Heatmap: Cluster_181 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.35 0.0 0.05 0.0 0.04 0.87 0.02 0.05 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.06 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.04 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.1 0.05 0.02 0.1 1.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.05 0.03 0.07 0.58
0.06 0.07 0.09 0.1 0.22 0.14 0.07 0.05 0.11 0.13 0.09 0.1 0.37 0.09 0.16 0.11 0.1 0.86 0.07 0.07 0.07 0.09 0.09 0.1 0.07 0.08 0.11 0.07 0.14 0.28 1.0
0.06 0.07 0.09 0.1 0.22 0.14 0.07 0.05 0.11 0.13 0.09 0.1 0.37 0.09 0.16 0.11 0.1 0.86 0.07 0.07 0.07 0.09 0.09 0.1 0.07 0.08 0.11 0.07 0.14 0.28 1.0
0.01 0.08 0.06 0.02 0.01 0.03 0.0 0.02 0.07 0.06 0.0 0.01 0.52 0.02 0.05 0.03 0.02 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.01 0.01 0.0 0.05 0.59
0.02 0.12 0.0 0.03 0.11 0.06 0.04 0.03 0.05 0.1 0.08 0.12 0.74 0.17 0.14 0.08 0.06 1.0 0.02 0.11 0.07 0.08 0.3 0.07 0.08 0.07 0.09 0.05 0.06 0.09 0.76
0.0 0.02 0.03 0.02 0.06 0.07 0.09 0.01 0.07 0.09 0.06 0.05 0.35 0.13 0.12 0.03 0.06 1.0 0.1 0.07 0.13 0.11 0.21 0.02 0.04 0.11 0.04 0.08 0.07 0.06 0.41
0.01 0.03 0.03 0.01 0.11 0.05 0.04 0.04 0.08 0.08 0.07 0.11 0.76 0.17 0.23 0.07 0.11 1.0 0.1 0.09 0.06 0.03 0.14 0.1 0.11 0.08 0.09 0.03 0.13 0.15 0.97
0.02 0.04 0.01 0.0 0.11 0.03 0.02 0.01 0.02 0.09 0.01 0.07 0.73 0.02 0.06 0.05 0.05 0.55 0.03 0.11 0.02 0.04 0.03 0.05 0.11 0.06 0.07 0.06 0.04 0.18 1.0
0.05 0.02 0.04 0.08 0.06 0.06 0.1 0.07 0.09 0.09 0.07 0.14 0.72 0.09 0.15 0.16 0.21 1.0 0.16 0.22 0.11 0.11 0.01 0.24 0.24 0.11 0.08 0.11 0.13 0.22 0.7
0.03 0.03 0.05 0.1 0.19 0.11 0.14 0.06 0.09 0.11 0.2 0.16 0.58 0.17 0.3 0.24 0.12 0.51 0.12 0.15 0.14 0.11 0.03 0.18 0.12 0.13 0.11 0.05 0.21 0.23 1.0
0.16 0.15 0.2 0.24 0.32 0.27 0.17 0.17 0.24 0.25 0.21 0.23 0.71 0.36 0.29 0.29 0.27 0.97 0.19 0.21 0.2 0.19 0.32 0.29 0.27 0.21 0.25 0.21 0.31 0.36 1.0
0.0 0.03 0.03 0.03 0.01 0.01 0.04 0.01 0.08 0.1 0.13 0.18 0.65 0.1 0.09 0.08 0.13 0.78 0.08 0.08 0.04 0.04 0.06 0.13 0.1 0.03 0.04 0.03 0.09 0.18 1.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.09 0.04 0.0 0.42 0.03 0.06 0.09 0.05 1.0 0.02 0.01 0.04 0.09 0.0 0.01 0.04 0.02 0.0 0.05 0.04 0.03 0.9
0.01 0.03 0.04 0.06 0.09 0.07 0.09 0.08 0.12 0.12 0.1 0.13 0.23 0.04 0.06 0.09 0.1 0.76 0.07 0.09 0.1 0.09 0.05 0.14 0.13 0.09 0.08 0.04 0.13 0.26 1.0
