Heatmap: Cluster_20 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
-3.26 0.34 -0.42 -0.87 -0.65 1.45 -1.92 -2.75 -2.96 -3.92 -1.25 -4.41 -4.34 -0.49 -0.3 -0.33 -3.15 -1.22 -1.77 -4.92 -2.56 -1.79 -2.68 -0.07 -0.78 -2.23 -1.21 -4.58 2.38 1.24 3.36
0.65 0.14 0.57 0.4 0.28 0.17 -0.62 -1.03 -0.28 -0.96 0.42 -0.55 -0.58 0.64 -0.07 -0.01 -0.21 0.29 -0.15 -0.63 -0.72 -0.66 -0.07 -0.16 -0.76 -0.38 -0.01 -0.69 -0.06 0.34 1.37
0.04 0.38 0.56 0.31 0.45 0.45 -0.03 -0.46 -0.43 -0.21 -0.39 -0.97 -1.1 0.64 -0.13 -0.52 -0.13 0.28 -0.18 -0.42 -0.92 -0.43 0.18 -0.63 -0.27 0.18 -0.21 -0.59 0.34 0.21 1.19
0.34 0.29 0.06 -0.08 -0.14 -0.15 0.65 0.73 -0.73 -0.42 -0.49 -0.18 0.86 -1.57 -0.31 -0.36 0.13 -0.27 -0.02 -0.17 -0.33 0.5 -1.92 0.2 0.54 -0.46 0.07 0.33 0.01 -0.34 0.14
-0.37 -0.1 -0.74 -0.51 -0.12 -1.08 0.43 1.14 0.37 0.68 0.49 0.89 -0.11 0.13 0.13 -0.25 -0.48 -1.04 0.25 -0.26 -0.55 -0.68 -1.98 -0.23 -0.19 -0.29 -0.38 -0.5 0.28 0.4 0.66
0.88 1.28 0.36 -0.38 0.54 0.13 -0.98 -0.61 -2.13 -1.42 -1.0 -0.86 0.73 0.2 0.23 -0.81 0.24 0.65 -0.29 -0.41 -0.37 -0.45 -0.08 -0.39 -0.07 -0.48 -0.85 -0.55 0.32 0.52 0.72
0.73 0.06 0.05 -0.33 0.32 0.66 0.07 0.06 -0.18 -0.11 -0.22 -0.26 -0.01 -0.84 -0.82 -0.02 -0.15 -0.97 -0.47 -0.1 0.04 0.18 -0.15 -0.07 0.14 0.19 0.18 0.68 -0.39 0.46 -0.45
0.25 0.91 0.56 0.08 -1.1 -0.97 -0.08 0.05 -0.02 -0.1 -0.24 0.33 -0.16 0.07 -0.08 -0.26 -0.35 -1.42 -0.57 -0.61 -0.02 -0.05 0.26 -0.17 -0.09 -0.27 -0.57 -0.31 0.46 0.59 1.03
0.15 0.61 0.61 -0.06 0.24 0.06 -0.61 -0.53 0.11 0.22 0.36 0.07 -1.37 -0.48 0.15 -0.27 -0.5 -0.26 -0.08 -0.07 -0.25 0.04 -3.62 -0.58 -0.56 -0.12 -0.3 -0.75 0.75 0.61 1.28
0.52 0.51 0.05 -0.42 -0.27 -0.18 -0.24 -0.44 0.1 0.13 0.13 0.04 -0.36 -0.0 -0.02 -0.06 0.02 0.0 -0.26 -0.03 -0.12 -0.08 -2.78 0.0 0.07 0.03 0.14 -0.3 0.06 0.46 0.85
0.05 0.58 -0.44 -1.65 1.2 0.72 -0.59 -0.81 -0.73 -1.17 -0.67 -1.2 -0.42 -0.32 -0.38 -0.43 -1.03 0.06 -0.07 -0.83 -0.47 -0.3 0.16 -0.12 -0.09 -0.71 -0.23 -1.0 1.11 1.1 1.71
-0.14 0.73 -0.36 -0.48 -0.09 0.81 -0.04 0.12 -0.29 -0.36 -0.09 -0.29 -0.05 0.42 0.52 0.27 -0.17 0.02 -0.38 -0.3 -0.17 -0.11 -0.69 -0.44 -0.28 0.15 -0.02 -0.86 -0.01 0.19 0.71
-0.72 -0.27 -0.86 -1.0 0.22 0.36 -0.13 -0.22 -0.49 -0.35 -0.3 -0.23 0.33 0.35 0.13 -0.03 -0.33 0.48 0.1 -0.23 -0.17 -0.01 -0.39 -0.01 -0.15 0.09 -0.09 -0.13 0.59 0.46 1.05
