Heatmap: Cluster_204 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_18400.1	0.69	0.3	0.18	0.11	0.25	0.33	0.31	0.09	0.13	0.09	0.08	0.01	-0.26	-0.15	-0.17	0.05	0.07	-2.3	-0.09	-0.04	0.03	0.1	-1.1	-0.04	-0.0	0.06	0.07	0.19	-0.26	-0.24	-0.52
Lsat_1_v5_gn_0_5321.1 (PGR1)	0.61	0.33	0.25	0.18	-0.19	-0.04	0.14	0.16	0.17	0.1	0.15	0.2	-0.03	-0.25	-0.18	0.12	0.16	-3.04	0.04	0.09	0.12	0.07	-1.98	0.12	0.08	0.09	0.13	0.19	-0.14	-0.2	-0.66
Lsat_1_v5_gn_1_103141.1 (RER4)	0.41	0.14	0.14	0.13	0.52	0.15	0.09	0.04	0.17	0.15	0.21	0.22	-0.16	-0.43	-0.26	-0.02	0.06	-2.66	-0.12	0.02	0.06	0.07	-2.33	0.18	0.13	0.1	0.14	0.43	-0.15	-0.14	-0.43
Lsat_1_v5_gn_1_14260.1 (RPE)	0.61	0.35	0.31	0.29	0.2	0.1	0.05	0.07	0.13	0.13	0.19	0.21	-0.15	-0.23	-0.27	-0.13	-0.03	-2.22	0.21	-0.03	-0.03	0.01	-1.54	0.07	0.03	-0.08	0.01	0.25	-0.1	-0.07	-0.53
Lsat_1_v5_gn_1_34201.1	0.96	0.39	0.3	0.22	0.36	0.22	0.2	0.2	0.22	0.17	0.12	0.26	-0.25	-0.89	-0.44	-0.05	0.12	-3.99	-0.08	0.04	0.13	0.11	-3.61	0.03	0.05	0.06	0.08	0.53	-0.28	-0.47	-1.21
Lsat_1_v5_gn_1_89341.1	0.54	0.32	0.26	0.21	0.11	0.02	-0.06	-0.07	0.25	0.16	0.17	0.19	-0.27	0.08	-0.08	-0.09	-0.05	-2.51	-0.1	-0.04	0.07	0.03	-1.63	0.02	0.04	0.05	0.11	0.08	-0.03	-0.02	-0.03
Lsat_1_v5_gn_1_9760.1 (ATM4)	0.7	0.36	0.07	-0.17	-0.04	0.01	0.17	0.34	0.27	0.2	0.15	0.24	-0.18	-0.57	-0.28	0.04	0.11	-4.06	0.07	0.12	0.21	0.19	-2.7	0.26	0.18	0.15	0.18	0.3	-0.27	-0.23	-0.89
Lsat_1_v5_gn_2_103001.1 (VTE5)	0.53	0.28	0.17	0.09	-0.29	-0.01	0.16	0.1	0.2	0.16	0.14	0.11	-0.12	-0.57	-0.57	-0.03	0.03	-1.77	-0.06	0.03	0.14	0.27	-0.93	0.06	0.11	0.24	0.25	0.15	-0.04	-0.06	-0.36
Lsat_1_v5_gn_2_118741.1 (RCA)	0.41	0.39	0.29	0.17	-0.18	-0.18	0.27	0.16	0.23	0.2	0.23	0.19	-0.26	-0.49	-0.15	0.18	0.17	-3.65	0.11	0.1	0.13	0.08	-2.84	0.07	0.06	-0.01	-0.02	0.03	0.07	0.1	-0.26
