1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_184 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.44 0.43 0.38 0.35 0.5 0.48 0.38 0.47 0.3 0.31 0.34 0.31 0.38 0.7 0.59 0.38 0.32 0.69 0.37 0.31 0.31 0.32 1.0 0.31 0.28 0.31 0.33 0.3 0.41 0.36 0.42
0.29 0.58 0.27 0.17 0.38 0.33 0.17 0.16 0.18 0.17 0.19 0.16 0.22 0.41 0.35 0.24 0.19 0.96 0.26 0.19 0.18 0.19 1.0 0.17 0.18 0.2 0.19 0.15 0.22 0.22 0.26
0.62 0.47 0.5 0.28 0.54 0.25 0.13 0.12 0.16 0.15 0.19 0.13 0.23 0.21 0.26 0.19 0.16 0.91 0.16 0.15 0.14 0.14 1.0 0.13 0.14 0.16 0.16 0.2 0.18 0.2 0.21
0.37 0.76 0.26 0.13 0.35 0.42 0.21 0.23 0.16 0.15 0.17 0.15 0.34 0.39 0.3 0.24 0.19 0.55 0.19 0.15 0.2 0.18 1.0 0.18 0.19 0.22 0.19 0.2 0.19 0.19 0.18
0.29 0.36 0.2 0.13 0.25 0.22 0.18 0.2 0.18 0.19 0.19 0.24 0.27 0.35 0.34 0.23 0.22 1.0 0.32 0.17 0.2 0.17 0.96 0.19 0.18 0.21 0.19 0.18 0.26 0.25 0.34
0.33 0.44 0.26 0.18 0.19 0.14 0.07 0.07 0.08 0.08 0.09 0.08 0.12 0.14 0.11 0.15 0.13 0.84 0.1 0.08 0.08 0.09 1.0 0.07 0.11 0.11 0.11 0.09 0.1 0.12 0.1
0.09 0.41 0.09 0.05 0.1 0.18 0.13 0.13 0.04 0.02 0.02 0.03 0.17 0.06 0.08 0.16 0.07 0.5 0.04 0.05 0.05 0.04 1.0 0.06 0.08 0.2 0.05 0.05 0.08 0.13 0.07
0.13 0.37 0.11 0.08 0.48 0.09 0.02 0.04 0.02 0.01 0.05 0.01 0.05 0.07 0.06 0.06 0.05 0.42 0.05 0.01 0.03 0.03 1.0 0.03 0.03 0.02 0.06 0.01 0.08 0.09 0.02
0.09 0.27 0.06 0.01 0.17 0.16 0.03 0.02 0.01 0.03 0.02 0.01 0.09 0.24 0.17 0.09 0.04 0.69 0.09 0.05 0.03 0.03 1.0 0.03 0.04 0.09 0.03 0.04 0.06 0.06 0.05
0.52 0.46 0.59 0.44 0.63 0.52 0.36 0.36 0.33 0.35 0.4 0.31 0.45 0.84 0.71 0.39 0.39 0.88 0.48 0.36 0.38 0.4 1.0 0.39 0.41 0.42 0.4 0.37 0.46 0.45 0.52
0.01 0.25 0.01 0.0 0.16 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.35 0.98 0.18 0.07 0.21 0.35 0.16 0.18 0.08 0.08 0.08 0.09 0.33 0.6 0.23 0.16 0.11 0.59 0.12 0.1 0.09 0.1 1.0 0.1 0.12 0.19 0.13 0.1 0.16 0.13 0.09
0.56 0.83 0.58 0.44 0.45 0.4 0.17 0.16 0.17 0.16 0.19 0.17 0.21 0.24 0.23 0.2 0.2 0.91 0.19 0.19 0.17 0.16 1.0 0.17 0.18 0.18 0.21 0.16 0.19 0.19 0.16
0.41 0.94 0.15 0.01 0.09 0.08 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.07 0.02 0.02 0.01 0.01 0.57 0.01 0.01 0.01 0.0 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02
