Heatmap: Cluster_76 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_11100.1 (IDD11)	0.13	0.11	0.18	0.19	0.64	0.4	0.16	0.15	0.24	0.28	0.3	0.32	0.61	1.0	0.67	0.36	0.29	0.57	0.34	0.27	0.21	0.23	0.22	0.24	0.19	0.25	0.27	0.21	0.4	0.42	0.95
Lsat_1_v5_gn_0_19300.1 (CMU2)	0.25	0.24	0.23	0.23	0.28	0.38	0.2	0.18	0.21	0.22	0.17	0.24	0.5	1.0	0.52	0.24	0.24	0.54	0.26	0.21	0.21	0.17	0.16	0.19	0.28	0.21	0.19	0.15	0.36	0.38	0.59
Lsat_1_v5_gn_0_34120.1	0.3	0.26	0.21	0.22	0.27	0.27	0.2	0.17	0.2	0.15	0.28	0.36	0.89	1.0	0.44	0.18	0.3	0.54	0.21	0.16	0.22	0.2	0.36	0.22	0.2	0.14	0.21	0.18	0.25	0.33	0.89
Lsat_1_v5_gn_0_740.1 (STY46)	0.26	0.25	0.41	0.36	0.38	0.32	0.16	0.13	0.17	0.21	0.18	0.17	0.42	1.0	0.55	0.24	0.17	0.54	0.2	0.17	0.17	0.22	0.47	0.14	0.14	0.2	0.18	0.15	0.21	0.2	0.45
Lsat_1_v5_gn_1_130141.1 (mtACP3)	0.16	0.1	0.13	0.11	0.19	0.28	0.21	0.13	0.12	0.15	0.17	0.19	0.5	1.0	0.46	0.2	0.18	0.35	0.19	0.18	0.23	0.26	0.31	0.24	0.25	0.21	0.2	0.28	0.26	0.24	0.36
Lsat_1_v5_gn_1_46661.1 (CCD8)	0.0	0.03	0.01	0.03	0.02	0.01	0.11	0.03	0.02	0.05	0.05	0.01	0.58	1.0	0.63	0.13	0.13	0.29	0.06	0.18	0.07	0.02	0.0	0.04	0.09	0.04	0.08	0.02	0.1	0.06	0.65
Lsat_1_v5_gn_1_74301.1 (LUP2)	0.12	0.11	0.13	0.17	0.23	0.25	0.3	0.3	0.39	0.41	0.43	0.41	0.65	1.0	0.64	0.32	0.36	0.85	0.42	0.46	0.37	0.29	0.33	0.54	0.48	0.33	0.31	0.38	0.58	0.57	0.82
Lsat_1_v5_gn_1_77381.1 (LUP1)	0.12	0.07	0.08	0.19	0.24	0.25	0.21	0.2	0.36	0.41	0.41	0.38	0.53	1.0	0.49	0.22	0.37	0.86	0.32	0.44	0.31	0.19	0.31	0.49	0.45	0.2	0.28	0.37	0.55	0.57	0.82
Lsat_1_v5_gn_1_97040.1	0.13	0.13	0.08	0.07	0.27	0.32	0.18	0.14	0.13	0.15	0.15	0.18	1.0	0.76	0.38	0.18	0.22	0.36	0.2	0.18	0.15	0.2	0.05	0.26	0.27	0.22	0.22	0.23	0.14	0.16	0.68
Lsat_1_v5_gn_2_116160.1 (TOE1)	0.24	0.32	0.25	0.15	0.25	0.41	0.3	0.4	0.15	0.15	0.18	0.16	0.79	1.0	0.57	0.25	0.24	0.95	0.31	0.19	0.22	0.25	0.15	0.31	0.32	0.22	0.26	0.3	0.28	0.22	0.3
Lsat_1_v5_gn_2_125021.1 (TRM1c)	0.28	0.3	0.24	0.34	0.27	0.27	0.38	0.52	0.41	0.34	0.31	0.42	0.8	0.86	0.59	0.27	0.37	0.28	0.43	0.4	0.37	0.32	0.21	0.42	0.4	0.44	0.26	0.39	0.44	0.44	1.0
Lsat_1_v5_gn_2_129520.1 (EXL3)	0.02	0.02	0.02	0.02	0.12	0.13	0.03	0.03	0.07	0.08	0.08	0.08	0.37	1.0	0.48	0.13	0.09	0.48	0.11	0.09	0.06	0.08	0.01	0.08	0.08	0.08	0.07	0.03	0.1	0.12	0.61
