Heatmap: Cluster_23 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_7801.1 (AAPT2)	-0.81	-0.71	-0.67	-0.54	0.15	0.22	-0.33	-0.28	-0.12	0.18	0.07	0.09	0.54	0.39	0.04	0.04	-0.04	-0.33	0.01	-0.09	0.01	0.02	-0.43	-0.01	0.0	0.01	0.09	-0.11	0.14	0.34	0.81
Lsat_1_v5_gn_1_18261.1	-0.92	-1.23	-0.61	-0.15	-0.07	-0.07	-0.66	-0.77	0.14	0.21	0.23	0.22	0.64	0.21	0.18	0.2	0.16	-0.06	-0.04	-0.01	-0.06	0.1	-1.78	-0.02	-0.04	0.11	0.02	-0.27	0.24	0.33	1.07
Lsat_1_v5_gn_1_30780.1	-2.2	-1.5	-1.43	-0.68	0.12	0.11	-0.57	-1.1	0.09	0.24	0.23	0.55	0.54	-0.49	-0.07	0.02	0.03	0.28	0.15	0.12	-0.22	0.01	-0.39	-0.07	0.04	0.21	0.18	-0.41	0.39	0.61	1.13
Lsat_1_v5_gn_1_31961.1	-2.37	-2.73	-3.87	-3.15	0.32	-0.36	-0.69	-2.35	-0.11	0.1	-0.0	0.07	1.37	-0.58	-0.14	0.37	0.31	-0.36	-0.63	0.38	-0.23	-0.3	-2.56	-0.59	0.12	-0.3	-0.02	-0.66	0.71	1.04	2.16
Lsat_1_v5_gn_1_37881.1	-1.17	-0.95	-1.19	-0.93	0.08	0.1	-0.31	-0.48	-0.16	0.01	-0.02	0.09	0.58	0.26	0.21	-0.02	0.13	-0.13	0.06	0.05	-0.0	0.05	-0.01	0.01	0.0	0.08	0.04	-0.08	0.37	0.48	0.84
Lsat_1_v5_gn_1_53921.1 (iqd2)	-1.72	-1.16	-1.46	-0.96	-0.44	-0.33	-0.28	-0.56	-0.13	-0.11	-0.19	-0.02	0.92	0.36	0.43	-0.02	-0.04	0.51	0.4	0.12	-0.21	-0.01	-1.8	0.19	0.08	0.03	0.0	-0.39	0.42	0.52	1.28
Lsat_1_v5_gn_1_54241.1 (LecRK-VIII.2)	-2.25	-1.39	-1.56	-0.93	0.35	0.57	-0.55	-0.87	-0.17	-0.07	-0.06	0.12	0.8	0.18	0.44	0.41	0.21	-0.08	0.1	-0.08	-0.24	-0.08	-1.98	0.11	-0.01	0.08	0.14	-0.41	0.22	0.41	1.29
Lsat_1_v5_gn_2_110141.1 (ABCI16)	-1.46	-1.23	-0.83	-0.51	0.08	0.05	-0.41	-0.86	0.04	0.16	0.25	0.3	0.59	0.67	0.68	-0.1	-0.04	0.12	-0.06	-0.06	-0.43	-0.37	-0.67	-0.34	-0.14	-0.63	-0.24	-0.7	0.34	0.48	1.47
Lsat_1_v5_gn_2_11701.1 (IQD32)	-0.99	-0.63	-0.77	-0.25	0.37	0.05	-0.76	-0.62	0.01	0.03	0.14	0.09	0.53	0.68	0.34	0.08	-0.19	-0.26	0.03	-0.21	-0.29	-0.15	-1.95	-0.17	-0.12	-0.05	-0.11	-0.62	0.48	0.54	1.33
Lsat_1_v5_gn_2_24380.1	-0.65	-0.59	-0.43	-0.34	-0.01	0.01	-0.27	-0.48	-0.1	0.0	0.13	0.17	0.88	-0.28	-0.23	0.05	0.2	0.29	-0.36	-0.08	-0.11	-0.03	-0.26	-0.03	0.12	0.04	-0.01	0.19	0.14	0.2	0.66
