Heatmap: Cluster_130 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_11461.1	-0.38	-0.36	-0.53	-0.74	0.16	0.13	-0.28	-0.29	-0.36	-0.24	-0.11	-0.19	0.11	0.46	0.26	0.07	-0.05	0.84	-0.18	-0.43	-0.28	-0.31	1.37	-0.34	-0.34	-0.05	-0.21	-0.51	0.08	0.15	0.38
Lsat_1_v5_gn_0_17841.1 (DMR6)	-0.68	-0.75	-1.21	-1.01	1.22	0.31	-2.01	-1.62	-2.13	-2.39	-2.19	-2.57	-1.14	0.84	1.13	-1.34	-1.43	1.87	-0.66	-2.49	-1.36	-1.13	3.06	-1.35	-1.06	-1.74	-0.75	-1.2	0.34	0.43	-1.89
Lsat_1_v5_gn_0_20981.1 (UBP12)	-0.58	-0.45	-0.61	-0.62	0.51	0.34	-0.27	-0.39	-0.39	-0.34	-0.25	-0.4	0.23	0.68	0.48	-0.05	-0.23	0.65	-0.12	-0.42	-0.34	-0.32	1.32	-0.46	-0.35	-0.3	-0.31	-0.21	0.16	0.11	0.43
Lsat_1_v5_gn_1_113340.1	-0.48	-0.6	-0.57	-0.59	0.41	0.48	-0.23	-0.28	-0.47	-0.32	-0.35	-0.5	0.43	0.56	0.39	-0.23	-0.29	0.97	-0.26	-0.43	-0.35	-0.31	1.21	-0.21	-0.26	-0.48	-0.28	-0.17	0.08	0.08	0.48
Lsat_1_v5_gn_1_115140.1	-0.66	-0.62	-1.13	-1.07	0.26	0.52	-0.38	-0.51	-0.51	-0.55	-0.41	-0.76	-0.6	0.48	0.3	-0.2	-0.54	1.33	0.15	-0.51	-0.31	-0.33	2.01	-0.23	-0.32	-0.14	-0.11	-0.4	-0.05	-0.07	-0.03
Lsat_1_v5_gn_1_16241.1 (TAN)	-0.28	-0.48	-0.65	-0.35	0.39	0.3	-0.43	-0.74	-0.48	-0.46	-0.48	-0.48	0.2	0.78	0.66	-0.11	-0.33	1.21	0.06	-0.43	-0.45	-0.34	1.32	-0.39	-0.46	-0.18	-0.17	0.13	-0.13	-0.34	-0.08
Lsat_1_v5_gn_1_2361.1 (GEM)	-0.19	-0.12	-0.15	-0.04	0.24	0.03	-0.39	-0.37	-0.34	-0.36	-0.18	-0.3	0.05	0.6	0.42	-0.15	-0.11	0.93	-0.16	-0.28	-0.41	-0.38	1.46	-0.5	-0.33	-0.33	-0.43	-0.43	0.02	-0.2	0.06
Lsat_1_v5_gn_1_43941.1 (CAMTA6)	-0.64	-0.66	-0.94	-0.79	0.66	0.33	-0.69	-0.74	-0.44	-0.34	-0.21	-0.54	-0.47	0.92	0.6	-0.14	-0.38	1.18	0.06	-0.57	-0.51	-0.41	1.69	-0.47	-0.49	-0.33	-0.26	-0.53	0.1	0.04	0.21
Lsat_1_v5_gn_1_44040.1 (AMSH3)	-0.2	-0.35	-0.7	-0.44	0.74	0.34	-0.39	-0.6	-0.4	-0.45	-0.09	-0.39	-0.1	0.51	0.42	-0.2	-0.37	0.95	-0.14	-0.48	-0.28	-0.23	1.29	-0.44	-0.19	-0.19	-0.26	-0.25	0.12	0.11	0.12