Lsat_1_v5_gn_2_133981.1 (EXS)	0.07	0.06	0.04	0.08	0.36	0.41	0.09	0.07	0.08	0.08	0.12	0.13	0.93	1.0	0.72	0.16	0.15	0.53	0.26	0.14	0.13	0.14	0.05	0.15	0.19	0.08	0.1	0.19	0.15	0.15	0.59
Lsat_1_v5_gn_2_20881.1 (TRM28)	0.1	0.21	0.07	0.09	0.46	0.42	0.3	0.24	0.29	0.31	0.34	0.42	0.9	1.0	0.92	0.27	0.37	0.53	0.57	0.31	0.25	0.29	0.17	0.39	0.4	0.34	0.37	0.47	0.19	0.21	0.81
Lsat_1_v5_gn_2_68880.1	0.11	0.16	0.05	0.09	0.24	0.35	0.39	0.53	0.22	0.23	0.28	0.3	1.0	0.96	0.56	0.29	0.27	0.46	0.31	0.26	0.28	0.29	0.07	0.3	0.27	0.26	0.28	0.17	0.29	0.31	0.84
Lsat_1_v5_gn_2_84460.1 (ASL1)	0.14	0.12	0.21	0.17	0.09	0.23	0.28	0.34	0.27	0.29	0.19	0.35	1.0	0.8	0.52	0.32	0.35	0.39	0.26	0.29	0.27	0.25	0.08	0.21	0.28	0.26	0.15	0.19	0.21	0.23	0.84
Lsat_1_v5_gn_2_86901.1 (PEAR1)	0.02	0.07	0.1	0.13	0.13	0.16	0.12	0.14	0.19	0.18	0.21	0.14	0.63	0.95	0.56	0.2	0.16	0.95	0.24	0.17	0.14	0.12	0.04	0.12	0.16	0.13	0.15	0.1	0.31	0.31	1.0
Lsat_1_v5_gn_2_98701.1 (CNGC15)	0.18	0.19	0.14	0.1	0.36	0.37	0.31	0.26	0.26	0.2	0.27	0.23	0.21	0.71	0.56	0.31	0.27	1.0	0.28	0.28	0.26	0.3	0.52	0.21	0.21	0.22	0.25	0.27	0.32	0.28	0.25
Lsat_1_v5_gn_3_13041.1 (UMAMIT21)	0.11	0.18	0.1	0.24	0.35	0.28	0.14	0.26	0.28	0.17	0.25	0.2	0.78	1.0	0.69	0.28	0.22	0.56	0.3	0.25	0.15	0.28	0.04	0.29	0.32	0.3	0.3	0.18	0.36	0.42	0.92
Lsat_1_v5_gn_3_19261.1 (HDG5)	0.25	0.37	0.29	0.18	0.38	0.4	0.28	0.37	0.22	0.26	0.34	0.29	0.83	1.0	0.66	0.48	0.42	0.5	0.41	0.29	0.29	0.34	0.16	0.31	0.28	0.34	0.31	0.29	0.5	0.47	0.81
Lsat_1_v5_gn_3_2521.1 (PME1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.09	0.01	0.01	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.15
Lsat_1_v5_gn_3_63200.1 (DXS)	0.05	0.06	0.07	0.06	0.16	0.1	0.07	0.04	0.11	0.14	0.12	0.12	0.51	1.0	0.33	0.17	0.18	0.52	0.1	0.13	0.1	0.12	0.1	0.14	0.16	0.1	0.13	0.1	0.28	0.26	0.65
Lsat_1_v5_gn_3_84721.1 (MYR2)	0.2	0.36	0.19	0.22	0.24	0.26	0.29	0.22	0.31	0.35	0.35	0.22	0.74	1.0	0.68	0.26	0.15	0.43	0.26	0.16	0.1	0.2	0.28	0.23	0.2	0.17	0.17	0.26	0.32	0.26	0.83
Lsat_1_v5_gn_4_119120.1	0.12	0.2	0.19	0.18	0.32	0.24	0.31	0.26	0.26	0.28	0.27	0.29	0.33	0.61	0.69	0.39	0.46	1.0	0.41	0.33	0.27	0.23	0.22	0.33	0.28	0.26	0.3	0.19	0.29	0.37	0.5
