Heatmap: Cluster_23 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
11.95 12.81 13.2 14.41 23.33 24.49 16.65 17.24 19.28 23.69 22.01 22.38 30.58 27.56 21.59 21.59 20.38 16.72 21.15 19.7 21.12 21.22 15.59 20.77 20.99 21.15 22.38 19.42 23.09 26.56 36.86
5.34 4.31 6.62 9.11 9.65 9.61 6.41 5.92 11.13 11.71 11.83 11.74 15.72 11.7 11.44 11.61 11.29 9.68 9.82 10.06 9.73 10.86 2.95 9.99 9.81 10.91 10.29 8.42 11.96 12.68 21.2
0.27 0.44 0.47 0.78 1.37 1.36 0.85 0.59 1.34 1.48 1.48 1.83 1.83 0.89 1.2 1.27 1.28 1.52 1.39 1.36 1.08 1.27 0.96 1.2 1.29 1.45 1.42 0.94 1.65 1.92 2.74
0.38 0.29 0.13 0.22 2.42 1.52 1.2 0.38 1.81 2.08 1.94 2.04 5.02 1.3 1.77 2.51 2.4 1.51 1.25 2.53 1.66 1.58 0.33 1.29 2.11 1.58 1.91 1.23 3.17 4.0 8.67
7.03 8.17 6.94 8.26 16.69 16.97 12.77 11.32 14.16 15.92 15.54 16.86 23.59 18.93 18.2 15.61 17.29 14.44 16.48 16.29 15.75 16.39 15.72 15.91 15.82 16.64 16.24 14.89 20.33 21.95 28.16
1.1 1.61 1.31 1.85 2.66 2.87 2.98 2.44 3.3 3.33 3.16 3.56 6.85 4.61 4.85 3.57 3.5 5.12 4.75 3.91 3.12 3.58 1.04 4.12 3.8 3.69 3.62 2.76 4.82 5.16 8.74
Lsat_1_v5_gn_1_54241.1 (LecRK-VIII.2)
0.52 0.96 0.85 1.31 3.19 3.71 1.71 1.36 2.22 2.37 2.4 2.71 4.36 2.83 3.4 3.33 2.89 2.36 2.68 2.36 2.12 2.37 0.63 2.69 2.48 2.65 2.76 1.88 2.91 3.32 6.09
1.27 1.48 1.95 2.45 3.69 3.61 2.62 1.91 3.58 3.88 4.14 4.27 5.23 5.55 5.56 3.24 3.38 3.78 3.33 3.35 2.58 2.7 2.19 2.76 3.16 2.25 2.96 2.15 4.4 4.84 9.65
6.57 8.43 7.65 10.91 16.77 13.47 7.68 8.5 13.13 13.28 14.38 13.89 18.84 20.8 16.44 13.79 11.44 10.88 13.28 11.23 10.63 11.74 3.36 11.6 11.97 12.62 12.07 8.5 18.19 18.98 32.67
15.23 15.86 17.68 18.87 23.77 24.0 19.73 17.12 22.23 23.86 26.11 26.9 44.03 19.7 20.29 24.71 27.34 29.23 18.62 22.56 22.08 23.37 19.93 23.43 26.01 24.58 23.71 27.18 26.28 27.36 37.75
1.4 1.68 3.06 5.55 8.93 5.8 2.23 2.19 6.43 7.08 7.72 7.34 11.85 9.76 8.17 5.82 6.11 6.59 5.9 6.23 5.39 6.27 3.59 6.47 5.69 6.53 6.31 5.18 6.28 8.6 18.05
5.86 5.35 6.86 5.81 9.16 9.45 6.77 6.42 9.07 9.46 8.8 9.95 10.88 9.75 8.51 8.91 8.95 5.74 9.48 6.88 8.34 7.61 4.51 8.67 8.83 8.78 8.17 7.82 9.41 10.86 14.63