Lsat_1_v5_gn_2_30981.1	-2.19	-1.92	-1.06	-0.2	0.48	-0.14	-1.52	-1.55	0.01	0.15	0.27	0.2	0.89	0.61	0.35	-0.14	-0.07	0.04	-0.12	-0.04	-0.25	-0.03	-0.83	0.02	-0.17	0.03	-0.02	-0.3	-0.03	0.43	1.5
Lsat_1_v5_gn_2_35600.1 (HDA8)	-0.52	-0.65	-0.29	-0.53	0.13	0.17	-0.31	-0.38	0.12	0.18	0.07	0.25	0.38	0.22	0.02	0.09	0.1	-0.55	0.18	-0.28	-0.01	-0.14	-0.89	0.05	0.08	0.07	-0.04	-0.1	0.17	0.37	0.8
Lsat_1_v5_gn_2_38660.1 (bZIP69)	-1.05	-0.67	-0.75	-0.51	0.04	-0.09	-0.25	-0.5	-0.1	-0.18	0.29	0.14	0.42	0.48	0.53	0.02	-0.05	-0.12	0.19	-0.25	-0.37	0.06	-0.4	-0.18	-0.05	0.13	-0.12	-0.17	0.33	0.33	1.01
Lsat_1_v5_gn_2_54721.1	-0.9	-1.21	-0.53	-0.07	0.26	0.06	-0.47	-0.84	0.01	0.02	0.24	0.27	0.34	0.09	0.18	-0.08	0.03	0.28	-0.06	0.1	-0.18	0.0	-0.19	0.03	-0.21	-0.07	-0.07	-0.39	0.19	0.36	1.02
Lsat_1_v5_gn_2_81560.1	-1.7	-0.87	-1.1	-0.71	-0.06	0.22	0.07	0.01	-0.07	0.17	0.16	0.27	0.42	-0.22	0.0	0.06	0.19	-0.14	0.03	0.17	-0.11	-0.1	-0.43	-0.0	-0.05	0.07	0.07	-0.57	0.06	0.41	1.23
Lsat_1_v5_gn_2_81641.1 (BAM1)	-1.82	-1.09	-1.49	-0.51	0.22	0.07	-0.63	-0.81	0.01	0.15	0.06	-0.08	0.8	0.6	0.49	0.23	0.14	0.47	0.18	0.05	-0.23	-0.4	-2.33	-0.11	-0.15	-0.06	-0.06	-0.27	0.24	0.34	1.21
Lsat_1_v5_gn_2_88340.1 (KDO8PS)	-0.78	-0.74	-0.52	-0.43	0.25	0.13	-0.37	-0.65	0.07	0.18	0.16	0.32	0.62	0.06	0.05	0.05	0.08	-0.29	-0.0	-0.03	-0.05	0.0	-0.6	0.25	0.01	0.11	0.02	0.04	0.08	0.18	0.58
Lsat_1_v5_gn_2_88840.1 (IQD31)	-0.79	-0.6	-0.49	-0.23	0.12	0.05	-0.37	-0.59	-0.01	0.13	0.1	0.11	0.39	0.23	0.33	0.13	0.04	-0.46	0.14	0.02	-0.08	-0.07	-1.36	-0.03	0.06	0.05	0.02	-0.24	0.32	0.45	0.89
Lsat_1_v5_gn_2_89501.1	-0.94	-0.94	-0.59	-0.31	0.08	0.03	-0.29	-0.53	-0.23	0.01	0.25	-0.1	0.53	0.32	0.41	0.13	0.02	0.19	-0.19	-0.16	-0.4	-0.18	-0.51	-0.15	-0.12	-0.07	0.1	-0.56	0.36	0.52	1.19
Lsat_1_v5_gn_2_95641.1 (ACIP1)	-0.95	-1.02	-0.98	-0.58	0.35	0.53	-0.09	-0.81	-0.22	-0.38	-0.16	-0.34	0.65	0.05	0.24	0.21	0.15	0.02	0.07	0.07	0.03	0.1	-3.98	0.14	0.25	0.23	0.38	-0.15	-0.09	0.18	1.15
