Heatmap: Cluster_121 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Light: 268 uE m-2 s-1	Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)	Light: 135 uE m-2 s-1	Light: 67.5 uE m-2 s-1	Photoperiod: L24	Photoperiod: L20D4 (Control)	Photoperiod: L12D12	Photoperiod: L8D16	RBW: 4:1:1 (Control)	RBW: 4:1:0	RBW: 3:1:1	RBW: 3:1:0	Nitrogen: 0%	Nitrogen: 25%	Nitrogen: 50%	Nitrogen: 100% (Control)	Nitrogen: 150%	Phosphorous: 0%	Phosphorous: 25%	Phosphorous: 50%	Phosphorous: 100% (Control)	Phosphorous: 150%	Potassium: 0%	Potassium: 25%	Potassium: 50%	Potassium: 100% (Control)	Potassium: 150%	Temperature: 20°C	Temperature: 25°C (Control)	Temperature: 30°C	Temperature: 35°C
Lsat_1_v5_gn_0_16540.1 (CFM2)	-0.16	-0.11	-0.42	-0.55	-0.03	0.13	-0.06	0.33	-0.33	-0.23	-0.11	-0.14	0.28	0.67	0.35	-0.16	-0.14	-1.33	0.06	-0.26	-0.11	0.02	0.05	0.04	-0.04	0.03	-0.26	-0.27	0.17	0.23	0.9
Lsat_1_v5_gn_1_15060.1 (RRT1)	-0.59	-0.51	-0.72	-0.18	-0.08	0.13	0.26	0.34	-0.18	-0.06	-0.03	0.03	0.26	0.46	0.15	-0.09	0.06	-0.18	-0.26	-0.09	-0.16	0.14	-0.14	-0.06	-0.09	-0.05	-0.2	-0.21	0.18	0.25	0.71
Lsat_1_v5_gn_1_41060.1	-0.75	-0.13	-0.58	-0.81	-0.25	0.08	0.18	0.86	-0.13	-0.27	-0.07	-0.23	-0.26	1.07	0.72	0.05	-0.12	-2.81	-0.03	-0.14	-0.25	0.1	-1.32	0.1	-0.07	-0.22	0.05	-0.56	0.17	0.4	0.95
Lsat_1_v5_gn_1_69760.1	-1.37	-0.76	-0.42	0.05	0.34	0.35	0.06	0.73	0.21	-0.21	0.08	-0.25	-0.71	1.01	0.8	-0.02	-0.44	-0.98	-0.57	-0.84	-0.35	-0.48	-0.7	-0.57	-0.18	-0.28	-0.52	-0.83	0.33	0.82	1.3
Lsat_1_v5_gn_1_77520.1 (FRF3)	-1.04	-1.49	-0.84	-0.23	-0.11	-0.05	0.03	0.69	-0.61	0.01	-0.29	0.0	0.18	0.67	0.68	-0.0	0.09	-0.32	-0.33	0.14	-0.08	-0.14	0.01	-0.21	-0.01	-0.47	-0.29	-0.17	0.27	0.33	1.03
Lsat_1_v5_gn_2_108301.1 (XPO2)	-1.11	-1.31	-0.23	0.07	0.37	0.14	-0.4	-0.11	-0.01	0.11	0.25	0.07	-0.36	1.04	0.73	-0.02	-0.12	-0.54	-0.16	-0.39	0.03	-0.46	-0.49	-0.43	-0.49	0.09	0.11	-0.56	0.32	0.64	0.64
Lsat_1_v5_gn_2_117820.1 (P5CS1)	-0.48	-0.61	-0.72	-0.29	0.01	0.11	0.1	0.34	-0.06	-0.09	-0.11	-0.1	0.27	-0.11	-0.06	-0.12	-0.15	0.17	0.01	-0.07	-0.28	-0.13	0.14	-0.0	-0.01	-0.26	-0.2	-0.24	0.44	0.52	0.88