1.49 1.95 1.84 2.17 3.17 2.91 2.59 2.18 2.88 2.72 3.79 3.4 4.14 4.29 4.47 3.14 2.98 2.84 3.52 2.6 2.39 3.22 2.34 2.73 2.99 3.38 2.84 2.74 3.89 3.89 6.22
3.07 2.47 3.97 5.44 6.85 5.96 4.14 3.2 5.77 5.82 6.74 6.91 7.25 6.07 6.49 5.42 5.85 6.96 5.48 6.14 5.05 5.72 5.0 5.83 4.93 5.45 5.44 4.37 6.5 7.36 11.61
1.48 2.62 2.24 2.94 4.59 5.61 5.03 4.83 4.56 5.4 5.37 5.8 6.41 4.11 4.8 5.01 5.47 4.35 4.89 5.39 4.45 4.47 3.56 4.78 4.64 5.04 5.04 3.23 4.99 6.4 11.26
0.93 1.54 1.16 2.3 3.82 3.43 2.12 1.87 3.31 3.63 3.42 3.11 5.72 4.98 4.61 3.85 3.61 4.55 3.72 3.4 2.81 2.48 0.65 3.04 2.95 3.14 3.16 2.72 3.88 4.15 7.6
8.69 8.94 10.42 11.04 17.69 16.33 11.55 9.47 15.59 16.91 16.7 18.61 22.94 15.54 15.44 15.43 15.79 12.21 14.87 14.6 14.36 14.95 9.8 17.71 15.0 16.05 15.1 15.31 15.75 16.85 22.22
11.13 12.72 13.72 16.37 20.98 19.87 14.85 12.78 19.07 21.0 20.7 20.82 25.2 22.57 24.26 21.11 19.8 14.04 21.27 19.58 18.18 18.34 7.49 18.81 20.1 19.89 19.58 16.28 24.03 26.35 35.72
3.27 3.27 4.16 5.07 6.64 6.42 5.14 4.34 5.36 6.31 7.49 5.86 9.05 7.86 8.35 6.88 6.38 7.19 5.49 5.61 4.78 5.53 4.43 5.67 5.78 5.97 6.74 4.28 8.09 9.02 14.38
5.21 4.95 5.09 6.71 12.76 14.46 9.45 5.72 8.62 7.73 8.97 7.92 15.71 10.4 11.89 11.62 11.16 10.17 10.57 10.52 10.28 10.75 0.63 11.07 11.96 11.81 13.08 9.04 9.43 11.4 22.25
6.61 8.48 8.53 11.72 15.93 15.21 13.22 13.56 18.74 22.24 22.85 24.18 30.66 18.66 21.1 19.56 19.22 19.89 20.06 22.17 18.07 17.57 8.19 18.66 19.78 17.79 16.51 13.99 26.0 28.54 42.68
0.6 0.42 0.54 0.66 1.82 1.94 1.28 1.48 1.36 1.25 1.49 1.63 2.99 1.93 2.65 1.97 2.24 1.51 1.98 2.0 1.31 1.31 0.43 1.64 1.18 1.11 1.34 1.06 1.58 2.3 4.34
5.82 5.86 6.08 8.36 11.02 10.25 9.47 8.47 9.51 10.15 10.04 10.36 15.37 14.36 14.35 10.67 9.97 11.84 10.87 10.26 8.47 9.29 6.38 8.73 9.6 9.69 9.7 8.21 11.84 12.02 17.69
1.68 1.81 2.14 2.01 4.95 5.52 2.71 1.41 5.14 3.73 4.85 4.47 7.42 6.28 6.27 4.65 4.34 7.45 4.85 4.38 3.72 5.63 2.57 6.58 5.33 4.95 4.74 3.32 7.29 8.36 14.28
7.83 8.88 6.67 7.39 14.67 16.91 13.14 10.73 12.75 13.73 14.3 15.01 21.25 19.17 17.54 15.32 17.52 15.35 15.94 15.71 13.62 15.54 8.87 14.58 14.9 16.47 14.44 13.82 19.22 19.87 24.73
4.09 4.46 4.23 5.14 8.65 7.93 6.16 6.48 6.31 6.84 7.43 7.64 11.95 11.58 10.49 7.07 6.41 7.83 7.87 7.07 6.7 7.58 4.18 7.15 7.19 7.61 7.12 6.33 9.61 10.29 16.67
