1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_51 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.0 0.01 0.04 0.04 0.06 0.05 0.01 0.0 0.03 0.02 0.03 0.02 0.21 0.22 0.1 0.02 0.02 1.0 0.03 0.03 0.03 0.01 0.54 0.01 0.03 0.02 0.02 0.0 0.09 0.08 0.29
0.13 0.13 0.14 0.22 0.36 0.25 0.19 0.18 0.35 0.39 0.34 0.42 0.61 0.34 0.49 0.27 0.33 0.49 0.25 0.24 0.26 0.2 0.82 0.31 0.28 0.27 0.3 0.13 0.43 0.53 1.0
0.15 0.08 0.13 0.16 0.33 0.2 0.05 0.06 0.14 0.14 0.19 0.14 0.4 0.33 0.28 0.13 0.11 1.0 0.12 0.11 0.12 0.1 0.55 0.09 0.12 0.09 0.1 0.08 0.23 0.26 0.34
0.18 0.22 0.28 0.33 0.46 0.33 0.28 0.23 0.38 0.39 0.41 0.49 1.0 0.49 0.46 0.39 0.44 0.76 0.36 0.37 0.5 0.32 0.65 0.34 0.47 0.33 0.39 0.34 0.36 0.55 0.98
0.14 0.13 0.2 0.31 0.29 0.34 0.16 0.11 0.28 0.36 0.35 0.36 0.89 0.52 0.45 0.35 0.38 0.56 0.21 0.29 0.26 0.19 0.84 0.4 0.35 0.28 0.27 0.19 0.3 0.46 1.0
0.35 0.34 0.45 0.47 0.5 0.55 0.38 0.33 0.54 0.57 0.6 0.61 0.69 0.58 0.6 0.58 0.59 0.88 0.47 0.45 0.45 0.43 0.95 0.53 0.51 0.43 0.47 0.38 0.59 0.69 1.0
0.15 0.27 0.16 0.26 0.18 0.1 0.17 0.16 0.14 0.16 0.12 0.15 0.28 0.26 0.3 0.16 0.19 1.0 0.11 0.14 0.12 0.06 0.42 0.12 0.12 0.15 0.2 0.1 0.21 0.23 0.35
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.13 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.04 0.0 0.07 1.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.56 0.2 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.12
0.07 0.1 0.12 0.13 0.41 0.22 0.14 0.16 0.21 0.22 0.26 0.27 0.72 0.32 0.5 0.27 0.29 0.84 0.41 0.35 0.23 0.2 0.65 0.36 0.31 0.19 0.23 0.17 0.53 0.58 1.0
0.0 0.0 0.03 0.02 0.09 0.06 0.06 0.03 0.01 0.05 0.07 0.01 0.17 0.06 0.02 0.07 0.0 1.0 0.02 0.02 0.0 0.04 0.75 0.01 0.02 0.05 0.07 0.04 0.03 0.12 0.26
0.14 0.12 0.15 0.13 0.31 0.27 0.4 0.34 0.31 0.3 0.37 0.4 0.57 0.4 0.44 0.47 0.52 1.0 0.32 0.36 0.29 0.24 0.92 0.44 0.42 0.31 0.37 0.24 0.35 0.59 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.31 0.37 0.34 0.36 0.58 0.51 0.4 0.34 0.37 0.34 0.31 0.34 0.51 0.34 0.43 0.39 0.35 0.99 0.33 0.36 0.4 0.38 0.91 0.45 0.5 0.43 0.41 0.26 0.54 0.64 1.0
0.06 0.08 0.13 0.12 0.43 0.32 0.15 0.07 0.02 0.02 0.07 0.07 0.21 0.44 0.3 0.23 0.1 1.0 0.05 0.1 0.08 0.17 0.28 0.29 0.13 0.22 0.15 0.05 0.19 0.39 0.89
0.13 0.29 0.23 0.28 0.3 0.17 0.27 0.29 0.37 0.37 0.4 0.35 0.4 0.31 0.31 0.25 0.3 0.7 0.23 0.27 0.28 0.24 0.79 0.41 0.35 0.29 0.3 0.26 0.41 0.54 1.0
