Heatmap: Cluster_46 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.58 0.5 0.09 0.54 0.12 0.0 0.08 0.0 0.25 0.16 0.0 0.16 0.08 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.08 0.2 0.0 0.34 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 1.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.41 0.0 0.19 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.14 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34
0.37 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.29 0.0 0.24 0.0 0.28 0.26 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.65 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.16 0.0 0.19 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26
0.11 0.09 0.22 0.24 0.06 0.15 0.15 0.19 0.44 0.28 0.2 0.17 0.64 0.07 0.34 0.75 0.18 0.23 1.0 0.47 0.45 0.26 0.65 0.76 0.42 0.35 0.28 0.22 0.11 0.29 0.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.09 1.0 0.0 0.09 0.41 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.0 0.0 0.23 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.13 0.22 0.17 0.0 0.06 0.0 0.24 0.34 1.0 0.14 0.0 0.0 0.95 0.16 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.16 0.0 0.19 0.54 0.46 0.28
0.0 0.0 0.0 0.44 0.1 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.15 0.92 0.24 1.0 0.12 0.0 0.0 0.52 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.13 0.06 0.12 0.37 0.67 0.43 0.51 0.2 0.32 0.4 0.06 0.32 0.87 0.81 0.22 0.28 0.85 1.0 0.17 0.37 0.42 0.1 0.23 0.0 0.13 0.09 0.05 0.19 0.32 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.33 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25
0.0 0.4 0.0 0.56 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.87 0.0 0.15 0.18 0.0 1.0 0.5 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.51 0.77 0.0 0.14 0.15 0.31 0.3 0.0 0.14 0.0
0.0 0.57 0.0 0.0 0.22 0.11 0.0 0.0 0.25 0.51 0.0 0.1 0.27 0.0 0.13 0.15 0.13 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.11 0.0 0.11 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.31 0.61 0.29 0.3 0.0 0.0 0.0 0.56 0.16 0.0 1.0 0.0 0.65 0.27 0.0 0.14 0.0 0.27 0.14 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.38 0.0 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.83 0.23 0.14 0.0 0.73 1.0 0.19 0.0 0.1 0.75 0.3 0.0 0.0 0.0 0.22 0.1 0.24 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.38 0.99 0.0 0.0 0.57 0.0 0.37 1.0 0.81 0.0 0.25 0.0 0.52 0.0 0.13 0.15 0.0 0.28 0.15 0.38
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.19 0.0 0.0 0.0 1.0 0.44 0.0 0.0 0.75 0.77 0.0 0.0 0.58 0.43 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.19 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.23 0.65
0.08 0.0 0.0 0.21 0.26 0.17 0.27 0.26 0.34 0.05 0.12 1.0 0.89 0.19 0.32 0.23 0.47 0.15 0.86 0.65 0.32 0.35 0.0 0.77 0.77 0.16 0.31 0.33 0.27 0.41 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.29 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.52 0.0 1.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.11 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.03 0.0 0.35
0.34 0.11 0.16 0.16 0.37 0.11 0.0 0.38 0.49 0.0 0.1 0.21 0.36 0.52 0.47 0.05 0.04 1.0 0.97 0.05 0.0 0.26 0.52 0.0 0.46 0.48 0.0 0.09 0.51 0.82 0.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.27 0.21 0.11 0.0 0.0 0.27 0.57 0.27 0.0 0.0 1.0 0.97 0.1 0.34 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.1 0.0 0.14 0.28
0.0 0.0 0.24 0.0 0.35 0.16 0.0 0.0 0.06 0.0 0.15 0.11 0.0 0.15 0.48 0.43 0.0 0.59 1.0 0.79 0.21 0.17 0.69 0.14 0.0 0.31 0.13 0.06 0.0 0.14 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.82 0.09 0.03 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.02 0.0 0.24 0.54 0.2 0.0 0.0 0.06 0.0 1.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.0 0.03 0.21 0.0 0.16
0.15 0.0 0.15 0.15 0.67 0.3 0.57 0.07 0.42 0.75 0.32 0.06 0.69 0.35 0.06 0.57 0.21 0.34 0.64 0.05 0.31 0.92 0.06 0.0 0.17 0.28 0.54 0.13 0.11 0.17 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.69 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.23 0.73
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13
0.31 0.0 0.6 0.43 0.28 0.18 0.12 0.1 0.18 0.05 0.26 0.16 0.57 1.0 0.12 0.0 0.16 0.88 0.87 0.0 0.54 0.12 0.08 0.17 0.35 0.16 0.05 0.0 0.3 0.71 0.98
0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.47 0.0 0.39 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.26
0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.4 0.55 0.22 0.41 0.0 0.59 0.25 0.45 0.0 0.0 0.92 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.27
0.23 0.07 0.36 0.47 0.7 0.14 0.41 0.2 0.49 0.03 0.15 0.43 0.34 0.22 0.6 0.54 0.33 1.0 0.82 0.28 0.33 0.43 0.53 0.53 0.29 0.27 0.2 0.28 0.45 0.26 0.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.47 0.16 0.15 0.14 0.0 1.0 0.8 0.56 0.18 0.0 0.36 0.31 0.54 0.8 0.28 0.14 0.0 0.0 0.57 0.15 0.28 0.0 0.0 0.44 0.3 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.18 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.07 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.27 0.28
0.38 0.0 0.17 0.0 0.18 0.14 0.0 0.0 0.36 0.27 0.08 0.0 0.0 0.78 0.19 0.11 0.0 0.68 1.0 0.07 0.22 0.44 0.0 0.0 0.08 0.0 0.49 0.08 0.07 0.0 0.65
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.54 1.0 0.36 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.32 0.0 0.19 0.14 0.5 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.19 0.0 0.37 1.0 0.47
0.0 0.14 0.0 0.0 0.2 0.27 0.06 0.14 0.21 0.0 0.07 0.27 0.08 0.47 1.0 0.09 0.26 0.0 0.73 0.0 0.55 0.0 0.0 0.55 0.06 0.59 0.17 0.0 0.37 0.16 0.13

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)