Heatmap: Cluster_28 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_10961.1 (LTA3)	-0.58	-0.63	-0.99	-0.73	-0.16	0.01	-0.01	0.28	-0.31	-0.25	-0.25	0.15	1.07	0.15	0.03	0.09	0.19	-0.02	-0.56	-0.15	-0.0	0.03	0.19	0.26	0.17	0.1	-0.06	0.24	-0.17	-0.12	0.46
Lsat_1_v5_gn_0_3100.1	-1.09	-1.11	-1.03	-0.5	-0.22	0.05	0.11	0.41	-0.41	-0.22	-0.25	0.09	0.95	0.02	-0.31	-0.11	0.03	-0.04	-0.71	0.05	0.06	0.17	-0.73	0.55	0.35	0.33	0.26	0.29	-0.09	-0.07	0.72
Lsat_1_v5_gn_0_37780.1 (RPS15AD)	-1.11	-1.38	-1.42	-0.82	-0.43	-0.09	0.09	0.48	-0.24	-0.0	-0.1	0.43	1.2	-0.16	-0.43	-0.02	0.22	0.05	-0.86	-0.07	-0.06	0.06	-0.59	0.53	0.29	0.13	-0.04	0.31	-0.22	-0.05	0.89
Lsat_1_v5_gn_0_41440.1	-1.5	-1.47	-1.68	-1.22	-1.12	-0.47	-0.16	0.68	-0.83	-0.58	-0.51	-0.1	0.93	0.5	0.24	0.01	0.09	-0.11	-0.34	0.05	0.3	0.31	0.39	0.62	0.47	0.35	0.24	0.24	-0.13	-0.25	0.66
Lsat_1_v5_gn_0_4221.1	-1.15	-1.34	-1.45	-1.06	-0.44	-0.07	-0.13	0.27	-0.2	-0.18	-0.12	0.42	1.17	0.1	-0.38	0.03	0.24	0.0	-0.82	-0.07	0.03	0.17	-0.35	0.59	0.33	0.09	0.03	0.3	-0.16	-0.1	0.88
Lsat_1_v5_gn_0_8021.1	-0.99	-1.16	-1.3	-0.93	-0.29	0.18	-0.0	0.45	-0.38	-0.39	-0.23	0.24	0.99	0.59	0.19	0.07	0.12	-0.05	-0.92	-0.27	-0.06	0.06	0.34	0.35	0.17	0.12	-0.13	0.25	-0.17	-0.21	0.63
Lsat_1_v5_gn_0_9581.1 (RPL30A)	-0.92	-1.14	-1.2	-0.98	-0.29	0.08	0.14	0.71	-0.56	-0.36	-0.36	0.1	1.26	0.26	-0.23	-0.19	0.13	0.1	-0.91	-0.08	-0.08	0.06	-0.24	0.41	0.32	0.08	-0.06	0.41	-0.27	-0.27	0.83
Lsat_1_v5_gn_1_11640.1	-1.27	-1.58	-1.75	-1.19	-0.71	-0.27	-0.15	0.53	-0.48	-0.25	-0.25	0.43	1.35	-0.08	-0.17	0.13	0.32	-0.3	-0.71	0.08	0.08	0.24	-0.36	0.6	0.44	0.19	0.06	0.5	-0.45	-0.35	0.82
Lsat_1_v5_gn_1_12380.1 (P40)	-1.15	-1.5	-1.55	-1.17	-0.79	-0.33	-0.39	0.17	-0.53	-0.53	-0.32	0.21	1.7	-0.08	-0.28	0.0	0.27	0.58	-0.97	-0.1	0.02	0.03	-0.04	0.54	0.2	0.12	-0.28	0.23	-0.41	-0.28	1.25