0.03 0.04 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.15 0.04 0.03 0.06 0.06 0.37 0.14 0.08 0.08 0.03 1.0 0.09 0.05 0.05 0.02 0.58 0.03 0.15 0.09 0.04 0.05 0.11 0.17 0.19
0.09 0.08 0.01 0.06 0.24 0.17 0.13 0.16 0.14 0.18 0.15 0.14 0.3 0.19 0.22 0.19 0.11 1.0 0.19 0.18 0.16 0.19 0.65 0.11 0.15 0.14 0.13 0.1 0.26 0.21 0.53
0.03 0.06 0.17 0.17 0.25 0.29 0.2 0.31 0.22 0.21 0.27 0.21 0.36 0.34 0.33 0.25 0.18 1.0 0.25 0.26 0.17 0.23 0.6 0.21 0.21 0.22 0.23 0.15 0.35 0.4 0.76
0.15 0.12 0.22 0.32 0.12 0.13 0.12 0.12 0.24 0.17 0.19 0.22 0.47 0.23 0.38 0.25 0.17 1.0 0.13 0.16 0.14 0.11 0.93 0.18 0.22 0.16 0.23 0.08 0.3 0.4 0.96
0.06 0.06 0.03 0.03 0.08 0.07 0.12 0.07 0.13 0.13 0.15 0.14 0.41 0.21 0.21 0.17 0.15 1.0 0.08 0.19 0.14 0.15 0.55 0.21 0.18 0.15 0.09 0.13 0.13 0.25 0.69
0.12 0.19 0.15 0.25 0.32 0.3 0.23 0.27 0.32 0.15 0.26 0.35 0.69 0.5 0.56 0.32 0.38 0.75 0.42 0.27 0.28 0.34 0.61 0.3 0.28 0.34 0.27 0.3 0.47 0.49 1.0
0.13 0.11 0.1 0.11 0.53 0.27 0.13 0.06 0.14 0.2 0.25 0.3 0.58 0.26 0.44 0.23 0.22 0.86 0.21 0.19 0.19 0.25 0.79 0.18 0.21 0.17 0.21 0.18 0.33 0.37 1.0
0.09 0.03 0.07 0.01 0.09 0.13 0.06 0.04 0.06 0.07 0.03 0.09 0.16 0.09 0.17 0.12 0.09 1.0 0.05 0.07 0.05 0.04 0.31 0.14 0.11 0.07 0.09 0.05 0.09 0.18 0.44
0.05 0.06 0.07 0.07 0.15 0.09 0.08 0.07 0.12 0.14 0.14 0.13 0.3 0.26 0.24 0.11 0.13 1.0 0.12 0.11 0.09 0.09 0.44 0.16 0.13 0.1 0.1 0.08 0.14 0.21 0.58
0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.07 0.03 0.01 0.04 0.0 0.05 0.05 0.03 0.07 0.08 0.07 0.11 1.0 0.07 0.02 0.03 0.04 0.33 0.0 0.05 0.03 0.03 0.08 0.04 0.05 0.04
0.33 0.39 0.38 0.38 0.51 0.55 0.6 0.59 0.5 0.54 0.57 0.54 0.59 0.6 0.54 0.51 0.57 0.68 0.44 0.5 0.41 0.45 0.89 0.52 0.51 0.46 0.43 0.39 0.72 0.7 1.0
0.02 0.0 0.03 0.0 0.04 0.03 0.04 0.01 0.02 0.03 0.02 0.05 0.35 0.12 0.15 0.05 0.05 1.0 0.03 0.04 0.04 0.04 0.45 0.06 0.03 0.04 0.05 0.05 0.05 0.06 0.13
0.12 0.15 0.11 0.13 0.17 0.23 0.18 0.33 0.15 0.15 0.16 0.16 0.34 0.33 0.24 0.2 0.16 1.0 0.16 0.14 0.14 0.16 0.69 0.12 0.12 0.14 0.14 0.14 0.2 0.19 0.33
0.04 0.09 0.09 0.06 0.15 0.13 0.1 0.11 0.11 0.13 0.12 0.13 0.15 0.36 0.24 0.12 0.13 1.0 0.18 0.1 0.1 0.06 0.52 0.12 0.12 0.15 0.11 0.06 0.22 0.28 0.44
0.05 0.04 0.05 0.08 0.13 0.12 0.14 0.13 0.2 0.25 0.23 0.26 0.36 0.24 0.31 0.2 0.24 1.0 0.18 0.25 0.15 0.12 0.39 0.21 0.23 0.14 0.15 0.11 0.21 0.32 0.68