Lsat_1_v5_gn_3_100200.1 (SVR9)	-1.5	-1.14	-1.13	-0.68	-0.23	-0.3	-0.5	-0.47	0.0	0.25	0.29	0.37	0.71	-0.0	0.17	0.06	0.04	0.09	0.1	0.24	-0.05	-0.09	-1.19	-0.0	0.08	-0.07	-0.18	-0.42	0.47	0.61	1.19
Lsat_1_v5_gn_3_30081.1	-1.41	-1.92	-1.56	-1.28	0.2	0.29	-0.31	-0.11	-0.23	-0.35	-0.09	0.03	0.91	0.28	0.73	0.31	0.5	-0.08	0.31	0.33	-0.29	-0.28	-1.9	0.05	-0.43	-0.52	-0.24	-0.59	-0.02	0.53	1.45
Lsat_1_v5_gn_3_34581.1 (KTN80.4)	-0.8	-0.79	-0.74	-0.28	0.12	0.01	-0.1	-0.26	-0.09	-0.0	-0.02	0.03	0.6	0.5	0.5	0.07	-0.03	0.22	0.1	0.02	-0.26	-0.13	-0.67	-0.22	-0.08	-0.07	-0.07	-0.31	0.22	0.24	0.8
Lsat_1_v5_gn_3_67441.1 (ALIS1)	-1.55	-1.45	-1.2	-1.3	0.01	0.16	-0.86	-1.81	0.06	-0.4	-0.02	-0.14	0.59	0.35	0.35	-0.09	-0.18	0.6	-0.02	-0.17	-0.41	0.19	-0.94	0.42	0.11	0.01	-0.06	-0.57	0.56	0.76	1.53
Lsat_1_v5_gn_4_12041.1	-0.91	-0.73	-1.14	-0.99	-0.0	0.2	-0.16	-0.45	-0.21	-0.1	-0.04	0.03	0.53	0.38	0.25	0.06	0.25	0.06	0.12	0.1	-0.11	0.08	-0.73	-0.01	0.02	0.16	-0.03	-0.09	0.39	0.43	0.75
Lsat_1_v5_gn_4_177040.1 (IQD28)	-0.9	-0.77	-0.85	-0.57	0.18	0.06	-0.31	-0.23	-0.27	-0.16	-0.04	0.0	0.65	0.6	0.46	-0.11	-0.25	0.04	0.05	-0.11	-0.18	-0.01	-0.87	-0.09	-0.08	-0.0	-0.1	-0.27	0.34	0.43	1.13
Lsat_1_v5_gn_4_178521.1	-1.74	-1.22	-0.74	-0.33	0.36	-0.42	-0.62	-0.81	0.04	0.46	0.14	0.13	0.59	-0.27	-0.12	-0.21	-0.14	0.11	-0.29	0.28	-0.13	-0.19	-0.15	-0.03	0.18	-0.07	0.15	-0.26	0.2	0.34	1.48
Lsat_1_v5_gn_4_44440.1 (CYCP3;2)	-	-3.11	-4.02	-1.57	-1.7	-1.41	0.25	-1.06	-0.24	0.87	0.11	0.2	0.78	-0.16	0.66	0.0	0.79	1.05	0.61	0.81	-0.37	-0.76	-	0.38	-0.29	-0.4	-0.41	-0.96	-0.42	0.26	1.81
Lsat_1_v5_gn_4_82360.1 (FADB)	-2.75	-2.93	-0.95	-0.91	0.32	0.18	-0.53	-0.53	-0.16	0.33	-0.02	0.4	0.57	-0.34	0.65	0.0	-0.03	0.36	0.35	0.3	-0.95	-0.29	-2.08	0.07	-0.13	-0.29	-0.6	-1.06	0.28	0.73	1.8
Lsat_1_v5_gn_5_114761.1	-1.31	-0.98	-1.28	-0.34	0.17	0.15	-0.53	-0.95	0.22	0.11	0.33	0.49	0.32	0.25	0.34	0.27	0.0	-0.12	-0.27	0.11	-0.26	-0.06	-0.46	-0.04	0.11	-0.02	0.0	-0.2	0.23	0.45	0.89
