1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_46 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.34 2.02 0.37 2.18 0.47 0.0 0.31 0.0 1.0 0.63 0.0 0.62 0.32 0.0 1.58 0.0 0.0 0.0 4.01 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.31 0.79 0.0 1.38 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.03 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.21 0.17 0.39 0.44 0.11 0.27 0.27 0.34 0.8 0.5 0.36 0.31 1.16 0.12 0.62 1.36 0.33 0.41 1.81 0.85 0.81 0.46 1.18 1.37 0.75 0.63 0.51 0.4 0.2 0.53 0.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.27 2.96 0.0 0.26 1.2 0.0 0.0 0.0 0.27 0.24 0.0 0.0 0.68 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.11 0.08 0.0 0.03 0.0 0.12 0.16 0.48 0.07 0.0 0.0 0.45 0.07 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.08 0.0 0.09 0.26 0.22 0.13
0.0 0.0 0.0 0.16 0.04 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.33 0.09 0.36 0.04 0.0 0.0 0.19 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.03 0.02 0.03 0.1 0.17 0.11 0.13 0.05 0.08 0.1 0.01 0.08 0.23 0.21 0.06 0.07 0.22 0.26 0.04 0.1 0.11 0.03 0.06 0.0 0.03 0.02 0.01 0.05 0.08 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.03 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01 0.01 0.0 0.08 0.04 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0
0.0 0.13 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.06 0.12 0.0 0.02 0.06 0.0 0.03 0.03 0.03 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.04 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.06 0.0 0.04 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.14 0.04 0.02 0.0 0.12 0.16 0.03 0.0 0.02 0.12 0.05 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.04 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.06 0.05 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.12 0.05 0.0 0.0 0.09 0.1 0.0 0.0 0.07 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04 0.11
0.02 0.0 0.0 0.06 0.07 0.05 0.08 0.08 0.1 0.02 0.03 0.29 0.26 0.06 0.09 0.07 0.14 0.04 0.25 0.19 0.09 0.1 0.0 0.22 0.22 0.05 0.09 0.1 0.08 0.12 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.09 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.02 0.0 0.29
1.78 0.56 0.85 0.82 1.94 0.6 0.0 1.98 2.56 0.0 0.52 1.08 1.87 2.7 2.47 0.28 0.23 5.22 5.09 0.24 0.0 1.37 2.74 0.0 2.38 2.49 0.0 0.47 2.65 4.29 1.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.03 0.05 0.03 0.0 0.0 0.09 0.09 0.01 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.03
0.0 0.0 1.04 0.0 1.55 0.72 0.0 0.0 0.27 0.0 0.66 0.51 0.0 0.67 2.12 1.91 0.0 2.6 4.42 3.51 0.93 0.74 3.04 0.61 0.0 1.36 0.57 0.26 0.0 0.62 0.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.98 0.11 0.04 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.03 0.0 0.29 0.64 0.24 0.0 0.0 0.07 0.0 1.2 0.0 0.31 0.0 0.0 0.01 0.02 0.03 0.0 0.03 0.25 0.0 0.2
0.04 0.0 0.04 0.04 0.17 0.08 0.15 0.02 0.11 0.19 0.08 0.02 0.18 0.09 0.02 0.15 0.06 0.09 0.17 0.01 0.08 0.24 0.02 0.0 0.04 0.07 0.14 0.03 0.03 0.04 0.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 1.21 1.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.4 1.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
2.15 0.0 4.14 2.93 1.93 1.23 0.79 0.68 1.26 0.32 1.79 1.12 3.88 6.85 0.85 0.0 1.1 6.03 5.96 0.0 3.71 0.8 0.55 1.17 2.39 1.09 0.37 0.0 2.05 4.87 6.7
0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.22 0.0 0.19 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.13
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.07 0.09 0.04 0.07 0.0 0.1 0.04 0.08 0.0 0.0 0.16 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.05
0.06 0.02 0.09 0.12 0.18 0.04 0.1 0.05 0.13 0.01 0.04 0.11 0.09 0.06 0.15 0.14 0.08 0.26 0.21 0.07 0.09 0.11 0.14 0.14 0.08 0.07 0.05 0.07 0.11 0.07 0.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.05 0.04 0.03 0.01 0.0 0.02 0.02 0.03 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.13 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.05 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02
0.45 0.0 0.21 0.0 0.21 0.16 0.0 0.0 0.43 0.32 0.1 0.0 0.0 0.93 0.23 0.13 0.0 0.82 1.2 0.08 0.26 0.53 0.0 0.0 0.09 0.0 0.58 0.09 0.09 0.0 0.78
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.72 1.34 0.48 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.04 0.03 0.12 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.0 0.09 0.23 0.11
0.0 0.26 0.0 0.0 0.36 0.51 0.1 0.27 0.39 0.0 0.13 0.5 0.16 0.86 1.85 0.16 0.48 0.0 1.36 0.0 1.02 0.0 0.0 1.02 0.12 1.1 0.32 0.0 0.69 0.3 0.24

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)