1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_59 (Lactuca sativa (Lsa) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.17 0.14 0.12 0.11 0.31 0.32 0.15 0.12 0.15 0.14 0.15 0.14 0.2 0.3 0.25 0.18 0.15 0.2 0.17 0.14 0.17 0.18 1.0 0.17 0.17 0.17 0.18 0.18 0.18 0.16 0.16
0.12 0.16 0.07 0.03 0.2 0.13 0.08 0.08 0.06 0.05 0.06 0.05 0.15 0.18 0.15 0.07 0.06 0.3 0.08 0.06 0.07 0.07 1.0 0.06 0.06 0.07 0.06 0.06 0.07 0.08 0.13
0.18 0.15 0.19 0.19 0.13 0.12 0.1 0.06 0.11 0.1 0.13 0.11 0.1 0.16 0.14 0.11 0.13 0.27 0.12 0.09 0.1 0.11 1.0 0.08 0.09 0.12 0.12 0.11 0.09 0.1 0.1
0.08 0.3 0.01 0.0 0.18 0.09 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.18 0.01 0.0 0.0 0.01 0.59 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02
0.13 0.16 0.13 0.11 0.14 0.19 0.1 0.09 0.07 0.06 0.07 0.06 0.08 0.18 0.14 0.1 0.07 0.2 0.1 0.06 0.07 0.08 1.0 0.07 0.08 0.08 0.08 0.07 0.11 0.1 0.1
0.06 0.09 0.12 0.08 0.38 0.13 0.04 0.07 0.09 0.07 0.07 0.04 0.12 0.25 0.1 0.03 0.02 0.14 0.15 0.04 0.04 0.03 1.0 0.05 0.06 0.06 0.1 0.08 0.1 0.1 0.06
0.05 0.12 0.04 0.06 0.18 0.08 0.02 0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.05 0.11 0.09 0.05 0.04 0.3 0.03 0.03 0.03 0.04 1.0 0.03 0.03 0.02 0.03 0.02 0.04 0.05 0.07
0.06 0.14 0.05 0.04 0.23 0.05 0.06 0.03 0.04 0.04 0.06 0.03 0.06 0.05 0.09 0.05 0.03 0.37 0.04 0.06 0.04 0.04 1.0 0.05 0.07 0.07 0.06 0.04 0.05 0.09 0.12
0.22 0.2 0.19 0.17 0.15 0.11 0.09 0.1 0.14 0.14 0.14 0.13 0.14 0.23 0.2 0.18 0.16 0.23 0.16 0.12 0.14 0.12 1.0 0.09 0.11 0.12 0.12 0.09 0.15 0.16 0.18
0.15 0.28 0.12 0.13 0.14 0.17 0.11 0.06 0.11 0.1 0.11 0.08 0.11 0.23 0.24 0.15 0.13 0.22 0.12 0.12 0.12 0.11 1.0 0.09 0.09 0.13 0.11 0.08 0.12 0.13 0.14
0.19 0.29 0.07 0.02 0.11 0.14 0.04 0.04 0.04 0.06 0.05 0.05 0.12 0.12 0.1 0.05 0.06 0.26 0.09 0.04 0.06 0.05 1.0 0.06 0.1 0.05 0.08 0.1 0.04 0.04 0.02
0.09 0.15 0.06 0.04 0.09 0.14 0.12 0.15 0.07 0.06 0.07 0.07 0.11 0.09 0.09 0.08 0.09 0.37 0.11 0.09 0.09 0.09 1.0 0.11 0.11 0.08 0.09 0.1 0.09 0.13 0.15
0.21 0.23 0.08 0.01 0.14 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.04 0.05 0.01 0.01 0.48 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01
0.17 0.14 0.18 0.17 0.14 0.16 0.1 0.12 0.11 0.11 0.12 0.12 0.14 0.17 0.14 0.12 0.11 0.09 0.12 0.09 0.1 0.1 1.0 0.11 0.11 0.1 0.1 0.1 0.13 0.14 0.16
0.05 0.06 0.05 0.06 0.12 0.14 0.06 0.06 0.06 0.05 0.07 0.05 0.06 0.15 0.14 0.09 0.07 0.13 0.05 0.05 0.06 0.07 1.0 0.06 0.07 0.07 0.07 0.05 0.11 0.11 0.11
