1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_181 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.05 0.06 0.06 0.88 0.0 0.11 0.0 0.09 2.18 0.06 0.14 0.02 0.0 0.02 0.06 0.02 0.05 0.0 0.0 0.02 0.16 2.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.08 0.04 0.02 0.08 0.82 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.0 0.05 0.02 0.06 0.48
0.34 0.42 0.52 0.58 1.33 0.84 0.4 0.29 0.65 0.77 0.54 0.62 2.19 0.52 0.94 0.65 0.57 5.09 0.43 0.39 0.41 0.53 0.52 0.57 0.44 0.46 0.62 0.4 0.82 1.63 5.9
0.34 0.42 0.52 0.58 1.33 0.84 0.4 0.29 0.65 0.77 0.54 0.62 2.19 0.52 0.94 0.65 0.57 5.09 0.43 0.39 0.41 0.53 0.52 0.57 0.44 0.46 0.62 0.4 0.82 1.63 5.9
0.05 0.47 0.37 0.1 0.04 0.17 0.0 0.12 0.4 0.38 0.0 0.04 3.04 0.1 0.3 0.16 0.09 5.89 0.0 0.0 0.04 0.0 0.19 0.0 0.0 0.4 0.05 0.09 0.0 0.27 3.46
0.03 0.15 0.0 0.04 0.14 0.08 0.05 0.04 0.07 0.12 0.1 0.15 0.93 0.22 0.18 0.11 0.07 1.27 0.02 0.14 0.09 0.11 0.38 0.08 0.1 0.09 0.11 0.07 0.08 0.12 0.97
0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.08 0.03 0.03 0.01 0.01 0.23 0.02 0.01 0.03 0.02 0.05 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.09
0.05 0.11 0.12 0.04 0.41 0.2 0.14 0.13 0.28 0.29 0.23 0.38 2.71 0.61 0.82 0.26 0.38 3.58 0.35 0.31 0.2 0.12 0.49 0.34 0.41 0.28 0.34 0.1 0.48 0.54 3.48
0.02 0.04 0.01 0.0 0.11 0.03 0.02 0.01 0.02 0.1 0.01 0.07 0.74 0.02 0.06 0.05 0.06 0.56 0.03 0.11 0.02 0.04 0.04 0.05 0.12 0.06 0.07 0.06 0.04 0.18 1.02
3.93 1.71 3.02 6.59 4.93 5.0 7.4 5.56 7.3 6.81 5.44 11.06 55.68 6.97 11.71 12.65 16.33 77.75 12.5 17.48 8.85 8.83 1.16 18.75 18.43 8.83 6.15 8.33 9.94 16.87 54.72
0.05 0.06 0.1 0.21 0.38 0.22 0.28 0.11 0.18 0.23 0.41 0.32 1.16 0.34 0.6 0.49 0.25 1.04 0.24 0.3 0.27 0.23 0.06 0.36 0.23 0.27 0.23 0.09 0.43 0.46 2.02
2.62 2.51 3.22 3.88 5.26 4.46 2.79 2.8 3.89 4.16 3.51 3.8 11.7 5.98 4.77 4.74 4.38 16.03 3.17 3.46 3.24 3.05 5.29 4.79 4.43 3.45 4.17 3.46 5.12 5.98 16.44
0.01 0.04 0.05 0.05 0.02 0.02 0.07 0.02 0.13 0.16 0.21 0.28 1.04 0.15 0.14 0.14 0.2 1.25 0.13 0.12 0.06 0.06 0.1 0.21 0.17 0.05 0.06 0.05 0.14 0.29 1.6
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.1 0.04 0.0 0.46 0.03 0.07 0.1 0.05 1.09 0.02 0.01 0.04 0.1 0.0 0.01 0.04 0.02 0.0 0.06 0.04 0.04 0.98
0.09 0.37 0.48 0.81 1.15 0.88 1.27 1.04 1.58 1.67 1.32 1.68 3.04 0.51 0.84 1.16 1.28 10.23 0.88 1.19 1.3 1.2 0.73 1.83 1.72 1.23 1.03 0.48 1.69 3.55 13.43
0.14 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.23 0.05 0.01 0.03 0.0 0.43 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.2
