1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_154 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_8901.1 (AtBBE-like 13)
 0.04 0.0 0.08 0.0 0.12 0.03 0.06 0.02 0.07 0.07 0.0 0.04 0.08 0.04 0.06 0.0 0.0 0.65 0.04 0.0 0.03 0.03 1.26 0.14 0.14 0.03 0.05 0.05 0.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.01 1.18 0.0 0.0 0.01 0.0 0.52 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.08
0.0 0.01 0.0 0.05 0.01 0.01 0.02 0.02 0.05 0.01 0.04 0.01 0.11 0.02 0.03 0.06 0.02 3.27 0.03 0.02 0.05 0.03 4.47 0.07 0.06 0.01 0.03 0.02 0.04 0.06 0.14
0.0 0.02 0.06 0.01 0.04 0.09 0.02 0.2 0.06 0.06 0.0 0.04 0.33 0.08 0.12 0.1 0.12 2.66 0.04 0.14 0.17 0.04 1.63 0.2 0.16 0.42 0.08 0.1 0.24 0.22 0.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.15 0.0 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0
0.03 0.0 0.02 0.03 0.14 0.14 0.1 0.05 0.3 0.08 0.57 0.33 0.29 0.29 0.36 0.28 0.32 2.83 0.2 0.23 0.21 0.06 3.06 0.29 0.04 0.17 0.18 0.06 0.04 0.16 0.22
0.03 0.02 0.11 0.14 0.03 0.03 0.24 0.18 0.2 0.24 0.18 0.22 0.36 0.44 0.36 0.08 0.2 1.76 0.19 0.35 0.25 0.16 3.54 0.23 0.18 0.11 0.1 0.1 0.16 0.24 0.36
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 1.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.1 0.13 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.03 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.1 0.03 0.01 0.06 0.0 0.09 0.03 0.03 0.08 0.0 0.03 0.11 0.06 0.08 0.57 0.07 0.0 0.0 0.0 0.32 0.01 0.03 0.02 0.06 0.07 0.0 0.04 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.15 0.0 0.0 0.0 0.11 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 1.19 0.02 0.0 0.0 0.0 0.75 0.05 0.06 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.02 0.01 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.01 0.01 0.05 1.41 0.02 0.0 0.02 0.0 2.26 0.02 0.08 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.02
0.0 0.0 0.28 0.81 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.34 0.0 0.0 0.12 0.29 1.32 0.0 0.0 0.0 0.0 2.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 2.4 0.0 0.0 0.0 0.0 2.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.04 0.72 0.08 0.53 9.43 9.72 0.09 0.37 0.72 0.87 1.05 0.79 9.05 13.12 8.24 0.87 0.54 50.42 3.12 0.66 2.49 2.37 34.37 2.39 3.26 2.01 2.04 2.81 1.73 1.15 0.17
0.05 0.03 0.0 0.04 0.19 0.17 0.06 0.03 0.02 0.02 0.05 0.02 0.07 0.42 0.29 0.07 0.05 1.68 0.03 0.0 0.05 0.06 0.68 0.07 0.05 0.03 0.04 0.0 0.08 0.03 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.6 0.1 0.0 2.96 0.08 0.0 0.0 0.0 1.15 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.06 0.03 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.22 0.21 0.32 2.84 1.79 0.42 0.47 0.68 0.66 0.69 0.66 2.36 1.19 1.74 1.0 1.02 26.04 0.69 0.69 0.87 0.68 14.53 0.98 0.5 0.82 0.52 0.48 1.37 1.68 4.99
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.02 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.26 0.44 0.37 0.18 1.67 0.95 0.84 0.41 0.12 0.12 0.18 0.23 1.39 1.44 0.48 0.28 0.27 8.76 0.11 0.21 0.23 0.55 1.7 0.53 0.45 0.59 0.44 0.4 0.92 0.56 0.49
0.0 0.0 0.0 0.0 1.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.7 2.85 0.84 2.06 0.0 0.0 11.2 1.61 0.0 0.0 0.0 7.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.1 0.0 0.0 0.0 0.0 1.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.12 0.0 0.0 0.7 0.57 0.2 0.23 0.0 0.0 0.7 0.0 0.9 1.05 1.71 0.63 0.24 2.97 0.1 0.1 0.0 0.0 9.47 0.0 0.11 0.0 0.41 0.18 0.33 0.1 0.21
