Heatmap: Cluster_15 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
- - - - - - - - - - - - - - - 4.23 - - - 3.61 - - - - - - - - - - -
-1.26 -1.4 -0.98 -0.82 -0.02 0.11 -0.27 -0.27 -0.04 0.12 0.39 0.13 0.55 0.65 0.94 0.05 0.4 -0.83 0.07 0.43 0.26 -0.12 -2.21 0.06 -0.18 0.13 0.03 -0.08 0.03 0.24 0.23
-1.84 -2.68 -2.59 -1.38 1.23 -0.12 0.12 -1.56 -0.15 0.88 0.73 -0.04 -0.87 0.62 1.21 0.31 0.53 -1.92 0.52 0.43 -0.13 0.03 -2.73 -0.01 -0.62 -0.74 0.76 0.06 -0.21 -0.03 -0.12
-1.1 -1.01 -0.47 -0.12 -0.17 -0.19 -0.35 -0.85 0.38 0.46 0.44 0.53 -0.08 -1.29 -0.43 0.43 0.42 -1.31 -0.0 0.41 0.31 0.33 -4.51 0.18 0.37 0.51 0.45 0.02 0.14 0.27 0.28
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
-0.28 -1.35 -0.05 -0.22 -2.31 -2.48 0.41 0.07 0.61 0.73 0.54 0.91 0.66 -3.89 -1.34 0.49 0.8 -3.07 0.06 0.62 0.24 -0.07 -6.71 0.51 0.48 -0.11 -0.17 -0.04 -0.67 0.41 0.15
- - - - - - - - - - - - - - 3.29 4.41 - - - - - - - - - - - - - - -
-0.93 -0.78 0.28 0.02 -0.11 -0.08 -0.72 -0.9 0.2 0.22 0.1 0.71 0.19 -2.2 -1.21 0.34 0.37 -1.2 -0.92 0.24 0.22 0.36 -3.6 0.04 0.57 0.83 0.86 0.45 0.13 0.13 -0.08
- - - -4.86 -2.05 -1.25 0.29 -0.18 0.78 0.96 1.11 0.73 -3.24 -2.43 0.95 1.63 1.27 -2.63 0.77 0.66 0.77 0.01 -2.44 -2.19 -1.01 0.74 0.98 -2.09 -0.1 0.16 -
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
-3.67 -2.65 -2.38 -1.6 -0.13 -0.4 -0.06 -1.02 0.6 1.03 0.51 0.71 -0.01 -3.39 -0.67 0.35 0.87 -4.48 1.25 1.4 0.36 -0.23 - 0.26 0.28 -0.18 -0.1 0.44 0.18 0.31 -1.01
-3.26 -2.56 -4.33 -0.89 -0.5 -0.72 -0.08 -0.8 0.41 0.86 0.56 0.89 -0.17 -3.18 -0.44 0.12 0.84 -4.13 1.19 1.33 0.33 -0.1 -4.68 0.43 0.66 -0.3 -0.08 0.46 0.15 0.44 -0.73
-0.51 -1.42 -0.54 -1.27 -0.29 -0.62 -0.24 -0.08 0.29 0.66 0.13 0.61 -0.23 -1.37 -0.78 0.21 0.18 -2.86 -0.42 0.87 0.67 0.7 -3.83 -0.24 0.29 0.51 0.69 1.15 0.27 -0.15 -0.74
-4.32 -3.95 -6.67 -4.71 -1.24 -0.77 0.99 1.05 -0.48 -0.25 -0.73 -0.73 -0.98 0.79 2.12 0.47 0.5 -0.67 0.67 0.57 -0.2 -0.26 -5.02 0.55 -0.05 -0.79 -0.24 -0.05 0.38 0.4 -0.39
-1.12 - 0.12 - -2.77 -2.08 -0.15 -1.73 -0.38 1.47 0.48 1.32 -1.77 -1.95 -2.12 -1.79 1.48 - - 1.44 -0.32 1.3 -1.67 -3.17 0.09 1.66 1.22 1.65 -1.71 - -2.47
- - - - 1.81 - - - - - - - 2.13 1.37 - 2.63 1.04 3.14 - - - - 1.8 - - - - - - - -
-2.5 -4.14 -2.96 -1.31 -1.62 -1.76 -0.51 -0.64 0.5 0.86 0.86 1.11 0.72 -1.24 0.58 0.48 0.79 -3.91 -0.15 0.73 0.22 -0.2 -4.95 0.65 0.33 -0.32 -0.39 0.28 -0.08 0.73 0.55
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