0.08 0.09 0.11 0.17 0.16 0.15 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.07 0.09 0.11 0.11 0.08 0.07 0.14 0.09 0.06 0.08 0.08 1.0 0.07 0.07 0.09 0.09 0.06 0.09 0.1 0.1
0.13 0.14 0.18 0.21 0.22 0.2 0.12 0.12 0.14 0.13 0.15 0.14 0.17 0.23 0.18 0.13 0.12 0.16 0.13 0.11 0.12 0.13 1.0 0.11 0.12 0.13 0.12 0.11 0.2 0.19 0.22
0.22 0.24 0.19 0.14 0.23 0.18 0.09 0.07 0.1 0.1 0.11 0.1 0.11 0.2 0.18 0.11 0.09 0.32 0.11 0.09 0.09 0.11 1.0 0.09 0.09 0.1 0.11 0.1 0.13 0.13 0.11
0.07 0.13 0.05 0.03 0.09 0.04 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.04 0.05 0.04 0.03 0.02 0.21 0.02 0.02 0.02 0.01 1.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01
0.09 0.13 0.06 0.02 0.09 0.08 0.08 0.1 0.03 0.03 0.04 0.04 0.04 0.06 0.05 0.03 0.03 0.18 0.04 0.03 0.04 0.03 1.0 0.04 0.04 0.03 0.03 0.02 0.09 0.05 0.05
0.15 0.11 0.09 0.08 0.25 0.23 0.09 0.08 0.08 0.08 0.09 0.08 0.14 0.25 0.16 0.12 0.1 0.21 0.16 0.09 0.12 0.12 1.0 0.12 0.12 0.11 0.11 0.12 0.16 0.12 0.09
0.19 0.15 0.15 0.14 0.34 0.29 0.14 0.14 0.16 0.16 0.19 0.17 0.22 0.25 0.2 0.19 0.16 0.24 0.17 0.16 0.18 0.18 1.0 0.17 0.18 0.18 0.19 0.19 0.17 0.16 0.16
0.02 0.13 0.03 0.0 0.11 0.06 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.07 0.06 0.01 0.02 0.31 0.02 0.01 0.0 0.0 1.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02
0.05 0.05 0.02 0.01 0.12 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.01 0.0 0.0 0.07 0.01 0.0 0.01 0.01 1.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0
0.09 0.06 0.02 0.01 0.23 0.17 0.03 0.02 0.04 0.06 0.04 0.03 0.12 0.12 0.1 0.07 0.04 0.08 0.07 0.02 0.07 0.08 1.0 0.05 0.06 0.09 0.04 0.05 0.06 0.07 0.04
0.09 0.06 0.02 0.01 0.23 0.17 0.03 0.02 0.04 0.06 0.04 0.03 0.12 0.12 0.1 0.07 0.04 0.08 0.07 0.02 0.07 0.08 1.0 0.05 0.06 0.09 0.04 0.05 0.06 0.07 0.04
0.23 0.41 0.14 0.05 0.2 0.05 0.02 0.02 0.03 0.02 0.03 0.02 0.1 0.12 0.09 0.04 0.04 0.25 0.04 0.03 0.03 0.03 1.0 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03 0.04 0.04 0.04
0.06 0.1 0.03 0.03 0.31 0.19 0.02 0.01 0.03 0.02 0.03 0.03 0.07 0.2 0.14 0.04 0.02 0.04 0.1 0.02 0.04 0.04 1.0 0.04 0.05 0.04 0.05 0.08 0.03 0.02 0.02
0.09 0.05 0.06 0.06 0.26 0.13 0.03 0.04 0.05 0.04 0.05 0.04 0.07 0.08 0.11 0.05 0.03 0.17 0.06 0.03 0.05 0.04 1.0 0.03 0.05 0.04 0.05 0.05 0.04 0.03 0.01
0.34 0.45 0.21 0.17 0.43 0.39 0.28 0.3 0.19 0.18 0.21 0.18 0.23 0.31 0.3 0.26 0.21 0.42 0.25 0.19 0.21 0.25 1.0 0.22 0.22 0.24 0.25 0.24 0.28 0.24 0.2
