1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_1 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.04 0.02 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.04 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.03 0.01 0.03 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.07 0.0 0.01 0.02 0.05 0.07 0.05 0.0 0.07 0.02 0.01 0.03 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
2.14 2.74 2.03 0.62 21.49 12.32 2.36 4.23 4.32 2.23 4.98 2.19 5.62 26.61 16.02 1.81 3.56 13.5 10.72 1.47 7.79 5.77 4.09 3.94 4.78 6.81 4.44 3.55 6.33 3.46 6.31
0.02 0.02 0.0 0.0 0.01 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.14 0.01 0.0 0.04 0.13 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.01 0.05 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.03 0.03 0.0 0.05 0.0 0.12 0.0 0.26 0.06 0.03 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.03 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.12 0.1 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.11 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.28 0.06 0.0 0.13 0.0 0.12 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.08 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.37 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.03 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.16 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13
1.03 0.35 0.34 0.0 0.19 1.33 1.07 2.0 3.03 3.12 0.0 1.95 2.2 5.7 4.03 2.77 2.01 2.65 2.17 2.03 1.2 2.72 8.21 0.91 0.3 2.67 0.0 1.15 0.95 4.42 5.98
0.68 0.0 0.0 0.0 0.22 0.69 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.3 1.29 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.28 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.05 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.2 0.11 0.01 0.02 0.26 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.02 0.0 0.02 0.01 0.03 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 3.27 0.37 1.84 0.28 2.28 0.38 0.14 0.18 0.17 5.57 1.5 0.63 7.68 0.12 1.63 0.05 0.22 0.0 0.14 0.72 2.31 0.88 0.09 1.82 0.0 1.58 0.0 0.2 0.05 1.74
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.17 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.18 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.08 0.08
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.01 0.03 0.04 0.0 0.07 0.03 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.34 0.0 1.12 0.0 2.29 0.0 0.0 0.0 0.0 12.55 8.07 0.36 14.97 0.0 5.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.96 0.0 0.0 1.6 0.0 3.24 0.0 0.89 0.0 5.83
0.12 0.0 0.0 0.17 0.15 0.61 0.0 0.06 0.06 0.39 0.22 0.09 0.81 0.96 0.52 0.2 0.0 0.0 0.1 0.05 0.35 0.51 1.2 0.15 0.1 0.35 0.0 0.14 0.11 0.21 0.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 1.77 0.31 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.12 0.0 0.1 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.05 0.09 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.34 0.11 0.0 0.0 0.04 0.1 0.03 0.01 0.0 0.0 0.06 0.01 0.0 0.05 0.0 0.06 0.05 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.02 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.05 0.0 1.7 0.85 0.22 0.05 0.52 0.36 0.52 0.23 0.46 2.74 0.47 0.17 0.29 1.45 0.39 0.41 0.64 1.01 0.5 0.45 0.4 0.58 0.34 0.2 0.2 0.14 0.47
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.21 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 1.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83
0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.09 0.0 0.0 0.13 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)