-4.47 -4.88 -4.59 -4.01 0.57 0.38 -0.29 -0.01 0.02 0.59 0.03 0.46 -1.03 -0.42 0.47 0.45 0.4 -0.32 0.36 0.02 -0.15 0.21 -5.58 -0.2 0.54 0.45 0.5 -0.61 1.1 0.95 -0.04
-2.54 -2.95 -0.98 0.13 -0.37 -0.66 -0.04 -0.39 0.36 0.63 0.49 0.73 0.24 -1.57 -0.43 0.22 0.51 -1.21 0.09 0.62 0.12 0.17 -5.14 0.65 0.35 0.33 0.16 0.3 -0.18 0.32 0.44
- - - - - - - - - - - - - - - 4.15 - - - - - - - - - - - - 3.72 - -
-1.12 - 0.07 -2.75 -1.46 0.66 -0.92 0.13 0.86 -0.56 -0.44 -0.75 -0.64 -0.85 -0.32 1.79 1.37 - 0.63 1.08 -0.11 0.53 - -0.89 0.86 0.91 -3.27 -2.05 -0.16 0.37 0.1
- - - - - - - - 2.48 - - - - - - 3.35 - - - - - - 2.33 - - 3.34 - - - - -
-2.7 -2.28 -2.11 -0.07 -1.54 -0.97 0.08 0.38 0.25 0.58 0.54 0.83 0.82 -0.92 -0.06 0.41 0.51 -1.76 -0.39 0.43 0.02 0.02 -2.3 0.54 0.39 0.13 0.06 -0.29 0.03 0.59 0.52
-3.38 -2.14 -2.56 -2.17 0.31 -0.99 -0.42 -1.55 0.66 1.01 0.18 0.94 0.1 -2.65 0.74 1.21 0.95 - -0.63 0.07 -0.15 -0.11 - -0.92 -0.28 0.84 0.82 -0.74 0.42 1.27 -0.21
- - 2.55 - - - - - 2.05 - - - - - 2.34 3.59 - - - 1.96 - - - - - - - - - - -
-0.61 -0.92 -0.6 -0.48 0.14 0.05 -0.36 -1.07 0.24 0.16 0.56 0.63 -0.06 0.61 0.61 0.06 0.25 -1.6 -0.02 0.02 0.03 -0.04 -0.15 0.05 -0.01 0.0 0.24 0.49 -0.14 -0.05 -0.39
- - - - -1.21 -1.42 -3.16 -5.37 -0.97 0.45 0.27 0.76 -0.15 -3.76 0.93 -0.08 0.38 -0.22 -0.06 0.72 0.41 0.03 -1.42 0.03 0.03 0.45 0.26 -1.78 1.44 1.49 1.83
1.81 - - - - - - - - - - - 0.65 0.84 - 3.22 - 3.16 - - - - - - - - -8.07 - - - 2.55
-0.38 -0.72 -1.19 -1.28 -0.67 -0.26 0.41 0.45 0.75 0.85 0.68 0.6 0.03 0.17 -0.38 0.21 0.39 0.5 -0.0 0.14 -0.02 0.09 0.66 -0.22 0.01 -0.26 -0.48 -0.65 -2.1 -1.94 -0.1
0.6 0.5 0.47 0.25 -0.0 -0.06 -0.49 -0.88 0.69 0.69 0.5 0.48 -2.06 0.15 0.63 0.33 0.1 -4.97 -0.02 0.21 0.35 -0.15 -1.05 -0.43 -0.29 -0.26 -0.14 -0.55 -0.2 -0.15 -1.2
-0.38 -0.71 0.11 0.56 0.02 -0.37 -0.01 -0.23 0.42 0.56 0.48 0.36 -0.42 0.27 0.51 0.43 0.24 -1.07 0.07 0.07 -0.25 0.19 -0.4 -0.41 -0.19 -0.16 -0.04 0.03 -0.4 -0.43 -0.49
- - - - - - - - - - - - - 3.83 - 4.07 - - - - - - - - - - - - - - -
- 0.58 - - 2.17 - - - - - 0.5 - - - 2.1 2.7 1.19 - - - - - 1.82 1.16 - - - - 1.29 1.24 -
- - - - - -1.37 1.51 1.1 1.08 1.83 2.08 -0.33 0.25 - -2.81 1.56 0.26 -0.8 -3.07 -0.88 -0.91 0.71 - - -3.1 0.92 0.57 -0.25 -1.35 -0.28 -0.95
-1.28 -1.05 -0.92 -0.52 -0.59 -0.16 -0.33 0.13 -0.09 0.24 0.24 0.29 0.18 0.76 0.68 0.21 0.09 -0.64 0.19 0.1 -0.06 0.02 -0.68 0.11 0.28 0.35 0.05 0.37 0.09 -0.31 0.05
-1.07 -1.06 -0.21 -0.02 -0.44 -0.4 -1.06 -1.79 0.3 0.16 0.11 0.54 0.05 -2.74 -1.69 0.85 0.8 -3.36 -1.15 0.28 0.4 0.85 -2.61 0.08 0.49 0.89 0.94 0.36 0.06 0.41 0.1