0.08 0.09 0.13 0.2 0.15 0.19 0.14 0.14 0.11 0.13 0.14 0.13 0.36 0.07 0.12 0.16 0.13 1.0 0.09 0.1 0.11 0.12 0.62 0.09 0.12 0.13 0.14 0.09 0.15 0.19 0.34
0.11 0.1 0.07 0.16 0.2 0.24 0.21 0.16 0.25 0.35 0.29 0.35 0.49 0.34 0.44 0.34 0.33 0.81 0.22 0.22 0.37 0.2 0.52 0.22 0.22 0.25 0.29 0.21 0.34 0.49 1.0
0.06 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.05 0.07 0.13 0.11 0.04 0.16 0.46 0.07 0.15 0.02 0.06 1.0 0.0 0.07 0.04 0.12 0.56 0.3 0.08 0.07 0.06 0.1 0.06 0.08 0.61
0.08 0.06 0.06 0.08 0.19 0.14 0.1 0.09 0.08 0.14 0.17 0.09 0.32 0.29 0.26 0.07 0.13 1.0 0.16 0.14 0.08 0.11 0.52 0.11 0.11 0.1 0.13 0.07 0.16 0.24 0.45
0.18 0.24 0.17 0.19 0.29 0.3 0.33 0.25 0.32 0.34 0.36 0.4 0.55 0.48 0.46 0.33 0.36 1.0 0.35 0.34 0.33 0.32 0.61 0.41 0.37 0.33 0.3 0.28 0.4 0.48 0.84
0.43 0.46 0.35 0.41 0.65 0.57 0.49 0.49 0.46 0.49 0.48 0.55 0.86 0.69 0.67 0.56 0.57 0.87 0.51 0.54 0.57 0.6 0.9 0.58 0.59 0.56 0.56 0.53 0.58 0.75 1.0
0.1 0.05 0.05 0.03 0.21 0.15 0.06 0.04 0.1 0.12 0.12 0.16 0.35 0.15 0.23 0.12 0.12 1.0 0.12 0.14 0.12 0.12 0.33 0.15 0.14 0.1 0.11 0.13 0.09 0.15 0.67
0.24 0.2 0.46 0.51 0.35 0.37 0.19 0.15 0.3 0.33 0.35 0.39 0.74 0.59 0.53 0.42 0.42 0.55 0.33 0.31 0.27 0.28 0.67 0.35 0.35 0.31 0.33 0.27 0.39 0.5 1.0
0.08 0.13 0.18 0.2 0.32 0.27 0.27 0.21 0.33 0.39 0.42 0.56 0.79 0.33 0.37 0.45 0.47 0.39 0.25 0.3 0.26 0.31 0.68 0.25 0.33 0.23 0.34 0.29 0.31 0.38 1.0
0.06 0.2 0.1 0.09 0.22 0.19 0.12 0.13 0.17 0.09 0.2 0.16 0.22 0.29 0.27 0.13 0.21 1.0 0.14 0.1 0.14 0.11 0.35 0.14 0.17 0.17 0.18 0.07 0.28 0.24 0.49
0.2 0.26 0.24 0.26 0.33 0.31 0.32 0.33 0.28 0.39 0.33 0.36 0.58 0.27 0.25 0.29 0.34 1.0 0.4 0.29 0.35 0.29 0.91 0.35 0.34 0.38 0.33 0.35 0.35 0.52 0.75
0.01 0.05 0.04 0.07 0.06 0.06 0.08 0.1 0.07 0.1 0.09 0.07 0.15 0.2 0.16 0.1 0.1 1.0 0.09 0.09 0.05 0.04 0.26 0.07 0.06 0.08 0.07 0.04 0.18 0.26 0.44
0.22 0.18 0.19 0.25 0.43 0.27 0.1 0.21 0.26 0.33 0.34 0.3 0.45 0.37 0.35 0.2 0.22 0.98 0.27 0.25 0.23 0.25 0.7 0.18 0.32 0.21 0.29 0.2 0.61 0.5 1.0
0.07 0.02 0.12 0.02 0.25 0.08 0.08 0.19 0.22 0.29 0.07 0.29 0.18 0.11 0.21 0.17 0.09 1.0 0.21 0.04 0.09 0.09 0.59 0.22 0.17 0.21 0.12 0.09 0.22 0.34 0.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.02 0.08 0.02 0.1 0.09 0.0 0.04 0.21 0.07 0.09 0.02 0.11 0.71 0.0 0.04 0.0 0.0 1.0 0.13 0.04 0.03 0.02 0.0 0.12 0.07 0.76