1.15 1.64 2.3 3.05 4.92 2.87 2.49 2.18 3.94 5.25 4.2 4.17 5.74 3.18 3.53 3.3 3.46 4.12 3.13 4.64 3.49 3.36 3.44 3.75 4.34 3.64 4.24 3.2 4.41 4.84 10.64
0.0 0.16 0.08 0.45 0.42 0.51 1.61 0.65 1.14 2.47 1.46 1.55 2.32 1.21 2.14 1.35 2.33 2.79 2.06 2.36 1.05 0.8 0.0 1.76 1.11 1.02 1.01 0.7 1.01 1.61 4.75
0.54 0.48 1.88 1.93 4.54 4.12 2.51 2.51 3.24 4.56 3.57 4.8 5.39 2.86 5.69 3.63 3.54 4.64 4.61 4.46 1.88 2.97 0.86 3.82 3.31 2.98 2.4 1.73 4.41 6.02 12.62
3.47 4.38 3.55 6.82 9.68 9.54 5.98 4.46 10.03 9.29 10.81 12.12 10.76 10.21 10.87 10.37 8.63 7.91 7.15 9.27 7.21 8.24 6.27 8.39 9.27 8.49 8.64 7.49 10.11 11.77 15.92
1.46 1.8 1.32 1.51 2.69 2.99 1.33 1.34 2.19 2.5 2.27 2.09 3.61 3.73 3.68 2.55 2.42 1.82 2.58 1.75 1.97 2.11 0.6 2.07 1.93 2.36 1.88 1.83 2.37 2.65 5.9
4.72 4.96 4.74 5.68 8.95 8.4 6.43 6.28 6.62 7.8 8.44 9.55 11.87 8.54 7.85 8.13 8.76 7.47 7.27 7.16 6.98 7.54 6.86 8.07 8.0 7.86 7.79 7.93 8.95 9.74 13.65
0.52 0.66 0.33 0.54 0.86 0.58 0.9 1.08 1.14 1.37 1.27 1.71 2.1 0.86 1.59 1.29 1.58 2.0 0.8 1.61 0.97 0.78 0.17 1.46 1.31 0.88 0.76 0.96 0.98 2.28 3.77
0.44 0.42 0.22 0.59 3.4 3.25 1.36 0.91 3.25 3.23 3.72 3.02 4.38 3.12 3.31 3.37 3.04 2.56 3.69 3.18 3.03 2.89 0.16 2.74 2.87 3.23 3.14 1.85 4.31 5.0 6.49
4.91 5.44 5.94 7.87 10.79 11.68 7.56 6.5 10.23 10.89 11.01 11.72 15.96 10.42 10.3 11.58 10.24 8.61 9.05 9.73 8.58 9.75 4.0 9.99 10.42 10.32 10.02 7.91 11.82 13.73 25.42
5.0 5.23 9.13 12.34 14.11 14.7 10.55 9.89 14.77 15.74 16.41 15.46 21.44 10.92 16.73 16.57 14.74 11.61 13.62 16.45 13.06 13.15 4.83 12.5 14.34 14.46 14.37 9.04 18.03 21.42 37.8
2.49 4.52 4.09 6.8 8.95 8.88 7.62 5.44 8.32 9.64 9.78 8.58 10.23 9.0 11.52 8.46 9.04 5.92 9.26 8.17 7.29 6.98 2.25 7.18 8.44 8.19 8.07 5.94 11.34 12.67 19.64
3.21 3.15 3.42 5.6 6.54 8.0 5.95 4.99 7.21 8.31 8.21 8.62 12.69 6.18 6.7 8.02 7.57 7.69 8.55 7.35 6.34 7.27 4.01 7.6 7.55 8.13 7.54 6.03 9.26 10.7 17.89
44.42 48.23 43.38 48.31 62.27 71.05 71.0 72.51 64.73 68.09 69.78 72.67 93.5 77.07 72.25 81.56 81.94 111.9 69.11 76.72 68.04 75.21 29.16 83.48 82.54 77.48 77.24 70.13 85.61 96.67 128.9
