1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_76 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.97 0.83 1.33 1.4 4.82 3.05 1.18 1.17 1.78 2.11 2.3 2.41 4.64 7.55 5.08 2.72 2.22 4.31 2.57 2.07 1.59 1.76 1.64 1.78 1.46 1.91 2.06 1.61 2.99 3.2 7.18
1.37 1.29 1.25 1.25 1.53 2.03 1.08 0.96 1.11 1.19 0.94 1.3 2.68 5.4 2.8 1.3 1.32 2.94 1.38 1.12 1.15 0.94 0.87 1.04 1.49 1.12 1.03 0.82 1.96 2.05 3.21
0.72 0.63 0.51 0.54 0.64 0.65 0.49 0.42 0.49 0.36 0.69 0.88 2.14 2.41 1.06 0.44 0.72 1.31 0.51 0.39 0.53 0.49 0.87 0.54 0.48 0.34 0.51 0.43 0.6 0.79 2.15
1.1 1.03 1.72 1.51 1.58 1.34 0.67 0.54 0.72 0.88 0.73 0.71 1.77 4.18 2.29 1.0 0.69 2.26 0.82 0.7 0.7 0.92 1.98 0.58 0.57 0.82 0.75 0.62 0.89 0.85 1.88
2.91 1.76 2.35 2.06 3.46 5.22 3.91 2.45 2.29 2.8 3.06 3.57 9.26 18.48 8.43 3.64 3.24 6.53 3.52 3.24 4.16 4.85 5.75 4.35 4.65 3.96 3.67 5.15 4.87 4.4 6.59
0.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.07 0.02 0.01 0.03 0.03 0.01 0.39 0.67 0.42 0.09 0.09 0.2 0.04 0.12 0.05 0.01 0.0 0.03 0.06 0.03 0.05 0.01 0.07 0.04 0.44
0.42 0.38 0.45 0.6 0.8 0.86 1.05 1.04 1.35 1.44 1.5 1.41 2.25 3.48 2.23 1.12 1.24 2.94 1.46 1.61 1.28 1.01 1.16 1.87 1.68 1.16 1.08 1.32 2.01 2.0 2.84
1.02 0.6 0.64 1.58 1.98 2.05 1.73 1.67 2.95 3.38 3.42 3.1 4.34 8.25 4.01 1.85 3.03 7.07 2.68 3.61 2.55 1.57 2.56 4.02 3.69 1.67 2.32 3.09 4.58 4.73 6.79
1.0 0.97 0.59 0.55 2.04 2.41 1.34 1.04 0.95 1.13 1.17 1.33 7.59 5.76 2.92 1.38 1.7 2.72 1.49 1.37 1.16 1.51 0.35 1.95 2.08 1.66 1.68 1.78 1.08 1.2 5.2
1.44 1.94 1.49 0.88 1.52 2.49 1.82 2.44 0.91 0.88 1.08 0.96 4.75 6.03 3.42 1.52 1.43 5.75 1.84 1.16 1.33 1.5 0.93 1.86 1.96 1.33 1.55 1.82 1.66 1.32 1.83
1.13 1.21 0.95 1.36 1.08 1.07 1.54 2.11 1.66 1.35 1.26 1.68 3.23 3.45 2.37 1.1 1.48 1.14 1.73 1.61 1.5 1.3 0.86 1.67 1.59 1.76 1.04 1.56 1.76 1.76 4.01
0.49 0.49 0.52 0.47 2.77 2.96 0.68 0.59 1.49 1.75 1.81 1.77 8.25 22.22 10.67 2.81 2.05 10.57 2.48 2.11 1.38 1.84 0.32 1.73 1.82 1.82 1.66 0.71 2.13 2.58 13.59
0.11 0.09 0.06 0.12 0.57 0.65 0.15 0.11 0.13 0.13 0.2 0.21 1.49 1.6 1.15 0.26 0.25 0.84 0.42 0.23 0.21 0.22 0.09 0.23 0.3 0.14 0.16 0.31 0.25 0.23 0.95
0.46 1.0 0.35 0.41 2.2 2.01 1.44 1.13 1.36 1.47 1.61 2.0 4.28 4.74 4.36 1.28 1.76 2.49 2.69 1.45 1.2 1.39 0.79 1.87 1.9 1.62 1.74 2.22 0.9 1.02 3.86
