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Heatmap: Cluster_105 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
- - - - - 1.57 - 2.92 - - - - - - - - - 1.72 - - - - 1.8 - 1.67 - 1.98 1.7 - - 1.72
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.39 - - 0.98 - - 1.82 - - - 0.61 - -0.79 1.99 - 0.22 2.41 - - -0.11 -0.83 -0.86 - -1.06 0.45 0.81 0.05 0.09 -1.03 1.77
- - - - - - - 3.76 - - - - - 1.68 3.83 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - -0.08 - 0.62 -1.43 1.41 -2.49 - 0.2 0.57 -1.74 -0.87 - -0.1 0.72 1.57 -1.74 0.99 0.05 - -1.12 0.62 1.19 -1.86 - 0.66 0.92 -0.14 2.02
- - - - - - - 4.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - 0.46 - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
- - 3.01 3.07 1.73 - - - - - - - - - - - - 1.48 - - - - - - - - - 3.08 - - -
- - - - - 2.7 - 2.56 - 2.87 - - - - - - - - - - - - - - 1.71 - - 3.01 - - -
- - 1.4 2.08 -1.55 -1.6 -1.28 0.81 -1.26 - - 0.36 - - - - -0.08 2.25 1.67 - - - 1.86 - - -1.22 - 1.85 0.38 -0.95 0.32
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
Lsat_1_v5_gn_3_112521.1 (AUXILIN-LIKE4)
 - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.2 - - - - - 2.19 - - - 3.28 3.6 1.24 -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
- - - 1.91 - 1.65 - 3.0 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 1.97 3.12 - 1.79 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
- - - - - - - - - 1.54 - - 2.55 1.61 - - 1.39 - - - - - - - - - 1.62 3.49 - - 1.18
- - - - -0.77 -0.81 1.96 3.33 - 1.13 - - -0.69 - -0.59 - - -1.04 - - - 0.49 2.61 - - 1.02 - 0.77 - -0.54 -
- - - - - - - 4.07 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.83
- - - - - - - 3.03 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.95 - 3.91
- - - - - - - 2.69 - - - - 2.64 - - - - - - 2.88 - - - - - 1.49 - - - - 3.02
- - - - 3.18 - - - - - - - - 3.56 - - - - - - - - - - - - - 3.35 - - -
- - - - - - - 4.07 - - - - - - - - - - - - - - - 3.82 - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
- - - - - - - 3.97 - - - - - - 3.94 - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - 2.73 2.8 - - - - - - - - - 2.52 - - - - 2.6 - - - - - - 2.49 -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.31 - - 3.49
- 2.81 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.19 - - - - 3.89 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 0.35 - 0.68 - - - - - 0.8 - - - 0.52 1.63 - 2.6 - - - - - 0.89 3.3 - 2.04 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
- - - - - - - 4.07 - - - - - - - - - - - - - - - 3.82 - - - - - - -
- - - - - - 1.99 - - - - - - - - - 2.15 - - - - - 3.04 - - - - 2.96 - - 2.72
- - - - 1.82 2.76 - 2.91 - - - - 1.9 - - - - - - - - - - - - - - 2.6 - 1.77 -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.61 - - - - - - - - - 2.74 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.45 -1.63 0.36 0.38 -2.01 0.45 -0.18 -0.99 - -0.83 -0.8 0.49 -0.79 - -0.02 1.08 -1.05 -1.03 0.41 -0.61 0.24 1.74 -1.08 -1.95 -0.53 -0.58 2.13 0.14 0.77 -0.42
- - - - - 3.23 - 3.51 - - - - 3.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 2.64 - 3.08 - - 3.03 - - - - - - 3.03 - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - -
- - - - - - - 3.98 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.93 - - - -
- - - - - - - 4.02 - - 3.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 3.72 0.88 - 0.92 - 2.39 - 1.93 - - 1.66 - - - - - - - - 0.9 - - - -
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 2.3 - - 3.84 - - - - - - - - - - - 2.47 - - - - - - - - - - 2.63
- - - - - - - - - 2.39 - 2.45 - - - - - - - - - - - - - 2.47 - 3.23 - - 2.43
- - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.