Lsat_1_v5_gn_2_37440.1 (HDA14)	0.39	0.29	0.01	-0.09	-0.01	0.17	0.26	0.06	0.21	0.16	0.2	0.09	-0.4	0.01	0.27	0.18	0.19	-2.4	0.05	0.19	0.14	0.07	-1.61	0.01	-0.01	0.06	0.12	0.14	-0.2	-0.24	-0.6
Lsat_1_v5_gn_3_10861.1 (NdhS)	0.29	0.36	0.52	0.43	-0.34	-0.11	0.33	0.08	0.28	0.3	0.22	0.13	-0.59	-0.49	-0.31	-0.03	-0.04	-2.45	0.04	0.06	-0.03	-0.02	-0.71	-0.02	0.07	-0.1	-0.08	0.18	0.17	0.15	-0.44
Lsat_1_v5_gn_3_11160.1 (PSAD1)	0.19	0.26	0.3	0.31	0.05	-0.08	0.1	0.03	0.15	0.18	0.18	0.13	-0.5	-0.95	-0.41	0.07	0.03	-2.9	0.32	0.26	0.22	0.17	-2.42	0.15	0.19	0.11	0.11	0.18	0.14	0.15	-0.34
Lsat_1_v5_gn_3_124261.1 (NDH18)	0.55	0.37	0.18	0.07	0.17	0.0	0.25	0.15	0.21	0.19	0.22	0.14	-0.22	-0.22	-0.01	-0.14	-0.07	-3.5	-0.05	-0.04	-0.0	0.04	-0.93	0.01	0.02	0.06	0.04	0.05	-0.0	0.0	-0.33
Lsat_1_v5_gn_3_19641.1	0.48	0.23	0.19	0.12	-0.11	-0.12	-0.09	-0.07	0.13	0.05	0.19	0.23	0.17	-0.03	-0.17	0.01	0.16	-1.74	0.05	0.05	0.07	0.06	-1.88	0.16	0.15	-0.07	-0.05	0.37	-0.13	-0.15	-0.13
Lsat_1_v5_gn_3_24441.1 (GLDP1)	0.73	0.37	0.17	-0.13	0.1	-0.16	0.18	-0.02	0.15	0.01	0.04	-0.01	-0.02	-0.14	0.08	0.1	0.16	-3.14	0.14	0.09	0.07	0.03	-3.38	0.05	0.03	-0.04	-0.07	0.2	0.08	0.05	-0.05
Lsat_1_v5_gn_3_29100.1 (PSBY)	0.12	0.22	0.37	0.33	-0.39	-0.54	-0.02	-0.11	0.33	0.34	0.33	0.39	-0.26	-0.74	-0.45	0.06	0.15	-2.77	0.2	0.23	0.21	0.15	-2.9	0.18	0.17	0.15	0.1	0.13	0.07	0.15	-0.22
Lsat_1_v5_gn_3_46681.1 (APX3)	0.51	0.16	0.12	-0.04	0.3	0.3	-0.0	-0.01	-0.05	-0.09	0.02	-0.04	-0.09	-0.12	-0.09	0.12	0.02	-1.6	0.07	-0.04	0.08	0.14	-0.71	0.03	0.03	0.02	0.04	0.18	0.08	-0.01	-0.39
Lsat_1_v5_gn_3_73300.1 (FNR1)	0.76	0.36	0.28	0.18	0.38	0.29	0.07	0.14	0.04	0.02	0.13	0.11	-0.19	-0.21	-0.24	-0.21	-0.11	-3.26	0.04	-0.05	-0.0	0.1	-1.92	0.12	0.09	-0.05	0.05	0.46	-0.19	-0.2	-0.56
Lsat_1_v5_gn_4_153081.1 (APE1)	0.71	0.44	0.27	0.19	0.06	-0.05	0.23	0.31	0.06	-0.01	0.09	0.09	-0.02	-0.06	-0.15	-0.07	0.0	-2.26	-0.17	-0.01	-0.04	0.01	-1.1	0.08	0.04	-0.04	0.0	0.25	-0.07	-0.12	-0.66