1.02 1.15 0.41 -1.16 0.61 0.56 -0.47 -0.74 -0.47 -0.55 -0.45 -1.08 0.77 -0.28 -1.06 -0.9 -1.09 0.64 0.05 -0.69 -0.4 -0.23 -0.58 0.03 -0.12 -0.15 -0.45 -0.5 0.65 0.25 0.59
-1.2 -2.78 -2.21 -2.6 0.72 -0.62 -0.9 -1.22 -0.24 -0.06 0.01 0.21 0.09 0.0 0.82 -0.2 -0.17 1.32 0.22 0.21 -1.06 0.07 0.91 -2.12 -0.99 0.02 0.68 -1.03 0.59 0.42 1.2
-0.36 0.24 1.0 0.89 0.26 0.22 -0.31 -0.51 -0.97 -0.59 0.14 -0.34 -0.72 0.2 -0.62 -0.11 -0.67 -0.34 -0.71 -0.33 -0.47 -0.31 0.23 -0.32 -0.84 -0.09 -0.35 -0.73 0.46 0.79 1.38
0.28 1.02 0.77 0.87 0.92 0.39 -0.04 0.29 0.43 0.25 0.16 -0.11 -0.97 -0.61 -0.64 -0.36 -0.77 -2.17 -0.26 -0.99 -0.21 -0.26 -3.93 -0.37 -0.65 -1.03 -0.26 -1.3 0.49 0.39 0.91
0.91 1.14 1.15 1.09 0.86 0.37 -0.72 -0.66 -0.4 -0.68 0.2 -0.6 -0.39 -0.73 -0.82 -0.72 -1.5 -0.41 -0.31 -0.24 -0.1 -0.26 -0.38 -0.76 -0.4 -0.06 -0.02 -0.31 -0.11 -0.24 0.41
0.39 0.44 0.34 0.34 0.66 -0.45 0.25 0.96 -0.0 -0.01 0.09 0.16 -0.29 0.38 0.03 -0.6 -0.46 -0.22 -0.44 -0.39 -0.55 -0.68 -0.09 -0.26 -0.34 -0.57 -0.46 -0.4 0.16 0.11 0.09
0.11 0.41 0.12 0.33 0.72 -1.01 0.32 1.31 0.05 0.23 0.4 0.49 -0.25 -0.02 -0.45 -1.03 -0.89 -0.13 -0.72 -0.43 -0.74 -0.81 0.0 -0.2 -0.55 -0.78 -0.62 -0.99 0.42 0.44 0.53
-0.36 -0.44 -0.1 0.26 0.79 0.26 -0.69 -0.35 -0.03 -0.01 0.38 0.06 -0.88 -0.98 -0.4 -0.31 -0.6 0.77 -0.21 -0.13 0.02 0.26 -0.8 -0.11 0.11 0.23 0.73 -0.92 0.11 0.21 0.64
1.1 1.17 0.36 -0.37 0.96 0.1 -0.29 0.07 -0.48 -0.42 -0.45 -0.52 0.17 -0.36 -0.48 -0.73 -0.77 1.39 -0.75 -0.62 -0.73 -0.62 0.1 -0.32 -0.65 -0.73 -0.69 -0.66 0.46 0.01 0.13
- - - - 3.16 2.41 - - - - - - 2.67 - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.38
0.39 1.21 -1.04 -2.82 0.31 0.81 0.4 0.21 -0.65 -0.68 -0.6 -0.79 1.49 -2.49 -2.77 -0.78 -0.84 -1.08 -0.39 -0.48 -0.04 0.23 -1.73 0.53 0.48 0.47 0.06 -0.12 0.42 0.1 0.58
-0.1 0.31 -0.28 -0.12 -0.1 0.18 -0.16 -0.36 0.22 0.24 0.21 0.28 -0.14 0.02 -0.17 0.2 0.17 -2.06 0.07 -0.35 -0.37 -0.33 -1.38 -0.19 -0.06 0.08 0.39 -0.31 0.38 0.42 0.91
0.36 -0.27 0.1 0.46 0.34 -0.23 -0.51 -0.45 0.04 -0.14 0.34 0.24 0.0 -0.25 -0.41 -0.0 -0.31 -0.58 -0.39 -0.52 -0.2 -0.14 0.07 0.03 -0.09 -0.34 0.02 -0.32 0.28 0.53 0.94
-1.55 -4.33 -1.24 -1.42 2.63 -0.2 -2.13 -4.87 -1.93 -1.36 -1.13 -2.82 0.93 -0.92 -1.15 -1.71 -1.81 -0.05 -1.85 -0.48 -1.0 -0.65 -1.71 1.8 -1.21 -1.49 -0.89 -0.41 -0.73 0.46 2.78