2.35 3.25 1.01 1.95 4.94 7.23 8.0 10.97 4.57 4.84 5.79 6.18 20.77 19.92 11.65 6.1 5.61 9.61 6.34 5.44 5.83 6.0 1.55 6.23 5.66 5.48 5.73 3.53 6.12 6.48 17.48
0.91 0.78 1.37 1.12 0.58 1.56 1.83 2.24 1.79 1.95 1.28 2.31 6.65 5.29 3.43 2.15 2.32 2.6 1.7 1.94 1.79 1.66 0.51 1.37 1.83 1.74 0.98 1.26 1.42 1.5 5.58
0.17 0.65 0.9 1.24 1.2 1.52 1.16 1.35 1.79 1.67 1.93 1.33 5.95 8.9 5.29 1.85 1.51 8.93 2.3 1.63 1.36 1.14 0.36 1.13 1.48 1.2 1.41 0.99 2.93 2.95 9.39
4.31 4.36 3.19 2.38 8.42 8.68 7.2 6.1 6.04 4.7 6.3 5.35 4.8 16.7 13.11 7.22 6.23 23.39 6.54 6.51 6.14 6.92 12.26 4.97 4.97 5.05 5.87 6.21 7.6 6.6 5.8
0.24 0.41 0.23 0.55 0.8 0.63 0.32 0.58 0.63 0.39 0.57 0.45 1.76 2.26 1.56 0.64 0.5 1.26 0.68 0.56 0.33 0.63 0.09 0.65 0.73 0.69 0.67 0.4 0.81 0.96 2.08
1.52 2.25 1.78 1.09 2.29 2.45 1.72 2.22 1.31 1.55 2.07 1.78 5.04 6.06 3.98 2.89 2.57 3.04 2.5 1.79 1.77 2.07 0.94 1.87 1.72 2.06 1.91 1.73 3.02 2.84 4.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 2.91 0.27 0.02 0.02 1.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.43
0.42 0.5 0.56 0.48 1.26 0.82 0.57 0.3 0.83 1.1 0.97 0.97 4.05 7.91 2.61 1.33 1.44 4.1 0.79 1.02 0.8 0.92 0.76 1.1 1.26 0.79 1.05 0.82 2.23 2.06 5.11
0.86 1.5 0.8 0.91 1.0 1.11 1.21 0.93 1.31 1.45 1.46 0.94 3.11 4.2 2.87 1.1 0.62 1.81 1.09 0.68 0.42 0.85 1.19 0.97 0.85 0.73 0.7 1.08 1.35 1.08 3.5
3.93 6.53 6.1 5.83 10.47 7.84 10.27 8.51 8.43 9.21 8.98 9.48 10.97 20.2 22.75 12.97 15.21 32.88 13.49 10.84 8.74 7.6 7.32 10.84 9.28 8.5 9.76 6.31 9.58 12.02 16.4
0.0 0.24 0.22 0.18 0.58 0.39 0.25 0.28 0.51 0.5 0.54 0.55 0.58 1.95 0.97 0.35 0.24 0.9 0.54 0.48 0.28 0.21 0.09 0.42 0.38 0.32 0.25 0.24 1.13 1.03 1.22
0.06 0.03 0.09 0.09 0.16 0.14 0.11 0.09 0.12 0.12 0.14 0.2 1.94 2.39 0.55 0.15 0.14 0.48 0.09 0.07 0.07 0.14 0.11 0.21 0.16 0.11 0.06 0.17 0.16 0.22 1.79
1.76 1.9 1.54 1.96 3.97 4.78 3.57 3.13 3.72 3.55 3.79 2.27 2.22 11.96 11.11 5.57 4.36 15.18 5.45 3.97 3.69 3.93 6.17 3.44 3.52 3.79 4.06 2.7 5.22 5.21 4.75
0.23 0.14 0.35 0.47 0.48 0.68 0.0 0.41 0.66 0.81 0.07 0.27 1.95 6.64 1.45 0.39 0.76 5.47 0.75 0.32 0.91 0.46 0.0 1.13 0.76 0.5 1.65 0.18 0.68 0.75 3.49
1.75 1.94 2.68 2.56 4.65 4.27 2.37 2.4 2.44 2.67 2.25 2.68 10.51 16.42 6.24 3.38 3.16 6.88 3.68 2.68 2.68 2.75 4.09 1.81 2.46 3.11 2.62 2.79 4.85 4.88 11.95
12.18 8.31 15.53 11.66 8.98 12.37 9.68 5.91 8.13 8.66 8.49 9.61 15.29 37.88 21.22 11.98 13.18 32.48 13.95 9.84 8.7 11.21 6.09 9.73 9.59 9.87 9.35 11.36 7.97 7.53 15.1