Lsat_1_v5_gn_4_119901.1	0.0	0.12	0.11	0.09	0.3	0.2	0.13	0.14	0.26	0.26	0.28	0.28	0.3	1.0	0.5	0.18	0.12	0.46	0.28	0.25	0.14	0.11	0.05	0.22	0.19	0.17	0.13	0.12	0.58	0.53	0.63
Lsat_1_v5_gn_4_160781.1 (HEB1)	0.03	0.01	0.04	0.04	0.07	0.06	0.05	0.04	0.05	0.05	0.06	0.08	0.81	1.0	0.23	0.06	0.06	0.2	0.04	0.03	0.03	0.06	0.05	0.09	0.07	0.05	0.03	0.07	0.07	0.09	0.75
Lsat_1_v5_gn_4_29341.1	0.12	0.13	0.1	0.13	0.26	0.32	0.24	0.21	0.24	0.23	0.25	0.15	0.15	0.79	0.73	0.37	0.29	1.0	0.36	0.26	0.24	0.26	0.41	0.23	0.23	0.25	0.27	0.18	0.34	0.34	0.31
Lsat_1_v5_gn_4_40881.1	0.03	0.02	0.05	0.07	0.07	0.1	0.0	0.06	0.1	0.12	0.01	0.04	0.29	1.0	0.22	0.06	0.11	0.82	0.11	0.05	0.14	0.07	0.0	0.17	0.11	0.07	0.25	0.03	0.1	0.11	0.53
Lsat_1_v5_gn_4_77061.1 (CuAO-zeta)	0.11	0.12	0.16	0.16	0.28	0.26	0.14	0.15	0.15	0.16	0.14	0.16	0.64	1.0	0.38	0.21	0.19	0.42	0.22	0.16	0.16	0.17	0.25	0.11	0.15	0.19	0.16	0.17	0.3	0.3	0.73
Lsat_1_v5_gn_5_10001.1 (SCRM)	0.32	0.22	0.41	0.31	0.24	0.33	0.26	0.16	0.21	0.23	0.22	0.25	0.4	1.0	0.56	0.32	0.35	0.86	0.37	0.26	0.23	0.3	0.16	0.26	0.25	0.26	0.25	0.3	0.21	0.2	0.4
Lsat_1_v5_gn_5_102560.1 (OFP8)	0.13	0.04	0.11	0.04	0.19	0.25	0.17	0.19	0.14	0.18	0.16	0.38	1.0	0.54	0.53	0.24	0.27	0.44	0.27	0.23	0.15	0.23	0.05	0.22	0.17	0.16	0.08	0.21	0.14	0.16	0.81
Lsat_1_v5_gn_5_132821.1	0.24	0.2	0.35	0.3	0.47	0.45	0.27	0.27	0.33	0.32	0.35	0.34	0.69	1.0	0.7	0.47	0.39	0.7	0.33	0.31	0.27	0.29	0.3	0.31	0.33	0.4	0.36	0.33	0.46	0.48	0.76
Lsat_1_v5_gn_5_134201.1 (GIN2)	0.28	0.3	0.24	0.19	0.43	0.39	0.25	0.25	0.23	0.23	0.24	0.25	0.68	1.0	0.67	0.35	0.34	0.85	0.38	0.23	0.32	0.32	0.08	0.28	0.31	0.33	0.34	0.29	0.38	0.37	0.74
Lsat_1_v5_gn_5_134280.1 (IQD26)	0.06	0.02	0.03	0.01	0.3	0.37	0.18	0.16	0.12	0.05	0.06	0.1	0.56	1.0	0.73	0.16	0.15	0.59	0.39	0.14	0.21	0.14	0.06	0.24	0.16	0.12	0.09	0.14	0.1	0.13	0.53
Lsat_1_v5_gn_5_148860.1 (KMS1)	0.28	0.28	0.27	0.21	0.46	0.57	0.19	0.17	0.28	0.29	0.28	0.25	0.68	1.0	0.81	0.39	0.37	0.61	0.27	0.34	0.26	0.37	0.26	0.43	0.29	0.21	0.3	0.23	0.33	0.48	0.73
Lsat_1_v5_gn_5_177901.1	0.01	0.05	0.0	0.0	0.11	0.07	0.03	0.03	0.01	0.01	0.0	0.0	0.03	1.0	0.24	0.02	0.06	0.5	0.13	0.02	0.02	0.05	0.04	0.03	0.03	0.04	0.05	0.02	0.09	0.04	0.11