-2.46 -2.47 -1.24 -0.15 -0.7 -1.04 -0.2 -0.14 0.39 0.61 0.56 0.76 0.33 -0.51 -0.02 0.37 0.67 -1.41 0.51 0.63 0.27 0.2 -8.25 0.38 0.19 0.18 0.14 0.38 -0.15 0.12 -0.09
-1.83 -1.29 0.26 0.62 -0.01 -0.48 -0.66 -1.27 0.19 0.23 0.49 0.43 -1.05 -4.46 -2.05 0.19 -0.08 -8.92 -1.13 0.4 0.57 0.74 -6.46 0.09 0.67 0.85 1.05 -0.31 0.46 0.97 0.36
-0.99 -1.61 -1.34 -2.41 -0.12 0.39 0.13 -0.03 1.36 0.66 0.39 0.66 0.55 0.72 0.45 1.21 1.02 -0.61 -0.3 -0.29 -0.64 -0.7 -0.88 -0.11 -0.37 -1.28 -1.24 -0.78 -1.05 -0.24 -0.16
-0.65 -1.66 -1.19 -0.36 0.44 0.06 -0.04 -0.69 0.21 0.2 0.15 -0.01 -0.55 0.46 1.18 0.22 0.49 -0.77 0.28 0.38 -0.38 -0.06 -1.88 -0.19 0.06 0.05 -0.17 -0.37 0.0 0.56 0.42
-1.46 -1.02 -0.62 -0.43 0.06 0.58 -0.01 -0.14 -0.08 0.05 0.02 0.16 -0.69 -0.41 -0.08 0.68 0.37 0.12 -0.12 0.04 0.25 0.4 -2.48 -0.29 0.22 0.61 0.65 -0.22 0.44 0.21 -0.3
-1.5 -1.57 -0.25 0.13 -0.28 -0.52 -0.04 -0.24 0.24 0.54 0.38 0.69 0.06 -4.16 -0.71 0.57 0.68 -2.81 -0.33 0.41 0.31 0.48 -6.55 -0.03 0.54 0.63 0.52 0.19 0.28 0.46 -0.65
-0.59 -0.89 -1.21 -1.81 0.31 -0.55 -0.42 -1.47 1.05 0.67 0.89 0.67 -3.24 -0.31 0.82 0.32 0.29 -5.79 0.07 0.61 0.15 0.06 -1.64 0.34 0.17 0.25 0.57 -1.03 -0.22 0.6 -0.34
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
-0.43 -1.06 -1.52 -0.75 -0.6 -0.68 -0.57 -1.71 0.72 0.73 0.47 0.69 -2.25 0.71 1.41 0.72 0.63 -5.6 0.21 0.63 0.05 -0.41 -0.73 -0.15 -0.18 -0.16 0.02 -1.69 0.26 0.64 -0.52
- - - - - 1.39 - - - - - - 3.25 - 1.6 3.43 - - - - - - - - - - - - 2.33 - -
-3.87 -4.12 -3.51 -4.31 0.16 -0.24 -0.27 0.1 0.12 0.07 -0.21 0.42 0.31 -0.8 -0.24 0.38 0.24 1.1 0.83 -0.19 -0.17 0.35 - -0.08 0.32 0.34 1.07 -0.15 0.25 0.18 0.71
0.12 -0.21 -0.74 -0.77 0.04 -0.18 -0.63 -1.22 0.08 0.14 0.22 0.13 0.02 0.73 0.33 -0.14 -0.03 -1.17 0.38 0.06 0.14 -0.04 -0.05 0.41 0.05 0.11 0.13 0.43 -0.01 -0.16 0.06
-2.33 -3.62 -2.25 -0.96 -0.67 -0.55 -0.43 -0.84 0.45 0.71 0.66 0.75 0.63 -0.33 1.03 0.65 0.88 -3.18 0.16 0.54 0.15 -0.0 -1.98 0.38 0.16 -0.23 -0.22 -0.19 -0.14 0.28 0.21
- - 2.92 - - - - - 2.85 - - - - - 2.89 3.14 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - 1.22 1.27 0.7 -1.58 - 0.26 -0.16 -0.78 - 0.54 -0.59 0.98 -0.17 0.0 -1.84 1.03 0.72 -1.83 1.11 -0.86 1.14 -0.19 0.12 -2.02 -0.77 0.99 0.73
- - - 3.05 - - 2.87 - - - - - - - - 3.16 - - - - - - - - - - - - - - 2.69
-0.36 -0.87 -0.99 -1.11 0.53 0.06 -0.82 -1.71 0.57 0.72 0.83 0.95 -4.29 0.68 1.01 0.57 0.7 - 0.18 0.55 -0.07 -0.37 -4.26 -0.09 0.36 0.11 0.21 0.4 -0.53 -0.52 -2.46
