1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_197 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.03 0.01 0.0 0.0 0.14 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.06 0.03 0.01 0.03 0.0 0.01 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.17 0.65 0.25 0.18 0.09 0.33 0.75 0.38 0.92 2.03 0.08 0.0 0.52 0.95 5.7 0.06 0.35 0.32 0.27 1.9 0.4 0.52 0.17 0.1 0.12 3.22 4.66 3.91
0.09 0.09 0.16 0.12 0.06 0.11 0.12 0.14 0.08 0.08 0.04 0.05 0.21 0.05 0.05 0.12 0.09 0.44 0.05 0.05 0.06 0.12 0.31 0.13 0.12 0.05 0.09 0.06 0.11 0.55 0.71
0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.03 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.13 0.19 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.08 0.1 0.65
0.12 0.25 0.16 0.43 0.48 0.75 0.7 0.9 0.83 0.55 0.94 0.44 0.49 1.28 1.46 1.09 0.55 0.45 0.53 0.69 0.56 0.37 1.48 0.76 0.63 0.79 0.45 0.23 1.57 2.13 2.07
0.0 1.34 0.86 1.44 0.37 0.25 0.4 0.35 0.37 0.27 0.32 0.55 1.13 0.32 0.73 0.24 1.3 5.61 0.58 0.36 0.65 0.0 0.0 0.52 0.89 0.92 0.51 0.27 2.28 2.5 4.91
0.09 0.11 0.11 0.02 0.58 0.51 0.17 0.29 0.35 0.31 0.25 0.25 1.55 0.39 0.37 0.41 0.27 0.69 0.34 0.28 0.13 0.37 1.85 0.41 0.43 0.39 0.19 0.25 0.43 1.18 2.33
81.66 129.42 85.79 74.33 109.98 103.39 176.23 195.75 140.41 116.28 151.43 135.36 124.21 240.38 250.14 171.91 153.86 176.5 129.15 114.92 129.26 105.37 365.4 165.17 166.81 162.47 165.04 102.63 201.86 355.46 256.84
76.77 77.01 77.4 160.4 80.76 63.86 38.47 113.61 76.16 98.6 85.84 101.24 133.37 45.13 56.89 57.69 57.65 287.68 45.01 55.52 53.88 61.18 127.72 60.66 80.02 88.81 84.99 63.64 71.62 146.17 233.24
1.39 1.89 0.48 0.24 1.21 1.73 1.13 1.68 0.14 0.21 0.45 0.13 0.85 5.86 3.77 0.44 0.26 1.59 0.81 0.04 0.36 0.2 0.39 0.39 0.46 0.95 0.58 0.87 2.52 3.99 2.45
0.03 0.04 0.0 0.0 0.15 0.18 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.24 0.09 0.04 0.0 0.22 0.0 0.03 0.02 0.01 0.62 0.03 0.05 0.05 0.02 0.03 0.08 0.33 0.05
0.26 0.39 0.36 0.28 0.36 0.34 0.38 0.27 0.14 0.22 0.18 0.71 2.91 0.19 0.28 0.14 0.26 1.97 0.03 0.13 0.4 0.57 2.59 0.51 0.4 0.25 0.32 0.25 0.66 2.17 3.97
0.4 0.26 0.73 0.04 0.29 0.33 0.5 0.32 0.57 0.37 0.78 0.5 1.06 0.86 0.52 0.33 0.89 1.08 0.14 0.46 0.7 0.33 0.82 0.72 0.43 0.67 0.63 0.43 0.67 1.14 4.07
0.4 0.26 0.73 0.04 0.29 0.33 0.5 0.32 0.57 0.37 0.78 0.5 1.06 0.86 0.52 0.33 0.89 1.08 0.14 0.46 0.7 0.33 0.82 0.72 0.43 0.67 0.63 0.43 0.67 1.14 4.07
