Heatmap: Cluster_158 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 1.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.16
0.23 0.0 0.0 0.0 0.39 0.18 0.23 0.18 0.21 0.1 0.21 0.34 0.21 0.67 0.24 0.09 0.19 0.1 0.29 0.15 0.21 0.14 0.0 0.29 0.17 0.22 0.22 0.19 0.2 0.37 2.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.09 0.0 0.28 0.0 0.0 0.71 0.0 0.37 0.0 0.0 0.08 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.79
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 2.99 0.0 0.46 0.0 0.0 10.12 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.85 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.95
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.17 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.14
0.05 0.12 0.05 0.05 0.23 0.08 0.06 0.0 0.07 0.0 0.12 0.0 0.02 0.2 0.08 0.0 0.04 0.28 0.13 0.0 0.09 0.05 0.19 0.06 0.16 0.02 0.23 0.0 0.18 0.38 1.79
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.1 0.05 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.07 0.0 0.0 0.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46
0.12 0.41 0.41 0.0 1.78 0.28 0.0 0.0 0.21 0.26 0.23 0.34 0.05 0.0 0.18 0.2 0.56 0.05 0.0 0.05 0.19 0.28 0.0 0.29 0.63 0.49 0.06 0.08 0.91 0.98 6.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.03 0.0 0.03 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.12 0.0 0.08 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22
0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.25 0.22 0.0 0.45 0.63 0.45 0.54 0.32 0.79 0.11 0.0 0.11 0.0 0.09 0.0 0.09 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.74 2.65
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.01 0.04 0.16 0.06 0.1 0.0 0.0 0.08 0.05 0.01 0.0 0.0 0.01 0.04 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
1.39 2.51 0.7 1.34 9.55 3.78 1.53 2.12 5.19 4.71 5.47 2.71 2.94 3.77 3.62 3.61 2.57 3.44 2.01 2.0 2.95 3.12 7.03 6.5 1.95 2.84 4.4 4.73 5.87 7.99 30.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 2.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.81
0.16 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.11 0.0 0.11 0.07 0.07 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.21 0.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.15 0.0 0.02 0.1 0.0 0.04 0.01 0.01 0.05 0.03 0.03 0.01 0.02 0.13 0.02 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.22 0.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.22 0.02 0.02 0.02 0.03 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.0 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.11 0.0 0.0 0.12 0.0 0.65
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.15 0.08 0.0 0.19 0.0 0.74 0.05 0.05 0.0 0.39 1.14 0.16 0.04 0.09 0.0 0.34 0.25 0.09 0.0 0.0 0.07 0.04 0.35 0.79
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.08 0.02 0.09 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.13
0.01 0.08 0.06 0.06 0.02 0.08 0.02 0.0 0.03 0.07 0.1 0.06 0.44 0.01 0.13 0.02 0.06 0.29 0.07 0.05 0.01 0.01 0.3 0.02 0.03 0.04 0.01 0.02 0.06 0.06 1.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.15 0.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24
0.02 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.02 0.04 0.03 0.12 0.02 0.07 0.0 0.03 0.25 0.0 0.02 0.01 0.01 0.19 0.01 0.04 0.02 0.01 0.01 0.06 0.07 0.6

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)