0.35 0.56 0.2 0.13 0.63 0.57 0.29 0.32 0.27 0.21 0.27 0.21 0.32 0.77 0.73 0.43 0.34 0.72 0.48 0.28 0.32 0.32 1.0 0.36 0.34 0.3 0.34 0.25 0.45 0.4 0.31
0.26 0.28 0.09 0.0 0.08 0.06 0.04 0.04 0.05 0.05 0.05 0.05 0.26 0.18 0.01 0.04 0.03 0.63 0.0 0.01 0.02 0.03 1.0 0.04 0.06 0.07 0.01 0.04 0.06 0.06 0.13
0.49 0.83 0.33 0.08 0.06 0.09 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.04 0.15 0.03 0.04 0.04 0.04 0.55 0.05 0.04 0.04 0.04 1.0 0.04 0.05 0.05 0.04 0.04 0.05 0.04 0.06
0.52 0.6 0.35 0.28 0.57 0.42 0.28 0.29 0.28 0.28 0.31 0.28 0.5 0.54 0.46 0.37 0.36 0.83 0.33 0.28 0.3 0.29 1.0 0.3 0.29 0.36 0.34 0.29 0.39 0.41 0.38
0.19 0.27 0.13 0.3 0.56 0.4 0.24 0.24 0.26 0.24 0.26 0.22 0.2 0.42 0.41 0.29 0.27 0.71 0.27 0.22 0.22 0.25 1.0 0.23 0.24 0.2 0.29 0.21 0.34 0.32 0.36
0.27 0.75 0.15 0.1 0.44 0.22 0.09 0.08 0.08 0.08 0.1 0.1 0.12 0.18 0.17 0.12 0.1 0.76 0.1 0.09 0.09 0.09 1.0 0.08 0.1 0.1 0.1 0.08 0.11 0.11 0.13
0.46 0.55 0.46 0.32 0.5 0.34 0.13 0.13 0.18 0.17 0.2 0.18 0.22 0.38 0.32 0.21 0.16 1.0 0.18 0.16 0.18 0.19 0.89 0.15 0.16 0.2 0.18 0.18 0.27 0.23 0.2
0.49 0.72 0.29 0.18 0.49 0.36 0.17 0.14 0.11 0.1 0.11 0.09 0.18 0.2 0.21 0.18 0.16 0.45 0.28 0.13 0.12 0.11 1.0 0.14 0.12 0.13 0.16 0.09 0.13 0.13 0.16
0.26 0.37 0.16 0.12 0.23 0.18 0.16 0.11 0.12 0.1 0.13 0.08 0.16 0.46 0.34 0.21 0.2 0.47 0.14 0.13 0.15 0.12 1.0 0.14 0.11 0.16 0.12 0.11 0.15 0.17 0.29
0.35 1.0 0.18 0.08 0.21 0.28 0.11 0.13 0.08 0.08 0.08 0.07 0.28 0.14 0.1 0.2 0.13 0.58 0.04 0.08 0.06 0.05 0.93 0.09 0.09 0.16 0.1 0.08 0.08 0.11 0.19
0.54 0.52 0.5 0.25 0.39 0.18 0.06 0.04 0.09 0.08 0.11 0.08 0.16 0.28 0.2 0.12 0.08 1.0 0.14 0.07 0.08 0.08 1.0 0.07 0.07 0.08 0.08 0.07 0.1 0.1 0.14
0.48 0.29 0.25 0.18 0.43 0.37 0.22 0.22 0.17 0.16 0.17 0.14 0.21 0.71 0.72 0.28 0.19 0.72 0.24 0.19 0.18 0.18 1.0 0.21 0.16 0.19 0.19 0.2 0.21 0.17 0.24
0.2 0.38 0.14 0.11 0.32 0.23 0.19 0.21 0.08 0.08 0.1 0.1 0.15 0.3 0.29 0.15 0.16 1.0 0.21 0.14 0.13 0.13 0.84 0.18 0.16 0.14 0.15 0.15 0.17 0.16 0.19
0.47 0.48 0.44 0.33 0.63 0.51 0.32 0.39 0.31 0.32 0.37 0.33 0.44 0.71 0.61 0.41 0.35 0.64 0.34 0.29 0.31 0.32 1.0 0.31 0.31 0.35 0.33 0.3 0.46 0.42 0.48
