Heatmap: Cluster_231 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_11020.1 (MLK3)	-1.65	-1.29	-1.03	-0.27	-0.06	0.19	0.03	0.16	-0.39	0.11	0.04	-0.04	-0.52	0.83	0.91	0.17	-0.13	-0.38	0.12	-0.31	0.08	-0.02	0.03	-0.36	-0.05	-0.02	0.09	-0.32	0.46	0.38	0.55
Lsat_1_v5_gn_0_14861.1 (OMT1)	0.1	0.14	-0.61	-1.77	-0.8	-0.84	0.71	0.75	-0.02	-0.38	-0.28	-0.48	0.35	-0.4	-0.02	0.28	0.71	-1.55	0.08	0.21	0.16	0.18	-3.75	0.4	0.23	0.14	0.24	-0.34	0.33	0.27	0.47
Lsat_1_v5_gn_0_29140.1 (PPI2)	-1.68	-0.58	-1.56	-1.0	-0.16	0.39	0.12	0.18	0.16	-0.12	0.3	-0.16	-0.02	0.58	0.83	0.3	0.05	-1.15	-0.09	-0.01	-0.22	-0.17	-0.1	-0.01	-0.3	-0.08	-0.03	-0.59	0.41	0.67	0.75
Lsat_1_v5_gn_0_2980.1	-1.54	-0.87	-1.54	-0.8	-0.11	0.28	-0.02	0.14	0.13	-0.16	0.08	-0.29	-0.14	0.6	0.48	0.02	-0.2	-0.52	-0.05	-0.31	-0.15	-0.22	0.3	-0.1	0.05	0.02	0.16	-0.54	0.54	0.76	0.99
Lsat_1_v5_gn_0_38301.1 (BSL3)	-1.31	-0.52	-0.77	-0.93	-0.12	-0.03	-0.36	-0.09	0.39	0.35	0.36	0.31	0.06	0.71	0.82	0.26	0.09	-0.23	0.19	-0.11	-0.01	-0.07	-0.45	-0.23	-0.1	0.19	0.09	-0.25	-0.02	-0.02	-0.07
Lsat_1_v5_gn_1_13860.1	-0.53	-0.38	-1.17	-0.8	-0.38	-0.04	0.46	0.33	-0.05	-0.01	-0.18	-0.06	0.3	0.38	0.64	0.13	-0.07	-0.53	0.2	-0.16	-0.09	0.03	0.41	-0.04	0.05	0.01	-0.05	-0.34	0.24	0.17	0.12
Lsat_1_v5_gn_1_35320.1 (SMR10)	-0.73	-0.81	-0.96	-0.42	-0.11	0.23	0.59	0.71	-0.24	0.11	0.07	-0.21	0.11	0.15	0.45	0.32	0.08	-0.47	0.11	0.16	-0.12	-0.14	-1.89	0.14	-0.04	0.01	0.22	-0.12	0.2	0.16	0.21
Lsat_1_v5_gn_1_37500.1 (MLK3)	-0.92	-0.4	-0.24	-0.12	-0.09	0.03	0.1	0.11	0.24	0.17	0.3	0.17	-0.31	0.39	0.41	0.12	0.07	-0.85	-0.05	-0.05	-0.06	-0.15	-0.87	-0.16	-0.06	0.17	0.12	-0.29	0.16	0.39	0.47
Lsat_1_v5_gn_2_119361.1 (ECR)	-1.17	-1.1	-1.43	-1.52	-0.52	0.07	0.44	0.52	-0.22	-0.22	-0.18	-0.07	0.38	0.51	0.45	0.35	0.4	-0.32	0.24	0.18	0.03	0.09	-0.31	0.16	0.13	0.08	0.08	0.08	0.01	0.03	0.21
Lsat_1_v5_gn_2_18880.1 (AL4)	-1.1	-0.76	-0.51	-0.15	-0.38	0.3	0.27	0.53	0.22	0.04	0.2	0.18	-0.03	0.33	0.48	0.22	-0.02	-1.22	-0.0	-0.14	0.03	0.02	-0.59	0.16	-0.03	0.13	0.2	-0.35	0.11	0.13	0.17