Lsat_1_v5_gn_5_187580.1 (ALKBH10B)	0.21	0.22	0.12	0.09	0.24	0.32	0.4	0.45	0.22	0.23	0.24	0.24	0.33	0.83	0.67	0.35	0.36	1.0	0.41	0.3	0.25	0.24	0.28	0.29	0.24	0.24	0.24	0.26	0.28	0.3	0.31
Lsat_1_v5_gn_5_188841.1 (NET1A)	0.07	0.06	0.06	0.04	0.07	0.07	0.07	0.04	0.06	0.05	0.07	0.08	0.57	1.0	0.22	0.07	0.09	0.28	0.04	0.05	0.05	0.05	0.02	0.09	0.09	0.07	0.05	0.09	0.04	0.07	0.33
Lsat_1_v5_gn_5_191040.1 (ATOEP16-4)	0.32	0.51	0.57	0.43	0.62	0.51	0.21	0.2	0.3	0.38	0.37	0.34	0.53	1.0	0.73	0.45	0.38	0.6	0.4	0.33	0.26	0.43	0.74	0.3	0.26	0.33	0.39	0.29	0.35	0.34	0.46
Lsat_1_v5_gn_5_70941.1	0.01	0.09	0.09	0.07	0.09	0.05	0.06	0.06	0.07	0.11	0.13	0.08	0.53	0.65	0.12	0.08	0.1	0.23	0.09	0.14	0.06	0.14	0.05	0.16	0.16	0.1	0.1	0.04	0.08	0.15	1.0
Lsat_1_v5_gn_5_8540.1	0.11	0.07	0.07	0.07	0.04	0.04	0.08	0.1	0.08	0.13	0.09	0.14	0.53	0.83	0.23	0.1	0.17	0.53	0.15	0.06	0.09	0.05	0.16	0.08	0.07	0.07	0.09	0.1	0.11	0.18	1.0
Lsat_1_v5_gn_6_10560.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.8	0.0	0.31	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_26681.1 (LMI1)	0.09	0.03	0.02	0.0	0.17	0.23	0.33	0.38	0.07	0.04	0.06	0.06	0.71	1.0	0.33	0.12	0.08	0.41	0.15	0.21	0.1	0.15	0.09	0.14	0.11	0.04	0.08	0.25	0.11	0.14	0.34
Lsat_1_v5_gn_6_38800.1 (FD3)	0.2	0.22	0.19	0.19	0.46	0.49	0.33	0.28	0.38	0.4	0.37	0.38	1.0	0.64	0.52	0.38	0.4	0.44	0.38	0.39	0.35	0.38	0.25	0.34	0.35	0.39	0.41	0.37	0.37	0.36	0.77
Lsat_1_v5_gn_6_72421.1 (PSKR1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	1.0	0.0	0.06	0.0	0.83	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08
Lsat_1_v5_gn_6_83501.1 (SWEET6)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.15	0.0	0.0	0.52	0.0	0.0	0.03	0.0	0.04	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.2
Lsat_1_v5_gn_7_20840.1 (ERF12)	0.0	0.0	0.0	0.03	0.05	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.0	0.01	0.23	1.0	0.15	0.0	0.02	0.22	0.09	0.03	0.0	0.03	0.08	0.12	0.01	0.0	0.0	0.03	0.02	0.01	0.3
Lsat_1_v5_gn_7_22140.1 (ETT)	0.11	0.29	0.28	0.26	0.46	0.43	0.29	0.27	0.36	0.42	0.35	0.31	0.59	1.0	0.6	0.35	0.31	0.69	0.45	0.37	0.3	0.23	0.1	0.27	0.3	0.35	0.25	0.22	0.54	0.52	0.88
Lsat_1_v5_gn_7_72140.1	0.11	0.33	0.16	0.13	0.14	0.22	0.12	0.14	0.17	0.16	0.15	0.14	1.0	0.52	0.38	0.22	0.21	0.65	0.2	0.2	0.13	0.16	0.1	0.18	0.18	0.17	0.16	0.12	0.19	0.22	0.72
