.97 0.08 0.08 0.08 0.05 0.21 0.12 0.09 0.11 0.07 0.05 0.18 0.75 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 1.0
0.0 0.02 0.0 0.01 0.24 0.32 0.03 0.02 0.04 0.03 0.02 0.01 0.02 0.06 0.2 0.03 0.03 0.55 0.1 0.02 0.02 0.02 0.13 0.01 0.05 0.03 0.05 0.08 0.64 1.0 0.01
0.28 0.27 0.21 0.28 0.39 0.47 0.37 0.68 0.29 0.31 0.3 0.43 0.58 0.71 0.61 0.46 0.48 0.72 0.28 0.3 0.34 0.36 1.0 0.4 0.38 0.3 0.35 0.32 0.6 0.6 0.96
0.29 0.32 0.5 0.37 0.21 0.08 0.11 0.1 0.09 0.11 0.11 0.11 0.34 0.14 0.17 0.17 0.21 1.0 0.13 0.13 0.1 0.12 0.02 0.11 0.17 0.16 0.16 0.09 0.19 0.26 0.7
0.1 0.09 0.03 0.06 0.24 0.19 0.08 0.06 0.15 0.08 0.11 0.1 0.67 0.32 0.18 0.09 0.11 0.91 0.09 0.09 0.11 0.1 1.0 0.12 0.13 0.1 0.12 0.12 0.18 0.43 0.54
0.23 0.23 0.3 0.28 0.39 0.43 0.44 0.67 0.26 0.3 0.28 0.31 0.77 0.8 0.61 0.48 0.49 0.86 0.35 0.37 0.42 0.43 0.94 0.46 0.46 0.44 0.35 0.42 0.64 0.58 1.0
0.14 0.15 0.17 0.22 0.27 0.28 0.51 0.64 0.29 0.29 0.32 0.37 0.71 0.42 0.46 0.38 0.35 0.55 0.36 0.38 0.31 0.32 1.0 0.37 0.37 0.36 0.31 0.32 0.4 0.65 0.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.41
0.03 0.09 0.05 0.05 0.14 0.17 0.16 0.23 0.1 0.05 0.12 0.15 0.33 0.46 0.29 0.13 0.13 0.31 0.13 0.14 0.12 0.12 0.61 0.19 0.21 0.17 0.09 0.09 0.29 0.26 1.0
0.09 0.07 0.08 0.08 0.17 0.16 0.1 0.09 0.06 0.1 0.07 0.1 0.55 0.15 0.12 0.1 0.11 0.45 0.07 0.08 0.08 0.08 1.0 0.07 0.18 0.07 0.05 0.1 0.13 0.74 0.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.18 0.24 0.18 0.22 0.39 0.41 0.26 0.26 0.23 0.23 0.23 0.25 0.43 0.57 0.52 0.29 0.27 0.53 0.26 0.24 0.22 0.22 1.0 0.25 0.2 0.24 0.26 0.21 0.4 0.66 0.83
0.24 0.28 0.16 0.21 0.37 0.45 0.2 0.32 0.21 0.21 0.2 0.21 1.0 0.39 0.31 0.25 0.25 1.0 0.34 0.19 0.27 0.3 0.81 0.34 0.39 0.23 0.23 0.27 0.3 0.71 0.85
0.18 0.22 0.19 0.17 0.34 0.35 0.26 0.41 0.17 0.21 0.2 0.27 0.45 0.51 0.41 0.27 0.27 0.52 0.23 0.2 0.22 0.27 0.79 0.26 0.27 0.25 0.22 0.22 0.51 0.49 1.0
0.19 0.15 0.15 0.12 0.28 0.29 0.21 0.23 0.23 0.25 0.16 0.23 0.54 0.84 0.59 0.28 0.35 0.55 0.36 0.3 0.32 0.41 1.0 0.37 0.34 0.34 0.32 0.24 0.6 0.62 0.75
0.04 0.04 0.01 0.02 0.13 0.12 0.05 0.04 0.05 0.02 0.03 0.03 0.1 0.2 0.1 0.04 0.03 0.31 0.06 0.07 0.06 0.02 1.0 0.03 0.15 0.05 0.05 0.04 0.05 0.92 0.33
0.0 0.03 0.0 0.01 0.04 0.07 0.02 0.0 0.05 0.06 0.05 0.05 0.05 0.06 0.03 0.04 0.02 1.0 0.01 0.04 0.03 0.03 0.71 0.03 0.01 0.04 0.01 0.01 0.07 0.6 0.17
0.16 0.1 0.08 0.09 0.28 0.4 0.23 0.19 0.14 0.13 0.15 0.1 0.37 0.69 0.58 0.28 0.2 0.31 0.25 0.22 0.19 0.16 0.5 0.17 0.19 0.23 0.16 0.14 0.27 1.0 0.43

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)