Lsat_1_v5_gn_2_30380.1 (VLN2)	-0.5	-0.81	-0.55	-0.29	-0.16	0.14	0.18	0.13	0.25	0.21	0.33	0.27	-0.56	0.63	0.74	0.3	0.07	-0.41	0.04	-0.15	-0.2	-0.01	-0.97	-0.24	-0.34	-0.09	0.1	-0.35	0.07	0.29	0.33
Lsat_1_v5_gn_2_89680.1 (HCF222)	-0.26	-0.7	-0.71	-0.49	-0.27	0.01	-0.22	0.36	0.31	0.37	0.36	0.3	0.28	0.43	0.4	0.27	0.07	-1.47	-0.21	-0.07	-0.1	-0.18	-0.52	0.2	0.17	0.01	-0.15	0.04	0.07	-0.03	0.2
Lsat_1_v5_gn_2_96801.1	-0.41	-0.73	-1.05	-0.63	-0.02	-0.07	0.41	0.54	0.03	0.12	-0.11	-0.09	0.26	0.58	0.41	-0.01	-0.09	-0.6	-0.03	-0.1	-0.01	0.19	-1.65	0.11	0.3	-0.12	0.12	-0.08	0.22	-0.01	0.51
Lsat_1_v5_gn_3_125660.1	0.05	-0.29	-0.64	-1.02	-0.2	-0.01	0.22	0.31	-0.34	-0.4	-0.3	-0.3	-0.06	0.39	0.6	0.25	0.22	-0.68	0.49	0.06	0.01	0.06	-0.37	0.09	0.0	-0.03	-0.01	0.05	0.41	0.18	-0.03
Lsat_1_v5_gn_3_13101.1	-0.87	-0.51	-0.74	-0.81	-0.05	-0.03	-0.19	0.19	0.24	0.23	0.04	0.22	-0.38	0.75	0.64	0.17	-0.14	-0.19	0.34	-0.0	-0.12	0.38	-0.22	-0.15	-0.19	0.01	0.21	-0.58	0.32	0.14	-0.26
Lsat_1_v5_gn_3_139201.1 (TBL25)	-1.86	-1.29	-1.97	-1.54	-0.59	-0.06	0.61	0.41	-0.06	-0.03	-0.11	-0.03	-0.27	0.46	0.58	0.15	0.16	-0.81	0.45	0.26	0.03	0.19	-1.24	0.28	0.07	0.13	0.25	-0.31	0.4	0.48	0.76
Lsat_1_v5_gn_3_23480.1 (PAE8)	-0.11	-0.27	-0.62	-0.69	-0.11	-0.0	0.41	0.6	-0.09	-0.12	0.01	-0.04	-0.01	0.31	0.53	0.03	0.22	-0.33	-0.11	0.02	-0.11	-0.13	-1.35	0.1	-0.01	-0.01	0.09	0.09	-0.08	0.1	0.4
Lsat_1_v5_gn_3_70301.1	-0.21	0.02	-0.37	-0.42	-0.35	-0.28	0.61	0.72	-0.31	-0.22	-0.28	-0.08	0.23	-0.31	-0.02	0.02	0.33	-0.58	0.17	-0.0	-0.1	0.11	-0.87	0.16	0.2	0.06	0.02	0.02	0.23	0.26	0.13
Lsat_1_v5_gn_4_111820.1 (NF-YB12)	-0.73	-0.49	-0.65	-0.38	0.09	0.15	0.39	0.31	-0.03	-0.03	-0.0	-0.2	-0.04	0.61	0.55	0.07	-0.07	-0.06	-0.35	-0.25	-0.25	-0.16	-0.1	-0.08	-0.11	-0.11	0.0	-0.21	0.31	0.32	0.45
Lsat_1_v5_gn_4_117401.1	-1.42	-0.89	-1.17	-0.9	-0.28	0.33	0.53	0.63	-0.09	-0.05	-0.09	-0.12	0.23	0.52	0.54	0.33	0.35	-1.01	0.17	0.22	0.21	0.16	-1.73	0.01	0.14	0.15	0.16	0.1	-0.1	-0.04	0.01