0.32 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.03 0.0 0.05 0.02 0.01 0.0 0.52 0.11 0.03 0.08 0.0 1.0 0.02 0.02 0.01 0.0 0.04 0.05 0.04 0.01 0.01 0.0 0.05 0.01 0.46
0.02 0.0 0.04 0.0 0.06 0.03 0.02 0.03 0.06 0.0 0.01 0.02 0.53 0.1 0.06 0.06 0.01 1.0 0.02 0.0 0.08 0.08 0.0 0.06 0.03 0.08 0.04 0.07 0.04 0.02 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.74 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.04 0.06 0.19 0.06 0.05 0.03 0.05 0.08 0.06 0.08 0.04 0.09 0.55 0.02 0.07 0.13 0.11 0.74 0.04 0.08 0.06 0.04 0.09 0.05 0.12 0.08 0.08 0.05 0.04 0.11 1.0
0.22 0.26 0.14 0.11 0.19 0.17 0.13 0.17 0.09 0.15 0.17 0.12 0.47 0.12 0.06 0.16 0.18 0.85 0.07 0.06 0.13 0.09 0.2 0.2 0.24 0.17 0.1 0.12 0.22 0.37 1.0
0.0 0.01 0.0 0.04 0.07 0.06 0.02 0.02 0.08 0.03 0.08 0.14 0.64 0.19 0.16 0.05 0.02 0.81 0.07 0.03 0.02 0.06 0.0 0.09 0.14 0.07 0.03 0.01 0.11 0.17 1.0
0.05 0.02 0.02 0.05 0.09 0.11 0.04 0.03 0.05 0.08 0.08 0.02 0.57 0.23 0.12 0.17 0.21 1.0 0.1 0.1 0.09 0.07 0.0 0.05 0.16 0.16 0.07 0.01 0.07 0.09 0.66
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.56 0.02 0.04 0.01 0.0 1.0 0.06 0.02 0.02 0.02 0.0 0.03 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.6
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.41 0.01 0.03 0.01 0.01 1.0 0.01 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.59
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74
0.01 0.03 0.0 0.03 0.09 0.05 0.05 0.09 0.09 0.07 0.08 0.05 0.42 0.08 0.06 0.07 0.06 1.0 0.07 0.13 0.02 0.06 0.08 0.07 0.14 0.11 0.09 0.07 0.15 0.08 0.79
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.48 0.0 0.02 0.0 0.06 0.3 0.0 0.03 0.02 0.0 0.09 0.02 0.0 0.01 0.0 0.04 0.01 0.06 1.0
0.04 0.04 0.11 0.15 0.13 0.12 0.11 0.09 0.13 0.14 0.15 0.17 0.53 0.27 0.29 0.21 0.15 0.69 0.12 0.15 0.12 0.09 0.04 0.15 0.14 0.1 0.09 0.09 0.15 0.25 1.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.13 0.11 0.09 0.09 0.14 0.08 0.09 0.57 0.17 0.11 0.1 0.13 0.71 0.12 0.12 0.12 0.12 0.08 0.09 0.2 0.09 0.18 0.08 0.19 0.22 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.15 0.72 0.12 0.04 0.01 0.0 0.64 0.0 0.03 0.02 0.03 0.0 0.08 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 1.0
0.0 0.01 0.02 0.01 0.11 0.05 0.02 0.01 0.1 0.09 0.12 0.13 0.38 0.12 0.1 0.07 0.08 1.0 0.14 0.12 0.08 0.06 0.03 0.14 0.11 0.08 0.06 0.06 0.09 0.19 0.89
0.02 0.01 0.02 0.02 0.07 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.04 0.03 0.46 0.09 0.05 0.02 0.03 1.0 0.06 0.02 0.02 0.03 0.01 0.03 0.04 0.03 0.04 0.03 0.04 0.05 0.78
