Heatmap: Cluster_150 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_14781.1 (LUC7B)	-0.36	-0.42	-0.64	-0.63	0.0	0.2	0.12	0.45	-0.37	-0.39	-0.32	-0.33	0.28	0.61	0.4	0.05	-0.01	0.29	-0.17	-0.19	-0.2	-0.08	0.48	-0.07	-0.16	-0.15	-0.1	-0.18	0.24	0.06	0.47
Lsat_1_v5_gn_0_19560.1	-1.07	-0.36	-1.91	-1.78	-0.36	-0.05	-0.32	0.57	-1.17	-1.04	-0.76	-0.24	0.92	1.26	0.36	-0.16	-0.16	0.03	-0.62	-0.52	-0.47	-0.12	1.04	-0.07	-0.26	-0.35	-0.43	-0.37	0.57	0.27	1.37
Lsat_1_v5_gn_0_47341.1 (CFM9)	-0.63	-0.46	-1.02	-0.68	0.03	0.26	-0.0	0.41	-0.88	-0.51	-0.58	-0.33	0.41	0.95	0.45	0.08	-0.06	-0.49	-0.32	-0.46	-0.36	-0.39	0.86	-0.27	-0.23	-0.26	-0.42	-0.15	0.56	0.46	0.99
Lsat_1_v5_gn_0_5300.1 (ABC1K10a)	-0.95	-0.37	-1.08	-1.06	0.31	0.36	-0.05	0.25	-0.56	-0.28	-0.32	-0.17	0.37	0.65	0.48	0.19	0.02	0.04	-0.11	-0.25	-0.14	-0.06	0.82	-0.15	-0.12	-0.09	-0.19	0.02	0.1	0.06	0.36
Lsat_1_v5_gn_1_11560.1	-0.42	-0.23	-0.63	-0.45	-0.07	0.17	0.11	0.48	-0.52	-0.3	-0.27	-0.22	0.29	0.41	0.35	0.07	-0.01	-0.01	0.01	-0.27	-0.2	-0.05	0.74	-0.23	-0.18	-0.04	-0.1	-0.2	0.13	0.13	0.46
Lsat_1_v5_gn_1_11920.1	-0.46	-0.66	-0.84	-0.69	-0.16	0.17	-0.01	0.35	-0.44	-0.4	-0.35	-0.18	0.59	0.51	0.13	0.15	0.1	0.22	-0.25	-0.2	-0.04	0.04	0.71	0.03	-0.05	0.04	-0.09	0.04	-0.12	0.01	0.46
Lsat_1_v5_gn_1_127920.1 (RRM)	-0.49	-0.31	-0.59	-0.44	0.3	0.19	-0.15	0.06	-0.52	-0.47	-0.21	-0.43	0.45	0.72	0.41	-0.06	-0.17	0.02	-0.03	-0.41	-0.35	-0.16	0.74	-0.13	-0.13	-0.19	-0.3	-0.22	0.15	0.24	0.84
Lsat_1_v5_gn_1_13261.1 (NRP2)	-0.84	-0.99	-0.95	-0.82	0.13	0.33	-0.37	0.11	-0.74	-0.47	-0.63	-0.4	0.7	0.99	0.68	-0.05	-0.2	0.46	-0.14	-0.32	-0.28	-0.14	0.5	-0.15	-0.24	-0.35	-0.47	-0.39	0.43	0.26	1.07
Lsat_1_v5_gn_1_27740.1 (BIR6)	-0.97	-0.87	-0.83	-0.69	-0.01	0.29	-0.22	0.27	-0.77	-0.74	-0.63	-0.48	0.59	1.07	0.66	-0.04	-0.26	0.08	-0.26	-0.55	-0.29	-0.2	0.86	-0.12	-0.42	-0.16	-0.52	-0.44	0.39	0.33	1.19