Lsat_1_v5_gn_4_13981.1 (AST91)	-0.8	-0.45	-1.24	-1.21	-0.27	0.29	1.01	0.78	-0.32	-0.35	-0.25	-0.43	-0.26	0.18	0.61	0.74	0.64	-1.91	-0.7	-0.05	0.07	0.07	-1.85	0.01	0.21	0.06	0.05	-0.18	0.11	0.23	0.65
Lsat_1_v5_gn_4_164340.1 (NILR2)	-1.23	-0.85	-1.3	-1.31	-0.36	-0.0	0.29	0.64	0.14	0.15	0.24	0.23	0.02	0.58	0.69	0.24	0.1	-0.56	0.18	0.08	-0.15	-0.07	-0.61	0.02	-0.09	-0.02	0.17	-0.31	0.06	0.26	0.29
Lsat_1_v5_gn_4_34441.1 (HS)	-0.7	-0.85	-0.12	0.22	0.1	0.2	0.34	0.33	-0.01	-0.03	-0.04	-0.19	0.01	0.05	0.31	0.1	-0.04	-0.9	-0.11	-0.07	-0.06	-0.05	-0.18	-0.07	0.06	0.28	0.2	0.05	0.18	0.08	0.06
Lsat_1_v5_gn_4_75780.1	-0.3	-0.22	-0.33	-0.24	-0.12	0.18	0.15	0.03	0.08	0.13	0.23	0.22	-0.23	0.58	0.54	0.07	-0.06	-0.96	0.03	-0.25	-0.1	-0.15	-0.64	-0.07	-0.02	0.0	0.03	-0.09	0.23	0.36	-0.01
Lsat_1_v5_gn_4_95380.1	-0.99	-1.16	-1.01	-0.44	-0.07	-0.51	-0.36	-0.43	0.13	0.19	0.33	0.07	-0.97	0.53	0.92	-0.38	-0.2	0.16	0.52	0.07	-0.14	0.23	0.6	-0.16	-0.02	0.02	0.04	-0.64	0.48	0.31	0.28
Lsat_1_v5_gn_4_96541.1 (VAB2)	-3.49	-3.1	-5.08	-1.55	0.21	-0.35	-0.82	-0.53	0.43	0.33	0.66	0.47	-0.85	1.16	1.36	0.24	-0.48	-0.05	0.5	0.13	-0.71	-0.21	0.19	0.6	-0.6	-0.14	0.08	-0.32	0.06	0.43	-0.02
Lsat_1_v5_gn_5_121181.1 (WAG1)	-3.51	-3.45	-3.02	-0.88	-0.51	0.49	0.77	0.92	-0.14	-0.15	-0.01	-0.4	-0.6	-0.27	0.71	0.64	0.5	-0.72	0.24	0.17	0.02	-0.31	-2.84	0.0	0.07	-0.09	0.17	-0.46	0.73	0.86	0.68
Lsat_1_v5_gn_5_153201.1 (PSL4)	-0.99	-0.94	-1.26	-1.36	-0.27	0.21	0.19	0.41	-0.07	-0.08	0.25	-0.08	-0.31	0.59	0.67	0.3	0.18	-0.83	0.23	0.14	-0.01	-0.01	-0.74	-0.02	-0.08	0.1	0.18	-0.34	0.35	0.5	0.46
Lsat_1_v5_gn_5_162601.1	-2.05	-1.53	-5.12	-5.44	-1.05	-0.0	0.74	1.47	-0.4	-0.43	-0.51	-0.5	0.24	1.06	0.85	0.33	0.14	-3.23	0.15	-0.12	-0.09	0.28	-3.68	0.42	-0.04	0.07	0.04	-0.51	0.45	0.67	0.76