Lsat_1_v5_gn_2_15941.1 (TN9)	-1.42	-1.35	-0.79	0.0	0.33	0.57	0.09	0.49	-0.33	-0.55	-0.06	-0.16	0.33	0.92	0.47	0.0	-0.15	-1.0	-0.28	-0.36	-0.36	-0.14	0.34	-0.43	-0.18	-0.32	-0.17	-0.41	0.12	0.46	1.06
Lsat_1_v5_gn_2_25880.1 (PAPS1)	-1.13	-1.79	-2.09	-1.83	-0.46	-0.55	-0.69	0.12	0.08	0.05	0.13	-0.09	0.5	0.93	0.78	0.2	-0.05	-0.33	0.19	0.18	-0.09	0.21	0.04	-0.09	-0.01	0.02	-0.03	-0.35	0.23	0.35	1.01
Lsat_1_v5_gn_2_4240.1 (TTN7)	-1.54	-1.49	-0.6	-0.24	-0.05	0.46	-0.03	-0.24	0.33	-0.09	0.16	0.03	-0.73	0.63	0.98	0.12	-0.23	0.05	0.1	-0.41	-0.05	-0.07	-0.85	-0.62	-0.08	0.35	0.0	-0.53	0.16	0.2	1.05
Lsat_1_v5_gn_2_78040.1	-0.53	-0.73	-0.54	-0.4	-0.18	0.14	-0.03	0.2	-0.04	0.01	-0.01	0.23	0.25	0.22	-0.09	0.1	0.08	-0.0	-0.05	-0.2	-0.26	0.03	-0.14	0.13	-0.21	0.02	-0.06	-0.26	0.17	0.35	0.86
Lsat_1_v5_gn_2_80401.1	-0.82	-0.98	-2.21	-0.39	0.14	0.46	-0.4	-0.21	-0.13	0.1	-0.13	0.15	0.54	0.43	0.13	-0.03	-0.18	-0.29	-0.57	-0.51	-0.47	-0.2	-0.01	0.14	0.02	0.08	-0.23	-0.23	0.44	0.65	1.33
Lsat_1_v5_gn_2_82680.1 (TRB1)	-1.18	-1.06	-1.23	-0.81	-0.01	0.34	0.06	0.32	-0.48	-0.09	-0.09	-0.18	0.64	0.82	0.16	-0.06	0.01	-0.02	-0.48	-0.18	-0.02	0.13	-0.5	0.05	-0.26	0.11	-0.08	-0.13	0.23	0.26	1.05
Lsat_1_v5_gn_2_83821.1	-1.27	-1.07	-1.24	-0.28	-0.37	0.01	-0.09	0.55	-0.33	-0.26	-0.15	0.19	0.52	0.2	0.01	-0.27	0.09	0.16	-0.5	0.14	0.12	-0.07	-0.26	0.3	0.02	0.28	-0.01	-0.4	0.14	0.08	1.24
Lsat_1_v5_gn_3_113520.1	-1.02	-0.86	-1.14	-0.44	0.26	0.63	0.23	0.49	-0.12	-0.25	0.16	0.13	-0.17	0.86	0.55	0.04	-0.28	-0.52	-0.03	-0.32	-0.36	-0.21	0.37	-0.37	-0.6	-0.28	0.08	-0.66	0.36	0.38	0.6
Lsat_1_v5_gn_3_134681.1 (AGL6)	-0.49	-1.11	-1.36	-0.93	0.01	0.38	0.36	0.83	-0.39	-0.85	-0.76	-0.38	0.83	0.71	0.34	-0.24	0.14	0.05	-0.52	-0.18	-0.38	-0.27	-0.74	-0.05	-0.2	0.25	0.01	-0.43	-0.03	0.4	1.24
Lsat_1_v5_gn_3_23500.1	-0.8	-0.9	-0.78	-1.01	-0.23	0.25	0.17	0.33	0.04	0.07	0.07	0.0	0.26	0.37	0.32	0.04	-0.17	-0.25	-0.21	-0.07	-0.17	0.05	0.16	-0.19	-0.09	-0.19	-0.09	-0.24	0.13	0.33	1.06