Lsat_1_v5_gn_8_23601.1 (MPH2)	0.26	0.19	0.29	0.26	0.42	0.45	0.17	0.13	0.2	0.2	0.2	0.15	0.43	1.0	0.61	0.28	0.25	0.75	0.22	0.22	0.19	0.15	0.31	0.15	0.17	0.17	0.24	0.16	0.21	0.19	0.46
Lsat_1_v5_gn_8_52260.1 (GFS1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.05	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.96	0.49	0.04	0.01	1.0	0.08	0.0	0.01	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.01	0.05
Lsat_1_v5_gn_8_54740.1 (AtHMP49)	0.28	0.2	0.33	0.3	0.28	0.29	0.21	0.15	0.27	0.29	0.25	0.26	0.35	1.0	0.67	0.36	0.34	0.79	0.4	0.39	0.26	0.25	0.09	0.25	0.23	0.25	0.28	0.17	0.25	0.32	0.58
Lsat_1_v5_gn_8_62721.1 (CYP71B14)	0.28	0.19	0.26	0.36	0.43	0.4	0.3	0.37	0.29	0.33	0.31	0.38	0.56	1.0	0.58	0.39	0.39	0.63	0.32	0.32	0.32	0.36	0.33	0.35	0.33	0.31	0.3	0.35	0.57	0.52	0.9
Lsat_1_v5_gn_8_9800.1 (OLE1)	0.03	0.02	0.0	0.01	0.08	0.08	0.03	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.09	1.0	0.23	0.02	0.04	0.62	0.1	0.03	0.05	0.04	0.06	0.1	0.06	0.05	0.04	0.04	0.06	0.05	0.06
Lsat_1_v5_gn_9_10200.1	0.08	0.07	0.07	0.04	0.1	0.12	0.11	0.09	0.08	0.09	0.09	0.11	1.0	0.41	0.17	0.12	0.16	0.48	0.1	0.11	0.08	0.1	0.03	0.14	0.13	0.13	0.11	0.13	0.09	0.12	0.45
Lsat_1_v5_gn_9_20640.1	0.05	0.05	0.03	0.04	0.12	0.12	0.08	0.1	0.07	0.07	0.08	0.13	1.0	0.61	0.34	0.12	0.1	0.43	0.1	0.09	0.08	0.11	0.01	0.12	0.11	0.09	0.07	0.1	0.09	0.14	0.64
Lsat_1_v5_gn_9_52760.1 (TPXL3)	0.06	0.02	0.05	0.0	0.06	0.06	0.06	0.04	0.06	0.1	0.06	0.05	0.44	1.0	0.11	0.06	0.09	0.15	0.02	0.06	0.07	0.08	0.04	0.1	0.1	0.03	0.05	0.09	0.04	0.09	0.34
Lsat_1_v5_gn_9_70101.1 (KCO4)	0.04	0.0	0.02	0.02	0.12	0.03	0.02	0.0	0.12	0.02	0.15	0.12	0.33	1.0	0.35	0.02	0.15	0.43	0.06	0.08	0.05	0.18	0.03	0.09	0.15	0.08	0.01	0.07	0.3	0.12	0.44
Lsat_1_v5_gn_9_7981.1 (D27)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.06	0.03	0.0	0.03	0.0	0.0	0.82	1.0	0.32	0.02	0.02	0.14	0.15	0.03	0.03	0.0	0.0	0.03	0.04	0.0	0.02	0.02	0.01	0.03	0.9
Lsat_1_v5_gn_9_8581.1 (PHT1;7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_9441.1 (MyoB1)	0.19	0.06	0.18	0.15	0.32	0.18	0.14	0.07	0.21	0.23	0.19	0.28	0.28	0.74	0.53	0.24	0.36	1.0	0.24	0.2	0.24	0.19	0.25	0.18	0.34	0.25	0.29	0.14	0.28	0.46	0.66

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)