1.82 2.71 3.32 4.09 5.25 5.02 3.54 3.29 5.43 5.11 5.64 5.13 7.52 6.63 5.96 5.35 4.91 6.18 4.68 3.92 3.93 4.64 4.11 4.87 4.01 4.92 5.68 3.33 5.45 6.25 11.47
15.05 15.0 16.89 18.68 31.31 33.69 21.16 21.04 23.31 25.53 26.14 27.85 43.35 37.9 33.19 29.48 26.96 24.95 28.47 27.02 25.48 27.86 17.09 27.05 28.1 28.04 26.67 26.99 35.65 37.36 52.67
1.74 1.76 1.56 1.83 3.94 3.79 3.12 3.01 3.5 4.22 4.08 4.8 6.11 5.5 4.55 3.48 3.9 5.14 4.88 4.94 3.65 3.85 2.65 3.93 4.31 3.61 3.86 3.96 4.81 5.26 8.4
1.41 2.61 2.48 2.06 4.21 5.35 2.97 2.44 4.84 4.44 5.36 4.84 5.83 6.03 5.41 4.2 4.24 3.1 3.77 3.74 4.49 3.35 3.55 3.6 4.6 3.99 4.16 3.7 4.35 5.82 8.92
10.66 12.56 12.59 15.14 17.93 16.41 12.44 10.35 15.97 17.47 18.14 20.62 26.0 15.88 16.44 18.87 19.2 19.35 14.96 16.81 15.95 17.85 10.48 17.42 17.45 18.41 17.48 17.52 19.17 21.78 24.63
2.0 2.08 3.06 5.78 4.99 4.26 2.59 2.36 4.89 5.3 5.09 5.04 6.88 5.78 4.83 4.52 4.8 5.98 4.56 4.68 4.24 4.3 2.95 4.03 4.32 4.48 4.24 3.97 5.43 6.53 11.84
1.12 1.31 1.19 1.81 3.39 3.57 3.43 2.96 3.5 3.66 3.99 3.87 5.33 5.32 5.46 3.83 3.75 3.82 3.95 3.59 3.16 3.3 0.92 3.34 3.28 3.72 3.77 2.84 4.19 5.45 8.71
1.26 1.0 1.12 1.33 3.95 4.15 1.37 1.11 2.7 2.98 3.31 3.5 4.3 3.96 3.6 3.27 3.31 2.42 3.33 2.98 2.8 2.85 1.0 3.26 3.31 3.46 2.79 2.77 3.69 5.38 6.57
0.9 0.79 0.86 1.3 6.21 6.17 3.1 2.21 5.37 6.42 5.8 6.92 9.4 6.53 8.11 5.62 6.01 8.34 7.32 7.26 5.43 5.4 1.7 6.69 6.43 5.67 6.41 4.44 7.03 9.15 17.96
9.25 9.59 11.3 16.85 26.19 28.2 16.46 14.55 22.41 26.16 25.74 25.07 31.41 26.24 26.56 23.78 23.61 20.79 23.96 23.08 22.63 23.57 14.45 20.93 22.63 22.05 22.95 20.8 25.63 27.76 34.66
22.44 23.69 24.24 24.54 35.91 33.01 23.08 19.33 29.53 32.19 33.83 33.73 40.47 36.22 32.54 28.78 31.61 23.48 29.03 26.67 25.14 26.81 12.46 28.19 27.85 27.82 28.0 26.54 35.22 39.41 47.65
3.06 2.93 4.46 5.0 7.69 7.93 3.96 3.84 6.14 6.13 5.9 6.53 9.53 8.36 8.75 6.93 6.77 5.44 6.03 5.43 5.85 5.73 1.42 5.13 5.61 5.48 5.94 4.07 8.02 9.2 14.97
1.13 0.72 1.09 1.84 2.11 1.6 1.2 0.85 2.69 2.48 2.28 2.43 3.27 1.67 1.8 1.94 2.12 1.64 1.41 2.05 1.55 1.79 0.81 2.29 1.88 1.65 1.91 1.63 2.01 2.68 5.7