0.02 0.02 0.01 0.02 0.05 0.09 0.04 0.03 0.05 0.04 0.05 0.05 0.27 0.16 0.12 0.03 0.06 1.0 0.05 0.05 0.03 0.05 0.51 0.05 0.05 0.05 0.05 0.03 0.07 0.05 0.24
0.05 0.03 0.03 0.04 0.14 0.1 0.06 0.05 0.14 0.1 0.15 0.13 0.39 0.26 0.19 0.14 0.13 1.0 0.14 0.14 0.12 0.11 0.5 0.11 0.14 0.13 0.12 0.09 0.16 0.24 0.62
0.31 0.4 0.3 0.25 0.41 0.6 0.45 0.44 0.42 0.44 0.44 0.43 0.64 0.5 0.47 0.47 0.47 0.8 0.52 0.43 0.41 0.48 1.0 0.44 0.53 0.49 0.48 0.37 0.7 0.71 1.0
0.09 0.04 0.11 0.06 0.07 0.09 0.07 0.08 0.07 0.04 0.1 0.08 0.41 0.11 0.1 0.09 0.08 1.0 0.09 0.08 0.06 0.13 0.65 0.07 0.08 0.16 0.13 0.08 0.1 0.09 0.44
0.27 0.22 0.28 0.32 0.35 0.34 0.33 0.31 0.27 0.34 0.25 0.26 0.63 0.28 0.24 0.27 0.32 1.0 0.31 0.36 0.31 0.33 0.8 0.42 0.41 0.38 0.33 0.36 0.35 0.39 0.59
0.29 0.36 0.41 0.37 0.4 0.25 0.24 0.23 0.33 0.38 0.41 0.48 0.47 0.43 0.45 0.38 0.36 0.99 0.3 0.27 0.31 0.24 0.95 0.36 0.36 0.31 0.33 0.26 0.33 0.52 1.0
0.53 0.44 0.67 0.72 0.61 0.71 0.52 0.53 0.53 0.58 0.6 0.64 0.86 0.81 0.73 0.67 0.72 0.77 0.61 0.52 0.55 0.59 0.8 0.61 0.64 0.6 0.59 0.63 0.72 0.69 1.0
0.14 0.05 0.2 0.13 0.27 0.2 0.27 0.31 0.39 0.37 0.27 0.25 0.54 0.33 0.36 0.33 0.38 1.0 0.18 0.3 0.28 0.35 0.84 0.28 0.31 0.36 0.27 0.18 0.28 0.33 0.68
0.02 0.01 0.01 0.01 0.11 0.14 0.1 0.07 0.08 0.05 0.05 0.05 0.13 0.21 0.16 0.1 0.07 1.0 0.09 0.1 0.1 0.09 0.41 0.08 0.1 0.06 0.09 0.08 0.13 0.14 0.2
0.12 0.06 0.14 0.18 0.33 0.25 0.26 0.16 0.3 0.2 0.22 0.24 0.32 0.41 0.4 0.21 0.22 1.0 0.16 0.17 0.21 0.25 0.52 0.2 0.23 0.29 0.24 0.14 0.4 0.52 0.84
0.02 0.05 0.02 0.03 0.06 0.03 0.07 0.15 0.07 0.05 0.11 0.12 0.38 0.15 0.17 0.12 0.13 1.0 0.06 0.1 0.1 0.1 0.9 0.09 0.05 0.1 0.05 0.05 0.12 0.21 0.8
0.2 0.24 0.25 0.34 0.44 0.46 0.39 0.37 0.55 0.52 0.48 0.59 0.98 0.59 0.62 0.67 0.58 0.77 0.4 0.47 0.44 0.4 0.89 0.42 0.51 0.43 0.44 0.37 0.48 0.62 1.0
0.15 0.1 0.09 0.09 0.12 0.15 0.17 0.19 0.16 0.16 0.16 0.19 0.58 0.16 0.14 0.16 0.16 1.0 0.14 0.14 0.14 0.11 0.71 0.13 0.15 0.17 0.16 0.1 0.14 0.19 0.68
0.26 0.22 0.26 0.42 0.5 0.47 0.38 0.28 0.56 0.46 0.49 0.53 0.7 0.59 0.56 0.49 0.37 0.65 0.26 0.4 0.43 0.47 0.93 0.47 0.5 0.43 0.47 0.39 0.49 0.6 1.0
0.28 0.42 0.25 0.28 0.42 0.4 0.36 0.41 0.32 0.34 0.4 0.35 0.46 0.51 0.5 0.43 0.43 1.0 0.3 0.33 0.28 0.28 0.53 0.38 0.39 0.38 0.42 0.32 0.38 0.48 0.69
0.46 0.45 0.4 0.34 0.55 0.41 0.42 0.31 0.49 0.52 0.52 0.52 0.73 0.68 0.71 0.52 0.53 0.96 0.46 0.5 0.44 0.49 0.86 0.5 0.5 0.48 0.49 0.42 0.58 0.61 1.0