Lsat_1_v5_gn_1_49241.1	-0.86	-1.03	-2.19	-2.15	1.26	0.59	-1.1	-1.44	-1.29	-1.64	-1.07	-1.7	-0.24	1.13	1.07	-0.39	-1.11	1.47	0.12	-1.05	-0.47	-0.48	2.69	-1.12	-1.03	-1.02	-0.73	-0.52	-0.15	-0.56	-1.42
Lsat_1_v5_gn_1_52021.1 (AtCDC48B)	-0.62	-0.67	-0.77	-0.74	0.4	0.08	-0.56	-0.71	-0.66	-0.56	-0.56	-0.66	0.1	0.62	0.53	-0.14	-0.34	1.43	-0.13	-0.61	-0.5	-0.53	2.01	-0.45	-0.45	-0.44	-0.5	-0.41	-0.01	-0.06	0.27
Lsat_1_v5_gn_1_54840.1 (PAH1)	-0.39	-0.25	-0.65	-0.88	0.52	0.67	-0.28	0.0	-0.75	-0.68	-0.54	-0.82	-0.16	0.65	0.5	-0.05	-0.52	1.35	0.32	-0.53	-0.63	-0.52	1.82	-0.52	-0.47	-0.58	-0.4	-0.47	-0.22	-0.4	-0.31
Lsat_1_v5_gn_1_56201.1 (SEC31A)	-0.7	-0.86	-0.8	-0.35	0.34	0.15	-0.78	-1.15	-0.25	-0.33	-0.08	-0.31	-0.05	0.82	0.68	-0.11	-0.46	1.01	0.18	-0.5	-0.32	-0.43	1.63	-0.54	-0.49	-0.34	-0.46	-0.61	0.1	0.12	0.58
Lsat_1_v5_gn_1_56460.1 (UBP12)	-0.28	-0.37	-0.46	-0.58	0.17	0.18	-0.29	-0.18	-0.48	-0.44	-0.36	-0.36	0.06	0.62	0.36	-0.09	-0.22	0.8	-0.18	-0.51	-0.37	-0.29	1.57	-0.45	-0.38	-0.28	-0.32	-0.36	0.13	0.21	0.41
Lsat_1_v5_gn_1_59740.1 (HOZ)	-0.96	-0.97	-1.47	-1.64	1.1	0.82	-0.93	-1.0	-1.15	-1.24	-1.14	-1.38	0.04	0.96	0.92	-0.26	-0.94	1.55	-0.28	-1.15	-0.69	-0.56	2.54	-0.7	-0.73	-0.65	-0.55	-0.41	-0.45	-0.77	-0.97
Lsat_1_v5_gn_1_63140.1 (AtCDC48C)	-0.12	-0.26	-0.36	-0.25	0.4	0.25	-0.39	-0.18	-0.42	-0.36	-0.19	-0.34	0.44	0.35	0.21	-0.09	-0.2	0.64	-0.23	-0.43	-0.29	-0.23	1.06	-0.21	-0.16	-0.23	-0.29	-0.09	0.13	0.07	0.33
Lsat_1_v5_gn_1_63160.1 (AtCDC48C)	-0.18	-0.35	-0.48	-0.42	0.41	0.27	-0.38	-0.3	-0.37	-0.39	-0.3	-0.34	0.36	0.5	0.34	-0.09	-0.17	0.6	-0.14	-0.35	-0.22	-0.17	1.01	-0.21	-0.15	-0.23	-0.28	-0.06	0.17	0.08	0.34
Lsat_1_v5_gn_1_72020.1	-0.36	-0.41	-0.44	-0.38	0.48	0.39	-0.3	-0.32	-0.48	-0.43	-0.18	-0.23	0.38	0.55	0.48	0.1	-0.22	0.5	0.03	-0.37	-0.24	-0.21	0.97	-0.25	-0.2	-0.13	-0.2	-0.13	0.12	-0.05	0.04
Lsat_1_v5_gn_1_72861.1 (GR1)	-0.31	-0.51	-0.77	-0.76	0.15	0.21	-0.19	-0.11	-0.52	-0.43	-0.34	-0.4	0.05	0.62	0.4	-0.16	-0.24	0.92	0.07	-0.3	-0.19	-0.19	1.42	-0.16	-0.17	-0.29	-0.21	-0.26	0.04	-0.04	0.18