Lsat_1_v5_gn_1_35540.1 (HSP60-3A)	-0.34	-0.54	-1.19	-1.51	-0.02	0.29	-0.3	0.04	-0.61	-0.56	-0.71	-0.13	0.6	0.95	0.49	0.05	-0.01	-0.39	-0.27	-0.68	-0.15	-0.1	0.58	0.08	0.07	-0.01	-0.42	-0.17	0.51	0.36	0.98
Lsat_1_v5_gn_1_38001.1 (Drg1-3)	-0.48	-0.55	-0.76	-0.8	0.27	0.37	0.06	0.39	-0.47	-0.43	-0.32	-0.26	0.38	0.56	0.2	0.02	-0.12	0.19	-0.03	-0.22	-0.13	0.08	0.32	-0.1	-0.07	0.09	0.03	-0.13	0.12	-0.01	0.53
Lsat_1_v5_gn_1_47181.1	-0.46	-0.36	-1.14	-0.86	-0.19	0.02	-0.08	0.26	-0.63	-0.64	-0.34	-0.39	0.62	0.61	0.17	-0.03	0.08	0.48	-0.05	-0.19	-0.21	0.05	0.44	-0.01	-0.03	-0.11	-0.39	-0.12	0.23	0.17	1.01
Lsat_1_v5_gn_1_54021.1 (RH57)	-0.82	-0.75	-0.9	-0.86	-0.09	0.14	0.03	0.75	-0.74	-0.59	-0.66	-0.5	0.83	0.66	0.44	-0.04	0.02	0.3	-0.44	-0.34	-0.43	-0.19	1.21	-0.16	-0.25	-0.24	-0.67	-0.29	0.07	0.0	0.95
Lsat_1_v5_gn_1_6540.1 (eIF5B1)	-0.8	-0.41	-1.16	-0.91	0.17	0.29	0.21	0.47	-0.42	-0.27	-0.23	-0.2	0.47	0.53	0.21	0.13	0.08	-0.24	-0.08	-0.3	-0.17	-0.02	0.75	-0.16	-0.04	-0.05	-0.07	-0.11	0.1	0.06	0.46
Lsat_1_v5_gn_1_85441.1 (NRPD8B)	-0.72	-0.7	-1.24	-1.03	0.22	0.56	-0.74	-0.24	-0.77	-0.83	-0.81	-0.66	0.44	1.23	0.76	-0.35	-0.62	0.31	-0.21	-0.77	-0.21	-0.31	1.24	-0.09	-0.09	-0.38	-0.26	-0.58	0.54	0.3	1.03
Lsat_1_v5_gn_2_107580.1	-2.03	-1.09	-1.92	-1.25	-0.22	0.0	0.1	1.12	-0.93	-0.85	-0.63	-0.29	0.41	1.14	0.61	-0.01	-0.01	-0.2	-0.35	-0.34	-0.4	-0.43	0.9	-0.04	-0.45	-0.39	-0.58	-0.33	0.6	0.47	1.18
Lsat_1_v5_gn_2_112761.1 (EMB2788)	-1.34	-0.92	-1.44	-1.49	0.28	0.4	-0.08	0.76	-1.26	-0.94	-1.02	-0.55	0.76	1.3	0.84	0.2	-0.15	-0.25	-0.41	-0.71	-0.26	-0.19	0.85	-0.53	-0.52	-0.29	-0.72	-0.11	0.49	0.09	1.09
Lsat_1_v5_gn_2_117981.1 (HTD1)	-1.26	-0.85	-1.57	-1.11	-0.22	0.13	-0.06	0.48	-0.74	-0.91	-0.72	-0.3	0.8	0.93	0.38	0.01	0.04	0.28	-0.3	-0.71	-0.32	-0.15	1.05	-0.19	-0.1	-0.17	-0.55	-0.49	0.37	0.44	1.14