0.05 0.0 0.09 0.0 0.14 0.06 0.05 0.06 0.14 0.0 0.03 0.04 1.14 0.22 0.14 0.14 0.02 2.16 0.05 0.0 0.17 0.18 0.0 0.14 0.06 0.16 0.09 0.14 0.09 0.05 0.81
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.18 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 2.38 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.21
0.15 0.22 0.75 0.25 0.21 0.12 0.19 0.3 0.24 0.33 0.16 0.33 2.18 0.09 0.26 0.5 0.41 2.9 0.16 0.33 0.23 0.15 0.34 0.19 0.47 0.29 0.31 0.2 0.17 0.42 3.93
0.2 0.24 0.13 0.1 0.17 0.15 0.12 0.15 0.08 0.13 0.15 0.1 0.42 0.11 0.06 0.14 0.16 0.76 0.06 0.06 0.11 0.08 0.18 0.18 0.22 0.15 0.09 0.11 0.2 0.33 0.9
0.0 0.02 0.0 0.05 0.1 0.08 0.03 0.03 0.12 0.05 0.11 0.2 0.92 0.27 0.23 0.07 0.03 1.17 0.1 0.04 0.02 0.09 0.01 0.13 0.19 0.1 0.04 0.01 0.16 0.24 1.43
0.05 0.02 0.02 0.05 0.09 0.11 0.04 0.03 0.05 0.08 0.08 0.02 0.56 0.23 0.12 0.16 0.21 0.99 0.09 0.1 0.09 0.07 0.0 0.05 0.16 0.16 0.07 0.01 0.07 0.09 0.66
0.0 0.03 0.0 0.02 0.18 0.06 0.08 0.1 0.18 0.07 0.13 0.14 6.29 0.25 0.5 0.16 0.04 11.18 0.62 0.22 0.18 0.17 0.0 0.31 0.18 0.16 0.37 0.19 0.1 0.15 6.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14
0.13 0.0 0.0 0.0 1.74 0.25 1.18 0.84 7.16 7.97 7.25 17.95 224.26 5.49 16.16 5.54 8.06 553.37 3.22 15.02 5.14 3.13 9.36 11.7 12.47 2.95 2.03 2.04 3.34 12.42 323.82
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05 0.12 0.02 2.34 0.03 0.03 0.0 0.02 8.13 0.0 0.0 0.04 0.0 0.47 0.02 0.07 0.07 0.0 0.0 0.03 0.24 8.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67
0.75 1.35 0.0 1.59 4.34 2.69 2.64 4.73 4.71 3.45 3.83 2.51 20.98 4.06 3.09 3.33 2.84 49.93 3.67 6.48 0.88 3.19 4.21 3.53 6.75 5.33 4.68 3.36 7.56 3.84 39.36
0.1 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.29 0.83 5.19 0.0 0.23 0.0 0.67 3.26 0.0 0.34 0.26 0.0 0.96 0.17 0.0 0.08 0.0 0.38 0.08 0.7 10.73
0.27 0.28 0.73 1.02 0.86 0.82 0.77 0.57 0.88 0.92 1.01 1.14 3.54 1.8 1.95 1.38 0.97 4.61 0.8 1.0 0.79 0.6 0.29 1.02 0.91 0.7 0.59 0.61 1.01 1.68 6.66
0.0 0.0 0.0 0.03 0.1 0.42 0.37 0.3 0.29 0.44 0.28 0.3 1.86 0.56 0.37 0.32 0.43 2.31 0.38 0.39 0.39 0.4 0.26 0.28 0.65 0.28 0.6 0.25 0.63 0.7 3.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.12 0.57 0.1 0.03 0.01 0.0 0.51 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.06 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.8
0.03 0.07 0.16 0.11 0.96 0.44 0.18 0.08 0.84 0.74 1.04 1.09 3.14 0.99 0.83 0.55 0.69 8.32 1.15 1.01 0.63 0.53 0.29 1.18 0.88 0.7 0.54 0.5 0.78 1.6 7.42
0.14 0.12 0.14 0.2 0.54 0.2 0.13 0.13 0.24 0.22 0.29 0.21 3.65 0.7 0.41 0.18 0.22 7.88 0.46 0.17 0.13 0.21 0.1 0.22 0.31 0.2 0.3 0.26 0.33 0.39 6.18
