Heatmap: Cluster_158 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
- - - - - - -0.96 - - - -0.76 - 0.19 - - - - 2.86 - - -0.54 - -0.24 - - - - - - - 4.32
- - - - - - - - 1.44 - 0.48 - - - - - 0.58 - - - - - 0.48 0.33 0.35 - - - - 2.37 4.03
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
-0.22 - - - 0.56 -0.57 -0.19 -0.55 -0.34 -1.42 -0.35 0.37 -0.35 1.32 -0.18 -1.62 -0.51 -1.37 0.12 -0.85 -0.35 -0.96 - 0.15 -0.62 -0.27 -0.26 -0.47 -0.4 0.47 3.07
- - - - - - 2.64 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.62 4.22
- - - - - - - - 0.57 - - - - - - - - - - 1.23 - - 0.89 - - - - - - 2.67 4.25
- - - - - - 1.03 - - - - 0.69 -0.08 - 1.51 - - 2.88 - 1.93 - - -0.19 0.65 - - - - 0.85 - 3.03
- - - - - - - - - 1.32 - - 3.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.36
- - - - - - - -1.16 - - - - 1.89 - -0.79 - - 3.65 - -0.04 - - - 0.08 -0.83 - - - - - 3.47
- - - - - - - - - - - - - - 2.11 - - 3.58 - 0.78 - - - - - 2.41 - - - - 2.95
- - - - - - - - - - 1.54 - - 2.52 - - - - - - - - - - - - - - - 1.25 4.32
-1.66 -0.33 -1.64 -1.69 0.6 -0.96 -1.3 - -1.11 - -0.36 - -2.93 0.4 -0.86 - -2.08 0.88 -0.27 - -0.76 -1.48 0.32 -1.47 0.11 -3.01 0.61 - 0.22 1.33 3.55
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.73 - - - - - - - - - - - - 4.15
- - - - - - - - - - - - 3.46 - - - - - 3.25 - - - - - - - - - - - 3.39
- - 0.27 0.2 - - - - - - - - 2.63 - - - - - -0.18 - - - - - - - - - - -0.22 4.37
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.94 - - 4.54
- - - - - - - - - - - - - 3.13 - - - - - - - - - - - - - - - - 4.48
- - - - - - - - - - - - - 0.35 1.19 0.14 - 3.71 - - - - - - - - 0.19 0.7 - - 3.39
- - - - - - - - - - 0.08 - 2.69 - - - - 3.57 - - - - - - - - - - - - 3.54
-2.02 -0.24 -0.27 - 1.86 -0.81 - - -1.25 -0.89 -1.07 -0.52 -3.16 - -1.46 -1.26 0.18 -3.34 - -3.37 -1.4 -0.81 - -0.75 0.37 0.0 -3.14 -2.56 0.9 1.0 3.65
- - - - 1.3 - - - - - - - 1.57 - - - - - - - 2.33 - - - - - - - - 3.19 3.52
- - - - - - - - -1.21 0.52 - - 1.64 - 0.17 - 0.17 3.72 - - - - -0.9 -1.15 0.48 - - - - - 3.04
- - - - -0.8 - - - 1.19 - 0.64 - 2.53 - 1.96 - 1.29 - - - - - 0.46 - - 1.29 - - - - 3.41
- - - 1.16 - -0.13 -0.27 - 0.75 1.23 0.76 1.01 0.24 1.56 -1.34 - -1.35 - -1.66 - -1.62 -0.4 - - - - - - -1.48 1.46 3.3
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - 0.43 1.35 - - - - 4.24 - - - - 0.27 - - - - - - - 2.82
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.37 - 4.37