4.31 4.18 4.3 4.76 7.35 8.51 6.71 5.32 7.86 7.62 9.59 9.65 12.92 8.18 8.32 9.23 9.86 7.58 8.36 8.37 7.63 8.85 3.07 8.93 8.94 9.13 9.55 8.74 8.0 9.82 17.35
3.62 5.01 4.51 5.56 11.43 11.19 8.48 6.32 9.4 11.39 10.51 11.5 15.93 14.54 14.45 13.01 13.77 8.3 12.4 10.96 10.3 10.84 3.16 10.11 11.1 11.45 10.35 11.88 15.73 14.85 18.29
31.11 22.81 39.04 55.11 52.93 56.1 41.7 30.37 56.29 55.2 63.54 62.31 127.22 43.54 49.21 64.1 63.99 66.6 38.8 50.69 53.69 51.6 31.04 56.1 60.4 69.35 53.21 50.62 43.93 49.48 85.42
0.72 0.81 1.59 8.26 24.28 22.53 8.63 4.76 18.66 24.25 24.59 22.14 41.51 11.09 15.33 15.24 15.09 20.99 18.49 16.56 15.22 19.52 3.11 17.02 23.33 14.0 20.88 11.19 20.38 27.12 66.82
1.55 1.72 1.73 1.3 7.02 10.18 4.68 2.95 7.15 5.81 7.46 6.67 10.27 8.14 9.06 6.65 6.13 3.01 6.1 6.49 6.55 6.57 0.46 8.25 8.36 7.64 8.05 6.94 6.48 7.38 15.56
1.21 1.16 1.7 2.73 3.56 4.47 1.98 2.0 2.5 3.08 3.45 3.63 4.9 5.46 5.88 3.37 3.07 3.94 3.92 3.21 2.97 3.09 2.37 3.18 3.42 3.2 3.02 2.31 3.46 4.38 6.8
6.08 8.16 9.83 10.11 19.63 16.18 11.54 8.51 15.04 16.83 16.95 15.46 19.9 16.56 22.27 17.65 17.32 12.58 16.91 16.7 13.93 14.67 4.44 14.77 15.37 15.55 16.74 12.27 18.21 20.61 27.81
5.17 5.55 4.86 5.93 10.1 9.34 6.21 5.55 8.27 8.96 9.95 10.39 13.5 11.43 10.75 10.13 8.52 4.62 9.23 8.04 7.88 8.72 4.48 8.61 9.33 9.27 8.52 7.91 10.26 12.21 16.86
4.42 7.06 5.95 7.61 14.63 8.35 9.39 8.95 11.03 12.2 13.79 11.97 15.97 13.43 16.84 10.02 9.45 7.87 10.22 8.88 8.69 7.96 0.0 10.74 9.59 7.48 6.81 6.62 14.15 15.58 36.92
7.43 7.73 8.11 10.79 20.01 19.75 12.21 10.35 17.35 18.93 20.14 21.59 33.65 21.15 19.34 21.31 20.96 26.75 17.15 18.91 16.68 19.06 9.06 19.26 19.75 20.03 19.44 18.36 26.36 25.42 34.6
12.25 16.12 15.97 19.34 30.03 31.93 21.5 19.76 27.56 28.36 29.62 29.48 36.09 33.57 31.84 34.5 32.24 23.87 25.19 25.61 24.62 25.26 4.3 26.01 29.09 30.2 30.78 21.91 29.95 35.41 48.35
12.18 10.68 14.04 15.85 19.8 19.24 12.56 13.36 17.31 18.24 20.94 21.6 35.92 19.9 18.83 20.88 21.89 25.51 17.81 21.02 18.07 20.6 17.45 20.26 20.79 21.98 22.89 21.73 21.08 21.41 28.09
3.31 3.57 5.24 6.48 13.15 9.07 5.51 4.03 10.99 12.7 13.05 14.75 17.33 11.84 13.28 13.88 13.41 12.09 11.23 13.5 10.8 11.04 2.09 13.31 13.63 13.89 12.16 10.18 10.83 14.91 26.72