Lsat_1_v5_gn_2_121640.1 (JMJ22)	-1.18	-1.13	-1.44	-1.11	0.03	0.17	0.29	0.67	-0.81	-0.52	-0.59	-0.26	0.77	0.69	0.4	-0.06	-0.01	0.4	-0.28	-0.22	-0.19	0.07	0.77	-0.0	-0.15	-0.1	-0.16	-0.21	-0.03	0.12	0.74
Lsat_1_v5_gn_2_129840.1 (AtRH7)	-0.86	-0.57	-0.68	-0.5	0.21	0.27	-0.01	0.11	-0.39	-0.25	-0.19	-0.08	0.54	0.77	0.3	0.1	0.01	0.03	-0.45	-0.34	-0.2	-0.1	0.12	-0.12	-0.12	0.0	-0.13	-0.36	0.19	0.13	0.92
Lsat_1_v5_gn_2_18861.1 (NUWA)	-0.58	-0.89	-0.94	-0.65	-0.3	-0.01	0.02	0.56	-0.56	-0.42	-0.31	-0.03	0.49	0.52	0.23	-0.07	0.02	-0.01	-0.23	-0.27	-0.1	-0.04	0.63	0.08	-0.18	-0.16	-0.23	-0.22	0.25	0.24	1.07
Lsat_1_v5_gn_2_20221.1 (EF-1alpha)	-0.28	-0.37	-0.57	-0.74	0.2	0.28	-0.02	0.31	-0.53	-0.47	-0.37	-0.25	0.31	0.47	0.18	0.03	-0.09	0.19	-0.05	-0.29	-0.18	0.0	0.74	-0.08	-0.06	-0.17	-0.17	-0.02	0.17	0.16	0.5
Lsat_1_v5_gn_2_29841.1	-0.66	-0.67	-1.22	-0.84	-0.08	0.32	-0.02	0.42	-0.62	-0.6	-0.45	-0.31	0.56	0.68	0.15	0.12	-0.07	0.18	-0.41	-0.35	-0.1	-0.11	1.0	-0.13	-0.1	0.24	-0.05	0.02	0.1	0.0	0.64
Lsat_1_v5_gn_2_33000.1	-1.08	-0.73	-1.14	-0.84	0.01	0.42	0.07	0.53	-0.56	-0.49	-0.21	-0.17	0.58	0.59	0.48	-0.15	-0.03	-0.05	-0.0	-0.22	-0.15	-0.1	0.98	-0.22	-0.13	-0.09	-0.12	-0.47	0.05	-0.11	0.78
Lsat_1_v5_gn_2_38521.1 (LARP1a)	-0.68	-0.59	-0.74	-0.42	-0.19	0.17	-0.12	0.13	-0.31	-0.18	-0.04	0.07	0.53	0.51	0.12	0.03	0.03	-0.29	-0.16	-0.31	-0.11	0.0	0.43	-0.06	-0.02	0.08	-0.12	-0.01	0.21	0.18	0.72
Lsat_1_v5_gn_2_46341.1	-0.32	-0.34	-0.6	-0.56	0.24	0.34	0.07	0.35	-0.47	-0.34	-0.3	-0.32	0.44	0.63	0.38	0.11	-0.01	-0.27	-0.21	-0.29	-0.13	-0.05	0.58	-0.14	-0.16	-0.08	-0.25	-0.09	0.12	0.04	0.45
Lsat_1_v5_gn_2_46500.1	-0.52	-0.63	-0.87	-0.97	0.26	0.46	-0.06	0.39	-0.51	-0.58	-0.38	-0.26	0.42	0.99	0.55	0.2	0.01	-0.35	-0.36	-0.27	-0.26	-0.09	0.25	-0.14	-0.16	-0.07	-0.22	-0.08	0.29	0.16	0.66
Lsat_1_v5_gn_2_49000.1 (OLI2)	-0.97	-0.57	-1.31	-0.87	0.05	0.25	-0.11	0.7	-1.01	-0.78	-0.62	-0.28	0.67	0.83	0.43	-0.02	-0.09	0.12	-0.49	-0.62	-0.23	-0.25	0.93	-0.16	-0.27	-0.27	-0.51	-0.22	0.59	0.24	1.03