0.01 0.06 0.02 0.04 0.16 0.12 0.02 0.0 0.06 0.12 0.05 0.08 0.42 0.19 0.2 0.08 0.08 0.81 0.07 0.06 0.06 0.05 0.17 0.08 0.1 0.04 0.05 0.04 0.09 0.14 1.0
0.0 0.0 0.05 0.0 0.07 0.12 0.08 0.0 0.0 0.22 0.1 0.02 0.65 0.09 0.27 0.03 0.1 0.83 0.04 0.12 0.06 0.15 0.04 0.16 0.04 0.07 0.02 0.02 0.37 0.16 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02 0.08 0.03 0.07 0.62 0.13 0.14 0.04 0.06 0.53 0.03 0.08 0.07 0.08 0.01 0.11 0.11 0.02 0.02 0.01 0.06 0.09 1.0
0.06 0.09 0.09 0.09 0.21 0.15 0.16 0.16 0.15 0.18 0.2 0.21 0.63 0.26 0.33 0.2 0.17 1.0 0.22 0.16 0.17 0.12 0.23 0.2 0.15 0.21 0.17 0.14 0.16 0.29 0.92
0.04 0.04 0.07 0.12 0.06 0.06 0.08 0.08 0.11 0.15 0.11 0.14 0.72 0.15 0.16 0.1 0.17 1.0 0.05 0.13 0.11 0.07 0.04 0.1 0.13 0.11 0.13 0.04 0.14 0.23 0.77
0.1 0.1 0.18 0.21 0.11 0.14 0.17 0.13 0.28 0.31 0.28 0.35 0.81 0.16 0.16 0.21 0.27 1.0 0.37 0.31 0.22 0.22 0.15 0.32 0.31 0.27 0.21 0.26 0.14 0.21 0.78
0.08 0.05 0.02 0.03 0.07 0.03 0.05 0.02 0.05 0.04 0.04 0.08 0.53 0.04 0.02 0.02 0.03 1.0 0.01 0.05 0.04 0.06 0.06 0.12 0.07 0.06 0.07 0.09 0.01 0.07 0.51
0.03 0.06 0.08 0.15 0.15 0.11 0.08 0.05 0.12 0.17 0.11 0.14 0.52 0.1 0.24 0.16 0.12 0.58 0.08 0.18 0.1 0.12 0.07 0.1 0.15 0.06 0.1 0.06 0.18 0.27 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.2 0.0 0.54 0.04 0.04 0.0 0.0 1.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.93
0.11 0.05 0.15 0.16 0.25 0.26 0.12 0.1 0.17 0.19 0.2 0.28 0.79 0.19 0.26 0.26 0.29 0.83 0.28 0.24 0.25 0.26 0.27 0.29 0.32 0.31 0.3 0.27 0.22 0.26 1.0
0.04 0.05 0.05 0.08 0.19 0.16 0.09 0.08 0.12 0.13 0.15 0.15 0.58 0.25 0.28 0.17 0.18 0.81 0.17 0.16 0.12 0.12 0.14 0.17 0.16 0.12 0.13 0.11 0.19 0.27 1.0
0.02 0.02 0.03 0.03 0.18 0.07 0.08 0.05 0.14 0.19 0.06 0.13 0.61 0.1 0.15 0.1 0.14 0.82 0.05 0.09 0.15 0.13 0.06 0.15 0.1 0.13 0.23 0.05 0.12 0.27 1.0
0.06 0.03 0.01 0.03 0.03 0.03 0.01 0.01 0.05 0.04 0.08 0.03 0.59 0.14 0.06 0.06 0.04 0.94 0.03 0.0 0.05 0.03 0.06 0.23 0.11 0.02 0.04 0.04 0.05 0.12 1.0
0.22 0.15 0.33 0.39 0.23 0.2 0.15 0.17 0.27 0.25 0.35 0.32 0.58 0.34 0.32 0.34 0.29 1.0 0.28 0.26 0.26 0.25 0.31 0.28 0.33 0.31 0.28 0.19 0.35 0.45 0.94
0.08 0.02 0.04 0.09 0.16 0.1 0.12 0.1 0.16 0.15 0.24 0.26 0.74 0.15 0.13 0.13 0.16 1.0 0.11 0.16 0.12 0.14 0.15 0.22 0.16 0.16 0.1 0.16 0.18 0.22 0.98

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)