0.61 0.17 0.56 0.21 0.95 1.23 0.82 0.93 0.66 0.86 0.79 1.85 4.9 2.64 2.58 1.18 1.31 2.14 1.3 1.13 0.73 1.13 0.23 1.09 0.81 0.79 0.38 1.05 0.71 0.77 3.96
2.77 2.28 4.1 3.51 5.49 5.23 3.19 3.1 3.81 3.71 4.13 3.96 8.07 11.66 8.16 5.44 4.51 8.12 3.79 3.65 3.2 3.37 3.47 3.67 3.84 4.61 4.19 3.8 5.34 5.63 8.8
1.85 1.96 1.54 1.24 2.83 2.51 1.66 1.64 1.52 1.52 1.56 1.62 4.44 6.51 4.37 2.31 2.2 5.53 2.47 1.48 2.07 2.09 0.55 1.84 2.01 2.13 2.2 1.92 2.46 2.4 4.85
0.12 0.04 0.07 0.02 0.62 0.79 0.37 0.35 0.25 0.1 0.13 0.2 1.19 2.1 1.55 0.33 0.32 1.24 0.83 0.28 0.45 0.29 0.13 0.5 0.33 0.26 0.19 0.29 0.21 0.27 1.12
1.03 1.03 0.97 0.77 1.68 2.08 0.7 0.62 1.0 1.08 1.0 0.9 2.47 3.65 2.95 1.43 1.34 2.22 1.0 1.26 0.95 1.35 0.95 1.56 1.07 0.76 1.1 0.85 1.2 1.74 2.66
0.01 0.12 0.0 0.0 0.27 0.17 0.07 0.07 0.03 0.02 0.01 0.0 0.07 2.43 0.58 0.04 0.14 1.22 0.33 0.04 0.05 0.11 0.1 0.08 0.08 0.09 0.12 0.05 0.22 0.09 0.26
19.76 20.73 10.88 8.3 22.22 29.81 37.27 42.43 20.76 21.72 22.6 22.57 30.56 77.16 62.2 32.23 33.19 93.32 38.18 27.66 23.36 22.03 25.73 26.99 22.69 21.94 22.54 23.9 25.95 28.11 29.24
2.06 1.67 1.67 1.09 2.24 2.11 2.03 1.2 1.86 1.66 2.21 2.38 17.3 30.23 6.68 2.11 2.58 8.6 1.3 1.48 1.5 1.44 0.56 2.87 2.76 2.15 1.65 2.67 1.33 2.15 10.05
20.71 33.48 37.28 27.77 40.43 33.6 13.59 12.82 19.89 24.74 24.04 22.42 34.9 65.26 47.4 29.48 24.62 39.34 25.79 21.33 17.28 27.84 48.45 19.41 17.09 21.39 25.52 18.84 22.63 21.89 30.08
0.83 7.75 7.64 6.56 7.73 4.5 5.13 5.38 5.89 9.94 11.23 7.42 47.44 58.25 10.6 6.86 8.51 20.69 8.19 12.17 5.44 12.79 4.47 14.36 14.41 9.26 8.6 3.85 7.5 13.01 89.03
0.23 0.15 0.16 0.14 0.09 0.08 0.17 0.21 0.18 0.27 0.19 0.29 1.12 1.75 0.48 0.21 0.36 1.12 0.31 0.12 0.18 0.11 0.34 0.16 0.16 0.14 0.19 0.21 0.23 0.39 2.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.08 0.05 0.0 0.44 0.61 0.87 1.01 0.18 0.1 0.16 0.15 1.87 2.63 0.86 0.31 0.21 1.07 0.39 0.56 0.26 0.39 0.24 0.37 0.29 0.12 0.21 0.66 0.3 0.38 0.9
26.09 28.8 23.96 23.81 59.02 62.38 41.99 35.43 48.75 51.26 47.31 48.97 128.54 82.45 67.26 48.64 51.59 57.01 48.96 49.63 44.95 49.45 32.2 43.6 45.31 50.27 53.2 47.45 47.77 46.86 98.73
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.84 0.0 0.05 0.0 0.69 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.06 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.08 0.13 0.06 0.05 0.04 0.08 0.06 0.0 0.04 0.63 2.76 0.42 0.0 0.04 0.6 0.25 0.07 0.0 0.07 0.22 0.34 0.04 0.0 0.0 0.09 0.06 0.04 0.82