Lsat_1_v5_gn_3_26781.1	-3.36	-5.36	-1.95	-1.26	-1.75	-1.44	0.28	0.75	0.23	0.23	0.11	-0.13	0.84	-0.63	-0.2	-0.46	0.39	-1.48	-0.84	0.03	0.03	-0.14	-0.11	0.54	0.41	-0.07	-0.65	-0.81	0.22	0.89	2.06
Lsat_1_v5_gn_3_33301.1	-1.19	-0.61	-0.99	-0.36	-0.13	0.1	0.09	0.41	-0.03	0.02	0.24	0.06	0.15	0.48	0.37	0.21	0.08	-0.6	-0.01	-0.17	-0.19	-0.07	0.11	-0.07	-0.15	-0.25	-0.02	-0.31	0.09	0.36	0.8
Lsat_1_v5_gn_3_34941.1 (PERK14)	-0.75	-0.97	-0.19	0.19	0.23	0.25	-0.15	-0.03	0.14	0.03	0.2	0.03	-0.65	0.66	0.51	0.04	-0.31	-0.33	0.04	-0.14	-0.06	-0.14	-0.41	-0.37	-0.29	0.03	0.15	-0.11	0.22	0.25	0.59
Lsat_1_v5_gn_4_100101.1	-0.81	-0.64	-1.5	-1.57	-0.64	0.33	1.19	0.74	0.06	-0.23	-0.23	-0.46	-0.78	1.31	0.72	-0.21	-0.31	-5.12	0.05	-0.12	-0.3	-0.29	-2.79	-0.01	0.01	-0.12	0.04	0.15	0.5	0.53	0.77
Lsat_1_v5_gn_4_115781.1 (HDA15)	-0.67	-0.38	-0.85	-0.49	0.02	0.15	-0.14	0.32	-0.06	-0.18	-0.02	-0.23	0.43	0.58	0.29	-0.02	-0.12	0.07	-0.1	-0.12	-0.42	-0.19	0.08	-0.05	-0.23	-0.2	-0.16	-0.3	0.16	0.36	1.03
Lsat_1_v5_gn_4_11761.1	-0.46	-0.45	-0.9	-0.49	0.0	0.17	-0.13	0.43	-0.68	-0.23	-0.51	-0.12	0.46	0.51	0.39	-0.17	0.22	-0.05	-0.08	-0.31	-0.25	-0.01	-0.1	0.07	-0.17	0.04	-0.28	-0.2	0.4	0.26	0.99
Lsat_1_v5_gn_4_141000.1	-1.09	-0.61	-0.67	-0.57	0.36	0.33	0.41	0.22	0.07	0.02	0.04	0.02	-0.64	0.63	0.31	-0.03	-0.22	-0.95	0.03	-0.2	-0.06	-0.08	-0.17	-0.29	-0.09	-0.19	0.05	-0.41	0.18	0.59	0.92
Lsat_1_v5_gn_4_161581.1 (DG1)	-0.4	-0.35	-0.98	-1.03	-0.14	0.23	0.17	1.02	-0.53	-0.43	-0.34	-0.11	0.09	0.75	0.46	0.01	-0.12	-0.79	-0.08	-0.31	-0.09	0.1	-0.14	0.01	-0.15	-0.17	-0.18	-0.43	0.35	0.28	0.89
Lsat_1_v5_gn_4_163920.1 (RLK)	-1.45	-0.9	-0.96	-0.49	-0.06	-0.06	0.22	0.49	-0.03	0.13	0.09	-0.01	0.49	0.43	0.38	-0.09	-0.01	0.19	0.0	-0.05	-0.29	-0.14	-0.49	-0.05	-0.16	-0.09	-0.08	-0.35	0.27	0.32	0.8
Lsat_1_v5_gn_4_1681.1 (CRN)	-1.67	-1.41	-1.56	-1.0	-0.1	0.35	0.05	0.47	-0.16	-0.36	0.03	-0.39	0.53	0.85	0.59	0.25	-0.05	0.17	-0.02	-0.22	-0.34	-0.13	-1.55	-0.14	-0.1	-0.1	-0.03	-0.75	0.33	0.41	1.32
Lsat_1_v5_gn_4_185401.1 (PPO2)	-0.59	-0.69	-0.54	-0.21	-0.54	-0.08	-0.03	0.29	-0.18	-0.07	0.12	0.06	0.42	0.33	0.35	0.17	0.1	-0.41	0.04	-0.02	-0.16	-0.06	-0.45	0.3	0.09	0.11	0.08	-0.18	-0.09	0.11	0.69