Lsat_1_v5_gn_1_16101.1	-1.28	-1.36	-1.58	-1.06	-0.46	-0.07	-0.07	0.38	-0.47	-0.26	-0.17	0.31	1.35	0.24	-0.05	0.0	0.15	0.09	-0.86	-0.14	-0.07	0.01	0.21	0.4	0.21	0.07	-0.14	0.2	-0.17	-0.12	0.94
Lsat_1_v5_gn_1_25420.1 (EVR1L1)	-1.55	-1.47	-1.69	-1.42	-1.01	-0.66	0.02	0.61	-0.22	-0.14	-0.12	0.55	1.37	-0.37	-0.37	0.16	0.39	0.19	-0.74	0.06	-0.0	0.01	-0.53	0.56	0.35	0.08	-0.18	0.19	-0.41	-0.03	1.13
Lsat_1_v5_gn_1_27840.1	-1.27	-1.2	-1.34	-0.97	-0.43	-0.08	-0.14	0.42	-0.56	-0.59	-0.54	0.06	1.03	0.43	0.11	-0.06	0.16	0.43	-0.56	-0.04	0.04	0.1	-0.06	0.47	0.29	0.22	-0.07	0.22	-0.15	-0.12	0.95
Lsat_1_v5_gn_1_32120.1	-1.35	-1.31	-1.53	-1.32	-0.55	-0.2	0.1	0.6	-0.42	-0.16	-0.35	0.31	1.33	-0.22	-0.51	-0.09	0.36	0.15	-0.64	0.03	-0.05	0.07	-0.28	0.58	0.31	0.2	-0.03	0.38	-0.27	-0.16	0.9
Lsat_1_v5_gn_1_38480.1 (P40)	-1.26	-1.38	-1.44	-0.93	-0.52	-0.21	-0.22	0.23	-0.2	-0.07	-0.03	0.41	1.13	0.37	0.02	0.07	0.26	0.05	-0.81	-0.11	0.02	0.06	0.02	0.47	0.22	0.07	-0.11	0.16	-0.14	-0.04	0.79
Lsat_1_v5_gn_1_43881.1 (PGY2)	-1.02	-1.19	-1.5	-1.09	-0.55	-0.14	-0.26	0.11	-0.31	-0.15	-0.11	0.42	1.17	0.31	0.02	0.11	0.29	0.22	-0.59	-0.1	0.02	0.08	-0.32	0.45	0.26	0.02	-0.11	0.23	-0.09	-0.04	0.8
Lsat_1_v5_gn_1_49881.1 (RPL37A)	-0.88	-1.19	-1.43	-1.16	-0.65	-0.22	-0.09	0.49	-0.25	-0.26	-0.15	0.46	1.36	0.06	-0.13	0.18	0.36	-0.16	-1.01	-0.08	0.04	0.15	-0.16	0.64	0.34	0.1	0.05	0.23	-0.43	-0.34	0.53
Lsat_1_v5_gn_1_53901.1	-0.87	-1.2	-1.36	-0.98	-0.37	-0.06	0.0	0.42	-0.32	-0.23	-0.26	0.27	1.03	-0.0	-0.3	-0.03	0.21	0.04	-0.54	0.03	0.08	0.26	-0.43	0.61	0.39	0.26	0.08	0.47	-0.19	-0.2	0.49
Lsat_1_v5_gn_1_54400.1 (RPL12C)	-1.33	-1.09	-1.28	-0.79	-0.46	-0.04	-0.02	0.26	-0.26	-0.34	-0.3	0.2	1.08	0.53	0.21	0.22	0.38	-0.22	-0.89	-0.11	0.0	0.04	0.06	0.34	0.22	0.11	-0.18	0.26	-0.06	-0.03	0.64
Lsat_1_v5_gn_1_57661.1 (dS17)	-1.24	-1.23	-1.51	-1.12	-0.45	-0.14	-0.11	0.3	-0.51	-0.36	-0.36	0.18	1.01	0.41	0.03	0.06	0.23	0.47	-0.69	-0.01	-0.02	0.11	-0.01	0.47	0.26	0.17	-0.05	0.13	-0.14	-0.16	0.95