0.18 0.42 0.12 0.07 0.23 0.18 0.09 0.05 0.1 0.08 0.08 0.09 0.26 0.28 0.17 0.18 0.17 0.51 0.17 0.14 0.12 0.12 1.0 0.09 0.12 0.19 0.11 0.11 0.1 0.14 0.2
0.37 0.84 0.07 0.03 0.06 0.05 0.02 0.02 0.01 0.0 0.02 0.01 0.05 0.02 0.01 0.01 0.01 0.75 0.0 0.01 0.01 0.01 1.0 0.02 0.01 0.02 0.01 0.0 0.07 0.09 0.08
0.06 0.19 0.01 0.03 0.1 0.13 0.03 0.02 0.02 0.0 0.01 0.03 0.03 0.12 0.05 0.02 0.01 0.75 0.03 0.03 0.04 0.03 1.0 0.03 0.08 0.07 0.03 0.03 0.05 0.06 0.04
0.32 0.35 0.23 0.15 0.49 0.39 0.11 0.09 0.17 0.16 0.17 0.15 0.25 0.82 0.54 0.28 0.21 0.6 0.3 0.16 0.17 0.18 1.0 0.16 0.19 0.22 0.19 0.23 0.15 0.16 0.22
0.47 0.44 0.45 0.4 0.38 0.35 0.18 0.18 0.26 0.29 0.29 0.3 0.33 0.36 0.3 0.34 0.3 0.76 0.29 0.26 0.24 0.28 1.0 0.24 0.28 0.27 0.32 0.28 0.23 0.32 0.34
0.52 0.6 0.41 0.37 0.61 0.39 0.24 0.25 0.24 0.26 0.28 0.23 0.27 0.54 0.45 0.29 0.27 0.94 0.29 0.23 0.23 0.24 1.0 0.2 0.23 0.24 0.25 0.23 0.31 0.28 0.31
0.35 0.55 0.23 0.13 0.24 0.31 0.1 0.13 0.07 0.06 0.08 0.09 0.1 0.25 0.15 0.1 0.09 0.64 0.12 0.07 0.07 0.06 1.0 0.1 0.08 0.1 0.1 0.07 0.14 0.14 0.17
0.43 0.45 0.36 0.27 0.32 0.18 0.06 0.05 0.1 0.1 0.12 0.1 0.14 0.23 0.17 0.11 0.09 1.0 0.1 0.07 0.09 0.09 0.95 0.07 0.09 0.09 0.09 0.09 0.13 0.12 0.13
0.39 0.37 0.26 0.25 0.46 0.42 0.31 0.35 0.27 0.27 0.28 0.25 0.38 0.64 0.55 0.33 0.28 0.67 0.31 0.24 0.26 0.28 1.0 0.25 0.27 0.28 0.29 0.27 0.38 0.37 0.45
0.38 0.52 0.24 0.21 0.37 0.32 0.19 0.22 0.2 0.2 0.24 0.19 0.42 0.42 0.35 0.28 0.25 0.78 0.3 0.24 0.21 0.2 1.0 0.2 0.17 0.28 0.22 0.2 0.23 0.24 0.29
0.29 0.32 0.24 0.32 0.51 0.39 0.28 0.34 0.19 0.19 0.21 0.22 0.39 0.62 0.51 0.31 0.3 0.69 0.27 0.24 0.26 0.26 1.0 0.24 0.26 0.25 0.28 0.26 0.34 0.3 0.37
0.42 0.77 0.37 0.35 0.81 0.37 0.17 0.16 0.21 0.21 0.22 0.2 0.22 0.46 0.37 0.23 0.2 0.99 0.22 0.19 0.18 0.2 1.0 0.17 0.18 0.22 0.21 0.17 0.24 0.21 0.22
0.67 0.74 0.36 0.16 0.52 0.25 0.04 0.03 0.06 0.06 0.08 0.08 0.19 0.16 0.17 0.13 0.1 0.88 0.1 0.06 0.07 0.07 1.0 0.04 0.07 0.09 0.07 0.12 0.05 0.04 0.03
0.23 0.39 0.13 0.1 0.46 0.29 0.11 0.11 0.13 0.11 0.14 0.14 0.23 0.3 0.23 0.16 0.17 0.54 0.13 0.08 0.09 0.1 1.0 0.1 0.11 0.12 0.09 0.11 0.22 0.23 0.38