-0.49 -0.7 -0.21 0.09 -0.78 -0.79 -0.31 -0.18 0.39 0.55 0.49 0.64 0.02 -1.13 -0.16 0.31 0.57 -1.17 0.15 0.47 0.22 0.16 -2.26 0.19 0.23 0.17 0.15 -0.13 -0.19 0.09 0.31
-0.83 -1.46 -1.2 -0.63 -0.16 -0.06 -0.23 -0.17 0.13 0.43 -0.03 0.27 0.57 0.59 0.67 0.56 0.48 -1.24 0.2 0.48 -0.03 -0.25 -1.92 -0.11 0.04 -0.49 -0.34 -0.22 0.21 0.4 0.55
-1.55 -1.5 -0.37 -0.11 0.04 0.38 -0.81 -1.37 0.16 0.4 0.32 0.22 0.05 -1.47 -0.6 0.33 0.39 0.38 -0.23 0.22 0.14 0.27 -1.58 -0.13 0.28 0.55 0.33 0.07 -0.03 0.3 0.82
-0.14 -0.64 -0.28 -0.58 -0.22 -0.43 -0.05 -0.34 0.22 0.29 0.38 0.4 0.31 0.07 0.44 0.09 0.16 -0.65 0.22 0.38 0.2 -0.2 -0.32 0.16 0.15 -0.11 0.1 0.12 -0.32 -0.23 -0.16
-3.27 -4.57 -7.47 -5.14 -0.68 -0.83 -0.56 -2.01 0.17 0.38 0.63 1.01 1.15 -0.36 1.43 0.17 0.68 -1.27 0.37 1.17 0.5 0.33 -4.47 0.63 0.47 0.36 0.2 0.46 -2.46 -1.62 -1.55
-3.04 - -6.84 -8.45 -0.88 -1.47 -1.32 -2.03 0.41 0.22 0.68 1.28 1.86 -0.53 1.2 0.04 0.49 -1.33 0.17 1.28 0.42 0.28 -5.03 0.38 0.48 -0.0 0.02 -0.29 -2.78 -2.03 0.35
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
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-2.38 -2.42 -0.95 -0.17 -0.29 -0.41 -0.26 -0.36 0.49 0.6 0.55 0.72 -0.76 -0.82 -0.07 0.94 0.89 -4.68 -0.79 0.14 0.21 0.24 -4.53 0.09 0.4 0.36 0.67 0.28 -0.24 0.44 0.42
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- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - 0.27 - 0.33 2.34 - - - - - - 3.92 0.8 - - - 1.91 - - - - 1.52 - - - - -
-2.51 -2.65 0.03 -0.29 0.23 0.06 -0.17 -1.5 0.29 0.42 -0.1 0.19 -1.35 0.55 0.7 0.82 0.95 -0.89 0.15 0.42 0.35 0.64 -2.24 -0.89 -0.49 -0.1 0.35 -0.61 0.86 0.35 -1.71
-2.67 -4.52 -3.15 -2.16 -0.03 -0.53 -0.78 -1.76 0.55 0.71 0.67 0.5 -3.42 0.12 1.19 0.07 0.39 -5.05 0.62 0.96 0.2 0.01 -9.0 0.5 0.06 -0.13 0.2 0.36 0.68 0.89 0.07
- -4.16 -3.17 - 0.25 0.26 -0.24 -0.14 0.05 -1.22 0.03 0.27 -2.72 0.17 1.34 0.63 0.08 0.83 0.84 0.44 -0.13 -0.31 -1.9 -0.97 -0.28 0.18 0.59 -1.61 1.11 0.58 0.78
-0.71 -1.73 -1.53 -1.08 -0.32 -0.35 0.05 -0.12 0.24 0.14 0.34 0.09 -0.07 0.32 0.97 0.32 0.46 -1.28 0.37 0.72 0.1 -0.09 -3.41 0.26 0.46 -0.31 -0.1 -0.06 -0.14 0.27 0.57
- - - - - - - - - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - -
-0.02 -0.58 -0.32 -0.09 0.11 -0.1 0.08 -0.59 -0.26 -0.12 0.31 0.53 0.28 0.41 1.02 0.4 0.46 -4.47 0.25 0.09 -0.24 -0.14 -4.17 0.07 0.08 -0.31 -0.26 0.38 -0.14 0.04 0.11
- - - - - - - - - - - - - - 3.86 4.04 - - - - - - - - - - - - - - -
1.47 - - - 0.51 2.12 1.21 - -0.39 - - - - - 0.64 1.9 - - 0.82 1.59 - 0.74 - - - - - - 2.31 1.41 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.