Lsat_1_v5_gn_1_59281.1 (PGY1)	-0.94	-0.83	-1.04	-0.9	-0.46	0.0	0.2	0.34	-0.3	-0.2	-0.23	0.13	1.03	0.13	-0.19	-0.0	0.22	0.24	-0.7	-0.02	-0.02	0.11	-0.12	0.29	0.16	0.15	-0.06	0.3	-0.06	-0.04	0.67
Lsat_1_v5_gn_1_59881.1 (RPS5B)	-1.07	-1.32	-1.23	-0.78	-0.43	-0.06	-0.12	0.19	-0.4	-0.24	-0.09	0.26	1.17	0.44	0.1	0.06	0.26	0.08	-0.85	-0.11	0.0	-0.01	-0.14	0.45	0.16	0.04	-0.13	0.32	-0.16	-0.03	0.76
Lsat_1_v5_gn_1_60041.1	-1.33	-1.53	-1.49	-1.2	-0.52	-0.04	0.11	0.57	-0.43	-0.25	-0.27	0.26	1.14	0.18	-0.08	0.07	0.33	-0.15	-0.62	-0.02	0.1	0.23	-0.27	0.48	0.32	0.2	0.06	0.3	-0.23	-0.17	0.7
Lsat_1_v5_gn_1_62040.1 (RPP2D)	-1.2	-1.31	-1.33	-1.07	-0.39	-0.05	-0.12	0.3	-0.32	-0.15	-0.22	0.29	1.07	0.27	-0.17	-0.2	0.07	0.19	-0.82	-0.13	-0.07	0.1	0.25	0.64	0.39	0.08	-0.13	0.27	-0.21	-0.08	0.85
Lsat_1_v5_gn_1_64240.1 (RPL12C)	-1.41	-1.57	-1.83	-1.26	-0.63	-0.22	-0.08	0.27	-0.41	-0.24	-0.23	0.49	1.29	0.09	-0.33	0.1	0.24	0.35	-0.86	-0.05	-0.06	0.02	-0.14	0.66	0.34	0.17	-0.04	0.35	-0.25	-0.21	0.95
Lsat_1_v5_gn_2_102901.1	-1.52	-1.78	-1.74	-1.09	-0.72	-0.45	-0.03	0.62	-0.45	-0.23	-0.2	0.42	1.61	0.02	-0.22	-0.02	0.24	-0.02	-1.12	-0.12	-0.1	-0.12	-0.32	0.71	0.26	-0.03	-0.23	0.21	-0.45	-0.17	1.25
Lsat_1_v5_gn_2_104400.1	-1.17	-1.29	-1.37	-1.14	-0.33	-0.02	0.12	0.64	-0.61	-0.43	-0.3	0.2	1.1	0.17	-0.14	0.01	0.18	0.21	-0.8	-0.08	0.01	-0.01	0.31	0.43	0.21	0.1	-0.21	0.24	-0.11	-0.05	0.83
Lsat_1_v5_gn_2_109600.1	-0.92	-1.24	-1.19	-0.88	-0.32	0.04	0.26	0.72	-0.54	-0.29	-0.16	0.19	1.23	0.0	-0.23	0.03	0.27	-0.23	-0.69	-0.06	-0.1	0.11	-0.12	0.43	0.23	0.1	-0.01	0.19	-0.28	-0.17	0.71
Lsat_1_v5_gn_2_115940.1 (RPL23A)	-1.16	-1.51	-1.49	-0.75	-0.63	-0.34	-0.29	0.17	-0.44	-0.35	-0.15	0.27	1.38	0.3	-0.01	0.07	0.21	0.16	-0.84	-0.07	0.02	0.06	-0.25	0.5	0.31	0.12	-0.15	0.17	-0.15	-0.13	1.07
Lsat_1_v5_gn_2_117061.1 (RPS6)	-0.96	-1.27	-1.28	-0.59	-0.27	0.06	0.01	0.45	-0.49	-0.28	-0.27	0.06	1.01	0.41	0.02	-0.07	0.11	-0.0	-0.79	-0.13	0.02	0.19	0.3	0.39	0.2	0.12	-0.05	0.14	-0.15	-0.12	0.72