- - - - 0.44 -1.45 - -0.31 -1.71 - -1.49 0.18 2.33 0.98 1.62 - - 1.38 0.58 -1.69 - - -1.52 0.42 -0.58 - - -1.42 0.02 -0.57 2.96
- - - - - - - - - - - - 3.44 - - - 2.53 - - - - - - - - - - - - - 3.85
- 1.45 - - - - - 1.44 - - - - - - 2.35 - - 3.36 - - - - - - - - - - 1.06 - 3.01
- - - - - - - - - - - - 2.65 - - - - 1.26 - - - - - - - - - - - - 4.48
-1.72 -0.87 -2.72 -1.78 1.05 -0.28 -1.59 -1.11 0.17 0.03 0.25 -0.76 -0.65 -0.29 -0.35 -0.35 -0.84 -0.42 -1.19 -1.2 -0.64 -0.56 0.61 0.5 -1.24 -0.69 -0.07 0.04 0.35 0.8 2.72
- - - - - - - 1.15 - - - - 0.13 - - - - 3.94 - - - - - - - - - - - - 3.63
1.29 - - - -0.05 - - - - - - 0.42 0.84 - 0.72 0.14 0.03 - - -1.22 - - 2.16 - - - -1.22 - -1.02 1.7 3.54
- - - - - - - - - - - - 2.47 - 2.03 - 0.85 3.42 - - - - - - - - - 0.88 - - 2.82
- - - - - - - - - - - - 2.46 - - - - 4.04 - - - - - - - - - - - - 3.18
- 2.71 - 1.59 - - - - - - - - 1.34 - - - - - - 1.15 1.1 - - - - - - - - 2.26 3.28
- - - - - - - -0.36 - 1.69 - -0.98 1.15 - -0.42 -1.71 -2.32 0.06 -0.77 -0.73 -2.2 -1.2 1.42 -1.16 -1.24 -0.37 - - - 2.21 3.48
- - - - - - - - - - - - 1.91 - - - - 3.67 - - - - - - - - - - - - 3.86
- - - - - 0.56 - - - - - 1.4 2.76 -0.72 -0.96 -0.94 -0.25 2.76 - - - - - - - - 0.3 - -0.17 - 3.13
- - - - - - - - - - - - 3.25 - - - - - - - - - 0.93 - - - - - - 2.55 3.78
- - - - 2.51 - - - - - - - - - - - - 2.11 - - - - - - - - - - - - 4.39
- - - - - - - - - - - 1.17 2.45 - - - - - - 1.18 - - - - 1.23 1.25 - - 1.33 - 3.79
- - - - - - - - - - - - 1.48 - - - - 3.1 - - - - - - - - - - - 2.61 3.76
- - - - - - - - - - - - 1.69 - - - - 3.16 - - - - 1.78 - - - - - - - 3.94
- - - - - -0.98 -1.97 -0.15 -1.03 - 0.18 - 2.16 -1.7 -1.65 - 1.23 2.78 -0.06 -2.08 -0.96 - 1.03 0.62 -0.88 - - -1.15 -1.99 1.08 2.25
- - - - - - - - - - - - - - - - - 3.33 - - - - - - - - - - - - 4.39
- - - - - - - - - - - 1.31 2.04 0.33 2.14 - - 3.09 - - - - - - - - - - 0.11 - 3.19
- - - - - - - - -0.04 - 2.09 - 2.69 - - - 0.25 0.98 - -0.04 - - - - - - - - 1.07 1.31 3.41
-3.41 -0.38 -0.91 -0.86 -2.79 -0.49 -2.67 - -1.68 -0.69 -0.07 -0.71 2.05 -3.68 0.26 -2.68 -0.73 1.47 -0.52 -1.19 -3.88 -3.68 1.48 -2.38 -1.82 -1.49 -2.83 -2.27 -0.77 -0.74 3.34
- - - - 0.32 - - - - - - - 1.63 - - - - - - - - - - - - - - - 0.71 3.12 4.03
- - - - - - - 3.06 - - - - 2.96 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.89
-1.36 - - -0.41 -2.74 -2.7 -1.18 - -2.63 -1.26 -0.61 -1.07 1.04 -1.49 0.38 - -1.06 2.19 - -1.29 -2.99 -2.49 1.73 -2.84 -0.54 -1.23 -2.61 -2.74 0.01 0.4 3.43

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.