Lsat_1_v5_gn_2_52561.1 (EDA14)	-0.94	-0.95	-0.88	-0.8	0.17	0.16	0.09	0.73	-0.66	-0.59	-0.46	-0.43	0.69	0.73	0.24	-0.15	-0.04	0.17	-0.26	-0.33	-0.22	-0.16	0.94	0.13	-0.23	-0.08	-0.01	-0.25	0.01	0.09	0.63
Lsat_1_v5_gn_2_58000.1 (RRP5)	-1.08	-0.62	-1.49	-1.28	-0.13	0.17	0.05	0.61	-0.89	-0.65	-0.82	-0.32	0.67	0.88	0.46	0.04	-0.02	-0.16	-0.45	-0.46	-0.3	-0.21	0.94	-0.05	-0.24	-0.22	-0.42	-0.23	0.43	0.28	1.24
Lsat_1_v5_gn_2_71081.1	-0.81	-0.89	-0.4	-0.27	0.14	0.19	-0.21	0.39	-0.38	-0.33	-0.24	-0.03	0.49	0.82	0.43	0.1	-0.1	0.05	-0.45	-0.33	-0.4	-0.29	0.55	-0.19	-0.09	-0.28	-0.27	-0.36	0.1	0.24	0.89
Lsat_1_v5_gn_2_74361.1 (AGS1)	-0.76	-0.56	-0.7	-0.37	0.11	0.1	-0.12	0.1	-0.25	-0.18	-0.13	-0.09	0.37	0.77	0.45	-0.1	-0.14	-0.11	-0.19	-0.33	-0.25	-0.04	0.04	-0.03	0.0	-0.03	-0.23	-0.18	0.27	0.26	0.92
Lsat_1_v5_gn_2_76721.1 (RPPR7)	-0.96	-0.76	-1.07	-0.72	-0.23	-0.01	-0.07	0.55	-0.72	-1.0	-0.36	-0.24	0.94	0.7	0.48	-0.09	0.11	0.35	-0.31	-0.45	-0.2	-0.34	0.79	-0.17	0.03	-0.23	-0.45	-0.07	0.3	0.19	0.88
Lsat_1_v5_gn_2_80001.1 (OVA9)	-0.62	-0.44	-0.7	-0.54	0.2	0.21	-0.16	0.14	-0.5	-0.41	-0.35	-0.27	0.57	0.82	0.62	0.02	-0.08	-0.3	-0.33	-0.34	-0.33	-0.16	0.73	-0.24	-0.18	-0.25	-0.3	-0.23	0.29	0.24	0.86
Lsat_1_v5_gn_3_100801.1 (THADA)	-0.88	-0.8	-0.81	-0.47	0.09	0.03	-0.06	0.38	-0.59	-0.56	-0.48	-0.18	0.68	0.66	0.23	0.12	-0.03	0.4	-0.36	-0.44	-0.19	-0.07	0.93	-0.27	-0.28	-0.16	-0.14	-0.16	0.24	0.15	0.74
Lsat_1_v5_gn_3_103380.1 (TNPO3)	-0.64	-0.59	-1.19	-1.26	0.18	0.33	-0.09	0.13	-0.33	-0.27	-0.15	-0.05	0.53	0.69	0.31	0.13	-0.0	-0.28	-0.1	-0.26	-0.11	-0.05	0.76	-0.03	-0.04	-0.02	-0.13	0.04	0.04	0.02	0.51
Lsat_1_v5_gn_3_112361.1 (MRP1)	-0.76	-0.75	-0.89	-0.76	0.06	0.14	0.03	0.46	-0.41	-0.32	-0.1	-0.15	0.25	0.44	0.26	0.02	-0.09	0.18	-0.05	-0.12	-0.14	0.03	0.81	-0.21	-0.06	0.15	0.03	-0.11	0.06	0.14	0.42
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.