0.04 0.23 0.06 0.14 0.65 0.5 0.07 0.02 0.25 0.49 0.21 0.3 1.66 0.74 0.8 0.33 0.31 3.22 0.29 0.26 0.22 0.18 0.67 0.3 0.4 0.16 0.19 0.16 0.36 0.54 3.97
0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.09 0.06 0.0 0.0 0.16 0.08 0.01 0.48 0.07 0.2 0.02 0.07 0.61 0.03 0.09 0.04 0.11 0.03 0.12 0.03 0.05 0.01 0.02 0.27 0.11 0.73
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.06 0.02 0.05 0.47 0.1 0.11 0.03 0.05 0.4 0.03 0.06 0.05 0.06 0.0 0.09 0.08 0.01 0.01 0.01 0.05 0.07 0.76
0.26 0.4 0.38 0.4 0.88 0.64 0.67 0.66 0.64 0.78 0.87 0.88 2.68 1.12 1.42 0.87 0.71 4.26 0.93 0.68 0.71 0.49 1.0 0.85 0.66 0.9 0.73 0.6 0.68 1.21 3.91
0.15 0.14 0.22 0.41 0.22 0.19 0.27 0.26 0.38 0.52 0.38 0.46 2.43 0.51 0.54 0.35 0.57 3.37 0.16 0.44 0.36 0.25 0.15 0.34 0.44 0.38 0.45 0.12 0.48 0.79 2.59
57.32 53.95 99.6 119.07 59.42 76.38 98.03 73.89 155.37 172.84 157.09 198.72 452.5 91.76 88.03 116.85 150.12 560.73 206.97 172.08 125.57 120.62 84.87 179.27 174.19 150.96 120.53 147.07 77.75 115.97 437.25
0.38 0.24 0.08 0.17 0.32 0.16 0.27 0.11 0.23 0.19 0.18 0.37 2.57 0.19 0.11 0.12 0.16 4.88 0.06 0.23 0.21 0.29 0.27 0.58 0.36 0.28 0.35 0.43 0.05 0.32 2.49
0.12 0.32 0.39 0.72 0.73 0.55 0.38 0.26 0.59 0.85 0.52 0.69 2.57 0.47 1.19 0.77 0.59 2.84 0.38 0.87 0.5 0.59 0.35 0.49 0.74 0.32 0.52 0.31 0.87 1.31 4.94
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.11 0.1 0.0 0.32 0.0 0.86 0.07 0.06 0.0 0.0 1.6 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 1.48
1.58 0.73 2.16 2.33 3.56 3.75 1.74 1.37 2.46 2.71 2.86 4.03 11.3 2.72 3.68 3.75 4.2 11.83 4.03 3.48 3.51 3.66 3.89 4.16 4.54 4.37 4.25 3.78 3.17 3.68 14.27
1.72 2.42 2.3 3.58 9.23 7.4 4.09 3.87 5.78 6.33 6.95 7.25 27.63 11.69 13.16 7.96 8.44 38.38 8.1 7.49 5.88 5.65 6.46 8.02 7.62 5.86 6.31 5.06 9.07 12.66 47.54
0.03 0.03 0.05 0.05 0.32 0.13 0.13 0.09 0.25 0.33 0.11 0.23 1.06 0.18 0.26 0.17 0.24 1.43 0.08 0.15 0.26 0.22 0.1 0.26 0.17 0.22 0.4 0.09 0.21 0.47 1.75
0.09 0.05 0.01 0.05 0.05 0.05 0.01 0.02 0.08 0.07 0.12 0.05 0.87 0.2 0.09 0.08 0.06 1.39 0.04 0.0 0.07 0.04 0.08 0.35 0.16 0.02 0.06 0.05 0.07 0.18 1.48
3.13 2.05 4.63 5.44 3.27 2.84 2.17 2.44 3.82 3.52 4.91 4.48 8.15 4.81 4.47 4.77 4.11 14.07 3.9 3.68 3.59 3.46 4.42 3.87 4.66 4.42 3.88 2.67 4.94 6.31 13.2
0.24 0.05 0.13 0.25 0.46 0.3 0.35 0.3 0.46 0.43 0.7 0.75 2.13 0.44 0.36 0.36 0.45 2.88 0.3 0.46 0.35 0.4 0.43 0.62 0.47 0.46 0.3 0.46 0.51 0.62 2.81

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)