Lsat_1_v5_gn_5_41441.1 (MIPS3)	0.09	-0.01	-0.61	-1.13	-0.02	0.18	0.39	0.08	-0.24	-0.48	-0.36	-0.66	-0.55	0.89	0.88	0.16	0.0	-1.28	0.47	0.06	0.02	0.13	-0.79	-0.08	-0.03	-0.02	0.01	-0.11	0.44	0.11	0.09
Lsat_1_v5_gn_5_44481.1	-0.41	-0.24	-1.17	-1.79	-0.95	-0.5	0.77	1.11	0.15	-0.06	-0.07	-0.43	0.13	-0.69	0.23	0.32	0.37	-1.88	0.31	0.29	0.37	0.34	-4.86	0.29	0.25	0.32	0.3	-0.27	0.13	0.16	0.18
Lsat_1_v5_gn_5_8681.1	-1.74	-1.54	-1.5	-0.93	-0.31	0.48	0.46	0.45	0.07	0.12	0.16	0.2	-0.08	-0.2	0.12	0.26	0.27	0.08	-0.15	0.04	0.05	0.22	-1.31	0.02	0.2	0.36	0.35	-0.06	0.04	0.3	0.39
Lsat_1_v5_gn_6_110001.1	-2.07	-1.1	-2.65	-2.73	-0.38	0.19	0.66	0.9	-0.17	-0.07	-0.04	-0.0	0.16	0.76	0.74	0.52	0.27	-0.32	0.32	0.1	-0.11	0.1	-4.26	0.11	0.12	0.02	0.02	-0.23	0.08	0.13	0.41
Lsat_1_v5_gn_6_112720.1 (MCTP6)	-1.38	-1.05	-1.74	-1.14	-0.66	-0.01	0.31	0.23	-0.0	-0.09	-0.03	-0.0	0.15	0.09	0.32	0.39	0.44	-0.38	0.38	0.18	0.08	-0.02	0.01	0.2	0.19	0.15	0.07	-0.04	0.11	0.23	0.49
Lsat_1_v5_gn_6_115560.1	-0.46	-0.36	-0.79	-1.19	-0.76	0.06	0.52	0.44	-0.2	-0.3	-0.17	-0.4	0.26	0.2	0.09	0.36	0.36	-0.37	0.37	0.1	0.02	0.08	-2.26	0.08	0.13	0.06	0.1	-0.13	0.23	0.43	0.7
Lsat_1_v5_gn_6_51980.1 (AAE18)	-0.6	-0.77	-0.75	-0.93	-0.64	-0.26	0.24	0.29	-0.21	-0.28	-0.07	-0.03	0.37	0.54	0.5	0.22	0.28	-0.48	0.51	0.04	-0.29	-0.03	-1.09	0.11	0.09	-0.06	-0.08	-0.24	0.2	0.34	0.88
Lsat_1_v5_gn_6_54400.1	-2.43	-1.89	-2.95	-1.98	-0.52	0.33	0.34	0.43	-0.01	0.03	-0.06	-0.07	-0.16	0.51	0.49	0.22	0.02	0.17	0.17	-0.03	-0.08	0.03	-0.19	0.05	0.19	0.0	0.29	-0.41	0.24	0.49	0.96
Lsat_1_v5_gn_6_62960.1 (GATA1)	-1.12	-0.43	-0.47	-0.06	0.02	0.31	0.46	0.71	-0.19	-0.11	-0.1	-0.3	0.22	0.57	0.17	0.14	0.17	-1.92	-0.03	-0.25	0.03	-0.1	-0.28	0.1	0.03	-0.1	0.16	0.17	0.25	0.14	-0.19
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Lsat_1_v5_gn_6_75441.1 (GRF5)	-1.17	-1.28	-1.16	-0.52	-0.25	0.02	0.12	0.14	0.15	0.07	0.19	0.03	0.14	0.8	0.54	0.13	0.03	0.24	0.06	-0.04	-0.35	-0.09	-0.27	-0.13	-0.15	-0.03	-0.01	-0.22	0.36	0.31	0.39
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.