Lsat_1_v5_gn_1_78160.1	-0.46	-0.43	-0.71	-0.64	0.6	0.32	-0.74	-0.57	-0.57	-0.71	-0.38	-0.64	-0.44	0.9	0.55	-0.1	-0.46	1.11	-0.03	-0.63	-0.36	-0.48	1.69	-0.47	-0.35	-0.39	-0.45	-0.56	0.26	0.07	0.5
Lsat_1_v5_gn_1_9460.1 (MUD1)	-0.55	-0.74	-0.81	-0.71	0.33	0.25	-0.58	-0.54	-0.46	-0.44	-0.42	-0.42	0.5	0.52	0.57	-0.01	-0.16	0.7	-0.1	-0.33	-0.26	-0.22	1.51	-0.18	-0.19	-0.25	-0.3	0.02	0.08	0.03	0.19
Lsat_1_v5_gn_2_107241.1 (RAX2)	-2.21	-2.03	-1.83	-1.39	0.42	0.32	-0.63	-0.63	-0.52	-0.55	-0.07	-0.41	-0.76	0.6	0.6	-0.34	-0.45	1.61	0.12	-0.42	-0.82	-0.43	2.46	-0.82	-0.93	-0.3	-0.76	-0.65	-0.28	-0.13	0.28
Lsat_1_v5_gn_2_114260.1 (VMA10)	-0.4	-0.63	-0.58	-0.53	0.36	0.4	-0.2	-0.39	-0.43	-0.38	-0.36	-0.41	0.16	0.07	0.06	-0.11	-0.11	0.91	-0.17	-0.32	-0.22	-0.06	1.36	-0.25	-0.11	-0.1	-0.06	0.11	0.16	0.07	0.03
Lsat_1_v5_gn_2_129181.1 (RIN2)	-1.02	-0.84	-0.93	-0.63	0.32	0.32	-0.42	-0.45	-0.3	-0.34	-0.26	-0.35	-0.3	0.7	0.6	-0.17	-0.41	1.08	-0.24	-0.44	-0.45	-0.34	1.84	-0.51	-0.43	-0.35	-0.18	-0.6	0.14	0.08	0.34
Lsat_1_v5_gn_2_22600.1	-0.59	-0.77	-0.47	-0.52	0.2	0.25	-0.28	-0.28	-0.66	-0.61	-0.41	-0.56	-0.07	0.48	0.31	-0.41	-0.51	1.09	-0.05	-0.32	-0.35	-0.2	1.81	-0.24	-0.35	-0.27	-0.2	-0.58	-0.01	0.05	0.59
Lsat_1_v5_gn_2_22661.1 (ATERDJ2A)	-0.6	-0.63	-0.67	-0.25	-0.01	0.1	-0.31	-0.39	-0.31	-0.23	-0.2	-0.22	0.41	0.53	0.3	0.04	-0.05	0.97	-0.1	-0.2	-0.26	-0.14	1.29	-0.19	-0.18	-0.11	-0.25	-0.13	-0.13	-0.12	-0.01
Lsat_1_v5_gn_2_48100.1 (E1B1)	-0.38	-0.53	-0.39	0.04	0.75	0.55	-0.61	-0.55	-0.67	-0.57	-0.47	-0.62	-0.3	0.74	0.58	-0.13	-0.59	0.96	-0.26	-0.64	-0.48	-0.45	1.94	-0.66	-0.6	-0.52	-0.36	-0.68	0.16	-0.04	-0.23
Lsat_1_v5_gn_2_67861.1 (XRN4)	-0.28	-0.26	-0.32	0.01	0.18	0.04	-0.26	-0.13	-0.28	-0.27	-0.19	-0.38	0.06	0.55	0.46	-0.11	-0.11	0.95	-0.06	-0.27	-0.36	-0.35	0.97	-0.25	-0.27	-0.21	-0.25	-0.15	0.09	0.02	-0.03