0.28 0.11 0.3 0.45 0.11 0.16 0.38 0.55 0.72 0.79 0.79 1.19 1.84 0.31 0.89 1.18 1.34 4.01 0.54 0.98 0.82 0.43 3.22 1.11 0.76 0.45 0.44 0.55 0.37 0.45 0.83
0.34 0.13 0.23 0.26 0.87 0.82 0.68 0.48 1.35 0.89 1.4 1.19 0.77 2.0 1.93 1.22 1.07 6.87 0.82 1.36 0.7 0.77 19.23 0.88 0.65 1.09 1.05 0.77 0.81 0.77 1.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.97 0.0 0.0 0.14 0.0 0.32 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.08 0.01 0.07 0.0 0.01 0.14 0.11 0.86 0.12 0.01 0.08 0.0 0.45 0.1 0.02 0.01 0.07 0.01 0.08 0.02 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.01 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.4 0.28 0.02 0.09 4.89 2.68 0.13 0.12 0.18 0.08 0.2 0.05 1.16 3.77 5.2 0.3 0.1 6.8 1.18 0.11 0.25 0.26 28.25 0.42 0.98 0.35 0.42 0.33 0.88 1.03 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.22 0.0 0.02 0.19 0.11 0.04 0.07 0.08 0.09 0.2 0.11 0.06 0.11 0.1 0.07 0.12 0.57 0.05 0.07 0.05 0.08 1.64 0.08 0.08 0.0 0.05 0.02 0.07 0.04 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.88 0.19 0.89 0.0 0.63 0.47 0.0 5.56 0.0 0.0 0.0 0.53 3.42 0.0 0.0 0.77 0.95 0.0 0.39 0.19 1.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
16.44 19.18 16.04 15.04 23.34 27.92 20.79 26.66 9.2 8.67 12.15 10.08 22.23 36.18 33.09 15.03 12.93 105.64 17.73 12.63 13.94 15.81 80.62 12.91 12.48 13.81 15.31 16.86 22.91 13.38 7.64
0.0 0.0 0.0 0.05 0.09 0.04 0.24 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.05 0.29 0.05 0.0 0.0 1.09 0.06 0.04 0.08 0.0 1.27 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.05 0.0 0.13
0.44 0.3 0.11 0.13 5.21 3.69 0.78 0.71 1.92 2.45 2.91 2.88 3.08 7.06 8.91 3.13 2.95 29.8 3.38 2.39 3.55 4.02 12.82 3.57 3.04 2.86 3.12 2.9 2.23 2.55 0.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.05 0.0 0.03 0.01 0.0 0.78 0.01 0.0 0.01 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02
19.58 7.91 2.89 1.3 224.97 250.73 10.1 9.8 14.53 14.4 19.05 13.13 121.44 596.97 436.46 69.0 27.41 2073.95 144.03 22.27 53.59 62.81 1358.57 91.48 70.54 41.38 62.93 48.24 95.05 63.3 47.99
0.37 0.56 0.32 0.14 1.25 1.01 0.69 0.74 0.31 0.2 0.16 0.2 2.0 0.41 0.44 0.56 0.38 7.86 0.41 0.32 0.28 0.31 3.02 0.5 0.39 0.25 0.32 0.15 0.45 0.63 1.58
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.13 0.02 0.06 0.01 0.01 0.03 0.01 0.31 0.08 0.04 0.1 0.08 1.05 0.05 0.05 0.0 0.05 1.27 0.13 0.05 0.01 0.03 0.03 0.13 0.04 0.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 1.64 0.36 1.99 0.58 0.0 0.36 1.98 0.96 1.63 1.15 1.49 0.0 9.28 0.0 1.08 0.0 0.45 34.09 0.0 2.7 0.32 1.4 0.0 0.75 0.84 0.9
0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.14 0.04 0.05 0.01 0.0 0.41 0.01 0.0 0.01 0.0 0.08 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07
0.04 0.0 0.01 0.0 0.4 0.38 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.06 0.14 0.57 0.72 0.06 0.0 5.61 0.06 0.01 0.05 0.03 2.8 0.03 0.19 0.02 0.07 0.02 0.01 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.27 0.0 0.0 0.0 0.02 0.12 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.08 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.12 2.88 3.06 0.0 0.0 18.16 0.26 0.0 0.0 0.0 5.49 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)