0.19 0.74 0.06 0.02 0.12 0.14 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.05 0.04 0.08 0.04 0.02 0.79 0.03 0.01 0.03 0.04 1.0 0.03 0.03 0.05 0.02 0.01 0.01 0.02 0.03
0.35 0.6 0.16 0.13 0.15 0.18 0.06 0.04 0.12 0.11 0.13 0.11 0.12 0.13 0.13 0.14 0.1 0.58 0.1 0.08 0.1 0.08 1.0 0.09 0.12 0.12 0.11 0.07 0.14 0.16 0.19
0.21 0.35 0.21 0.13 0.26 0.42 0.19 0.13 0.23 0.17 0.2 0.19 0.26 0.33 0.29 0.28 0.26 0.91 0.21 0.17 0.19 0.18 1.0 0.17 0.19 0.22 0.21 0.16 0.2 0.23 0.19
0.65 0.6 0.41 0.32 0.55 0.41 0.24 0.18 0.3 0.28 0.34 0.34 0.22 0.36 0.35 0.31 0.24 1.0 0.37 0.21 0.27 0.23 0.86 0.21 0.22 0.24 0.27 0.26 0.36 0.38 0.25
0.4 0.55 0.3 0.25 0.37 0.4 0.25 0.24 0.24 0.23 0.26 0.24 0.37 0.5 0.42 0.34 0.3 0.82 0.28 0.25 0.26 0.26 1.0 0.25 0.26 0.28 0.27 0.27 0.29 0.29 0.29
0.62 0.51 0.5 0.35 0.53 0.37 0.19 0.18 0.2 0.19 0.2 0.22 0.32 0.36 0.36 0.27 0.28 0.93 0.31 0.26 0.28 0.28 1.0 0.23 0.27 0.26 0.28 0.38 0.2 0.15 0.11
0.28 0.47 0.25 0.21 0.44 0.37 0.19 0.21 0.18 0.17 0.2 0.19 0.18 0.35 0.29 0.22 0.19 1.0 0.21 0.16 0.17 0.17 0.88 0.16 0.18 0.18 0.18 0.14 0.24 0.26 0.29
0.09 0.27 0.08 0.07 0.19 0.12 0.03 0.03 0.04 0.03 0.04 0.03 0.11 0.22 0.19 0.04 0.03 1.0 0.07 0.03 0.03 0.03 0.83 0.02 0.02 0.04 0.02 0.04 0.04 0.03 0.02
0.43 0.47 0.3 0.24 0.68 0.49 0.34 0.32 0.24 0.26 0.28 0.25 0.26 0.74 0.68 0.38 0.29 0.66 0.36 0.22 0.25 0.27 1.0 0.27 0.24 0.25 0.28 0.26 0.47 0.43 0.38
0.47 0.72 0.35 0.29 0.59 0.26 0.07 0.07 0.09 0.09 0.12 0.1 0.1 0.27 0.21 0.13 0.1 0.65 0.12 0.08 0.08 0.08 1.0 0.08 0.09 0.08 0.12 0.07 0.18 0.17 0.15
0.74 0.73 0.56 0.44 0.58 0.3 0.16 0.15 0.18 0.23 0.23 0.22 0.31 0.37 0.37 0.27 0.24 1.0 0.25 0.21 0.24 0.24 0.97 0.2 0.24 0.23 0.23 0.21 0.3 0.3 0.35
0.55 0.71 0.39 0.48 0.7 0.4 0.25 0.28 0.23 0.23 0.23 0.21 0.26 0.51 0.42 0.27 0.26 0.51 0.28 0.25 0.25 0.27 1.0 0.25 0.26 0.25 0.29 0.24 0.32 0.28 0.3
0.36 0.42 0.22 0.11 0.33 0.29 0.26 0.24 0.18 0.14 0.15 0.11 0.16 0.3 0.22 0.17 0.14 0.81 0.13 0.13 0.15 0.15 1.0 0.14 0.15 0.18 0.17 0.18 0.22 0.19 0.14
0.07 0.34 0.06 0.02 0.11 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.02 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.01 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.07 0.0