Lsat_1_v5_gn_5_118181.1	-0.65	-0.35	-0.8	-0.6	0.22	0.38	-0.79	-0.78	-0.07	0.12	-0.02	-0.14	0.65	0.7	0.68	0.15	0.07	-0.34	0.17	-0.39	-0.22	-0.12	-1.94	-0.15	-0.26	0.04	-0.29	-0.33	0.04	0.2	1.36
Lsat_1_v5_gn_5_136800.1	-0.73	-0.66	-0.73	-0.46	0.19	0.1	-0.29	-0.32	-0.24	-0.01	0.11	0.28	0.6	0.12	0.0	0.05	0.16	-0.07	-0.11	-0.13	-0.17	-0.06	-0.19	0.04	0.03	0.0	-0.01	0.02	0.19	0.31	0.8
Lsat_1_v5_gn_5_15080.1	-1.2	-0.85	-1.85	-1.14	-0.48	-1.04	-0.41	-0.15	-0.07	0.2	0.08	0.51	0.81	-0.47	0.41	0.1	0.4	0.74	-0.59	0.43	-0.3	-0.63	-2.8	0.29	0.13	-0.44	-0.65	-0.32	-0.29	0.93	1.65
Lsat_1_v5_gn_5_184780.1 (TRM5)	-2.66	-2.73	-3.68	-2.25	0.29	0.22	-1.03	-1.62	0.23	0.22	0.42	0.12	0.66	0.17	0.25	0.28	0.13	-0.12	0.41	0.19	0.12	0.06	-4.16	-0.02	0.05	0.21	0.17	-0.59	0.63	0.85	1.22
Lsat_1_v5_gn_5_2560.1 (MAP65-2)	-1.04	-0.89	-0.76	-0.36	0.1	0.21	-0.41	-0.63	0.02	0.11	0.13	0.22	0.66	0.05	0.03	0.2	0.02	-0.23	-0.15	-0.05	-0.23	-0.05	-1.33	-0.01	0.05	0.03	-0.01	-0.35	0.23	0.45	1.33
Lsat_1_v5_gn_5_76560.1 (AtHMP25)	-1.5	-1.43	-0.63	-0.2	-0.0	0.06	-0.42	-0.52	0.06	0.15	0.21	0.13	0.6	-0.37	0.24	0.23	0.06	-0.28	-0.05	0.22	-0.11	-0.1	-1.55	-0.18	0.02	0.03	0.02	-0.64	0.35	0.6	1.42
Lsat_1_v5_gn_5_99261.1	-1.72	-0.86	-1.01	-0.27	0.12	0.11	-0.11	-0.59	0.02	0.23	0.25	0.06	0.32	0.13	0.49	0.04	0.14	-0.47	0.17	-0.01	-0.17	-0.24	-1.87	-0.19	0.04	-0.0	-0.03	-0.47	0.46	0.62	1.26
Lsat_1_v5_gn_6_100781.1 (SERK1)	-1.21	-1.24	-1.12	-0.41	-0.18	0.11	-0.32	-0.57	-0.04	0.16	0.14	0.22	0.77	-0.27	-0.15	0.11	0.03	0.05	0.2	-0.02	-0.23	-0.03	-0.89	0.03	0.02	0.13	0.02	-0.3	0.32	0.53	1.27
Lsat_1_v5_gn_6_109441.1 (WPP1)	-0.72	-0.61	-0.76	-0.6	-0.24	-0.05	-0.05	-0.02	-0.18	-0.11	-0.07	-0.01	0.35	0.07	-0.02	0.15	0.16	0.61	-0.09	0.06	-0.11	0.04	-1.33	0.19	0.17	0.08	0.07	-0.07	0.22	0.4	0.81
Lsat_1_v5_gn_6_109840.1 (ATL58)	-1.45	-0.88	-0.58	-0.28	0.08	0.01	-0.49	-0.6	0.13	0.04	0.18	0.05	0.6	0.42	0.26	0.1	-0.02	0.31	-0.09	-0.34	-0.34	-0.1	-0.27	-0.03	-0.31	-0.02	0.19	-0.58	0.13	0.33	1.21
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.