Heatmap: Cluster_154 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_8901.1 (AtBBE-like 13)	0.03	0.0	0.06	0.0	0.1	0.02	0.05	0.01	0.05	0.06	0.0	0.03	0.06	0.03	0.05	0.0	0.0	0.52	0.03	0.0	0.03	0.02	1.0	0.11	0.11	0.03	0.04	0.04	0.04	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_19741.1 (CYP82C2)	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.44	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Lsat_1_v5_gn_1_43960.1 (PBL16)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.18
Lsat_1_v5_gn_1_6461.1 (BBE22)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.73	0.01	0.0	0.01	0.01	1.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.03
Lsat_1_v5_gn_1_71921.1 (WIND1)	0.0	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.07	0.02	0.02	0.0	0.01	0.12	0.03	0.04	0.04	0.04	1.0	0.02	0.05	0.06	0.02	0.61	0.07	0.06	0.16	0.03	0.04	0.09	0.08	0.18
Lsat_1_v5_gn_1_82140.1 (HERK1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.04	0.13	0.0	0.0	0.08	0.0	0.25	0.08	0.0	0.0	1.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0	0.03	0.36	0.0	0.0	0.03	0.0
Lsat_1_v5_gn_1_83841.1 (ZW18)	0.01	0.0	0.01	0.01	0.05	0.05	0.03	0.01	0.1	0.03	0.18	0.11	0.1	0.09	0.12	0.09	0.1	0.92	0.07	0.08	0.07	0.02	1.0	0.09	0.01	0.05	0.06	0.02	0.01	0.05	0.07
Lsat_1_v5_gn_2_119680.1 (VUP2)	0.01	0.0	0.03	0.04	0.01	0.01	0.07	0.05	0.06	0.07	0.05	0.06	0.1	0.12	0.1	0.02	0.06	0.5	0.05	0.1	0.07	0.04	1.0	0.07	0.05	0.03	0.03	0.03	0.05	0.07	0.1
Lsat_1_v5_gn_2_128861.1	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.06	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.08	0.1	0.04	0.0	0.0	0.02	0.0	0.1
Lsat_1_v5_gn_2_25920.1 (ERF1-1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.33	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.97	0.43	0.45	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_44180.1	0.0	0.18	0.0	0.17	0.05	0.02	0.11	0.0	0.16	0.04	0.05	0.14	0.0	0.06	0.2	0.11	0.14	1.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.57	0.02	0.05	0.04	0.1	0.12	0.0	0.07	0.09
Lsat_1_v5_gn_2_51741.1 (CHUP1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.81	0.0	0.0	0.0	0.6	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_2_53220.1 (CYP76C3)	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.63	0.04	0.05	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01
Lsat_1_v5_gn_2_83261.1 (ACA7)	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.06	0.27	0.19	0.0	0.0	0.0	0.82	0.0	0.14	0.0	0.0	1.0	0.0	0.2	0.14	0.0	0.0	0.0	0.05	0.51
Lsat_1_v5_gn_2_97041.1 (EXT15)	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.01	0.02	0.62	0.01	0.0	0.01	0.0	1.0	0.01	0.04	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01
Lsat_1_v5_gn_3_100980.1	0.0	0.0	0.12	0.35	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.15	0.0	0.0	0.05	0.13	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_106100.1 (ADL5)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.54	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_107581.1 (AtBBE8)	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_124781.1	0.06	0.01	0.0	0.01	0.19	0.19	0.0	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.18	0.26	0.16	0.02	0.01	1.0	0.06	0.01	0.05	0.05	0.68	0.05	0.06	0.04	0.04	0.06	0.03	0.02	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_41941.1	0.03	0.02	0.0	0.03	0.11	0.1	0.04	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.25	0.17	0.04	0.03	1.0	0.02	0.0	0.03	0.03	0.4	0.04	0.03	0.01	0.03	0.0	0.05	0.02	0.04
Lsat_1_v5_gn_3_57900.1 (GIS2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.2	0.03	0.0	1.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.02	0.01	0.01
Lsat_1_v5_gn_3_81200.1 (RHD6)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_3_90340.1 (RD21B)	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.07	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.09	0.05	0.07	0.04	0.04	1.0	0.03	0.03	0.03	0.03	0.56	0.04	0.02	0.03	0.02	0.02	0.05	0.06	0.19
Lsat_1_v5_gn_3_94261.1 (BGLU40)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_116381.1 (CRK15)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0
Lsat_1_v5_gn_4_146281.1 (PAP2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.03	0.0	0.03	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09
Lsat_1_v5_gn_4_160520.1 (7TM1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_115421.1	0.14	0.05	0.04	0.02	0.19	0.11	0.1	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.16	0.16	0.05	0.03	0.03	1.0	0.01	0.02	0.03	0.06	0.19	0.06	0.05	0.07	0.05	0.05	0.11	0.06	0.06