Lsat_1_v5_gn_4_19561.1 (T5L1)	-2.78	-1.56	-1.5	-0.96	-1.08	0.09	0.46	0.37	-0.29	-0.81	-0.34	-0.36	0.15	0.44	0.87	0.03	-0.19	-0.01	0.28	0.02	-0.44	-0.84	0.39	0.08	0.03	-0.43	-0.62	-0.88	0.5	0.87	1.68
Lsat_1_v5_gn_4_20860.1 (CR88)	-0.42	-0.38	-1.05	-1.51	-0.52	0.07	0.15	0.71	-0.51	-0.47	-0.4	-0.03	0.19	0.73	0.25	-0.14	-0.05	-1.32	-0.14	-0.32	-0.03	0.07	0.0	0.12	0.03	-0.07	-0.36	-0.25	0.59	0.53	1.23
Lsat_1_v5_gn_4_42560.1	-2.38	-1.07	-2.45	-2.12	-0.74	0.08	0.71	0.89	-0.39	-0.58	-0.38	-0.57	-0.09	1.35	0.7	-0.03	-0.26	-0.38	0.02	-0.02	0.18	0.12	-2.17	-0.25	0.06	-0.16	-0.14	-0.46	0.8	0.77	0.92
Lsat_1_v5_gn_4_51620.1 (ANU10)	-0.3	-0.43	-0.98	-0.92	-0.23	0.25	-0.06	0.55	-0.49	-0.44	-0.27	-0.09	0.29	0.49	0.1	0.02	-0.0	-0.57	-0.23	-0.16	-0.11	0.1	0.31	0.02	-0.07	-0.1	-0.26	-0.04	0.39	0.47	0.97
Lsat_1_v5_gn_4_69980.1 (ROPGEF1)	-1.41	-1.38	-1.56	-0.94	-0.31	-0.0	-0.02	0.27	-0.26	-0.27	-0.01	0.03	0.69	0.58	0.31	-0.1	0.0	-0.69	0.16	-0.12	0.07	-0.05	-2.18	0.27	0.26	-0.03	0.22	-0.06	0.19	0.45	1.34
Lsat_1_v5_gn_5_128320.1	-0.53	-1.43	-0.44	-0.2	-0.16	0.19	-0.24	0.46	-0.18	-0.05	-0.02	-0.13	0.12	0.72	0.72	0.22	0.09	-1.63	-0.16	-0.22	-0.13	-0.15	-1.18	0.2	-0.43	0.05	-0.28	-0.39	0.29	0.36	1.24
Lsat_1_v5_gn_5_148201.1	-1.6	-0.64	-3.16	-5.32	-0.56	0.51	0.59	1.35	-0.62	-0.62	-0.32	-0.71	-0.1	1.47	0.91	-0.22	-0.08	-2.78	-0.15	-0.62	-0.16	0.22	-3.12	0.43	-0.11	0.38	0.01	-0.62	0.26	0.64	0.82
Lsat_1_v5_gn_5_169761.1 (CRR2)	-0.58	-0.61	-1.25	-1.3	-0.35	-0.03	0.09	0.54	-0.28	-0.29	-0.23	-0.13	-0.04	0.75	0.52	-0.01	-0.03	0.29	0.49	-0.46	-0.05	0.05	-0.81	0.16	-0.27	-0.06	-0.19	-0.41	0.32	0.25	1.13
Lsat_1_v5_gn_5_180841.1 (APD1)	-3.93	-0.63	-2.31	-2.5	-1.01	-0.07	0.64	0.75	-0.62	-0.87	-0.26	-0.45	0.18	1.23	0.89	-0.22	-0.35	0.34	0.21	-0.71	-1.04	-0.66	0.75	-0.12	-0.56	-0.37	-0.9	-1.23	0.48	0.97	1.57
Lsat_1_v5_gn_5_187740.1 (ABP)	-1.16	-0.83	-1.45	-1.2	-0.18	0.25	0.12	0.47	-0.18	-0.57	-0.18	-0.2	-0.09	0.73	0.44	-0.22	-0.4	0.23	0.45	-0.45	-0.12	0.09	0.22	0.03	-0.19	-0.1	-0.12	-0.37	0.19	0.43	1.22
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.