Lsat_1_v5_gn_4_153980.1 (RBCS1A)	0.19	0.04	0.12	0.16	-0.42	-0.49	0.09	0.02	0.33	0.31	0.24	0.35	-0.1	-0.63	-0.32	0.18	0.35	-3.66	0.24	0.33	0.22	0.12	-2.79	0.24	0.19	0.12	0.16	0.09	-0.08	0.06	-0.25
Lsat_1_v5_gn_4_156361.1 (STM)	0.66	0.5	0.35	0.16	0.33	0.18	0.08	0.0	0.14	0.08	0.1	0.06	-0.38	-0.38	-0.19	-0.05	-0.03	-3.49	0.28	0.01	0.02	0.02	-1.19	0.01	-0.04	-0.06	-0.08	0.05	0.05	0.03	-0.34
Lsat_1_v5_gn_5_120941.1 (GOX1)	0.7	0.32	0.24	0.1	-0.17	0.13	0.19	0.14	0.15	0.06	0.15	0.17	0.03	-0.57	-0.43	0.06	0.14	-3.42	-0.03	0.05	0.17	0.15	-1.96	0.16	0.17	0.13	0.11	0.3	-0.2	-0.12	-0.67
Lsat_1_v5_gn_5_130901.1 (PSAH-1)	0.29	0.31	0.38	0.29	-0.12	-0.36	0.06	-0.11	0.38	0.36	0.34	0.4	-0.33	-1.41	-0.5	0.08	0.11	-3.22	0.05	0.25	0.18	0.11	-3.6	0.14	0.12	0.15	0.13	0.26	0.11	0.11	-0.32
Lsat_1_v5_gn_5_158001.1 (GLUS)	0.61	0.48	0.33	0.19	-0.07	-0.08	0.17	0.09	0.09	0.05	0.11	0.14	0.22	-0.13	-0.33	-0.05	0.12	-3.49	-0.02	-0.13	-0.05	0.01	-1.45	0.04	0.04	-0.06	-0.11	0.15	-0.07	0.12	-0.06
Lsat_1_v5_gn_5_168921.1 (ALB3)	0.45	0.25	0.16	0.15	0.19	0.17	0.06	0.05	0.1	0.07	0.13	0.07	-0.15	-0.2	-0.27	0.08	-0.05	-1.75	0.19	0.04	0.06	0.06	-1.34	0.05	0.01	0.06	0.04	0.12	0.07	0.02	-0.39
Lsat_1_v5_gn_5_34621.1	0.65	0.38	0.33	0.29	-0.06	-0.5	0.06	-0.16	0.38	0.28	0.27	0.31	0.09	-0.54	-0.27	-0.14	0.14	-4.15	-0.11	0.13	0.02	0.0	-2.72	0.16	0.08	-0.04	0.04	0.26	-0.22	-0.03	0.06
Lsat_1_v5_gn_5_61061.1 (FBN6)	0.38	0.21	0.36	0.31	-0.18	0.09	0.35	0.18	0.12	0.15	0.13	0.03	-0.25	-0.35	-0.3	-0.09	-0.03	-2.5	0.12	0.0	0.07	0.12	-1.52	0.05	0.08	0.12	0.02	0.08	-0.01	0.07	-0.07
Lsat_1_v5_gn_5_77601.1 (GS2)	0.58	0.37	0.31	0.25	-0.49	-0.21	0.21	-0.02	0.27	0.24	0.31	0.35	0.18	-1.2	-0.89	0.08	0.24	-3.84	-0.08	0.12	0.19	0.2	-4.58	0.21	0.24	0.18	0.12	0.38	-0.22	-0.06	-0.51
Lsat_1_v5_gn_5_8240.1 (NDF1)	0.6	0.33	0.23	0.18	0.08	0.1	0.18	0.04	0.15	0.13	0.25	0.19	0.02	-0.3	-0.09	0.11	0.09	-3.63	0.04	0.01	0.07	0.11	-2.4	0.04	0.05	0.02	0.1	0.3	-0.29	-0.2	-0.53