Lsat_1_v5_gn_5_47540.1 (JMJ17)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.25	0.07	0.18	0.0	0.0	1.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.67	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_6021.1 (mCSF2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_5_81581.1	0.0	0.01	0.0	0.0	0.07	0.06	0.02	0.02	0.0	0.0	0.07	0.0	0.1	0.11	0.18	0.07	0.03	0.31	0.01	0.01	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02
Lsat_1_v5_gn_6_101321.1 (KCS2)	0.07	0.03	0.08	0.11	0.03	0.04	0.1	0.14	0.18	0.2	0.2	0.3	0.46	0.08	0.22	0.29	0.34	1.0	0.13	0.25	0.2	0.11	0.8	0.28	0.19	0.11	0.11	0.14	0.09	0.11	0.21
Lsat_1_v5_gn_6_106641.1 (PCK1)	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.04	0.02	0.07	0.05	0.07	0.06	0.04	0.1	0.1	0.06	0.06	0.36	0.04	0.07	0.04	0.04	1.0	0.05	0.03	0.06	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06
Lsat_1_v5_gn_6_10940.1 (CAD1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	1.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.33	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_110120.1 (ACO5)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.04	0.0	0.02	0.09	0.01	0.08	0.0	0.01	0.16	0.12	1.0	0.14	0.01	0.09	0.0	0.52	0.11	0.02	0.01	0.08	0.01	0.09	0.02	0.19
Lsat_1_v5_gn_6_16901.1 (InvINH2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.02	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_49441.1 (JMJ29)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_72841.1 (ASD)	0.01	0.01	0.0	0.0	0.17	0.09	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.04	0.13	0.18	0.01	0.0	0.24	0.04	0.0	0.01	0.01	1.0	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01
Lsat_1_v5_gn_6_76841.1 (SZE2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_6_77061.1 (CYP707A1)	0.02	0.13	0.0	0.01	0.11	0.06	0.02	0.04	0.05	0.06	0.13	0.07	0.04	0.07	0.06	0.04	0.08	0.35	0.03	0.04	0.03	0.05	1.0	0.05	0.05	0.0	0.03	0.01	0.04	0.02	0.1
Lsat_1_v5_gn_6_82620.1 (ANU1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.16	0.04	0.16	0.0	0.11	0.08	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.62	0.0	0.0	0.14	0.17	0.0	0.07	0.03	0.32
Lsat_1_v5_gn_7_103741.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.6	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_7_104561.1 (CYP71B14)	0.16	0.18	0.15	0.14	0.22	0.26	0.2	0.25	0.09	0.08	0.11	0.1	0.21	0.34	0.31	0.14	0.12	1.0	0.17	0.12	0.13	0.15	0.76	0.12	0.12	0.13	0.14	0.16	0.22	0.13	0.07
Lsat_1_v5_gn_7_42040.1 (CROLIN1)	0.0	0.0	0.0	0.04	0.07	0.03	0.19	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.04	0.23	0.04	0.0	0.0	0.86	0.05	0.03	0.06	0.0	1.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.03	0.04	0.0	0.1
Lsat_1_v5_gn_7_43280.1	0.01	0.01	0.0	0.0	0.17	0.12	0.03	0.02	0.06	0.08	0.1	0.1	0.1	0.24	0.3	0.11	0.1	1.0	0.11	0.08	0.12	0.13	0.43	0.12	0.1	0.1	0.1	0.1	0.07	0.09	0.03
Lsat_1_v5_gn_7_56580.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.03	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.07	0.0	0.04	0.01	0.0	1.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.85	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03
Lsat_1_v5_gn_8_142920.1	0.01	0.0	0.0	0.0	0.11	0.12	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.29	0.21	0.03	0.01	1.0	0.07	0.01	0.03	0.03	0.66	0.04	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.03	0.02
Lsat_1_v5_gn_8_74420.1	0.05	0.07	0.04	0.02	0.16	0.13	0.09	0.09	0.04	0.03	0.02	0.03	0.25	0.05	0.06	0.07	0.05	1.0	0.05	0.04	0.04	0.04	0.38	0.06	0.05	0.03	0.04	0.02	0.06	0.08	0.2
Lsat_1_v5_gn_8_81521.1 (MIZ1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.1	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.24	0.06	0.03	0.08	0.06	0.82	0.04	0.04	0.0	0.04	1.0	0.1	0.04	0.01	0.02	0.02	0.1	0.03	0.51
Lsat_1_v5_gn_9_10461.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_117720.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.05	0.01	0.06	0.02	0.0	0.01	0.06	0.03	0.05	0.03	0.04	0.0	0.27	0.0	0.03	0.0	0.01	1.0	0.0	0.08	0.01	0.04	0.0	0.02	0.02	0.03
Lsat_1_v5_gn_9_67180.1 (EF1a)	0.0	0.07	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.33	0.09	0.12	0.03	0.0	1.0	0.01	0.0	0.02	0.0	0.2	0.01	0.01	0.04	0.0	0.0	0.0	0.07	0.17
Lsat_1_v5_gn_9_70980.1 (CYP71B21)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.07	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.1	0.13	0.01	0.0	1.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.5	0.01	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_89320.1 (NAK)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Lsat_1_v5_gn_9_91081.1 (MRP7)	0.0	0.03	0.02	0.05	0.06	0.05	0.06	0.06	0.0	0.05	0.0	0.0	0.09	0.05	0.03	0.01	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.46	0.05	0.0	0.07	0.02	0.03	0.02	0.01	0.16
Lsat_1_v5_gn_9_9401.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.16	0.17	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.3	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)