0.98 1.36 0.74 0.1 0.89 -0.63 -1.97 -1.1 -1.24 -1.16 -1.09 0.31 -0.21 0.52 -0.21 -0.54 -0.65 1.43 -1.14 -0.9 -1.58 -1.4 1.04 -1.84 -1.73 -1.11 -0.73 -1.28 0.37 0.26 1.28
-0.01 0.95 0.88 0.44 0.84 -0.08 -0.37 -0.43 0.1 -0.51 0.13 -1.12 -1.32 1.0 0.14 -0.63 -1.17 -0.14 -0.04 -0.77 -0.35 -0.53 -7.48 -1.08 -0.44 -0.09 -0.29 -1.38 0.76 0.63 1.11
0.07 0.4 -0.37 -0.6 0.68 0.12 0.19 1.19 -0.13 -0.41 -0.08 -0.18 -0.72 -0.35 -0.12 -0.24 -0.69 1.3 -0.48 -0.79 -0.55 -0.6 1.05 -0.46 -0.58 -0.65 -0.31 -0.71 0.21 0.23 -0.22
0.31 0.47 0.36 -0.26 0.72 0.89 -0.52 -0.85 -0.47 -0.46 -0.22 -0.37 0.08 0.44 0.21 0.19 -0.25 0.27 -0.04 -0.6 -0.29 -0.25 -3.61 -0.26 -0.19 -0.12 -0.09 -0.74 0.12 0.16 0.95
1.0 1.25 0.53 -0.77 0.51 0.04 -0.95 -0.68 -0.34 -0.49 0.05 -0.53 -0.09 0.12 0.02 -0.36 -0.51 0.57 -0.23 -0.59 -0.94 -0.86 0.17 -0.84 -0.88 -0.42 -0.47 -0.88 -0.08 0.25 1.48
0.3 0.25 -0.11 -0.08 0.33 -0.02 -0.16 -1.3 0.08 -0.32 -0.07 -0.45 0.24 0.25 0.44 -0.34 -0.54 0.36 0.14 -0.41 -0.43 -0.13 -0.56 0.04 -0.28 -0.64 -0.07 0.07 0.13 0.24 1.13
0.56 1.3 1.08 0.41 1.05 1.12 -0.04 0.45 -0.65 -1.35 -0.13 -1.26 -3.03 0.56 -0.08 -0.61 -1.94 -0.23 -1.03 -1.84 -0.78 -0.27 -5.15 -0.81 -0.82 -0.63 -0.15 -1.12 0.6 -0.12 1.37
- -1.61 -0.19 0.1 -0.09 -1.0 -1.12 -2.28 1.74 1.55 1.37 -1.66 -1.63 -4.51 -5.51 1.03 -1.25 -3.57 -1.26 -2.43 0.15 -0.64 -1.17 -0.41 -1.33 -2.31 0.18 -2.06 1.03 0.58 2.44
0.74 1.03 0.89 0.66 -0.04 -0.43 0.04 0.21 -0.37 -0.06 0.24 0.2 0.39 -0.37 -1.0 -1.05 -0.7 -0.08 -1.22 -0.93 -0.43 -0.19 -2.02 -0.79 -0.31 -0.43 -0.72 -0.61 0.29 0.58 1.22
0.91 1.36 0.91 1.17 -0.08 -0.69 -1.02 -1.03 -1.09 -0.41 0.03 -0.38 0.78 -0.64 -0.83 -0.52 -0.32 0.88 -1.02 -1.23 -0.46 -0.84 0.9 -0.75 -0.45 -0.64 -0.35 -0.76 -0.05 -0.11 0.39
0.46 0.44 0.79 0.9 -0.09 0.11 0.02 0.11 0.24 0.22 0.41 0.24 -0.15 0.38 -0.1 -0.3 -0.49 -0.48 -0.92 -1.01 -0.43 -0.6 -0.68 -0.45 -0.58 -0.55 -0.37 -0.87 0.1 0.44 0.52
-1.41 1.55 -2.11 -0.55 0.29 0.82 - -1.25 - - -3.24 - 1.66 0.09 -0.07 0.2 -0.43 1.91 -1.3 - - -0.62 -2.37 0.74 -3.53 -0.66 - -2.02 0.55 -0.08 2.62
0.64 0.64 -0.95 -1.37 1.78 1.75 -0.73 0.41 -2.59 -3.09 -2.4 -3.77 1.57 -1.05 -3.32 -1.77 -2.07 1.15 -1.62 -3.4 -1.95 -1.18 0.34 -0.77 -1.73 -1.53 -1.88 -2.22 0.37 -0.75 2.44