Lsat_1_v5_gn_5_90580.1	0.65	0.34	0.27	0.26	0.24	0.14	0.22	0.17	0.13	0.16	0.18	0.14	-0.16	-0.45	-0.26	-0.03	0.04	-2.97	0.03	-0.01	-0.03	0.1	-1.58	0.01	0.07	-0.05	-0.02	0.36	-0.05	-0.16	-0.76
Lsat_1_v5_gn_5_9161.1	0.58	0.29	0.3	0.11	-0.22	0.05	0.4	0.29	0.1	0.18	0.14	0.21	0.03	-0.45	-0.33	0.07	0.13	-3.18	-0.07	-0.02	-0.02	0.12	-2.74	0.13	0.14	0.14	0.14	0.33	-0.19	-0.15	-0.55
Lsat_1_v5_gn_6_17740.1 (PRK)	0.63	0.35	0.27	0.13	0.06	0.11	0.19	0.11	0.22	0.18	0.23	0.21	-0.16	-0.56	-0.3	-0.0	0.06	-3.49	0.06	0.02	0.05	0.12	-2.57	0.1	0.04	0.0	0.04	0.3	-0.08	-0.02	-0.42
Lsat_1_v5_gn_6_67720.1	0.49	0.24	0.24	0.24	0.07	0.04	0.26	0.14	0.2	0.22	0.16	0.17	0.02	-0.42	-0.19	0.06	0.12	-2.74	0.03	0.04	-0.02	0.05	-1.66	0.02	0.06	0.01	0.02	0.21	-0.13	-0.1	-0.43
Lsat_1_v5_gn_6_80041.1	0.42	0.26	0.11	0.13	0.38	0.27	0.08	0.03	0.02	0.04	0.09	0.03	-0.14	-0.09	-0.04	-0.07	-0.1	-1.94	0.02	0.02	-0.08	0.04	-0.76	0.11	-0.01	-0.01	-0.03	0.19	-0.07	-0.16	-0.03
Lsat_1_v5_gn_6_85860.1	0.43	0.39	0.37	0.28	0.04	-0.16	0.3	0.2	0.34	0.25	0.24	0.22	-0.25	-0.29	-0.21	-0.16	-0.07	-2.61	-0.2	0.0	0.08	0.04	-1.79	0.02	0.06	0.09	0.04	0.12	-0.1	-0.05	-0.31
Lsat_1_v5_gn_6_99680.1 (FBP)	0.63	0.28	0.12	-0.18	-0.16	-0.06	0.29	0.49	0.2	0.11	0.13	0.06	-0.24	-0.04	0.18	-0.07	0.02	-3.52	0.11	0.1	0.06	0.12	-2.47	0.13	0.04	0.04	0.08	0.16	-0.16	-0.1	-0.35
Lsat_1_v5_gn_7_16100.1 (ATPC1)	0.59	0.34	0.3	0.19	-0.14	-0.08	0.14	-0.01	0.2	0.16	0.16	0.2	-0.12	-0.59	-0.43	-0.01	0.13	-3.28	0.22	0.15	0.14	0.15	-1.66	0.22	0.15	0.04	0.05	0.44	-0.2	-0.2	-0.68
Lsat_1_v5_gn_7_65521.1 (ADG2)	0.46	0.34	0.32	0.24	-0.05	-0.07	0.42	0.25	0.18	0.21	0.16	0.19	-0.08	-0.33	-0.18	-0.05	0.08	-2.88	0.11	0.09	0.01	0.06	-2.76	0.01	0.02	-0.01	-0.07	0.31	-0.16	-0.08	-0.35
Lsat_1_v5_gn_7_85921.1 (PSAO)	0.16	0.28	0.48	0.51	0.14	-0.19	0.24	0.12	0.41	0.47	0.43	0.42	-0.46	-1.96	-0.72	0.12	0.11	-3.53	0.0	0.19	0.07	0.04	-2.88	-0.01	0.05	0.08	0.07	0.18	-0.0	0.09	-0.56