0.05 0.17 0.23 0.45 0.57 0.53 0.33 0.35 0.47 0.8 0.64 0.69 0.81 0.48 0.64 0.59 0.58 0.73 0.63 0.73 0.52 0.5 0.37 0.57 0.52 0.57 0.63 0.39 0.86 0.96 1.68
0.89 0.74 1.15 1.28 2.31 1.82 0.7 0.72 2.04 1.86 1.63 2.46 3.86 2.33 2.28 2.15 1.83 1.02 1.4 2.04 1.59 1.89 0.54 1.45 1.79 1.56 1.6 1.35 1.83 2.26 5.82
4.76 5.67 6.64 8.76 12.29 12.94 10.09 8.18 10.64 11.55 12.41 12.08 14.21 10.63 10.53 11.97 11.11 10.81 10.97 11.66 10.59 10.81 10.4 11.31 11.9 10.1 10.81 10.69 13.07 14.85 23.72
10.27 8.98 8.07 11.36 13.62 14.71 11.5 8.71 15.27 15.86 15.11 16.23 25.63 10.92 12.96 14.26 15.94 15.46 11.83 15.55 13.42 13.47 8.39 16.1 15.9 14.94 13.49 17.67 14.25 17.12 21.41
0.09 0.11 0.1 0.19 0.64 0.91 1.49 0.98 1.57 1.88 1.83 2.12 3.07 1.8 3.61 1.96 2.08 3.63 2.61 2.72 1.52 1.01 0.13 2.01 1.62 1.6 1.32 0.99 1.56 2.32 4.83
1.13 1.14 1.01 1.61 2.64 2.72 2.63 2.46 2.38 2.63 2.51 2.66 4.69 2.59 2.75 2.68 2.69 2.23 2.79 2.99 2.56 2.82 2.61 2.39 2.48 2.71 2.84 2.72 3.51 3.64 5.81
0.72 0.84 0.91 1.51 2.32 2.11 1.23 1.26 1.67 1.96 1.95 2.03 3.16 2.13 2.43 2.31 2.16 1.63 2.28 1.92 2.17 1.73 0.73 2.19 2.23 1.95 1.81 1.76 2.66 3.21 4.7
1.37 2.31 2.16 4.42 15.64 17.87 15.83 13.64 19.3 20.05 17.69 17.44 18.74 11.88 23.71 18.68 20.39 33.34 28.65 30.44 19.29 17.43 1.19 26.74 22.5 18.26 20.37 14.75 17.07 25.46 60.66
1.32 1.5 1.94 2.33 3.31 2.62 1.81 1.28 2.67 2.9 3.11 2.99 3.23 2.08 2.66 2.19 2.17 1.64 2.51 2.33 2.17 2.39 1.33 2.27 2.29 2.55 2.38 2.29 3.25 3.96 6.45
9.16 9.78 9.47 12.03 15.89 15.54 13.49 11.96 15.11 14.8 17.93 15.81 17.55 19.08 19.81 16.94 15.22 17.05 15.67 15.01 15.0 13.91 8.79 15.39 15.81 15.58 16.66 13.52 21.14 22.27 25.76
5.67 5.76 5.88 6.49 9.18 8.23 4.83 3.9 6.82 6.69 7.23 7.38 9.9 6.26 7.21 7.49 6.98 5.66 7.9 7.11 6.7 6.67 3.7 6.29 7.28 7.45 6.88 7.35 7.99 8.74 11.73
4.68 3.99 5.46 6.65 7.77 8.02 5.93 5.14 6.6 7.2 7.51 7.7 8.05 7.86 7.74 7.55 7.17 6.95 6.98 7.28 6.78 6.81 5.57 7.4 7.53 7.06 7.36 6.92 8.09 9.18 9.93
1.97 1.84 1.6 2.47 3.78 3.77 3.06 2.68 3.53 3.81 4.3 3.77 5.33 4.99 5.14 3.94 3.75 3.53 4.55 3.37 3.53 3.5 2.44 3.24 3.34 4.15 3.23 3.36 4.8 5.17 7.61

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)