- - - - 3.16 1.79 - 0.22 - - - 0.71 0.15 1.19 -0.81 - - -0.07 - -0.09 - 0.83 - - -1.05 - - - - -0.04 2.74
-0.93 -0.84 -2.67 -2.8 2.05 0.5 -1.93 -1.07 0.42 0.04 0.44 -1.45 -2.52 -4.74 -3.1 -0.45 -2.33 -6.23 -2.72 -1.48 -0.66 -0.41 - 1.66 -1.04 -0.97 0.66 -0.39 -1.06 1.03 2.82
0.6 0.3 -0.28 -1.19 2.31 0.14 0.59 -0.19 -0.3 -1.31 -2.07 -0.13 -0.66 -1.35 -1.0 0.68 -0.35 -1.75 -0.95 - -0.53 - - -0.21 0.56 0.28 0.86 -0.52 0.89 0.31 0.66
- - - -0.22 2.97 2.6 - - - - - - - - 1.6 - 1.62 1.58 - - - - - - -0.65 - - - 0.45 0.97 1.68
- - - -2.81 3.14 0.6 -3.29 -2.08 -1.26 -2.05 -0.79 -2.35 -1.21 -2.36 -2.17 -0.14 -2.1 0.33 -1.26 -1.27 -1.48 -0.74 1.1 0.61 -2.58 -1.37 -0.01 -1.08 -2.5 -0.52 2.84
0.26 0.14 -0.28 -0.51 1.03 0.29 -0.3 -0.68 0.1 -0.22 0.14 -0.48 -0.45 0.18 0.3 -0.01 -0.34 -1.25 -0.01 -0.29 -0.2 -0.1 -0.16 0.31 -0.56 -0.19 0.1 -0.04 -0.18 0.32 0.97
-4.07 -2.82 -2.8 -3.28 0.83 -0.12 -0.8 -1.25 -0.26 0.01 0.05 -0.04 0.04 -1.38 0.16 0.04 0.51 1.81 0.09 0.13 0.14 -0.07 0.15 -0.71 -0.22 0.11 0.57 -1.09 0.23 0.46 1.09
0.61 0.65 -0.03 -0.78 1.17 0.84 0.28 0.39 -1.48 -1.01 -1.03 -1.03 1.09 -1.07 -0.93 -1.22 -0.63 1.89 -1.12 -1.2 -1.15 -0.69 -0.19 0.05 -0.49 -0.63 -0.96 -0.92 -0.13 0.15 0.78
-0.79 -0.7 -1.14 - 2.34 2.25 -0.11 0.49 - -1.13 -2.22 -3.02 1.11 -2.53 -3.52 -1.81 -1.66 0.25 -1.9 -0.92 -1.23 0.12 0.06 0.9 -1.15 -0.04 -1.42 -0.55 -0.53 -0.78 1.69
-0.33 0.24 -0.26 -0.27 0.04 0.04 0.32 0.49 -0.17 -0.01 -0.01 -0.12 -0.0 0.5 0.5 -0.01 -0.02 -0.42 -0.13 0.04 -0.18 -0.23 -1.49 -0.02 -0.21 0.05 -0.02 -0.26 0.02 0.19 0.48
- - - - 3.59 -1.61 - - -3.59 -5.03 -2.21 - -5.85 - - -3.37 - - - - - -3.83 - -1.49 - - -2.07 -6.33 -5.18 -3.38 4.12
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0.7 1.43 -0.98 -3.48 0.26 0.88 0.28 -0.01 -0.51 -0.65 -0.53 -0.91 1.44 -3.01 -3.29 -0.95 -1.12 0.3 -0.21 -0.53 -0.0 0.18 -2.38 0.28 0.4 0.59 0.04 0.01 0.23 -0.14 0.11
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0.46 1.0 1.04 0.81 0.7 0.12 -0.27 -0.38 -0.16 -0.16 0.2 -0.36 -1.72 0.29 0.02 -0.6 -1.16 -0.15 -0.09 -0.65 -0.13 -0.21 -2.27 -0.65 -0.49 0.05 -0.06 -1.0 0.17 0.07 0.7
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- 2.4 - - 3.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.04 2.93
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.