Lsat_1_v5_gn_2_120360.1	-0.87	-1.01	-1.05	-0.7	-0.18	0.09	-0.08	0.33	-0.42	-0.32	-0.34	0.13	1.16	0.51	0.23	-0.12	0.15	-0.05	-0.51	-0.14	-0.04	0.07	-0.26	0.38	0.22	0.05	-0.09	0.15	-0.0	-0.12	0.6
Lsat_1_v5_gn_2_121560.1 (EIF2)	-0.75	-0.95	-0.81	-0.85	-0.23	-0.08	0.06	0.67	-0.6	-0.5	-0.36	0.02	1.05	0.35	0.06	0.03	0.28	0.23	-0.52	-0.05	-0.08	0.06	0.19	0.27	0.03	0.02	-0.16	0.21	-0.2	-0.15	0.6
Lsat_1_v5_gn_2_128701.1	-1.21	-1.34	-1.51	-0.94	-0.57	-0.17	-0.15	0.4	-0.37	-0.14	-0.21	0.44	1.18	0.33	0.02	0.14	0.35	-0.1	-1.01	-0.11	-0.02	0.14	-0.52	0.54	0.32	0.06	-0.07	0.2	-0.13	-0.07	0.88
Lsat_1_v5_gn_2_131381.1	-0.91	-1.12	-0.91	-0.65	-0.36	-0.1	-0.22	0.1	-0.26	-0.15	0.01	0.26	1.03	0.41	0.17	0.17	0.25	0.01	-0.53	-0.07	0.05	0.02	-0.0	0.35	0.16	0.06	-0.06	0.02	-0.15	-0.04	0.54
Lsat_1_v5_gn_2_131641.1 (RPL24A)	-0.81	-0.96	-1.24	-0.79	-0.38	0.02	-0.02	0.3	-0.57	-0.32	-0.19	0.24	1.08	0.32	0.06	-0.09	0.08	0.12	-0.43	-0.12	0.08	0.19	-0.27	0.49	0.35	0.14	-0.06	0.36	-0.07	-0.32	0.49
Lsat_1_v5_gn_2_19401.1 (SAC53)	-0.89	-1.13	-1.18	-0.84	-0.46	-0.1	-0.28	-0.02	-0.35	-0.21	-0.21	0.25	0.99	0.37	0.03	0.12	0.22	0.16	-0.54	-0.05	0.08	0.09	0.12	0.44	0.23	0.09	-0.11	0.27	-0.06	-0.12	0.75
Lsat_1_v5_gn_2_54780.1	-1.27	-1.4	-1.48	-0.95	-0.61	-0.18	-0.25	0.04	-0.23	-0.14	-0.19	0.27	1.2	0.09	-0.3	0.08	0.26	0.27	-0.78	-0.01	0.13	0.13	-0.19	0.57	0.38	0.24	0.04	0.3	-0.15	-0.08	0.79
Lsat_1_v5_gn_2_56521.1	-1.07	-1.23	-1.32	-1.03	-0.33	0.01	-0.17	0.23	-0.51	-0.34	-0.21	0.18	1.05	0.34	0.07	-0.04	0.09	0.51	-0.57	-0.14	-0.0	0.06	0.49	0.38	0.22	0.07	-0.09	0.11	-0.17	-0.22	0.76
Lsat_1_v5_gn_2_58480.1 (AML1)	-0.86	-1.07	-1.11	-0.71	-0.39	-0.02	-0.04	0.42	-0.41	-0.2	-0.14	0.2	1.1	0.32	0.02	0.06	0.27	-0.02	-0.67	-0.05	0.02	0.08	-0.18	0.33	0.16	0.1	-0.14	0.25	-0.09	-0.13	0.66
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.