Heatmap: Cluster_145 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
- 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 3.1 - - - - - - - - - - - 1.44 - - 1.13 - - - - - - - 2.2 2.95 1.48 - - - 1.22
0.03 1.71 0.21 1.57 0.24 -1.11 0.11 0.59 -0.13 -0.03 0.95 0.6 0.02 - - -0.41 -0.86 -4.05 -1.24 -0.31 -0.06 -1.38 - -1.23 0.19 0.65 0.04 -0.7 0.49 0.79 -2.72
- 4.5 - - - - - 1.51 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.45 - - -
0.08 - - 1.1 1.6 2.52 - - 1.16 - - -0.31 0.94 - -0.14 -0.17 0.6 - - 0.59 - 1.55 2.04 - - - - - - - 1.17
0.89 3.14 - - - - - - 0.6 - - - 0.68 - - 1.13 - - - - - 2.85 0.67 - - 2.23 - - - - 0.59
- - - - - 3.05 - - 3.04 - - - - - - - - 2.05 - - - - 2.61 - - - - - - - 2.09
- - - 2.53 - - - - 3.77 - - - - 3.53 - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.48 - - - - - - - - 3.12 - - - - - - - - - - - - -
0.9 0.66 -1.07 1.34 0.25 0.75 -0.2 -0.82 0.63 0.6 0.14 0.53 -1.04 0.76 0.24 -0.52 -0.46 -2.6 -1.08 0.53 -1.83 -1.87 -1.27 -0.36 -3.08 -0.35 0.24 -0.17 -0.65 -0.86 0.88
- 2.75 -1.19 0.85 0.25 0.11 1.6 -0.27 0.95 0.05 -0.43 - - - 0.3 -1.3 -0.26 - 0.13 -0.62 -1.63 - -0.45 1.29 - 0.87 -0.31 - -0.45 - 0.09
0.42 -1.82 -1.82 -0.23 -0.51 0.76 -1.32 -0.29 1.29 0.49 -0.14 0.42 -1.42 0.54 -1.23 -0.63 0.71 -0.61 0.88 0.5 -1.6 -0.82 -2.91 0.18 -0.06 -0.26 -3.23 0.4 -0.4 -0.16 1.61
- - - - - - - 4.09 3.8 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.05 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.85 - -
1.15 2.78 - - - - - - - 3.2 - - - - - - 1.35 - - - - - - - 1.87 - - 0.58 - - 2.34
- - - - - - - - 4.09 - - - - - - - - - - - - - 3.81 - - - - - - - -
-23.79 3.26 3.35 - - - - -18.33 - - - - - - - - -18.78 - - -26.18 - -0.15 2.72 -24.13 -5.56 -6.15 - -2.7 - 0.98 0.72
- 4.65 - - - - - - - - - 2.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.11 - - - - - - 3.77 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 2.82 - 1.82 - 1.5 - - 1.44 1.54 - - - - - - - - - - - 2.57 - - 1.6 - - 1.58 - - -
- - - - - - 3.97 - 3.94 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.9 - - - - 3.0 - - - 1.54 1.89 - - - - - - - - 3.15 - - - - - - - -
0.64 3.19 - - - - -0.82 - - -0.34 - - -0.34 - - - 0.7 1.95 - - -0.54 - 3.14 - - 0.31 - - - - 0.98
- - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.38 - - - 3.35 - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.19 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.67 - - - - - - - - - -
- 4.3 - - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.26 - - - - - 2.7 - - - -
- - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 0.8 2.08 1.49 - - 2.77 - - 0.48 - - 0.67 - - - - - - - 2.37 - - - 1.71 - -0.59 - 1.72
- - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - -0.85 - -0.62 1.06 -0.82 -1.01 0.66 0.66 0.17 0.08 0.98 -0.35 0.33 -0.9 -0.61 -0.69 1.81 0.45 0.22 -0.63 - -1.27 -1.24 0.14 -2.38 0.36 -2.18 1.23 1.5
- - - - -7.61 - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.44 2.44 - - -0.91 - - - - -0.72 - - 2.72 0.24 0.83 - -0.76 2.85 0.59 - - - - 0.99 - - - -1.17 - -0.99 0.31
- - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - 2.37 - - - - 3.28 - - 2.33 - 1.69 1.45 - - - - - - - - - - - 1.51 - - 1.2 -
- 3.48 - - - - - - 0.09 0.19 -0.03 1.92 - - - - - -0.12 - 0.74 - - -0.02 - - - - 1.71 - - 2.58
- 4.16 - - - - - - - - - - - - - - - 3.71 - - - - - - - - - - - - -
0.33 3.25 - 2.22 - - - - - - - 2.73 - - - - - - 2.58 - 1.14 -13.45 -0.46 - - - - - - - -
- - - - 0.41 0.36 0.79 - 2.27 0.29 - - 0.4 - - - 1.56 - - 1.18 - 0.65 - 1.87 1.4 0.08 - 1.73 - - 0.85
- - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.61 1.88 - - 0.13 - - - 0.04 - - -0.77 - - -0.59 -0.34 1.53 1.37 - - - 1.18 2.07 -0.9 -0.86 0.66 - 0.01 1.48 -0.53 1.35
- 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - 4.27 - 3.55 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 3.61 3.34 - - - - - - - - - - - - - - - - 3.11 - - - - -
1.16 3.12 1.62 -2.75 0.95 -3.14 - -2.76 0.48 - - - 0.1 - -2.49 - -1.69 0.9 -1.91 -2.94 -1.95 - 2.58 - -2.81 -0.26 0.03 -2.76 - -0.65 -1.34
- 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
-3.11 0.5 -2.19 -0.07 0.96 0.44 -0.67 -0.96 -1.71 -0.02 0.22 -1.65 0.29 0.49 0.4 -2.57 0.56 1.09 -1.31 -0.18 -1.28 0.85 -0.25 -0.99 -1.66 0.26 -0.02 0.98 1.11 -1.46 0.62
- - - - - - - - 4.95 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- 4.5 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 3.07
0.98 2.76 -0.72 - 0.88 0.45 -1.36 -0.44 - -3.08 -2.88 -1.98 -0.19 -0.09 0.92 -1.33 -1.95 1.06 -1.13 -0.65 -0.7 - 2.75 - -1.55 -0.04 - -2.03 - -2.83 -2.11
1.82 3.52 - -0.61 1.13 0.9 0.33 -0.71 -0.68 - - - -1.0 - 0.47 - - - - - - - - -0.97 0.29 0.97 - - 1.21 - -0.2
- 0.42 - 0.34 -0.17 1.62 - - 2.37 1.52 0.4 0.27 - 0.75 - - 1.62 - 1.34 1.25 - - - - - - - 1.28 - - 0.82
- 2.9 - - - - - - - - - 0.82 3.04 - - - - 2.9 - - - - - - - 1.0 - 2.02 - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.