Heatmap: Cluster_1 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_11880.1 (SDHAF1)	0.16	0.0	0.0	0.14	0.1	0.0	0.5	0.26	0.31	0.0	0.61	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.69	0.0	0.32	0.5	0.14	0.0	0.21	0.21	0.0	0.0	0.33	0.11	0.32	0.49
Lsat_1_v5_gn_0_22380.1 (EXO70B1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_0_27401.1 (AT-IE)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_116380.1 (QWRF2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_119941.1	0.0	0.0	0.2	0.22	0.34	1.0	0.0	0.19	0.35	0.76	0.94	0.74	0.0	0.97	0.34	0.17	0.46	0.77	0.0	0.0	0.15	0.0	0.38	0.0	0.14	0.13	0.13	0.31	0.32	0.29	0.14
Lsat_1_v5_gn_1_3360.1 (WAKL1)	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_34700.1	0.08	0.1	0.08	0.02	0.81	0.46	0.09	0.16	0.16	0.08	0.19	0.08	0.21	1.0	0.6	0.07	0.13	0.51	0.4	0.06	0.29	0.22	0.15	0.15	0.18	0.26	0.17	0.13	0.24	0.13	0.24
Lsat_1_v5_gn_1_40741.1	0.11	0.11	0.0	0.0	0.08	0.4	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	1.0	0.09	0.0	0.31	0.94	0.56	0.0	0.23	0.0	0.0	0.15	0.08	0.33	0.0	0.0	0.09	0.1	0.24
Lsat_1_v5_gn_1_67660.1 (PFK3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_87081.1 (ASG7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_8860.1 (DAG2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18
Lsat_1_v5_gn_2_111921.1 (AGL40)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.57	0.1	0.11	0.0	0.2	0.0	0.44	0.0	1.0	0.22	0.11	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.1	0.1	0.0	0.19
Lsat_1_v5_gn_2_115621.1 (bHLH010)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_131621.1 (RH11)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_44960.1 (TCU1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43
Lsat_1_v5_gn_3_107080.1 (Kin7.4)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_130621.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_54121.1 (NUDT22)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.36	0.98	0.8	0.0	0.0	0.29	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.21	1.0
Lsat_1_v5_gn_3_66781.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.38	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.96	0.0	0.0	0.0	1.0	0.2	0.0	0.46	0.0	0.41	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	0.28	0.34	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_67820.1 (STI)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_128580.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_13281.1 (PKS11)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_161140.1 (NRX2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_42240.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	1.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54
Lsat_1_v5_gn_4_51400.1 (EMB2758)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_52220.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.2	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	1.0	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.78
Lsat_1_v5_gn_4_60381.1 (RNJ)	0.13	0.04	0.04	0.0	0.02	0.16	0.13	0.24	0.37	0.38	0.0	0.24	0.27	0.69	0.49	0.34	0.25	0.32	0.26	0.25	0.15	0.33	1.0	0.11	0.04	0.33	0.0	0.14	0.12	0.54	0.73
Lsat_1_v5_gn_4_79021.1	0.53	0.0	0.0	0.0	0.17	0.54	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.24	1.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.0	0.22	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_84380.1 (LFY)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.04	0.08	0.21	0.07	0.0	0.0	0.07	0.03	0.79	0.42	0.04	0.07	1.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.17	0.09	0.0	0.07	0.03	0.13	0.13
Lsat_1_v5_gn_4_99421.1 (PDR1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_152620.1 (PSAA)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_166240.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_16661.1 (NLP6)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.82
Lsat_1_v5_gn_5_4000.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_53180.1 (LLR2)	0.02	0.43	0.05	0.24	0.04	0.3	0.05	0.02	0.02	0.02	0.72	0.19	0.08	1.0	0.02	0.21	0.01	0.03	0.0	0.02	0.09	0.3	0.11	0.01	0.24	0.0	0.21	0.0	0.03	0.01	0.23
Lsat_1_v5_gn_5_84721.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_94200.1 (ALKBH6)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.26	0.75	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Lsat_1_v5_gn_5_95200.1 (NOT3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.61	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.26	0.27
Lsat_1_v5_gn_6_29401.1	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.16	0.29	0.41	0.0	0.77	0.31	0.37	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_36421.1 (NAP4)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_53880.1	0.0	0.16	0.0	0.08	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84	0.54	0.02	1.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.06	0.0	0.0	0.11	0.0	0.22	0.0	0.06	0.0	0.39
Lsat_1_v5_gn_6_67241.1 (HGL1)	0.1	0.0	0.0	0.14	0.12	0.5	0.0	0.05	0.05	0.32	0.19	0.08	0.67	0.8	0.43	0.17	0.0	0.0	0.08	0.04	0.29	0.43	1.0	0.12	0.08	0.29	0.0	0.12	0.09	0.17	0.43
Lsat_1_v5_gn_6_72441.1 (BBX30)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_93061.1 (PAT1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	1.0	0.17	0.0	0.03	0.0	0.0	0.05	0.07	0.0	0.06	0.0	0.0	0.03	0.0	0.03	0.03	0.05	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_17941.1 (PetM)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.12	0.0	1.0	0.31	0.0	0.0	0.11	0.31	0.07	0.03	0.0	0.0	0.18	0.04	0.0	0.15	0.0	0.17	0.15	0.05
Lsat_1_v5_gn_7_18700.1 (SEH)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.73	0.0	0.0	0.0	0.66
Lsat_1_v5_gn_7_38040.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_75721.1 (IMPA-2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_85660.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.18	0.15	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.51	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_113721.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_142981.1 (CTR1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.79	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32
Lsat_1_v5_gn_8_26780.1 (MEE32)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_48460.1 (SMG7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_54540.1 (ACO1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.43	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22
Lsat_1_v5_gn_8_59300.1	0.0	0.0	0.02	0.0	0.62	0.31	0.08	0.02	0.19	0.13	0.19	0.08	0.17	1.0	0.17	0.06	0.11	0.53	0.14	0.15	0.24	0.37	0.18	0.16	0.15	0.21	0.12	0.07	0.07	0.05	0.17
Lsat_1_v5_gn_8_67001.1 (AXR6)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_89261.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.77	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_8_95521.1 (PFK5)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.15	1.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.12	0.12
Lsat_1_v5_gn_9_3120.1 (SYD)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_53001.1 (OXR2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74	0.0	0.0	0.0	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.74
Lsat_1_v5_gn_9_58161.1 (AHG3)	0.0	0.0	0.54	0.0	0.29	0.14	0.19	0.0	0.0	0.14	0.66	0.0	0.0	1.0	0.0	0.16	0.39	0.0	0.0	0.0	0.51	0.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.57
Lsat_1_v5_gn_9_9820.1 (MAP18)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)