Lsat_1_v5_gn_2_71501.1 (CYP72A7)	-1.09	-0.57	-1.95	-2.22	0.86	0.92	-0.39	0.21	-1.21	-1.32	-0.8	-1.38	-1.37	1.16	0.85	-0.47	-1.03	1.69	0.03	-0.83	-0.88	-0.72	2.13	-0.33	-0.55	-0.97	-0.77	-0.79	-0.01	0.01	-0.25
Lsat_1_v5_gn_2_72161.1	-1.44	-1.15	-2.08	-2.02	0.42	-0.01	-0.32	-0.09	-0.67	-0.59	-0.55	-0.55	0.05	0.71	0.95	-0.02	-0.08	1.0	-0.26	-0.71	-0.55	-0.47	2.4	-0.65	-0.71	-0.63	-0.39	-0.5	-0.2	0.0	0.09
Lsat_1_v5_gn_2_73501.1 (DSK2)	-0.38	-0.4	-0.48	-0.52	0.5	0.26	-0.56	-0.66	-0.54	-0.64	-0.49	-0.62	0.05	0.5	0.43	-0.09	-0.22	1.05	-0.19	-0.47	-0.36	-0.24	1.81	-0.35	-0.31	-0.3	-0.29	-0.07	0.02	-0.13	-0.06
Lsat_1_v5_gn_2_80860.1	-0.67	-0.46	-0.72	-0.83	0.46	0.28	-0.37	-0.5	-0.65	-0.6	-0.53	-0.47	0.09	0.62	0.54	-0.08	-0.1	1.17	-0.07	-0.43	-0.33	-0.26	1.68	-0.37	-0.31	-0.38	-0.25	-0.21	-0.04	-0.17	0.06
Lsat_1_v5_gn_2_82920.1 (pCK2)	-0.54	-0.68	-0.65	-0.51	0.09	0.19	-0.22	-0.11	-0.48	-0.32	-0.23	-0.28	0.64	0.45	0.32	0.11	-0.02	0.78	-0.13	-0.2	-0.19	-0.31	1.16	-0.26	-0.11	-0.12	-0.18	-0.03	-0.05	-0.22	0.17
Lsat_1_v5_gn_2_9160.1 (FREE1)	-0.47	-0.32	-0.43	-0.33	0.39	0.15	-0.46	-0.56	-0.37	-0.41	-0.36	-0.42	0.07	0.72	0.42	-0.06	-0.17	1.01	-0.24	-0.54	-0.46	-0.36	1.76	-0.63	-0.41	-0.36	-0.34	-0.49	-0.06	-0.04	0.15
Lsat_1_v5_gn_3_115720.1 (CYCLINC1-1)	-0.66	-0.43	-0.66	-0.6	0.57	0.54	-0.67	-0.38	-0.63	-0.71	-0.27	-0.71	-0.21	1.07	0.59	-0.31	-0.84	1.08	0.22	-0.75	-0.83	-0.65	1.84	-0.58	-0.67	-0.52	-0.44	-0.92	0.14	0.12	0.45
Lsat_1_v5_gn_3_12881.1 (RPN12a)	-0.3	-0.54	-0.61	-0.38	0.48	0.31	-0.43	-0.36	-0.42	-0.48	-0.3	-0.32	0.52	0.16	0.27	-0.18	-0.23	0.85	-0.32	-0.39	-0.34	-0.25	1.52	-0.22	-0.2	-0.28	-0.36	-0.03	-0.05	-0.11	0.36
Lsat_1_v5_gn_3_132060.1 (PAT14)	-1.16	-0.72	-1.06	-0.7	0.07	0.1	-0.48	-0.53	-0.52	-0.31	-0.46	-0.44	0.19	0.61	0.62	-0.17	-0.3	1.37	-0.36	-0.42	-0.63	-0.59	1.99	-0.52	-0.53	-0.55	-0.53	-0.67	0.05	-0.02	0.7
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.