Lsat_1_v5_gn_7_99221.1 (LHCA3)	0.21	0.44	0.52	0.56	0.07	-0.23	0.3	0.25	0.31	0.35	0.26	0.24	-0.56	-1.4	-0.61	-0.03	0.06	-3.3	0.04	0.17	0.06	0.02	-3.14	0.04	0.05	0.03	0.01	0.04	0.17	0.2	-0.29
Lsat_1_v5_gn_8_12460.1 (EGY2)	0.57	0.18	0.26	0.46	-0.05	-0.18	-0.26	0.01	0.22	0.18	0.39	0.43	0.23	-0.74	-0.64	-0.13	-0.0	-2.2	0.03	0.01	-0.06	0.07	-2.88	0.27	0.13	0.0	0.16	0.48	-0.36	-0.15	-0.08
Lsat_1_v5_gn_8_44241.1 (NdhL)	0.47	0.36	0.3	0.28	-0.06	-0.06	0.12	0.05	0.16	0.15	0.16	0.19	-0.14	-0.2	-0.12	-0.13	-0.02	-2.36	0.09	0.01	0.08	0.08	-1.81	0.1	0.12	0.07	0.12	0.12	-0.18	-0.12	-0.11
Lsat_1_v5_gn_8_61000.1	0.9	0.56	0.36	0.3	0.22	0.0	0.22	0.45	0.04	-0.07	0.02	0.05	-0.2	-0.08	-0.16	-0.26	-0.15	-2.29	-0.03	-0.13	-0.03	-0.0	-0.86	-0.05	-0.02	-0.11	-0.1	0.23	-0.21	-0.28	-0.57
Lsat_1_v5_gn_8_99200.1 (NdhN)	0.61	0.19	0.11	0.07	-0.01	-0.02	0.07	-0.02	0.21	0.2	0.24	0.18	-0.04	-0.33	-0.17	0.08	0.18	-2.88	-0.0	0.14	0.1	0.13	-1.67	0.14	0.1	0.1	0.16	0.3	-0.23	-0.22	-0.51
Lsat_1_v5_gn_9_15700.1 (NdhV)	0.46	0.16	0.08	-0.04	0.12	-0.1	0.14	0.09	0.23	0.26	0.2	0.19	-0.19	-0.05	0.17	0.08	0.11	-2.94	0.2	0.19	0.1	0.1	-2.08	0.04	0.01	0.02	0.05	0.19	-0.07	-0.18	-0.58
Lsat_1_v5_gn_9_16861.1 (PSAL)	0.46	0.23	0.27	0.23	0.15	-0.1	0.08	0.06	0.24	0.25	0.23	0.32	-0.13	-0.82	-0.43	-0.02	0.13	-3.25	0.08	0.19	0.11	0.06	-2.14	0.25	0.15	0.09	0.11	0.28	-0.1	-0.13	-0.57
Lsat_1_v5_gn_9_41341.1	0.63	0.46	0.37	0.2	0.37	0.18	-0.0	0.04	0.07	-0.07	0.12	-0.02	-0.17	-0.1	-0.09	-0.05	-0.16	-1.92	0.15	-0.0	0.02	-0.03	-1.1	-0.11	-0.09	-0.01	-0.01	0.18	0.09	-0.14	-0.52
Lsat_1_v5_gn_9_46781.1	0.38	0.17	0.19	0.26	0.11	0.03	0.16	0.13	0.18	0.22	0.17	0.2	-0.13	-0.45	-0.2	0.1	0.13	-2.42	0.21	0.05	0.05	0.0	-1.3	0.09	0.12	0.01	-0.02	0.2	-0.06	-0.11	-0.53

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.