0.26 0.55 0.29 0.38 1.11 0.96 0.81 1.34 0.44 0.57 0.54 0.53 1.3 1.53 1.28 0.67 0.88 0.9 0.64 0.58 0.56 0.95 1.89 0.72 0.73 0.68 0.66 0.68 1.2 1.2 2.55
1.25 0.82 0.69 0.45 1.23 1.28 0.93 1.23 0.69 0.52 0.7 0.91 1.92 2.53 1.47 0.69 0.65 1.97 0.93 0.75 0.9 0.7 2.99 1.02 1.16 0.72 0.68 0.62 1.52 2.06 2.75
0.1 0.14 0.06 0.1 0.13 0.13 0.1 0.08 0.12 0.19 0.31 0.11 1.17 0.2 0.19 0.16 0.22 0.71 0.13 0.28 0.11 0.1 0.47 0.25 0.19 0.21 0.11 0.2 0.19 0.68 1.33
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08
17.13 7.97 5.09 2.41 8.49 5.83 6.07 5.67 4.66 3.76 4.47 3.8 3.85 7.86 8.16 5.08 3.16 38.45 3.81 3.21 3.47 3.83 10.77 5.58 6.29 2.94 4.61 4.44 18.6 19.14 7.85
0.03 0.11 0.24 0.11 0.06 0.12 0.09 0.03 0.09 0.12 0.05 0.12 0.9 0.23 0.16 0.16 0.17 1.05 0.08 0.16 0.13 0.08 1.53 0.2 0.16 0.13 0.08 0.14 0.21 0.77 1.28
8.75 7.78 7.37 7.23 10.82 11.32 11.22 13.57 9.22 9.74 9.34 10.07 12.71 17.27 14.43 11.84 11.12 14.44 10.46 8.83 8.79 9.46 20.68 10.05 10.33 10.25 9.67 9.69 13.38 14.11 21.83
1.49 1.46 1.08 1.02 1.96 2.12 1.39 0.96 1.42 1.41 1.56 1.21 3.34 3.64 2.63 1.18 1.18 2.99 1.55 1.22 1.03 1.46 7.1 1.81 1.57 1.83 1.51 1.2 2.46 4.59 5.82
6.7 12.85 10.36 9.16 5.86 4.08 5.43 5.06 5.31 6.05 5.95 6.33 9.77 6.41 6.67 7.3 9.85 27.33 5.31 5.25 4.56 4.5 7.83 7.19 6.86 5.01 6.64 4.29 11.26 16.18 24.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.08
9.87 9.37 9.65 10.89 15.87 17.14 14.17 16.82 11.01 11.23 13.43 12.42 16.87 20.41 16.54 15.14 14.48 20.21 13.35 13.28 13.03 14.03 31.68 13.42 13.47 13.44 12.5 10.39 19.21 18.85 29.38
0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.07
0.06 0.24 0.16 0.13 0.27 0.34 0.22 0.27 0.28 0.32 0.35 0.37 0.46 0.25 0.32 0.27 0.29 0.87 0.16 0.36 0.31 0.29 0.41 0.18 0.24 0.45 0.42 0.2 0.64 0.73 0.8
0.2 0.38 0.0 0.18 0.64 0.48 0.18 0.19 0.17 0.0 0.0 0.0 2.12 3.35 2.35 0.0 0.52 0.68 0.55 0.53 0.34 0.6 3.0 0.0 0.35 0.0 0.2 0.53 0.7 2.75 1.59
4.62 4.78 4.18 3.93 7.44 9.02 7.82 8.66 5.75 6.46 5.02 6.07 10.5 9.52 8.76 7.16 7.02 11.1 5.64 6.49 6.53 6.37 12.46 7.11 6.64 6.88 6.92 6.53 8.88 7.45 12.22
4.85 3.86 3.66 3.79 6.66 6.81 5.22 5.05 5.95 6.01 6.18 6.05 8.46 12.03 9.1 5.68 5.81 4.75 6.05 5.87 5.65 6.9 19.54 6.5 6.62 7.1 6.36 6.38 6.69 20.13 15.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
1.33 3.22 1.93 1.29 1.29 0.34 0.45 0.38 0.32 0.37 0.54 0.52 1.61 0.48 0.37 0.57 0.93 4.78 0.38 0.39 0.39 0.23 1.02 0.6 0.45 0.54 0.33 0.27 0.86 3.66 4.91
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02