0.28 0.58 0.17 0.1 0.37 0.21 0.06 0.07 0.07 0.07 0.06 0.06 0.12 0.31 0.22 0.08 0.09 0.65 0.09 0.05 0.05 0.07 1.0 0.06 0.08 0.07 0.08 0.06 0.1 0.09 0.13
0.31 0.43 0.28 0.2 0.27 0.31 0.25 0.18 0.18 0.18 0.18 0.19 0.14 0.15 0.23 0.26 0.24 0.56 0.16 0.16 0.18 0.17 1.0 0.14 0.17 0.19 0.18 0.14 0.17 0.2 0.19
0.24 0.35 0.18 0.13 0.31 0.2 0.09 0.09 0.07 0.06 0.06 0.07 0.14 0.28 0.23 0.12 0.12 1.0 0.1 0.07 0.09 0.08 0.89 0.05 0.07 0.1 0.07 0.1 0.08 0.08 0.11
0.54 0.75 0.53 0.37 0.67 0.3 0.06 0.06 0.13 0.13 0.15 0.13 0.13 0.25 0.19 0.15 0.11 0.78 0.12 0.1 0.12 0.12 1.0 0.08 0.11 0.13 0.14 0.11 0.15 0.15 0.09
0.53 0.53 0.34 0.25 0.59 0.43 0.09 0.04 0.07 0.07 0.12 0.06 0.19 0.25 0.2 0.11 0.05 0.8 0.09 0.07 0.08 0.07 1.0 0.08 0.09 0.09 0.08 0.11 0.18 0.12 0.08
0.34 0.5 0.21 0.28 0.61 0.34 0.18 0.15 0.17 0.16 0.16 0.16 0.22 0.5 0.41 0.24 0.25 0.6 0.22 0.17 0.17 0.18 1.0 0.18 0.18 0.2 0.25 0.16 0.22 0.19 0.22
0.13 0.27 0.14 0.08 0.21 0.25 0.08 0.08 0.06 0.06 0.07 0.07 0.13 0.14 0.12 0.11 0.07 0.59 0.08 0.09 0.08 0.09 1.0 0.08 0.1 0.12 0.09 0.09 0.1 0.08 0.11
0.45 0.75 0.29 0.2 0.45 0.17 0.08 0.07 0.07 0.07 0.1 0.06 0.12 0.33 0.26 0.12 0.1 0.64 0.12 0.07 0.07 0.07 1.0 0.06 0.07 0.07 0.08 0.07 0.11 0.12 0.08
0.12 0.13 0.03 0.05 0.25 0.07 0.07 0.03 0.04 0.06 0.05 0.01 0.06 0.34 0.1 0.06 0.04 0.54 0.05 0.05 0.03 0.08 1.0 0.02 0.03 0.07 0.1 0.06 0.01 0.02 0.0
0.21 0.54 0.14 0.06 0.4 0.17 0.04 0.02 0.06 0.04 0.07 0.04 0.17 0.1 0.11 0.1 0.07 0.58 0.09 0.06 0.07 0.08 1.0 0.03 0.05 0.11 0.04 0.06 0.06 0.07 0.04
0.57 0.76 0.44 0.31 0.44 0.25 0.08 0.06 0.12 0.11 0.13 0.11 0.13 0.18 0.15 0.14 0.14 0.71 0.14 0.1 0.1 0.1 1.0 0.11 0.11 0.11 0.11 0.1 0.12 0.12 0.12
0.41 0.49 0.3 0.21 0.45 0.36 0.17 0.22 0.18 0.16 0.17 0.13 0.23 0.75 0.52 0.26 0.22 0.6 0.25 0.18 0.18 0.17 1.0 0.2 0.18 0.22 0.2 0.14 0.27 0.26 0.26
0.37 0.42 0.27 0.24 0.46 0.25 0.2 0.19 0.17 0.18 0.18 0.18 0.15 0.25 0.25 0.19 0.17 0.91 0.18 0.16 0.16 0.17 1.0 0.14 0.15 0.16 0.19 0.17 0.21 0.21 0.23
0.39 0.61 0.22 0.09 0.2 0.2 0.05 0.05 0.09 0.08 0.1 0.07 0.1 0.21 0.17 0.11 0.12 0.66 0.14 0.07 0.06 0.06 1.0 0.06 0.1 0.11 0.11 0.13 0.13 0.11 0.13

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)