0.0 0.0 0.03 0.08 0.07 0.06 0.04 0.04 0.05 0.05 0.06 0.01 0.24 0.16 0.21 0.04 0.09 1.0 0.09 0.02 0.05 0.04 0.54 0.03 0.04 0.04 0.09 0.03 0.07 0.04 0.42
0.07 0.05 0.06 0.09 0.1 0.06 0.05 0.11 0.06 0.06 0.05 0.05 0.4 0.11 0.12 0.13 0.1 1.0 0.1 0.09 0.06 0.06 0.66 0.07 0.14 0.07 0.08 0.07 0.1 0.1 0.51
0.11 0.14 0.09 0.08 0.37 0.27 0.16 0.14 0.29 0.31 0.29 0.31 0.45 0.39 0.36 0.27 0.26 0.82 0.35 0.33 0.26 0.27 0.81 0.23 0.28 0.26 0.21 0.17 0.36 0.42 1.0
0.21 0.25 0.29 0.41 0.32 0.38 0.37 0.38 0.25 0.25 0.29 0.3 0.45 0.35 0.37 0.36 0.35 1.0 0.33 0.27 0.28 0.31 0.65 0.31 0.35 0.34 0.37 0.31 0.4 0.38 0.42
0.19 0.26 0.26 0.32 0.47 0.37 0.38 0.38 0.34 0.47 0.41 0.52 0.7 0.52 0.51 0.44 0.41 0.67 0.41 0.28 0.35 0.39 0.73 0.37 0.41 0.37 0.39 0.34 0.51 0.58 1.0
0.22 0.32 0.21 0.3 0.37 0.35 0.29 0.39 0.3 0.29 0.36 0.32 0.51 0.41 0.41 0.33 0.31 1.0 0.32 0.28 0.28 0.29 0.7 0.26 0.27 0.32 0.32 0.21 0.37 0.44 0.87
0.19 0.27 0.25 0.46 0.5 0.42 0.36 0.25 0.39 0.5 0.51 0.41 0.5 0.48 0.43 0.43 0.41 0.77 0.37 0.41 0.43 0.32 0.98 0.35 0.42 0.43 0.34 0.22 0.55 0.58 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.05 0.01 0.04 0.05 0.05 0.01 0.39 0.04 0.05 0.04 0.12 1.0 0.09 0.03 0.02 0.01 0.65 0.02 0.07 0.09 0.05 0.07 0.06 0.06 0.17
0.06 0.15 0.09 0.26 0.18 0.2 0.16 0.29 0.28 0.27 0.28 0.28 0.27 0.39 0.43 0.27 0.28 0.64 0.25 0.32 0.23 0.2 0.58 0.3 0.24 0.38 0.3 0.22 0.34 0.55 1.0
0.05 0.07 0.02 0.1 0.08 0.13 0.07 0.03 0.19 0.09 0.04 0.13 0.43 0.22 0.22 0.1 0.13 1.0 0.05 0.05 0.07 0.08 0.33 0.11 0.16 0.12 0.08 0.1 0.21 0.12 0.75
0.03 0.06 0.06 0.04 0.18 0.17 0.03 0.04 0.09 0.07 0.08 0.1 0.26 0.28 0.23 0.12 0.09 1.0 0.11 0.12 0.08 0.08 0.41 0.1 0.06 0.08 0.08 0.07 0.1 0.14 0.42
0.34 0.2 0.29 0.21 0.26 0.25 0.35 0.38 0.26 0.3 0.31 0.3 0.6 0.51 0.4 0.27 0.36 1.0 0.28 0.32 0.3 0.3 0.57 0.34 0.28 0.33 0.31 0.34 0.32 0.41 0.87
0.03 0.07 0.13 0.12 0.1 0.1 0.1 0.12 0.13 0.18 0.21 0.13 0.11 0.25 0.21 0.15 0.1 1.0 0.13 0.14 0.09 0.06 0.37 0.14 0.13 0.09 0.11 0.06 0.2 0.26 0.55
0.07 0.07 0.09 0.26 0.22 0.23 0.13 0.19 0.34 0.33 0.27 0.37 0.4 0.35 0.36 0.22 0.25 0.51 0.24 0.29 0.2 0.2 0.57 0.26 0.23 0.35 0.34 0.11 0.33 0.42 1.0
0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.63 0.23 0.05 0.03 0.04 1.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.83 0.05 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)