0.29 0.74 0.71 0.66 1.17 1.09 0.74 0.68 0.93 1.06 0.89 0.79 1.5 2.55 1.52 0.88 0.79 1.77 1.15 0.95 0.76 0.6 0.25 0.68 0.76 0.89 0.63 0.57 1.37 1.33 2.25
1.17 3.47 1.67 1.32 1.51 2.29 1.21 1.42 1.8 1.68 1.6 1.48 10.39 5.4 3.97 2.27 2.15 6.73 2.04 2.05 1.35 1.65 1.09 1.86 1.89 1.8 1.68 1.23 2.01 2.3 7.43
10.82 7.94 12.47 10.87 17.72 19.02 7.23 5.57 8.53 8.52 8.66 6.23 18.24 42.33 25.86 11.72 10.51 31.81 9.35 9.25 8.13 6.41 13.02 6.2 7.1 7.24 10.17 6.89 9.02 8.24 19.29
0.0 0.06 0.0 0.0 0.83 0.76 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 13.91 7.17 0.56 0.21 14.53 1.09 0.05 0.18 0.42 0.05 0.16 0.0 0.05 0.05 0.22 0.48 0.1 0.67
7.1 5.01 8.34 7.56 7.24 7.38 5.38 3.8 6.81 7.35 6.46 6.68 8.9 25.58 17.24 9.18 8.69 20.18 10.12 10.04 6.62 6.52 2.32 6.31 5.89 6.31 7.27 4.23 6.28 8.14 14.85
3.46 2.34 3.21 4.4 5.34 4.99 3.67 4.62 3.6 4.1 3.88 4.73 6.87 12.37 7.16 4.77 4.8 7.82 4.01 3.91 3.91 4.39 4.05 4.3 4.03 3.89 3.75 4.28 7.05 6.38 11.13
1.11 0.81 0.2 0.51 3.16 3.36 1.23 1.12 1.68 0.79 1.15 0.82 3.76 41.26 9.56 0.91 1.6 25.51 4.04 1.03 2.17 1.63 2.67 4.2 2.34 2.11 1.55 1.78 2.51 2.23 2.6
1.46 1.26 1.26 0.78 1.78 2.12 1.94 1.58 1.41 1.53 1.53 1.91 17.52 7.12 2.94 2.08 2.75 8.39 1.79 1.88 1.47 1.68 0.44 2.47 2.33 2.23 1.99 2.26 1.58 2.11 7.97
0.21 0.19 0.13 0.18 0.49 0.5 0.32 0.38 0.3 0.3 0.33 0.51 4.01 2.46 1.37 0.47 0.41 1.71 0.39 0.37 0.31 0.45 0.04 0.49 0.43 0.37 0.28 0.39 0.38 0.57 2.58
0.18 0.07 0.15 0.01 0.18 0.2 0.18 0.11 0.18 0.31 0.2 0.16 1.37 3.13 0.36 0.18 0.27 0.48 0.07 0.18 0.22 0.27 0.12 0.33 0.31 0.11 0.15 0.29 0.13 0.27 1.06
0.14 0.0 0.07 0.06 0.43 0.1 0.08 0.0 0.42 0.06 0.55 0.44 1.19 3.59 1.25 0.06 0.55 1.53 0.2 0.29 0.19 0.64 0.12 0.31 0.55 0.3 0.05 0.24 1.06 0.42 1.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.08 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 1.01 1.24 0.4 0.02 0.02 0.17 0.18 0.03 0.03 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.02 0.02 0.02 0.03 1.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.04 0.13 0.11 0.23 0.13 0.1 0.05 0.15 0.17 0.14 0.21 0.21 0.54 0.38 0.18 0.26 0.73 0.17 0.15 0.18 0.14 0.18 0.13 0.25 0.18 0.21 0.1 0.21 0.34 0.48

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)