0.04 0.25 0.01 0.11 2.59 3.5 0.29 0.25 0.44 0.32 0.2 0.16 0.19 0.65 2.21 0.37 0.32 6.01 1.05 0.23 0.19 0.27 1.43 0.12 0.53 0.32 0.58 0.88 6.95 10.9 0.16
2.07 1.94 1.55 2.02 2.83 3.43 2.7 4.93 2.13 2.25 2.14 3.15 4.24 5.15 4.43 3.37 3.48 5.25 2.04 2.17 2.49 2.6 7.27 2.91 2.75 2.19 2.53 2.31 4.35 4.35 7.01
1.19 1.34 2.1 1.52 0.87 0.34 0.44 0.42 0.38 0.44 0.45 0.46 1.39 0.58 0.69 0.7 0.86 4.16 0.55 0.53 0.41 0.52 0.1 0.46 0.69 0.66 0.68 0.37 0.79 1.1 2.92
0.26 0.24 0.08 0.17 0.65 0.52 0.23 0.16 0.39 0.22 0.29 0.28 1.82 0.87 0.5 0.25 0.29 2.45 0.25 0.25 0.3 0.26 2.7 0.33 0.36 0.26 0.34 0.33 0.47 1.16 1.46
3.11 3.07 4.06 3.76 5.32 5.74 5.96 9.05 3.45 4.04 3.78 4.12 10.34 10.83 8.18 6.5 6.55 11.64 4.67 5.04 5.65 5.83 12.67 6.23 6.17 5.99 4.79 5.6 8.59 7.86 13.49
2.3 2.5 2.85 3.78 4.56 4.64 8.63 10.73 4.9 4.84 5.45 6.18 12.03 7.13 7.74 6.42 5.84 9.28 6.06 6.39 5.26 5.46 16.84 6.24 6.21 6.04 5.2 5.33 6.67 10.93 15.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
0.24 0.6 0.34 0.34 1.0 1.17 1.12 1.61 0.73 0.35 0.84 1.02 2.36 3.24 2.05 0.92 0.92 2.15 0.93 0.99 0.87 0.86 4.28 1.33 1.49 1.23 0.66 0.64 2.03 1.81 7.04
0.54 0.38 0.46 0.46 1.01 0.94 0.56 0.53 0.38 0.56 0.42 0.57 3.21 0.87 0.7 0.6 0.63 2.65 0.41 0.47 0.47 0.47 5.84 0.41 1.06 0.39 0.27 0.58 0.75 4.33 4.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.89 1.16 0.87 1.05 1.87 1.97 1.26 1.25 1.13 1.1 1.09 1.2 2.06 2.73 2.48 1.37 1.3 2.53 1.24 1.14 1.03 1.06 4.8 1.21 0.98 1.13 1.23 0.99 1.93 3.19 4.01
1.46 1.71 1.01 1.31 2.32 2.8 1.24 1.96 1.29 1.28 1.26 1.29 6.19 2.44 1.92 1.57 1.54 6.17 2.12 1.16 1.69 1.86 5.0 2.09 2.4 1.46 1.41 1.69 1.84 4.42 5.29
6.98 8.45 7.24 6.73 13.25 13.59 9.99 15.77 6.56 7.91 7.78 10.42 17.31 19.55 15.87 10.48 10.49 20.02 8.77 7.72 8.55 10.49 30.42 10.04 10.36 9.49 8.48 8.62 19.82 18.84 38.56
0.31 0.25 0.25 0.2 0.47 0.48 0.35 0.39 0.39 0.42 0.27 0.39 0.9 1.4 0.98 0.47 0.58 0.92 0.6 0.51 0.53 0.68 1.66 0.61 0.57 0.57 0.53 0.39 0.99 1.03 1.24
0.17 0.16 0.04 0.09 0.48 0.47 0.21 0.14 0.2 0.07 0.13 0.12 0.39 0.75 0.4 0.17 0.1 1.2 0.24 0.25 0.21 0.09 3.84 0.12 0.56 0.19 0.18 0.15 0.21 3.52 1.26
0.0 0.05 0.0 0.02 0.06 0.1 0.04 0.0 0.07 0.08 0.07 0.08 0.07 0.09 0.04 0.06 0.02 1.45 0.01 0.05 0.05 0.05 1.04 0.04 0.01 0.06 0.02 0.01 0.11 0.87 0.24
0.83 0.52 0.39 0.48 1.45 2.05 1.17 0.98 0.73 0.69 0.77 0.53 1.92 3.53 2.98 1.43 1.05 1.58 1.28 1.11 1.0 0.83 2.56 0.89 1.0 1.16 0.82 0.75 1.4 5.16 2.2

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)