0.22 0.42 0.15 0.13 0.35 0.25 0.08 0.06 0.13 0.1 0.08 0.08 0.08 0.13 0.13 0.1 0.07 0.46 0.11 0.09 0.09 0.1 1.0 0.08 0.1 0.09 0.08 0.08 0.11 0.1 0.05
0.04 0.04 0.08 0.11 0.13 0.13 0.03 0.04 0.04 0.04 0.05 0.05 0.07 0.16 0.09 0.06 0.06 0.17 0.05 0.04 0.05 0.05 1.0 0.06 0.07 0.07 0.07 0.05 0.07 0.07 0.08
0.05 0.05 0.02 0.02 0.17 0.12 0.05 0.03 0.06 0.06 0.05 0.05 0.07 0.16 0.12 0.06 0.06 0.15 0.08 0.07 0.07 0.07 1.0 0.05 0.07 0.07 0.08 0.06 0.06 0.05 0.06
0.0 0.16 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.08 0.03 0.01 0.17 0.07 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.08 0.08 0.02 0.01 0.12 0.03 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01
0.13 0.25 0.06 0.02 0.22 0.12 0.03 0.03 0.04 0.03 0.04 0.03 0.08 0.1 0.11 0.08 0.05 0.12 0.08 0.04 0.05 0.05 1.0 0.04 0.05 0.06 0.04 0.06 0.05 0.05 0.02
0.09 0.03 0.01 0.01 0.2 0.14 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.12 0.1 0.05 0.01 0.01 0.18 0.02 0.0 0.02 0.02 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01
0.11 0.18 0.07 0.04 0.1 0.08 0.03 0.03 0.04 0.05 0.05 0.04 0.11 0.12 0.09 0.05 0.05 0.25 0.05 0.03 0.04 0.04 1.0 0.04 0.05 0.05 0.05 0.03 0.04 0.03 0.06
0.01 0.0 0.0 0.0 0.18 0.07 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.1 0.09 0.02 0.02 0.11 0.03 0.02 0.02 0.03 1.0 0.01 0.02 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01
0.28 0.48 0.16 0.12 0.35 0.16 0.12 0.11 0.11 0.11 0.12 0.11 0.15 0.19 0.18 0.12 0.1 0.29 0.14 0.11 0.11 0.12 1.0 0.1 0.12 0.12 0.12 0.12 0.15 0.16 0.17
0.17 0.21 0.09 0.01 0.12 0.12 0.03 0.03 0.03 0.03 0.04 0.03 0.1 0.35 0.25 0.08 0.06 0.23 0.06 0.04 0.04 0.04 1.0 0.05 0.04 0.05 0.04 0.04 0.05 0.06 0.09
0.04 0.05 0.02 0.0 0.17 0.11 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.08 0.21 0.12 0.05 0.0 0.07 0.03 0.01 0.01 0.03 1.0 0.02 0.03 0.01 0.03 0.01 0.03 0.02 0.02
0.14 0.11 0.11 0.12 0.24 0.23 0.1 0.11 0.11 0.12 0.12 0.11 0.16 0.21 0.19 0.14 0.11 0.18 0.12 0.1 0.11 0.11 1.0 0.11 0.11 0.12 0.12 0.14 0.14 0.14 0.13
0.05 0.05 0.06 0.1 0.19 0.15 0.05 0.04 0.06 0.06 0.08 0.08 0.09 0.1 0.11 0.09 0.09 0.16 0.1 0.07 0.09 0.09 1.0 0.06 0.07 0.09 0.08 0.07 0.12 0.1 0.08
0.38 0.57 0.22 0.13 0.21 0.21 0.19 0.38 0.18 0.17 0.13 0.19 0.33 0.37 0.29 0.24 0.19 0.43 0.18 0.18 0.24 0.19 1.0 0.16 0.23 0.17 0.21 0.19 0.19 0.18 0.19
0.04 0.01 0.0 0.0 0.16 0.09 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.04 0.12 0.1 0.01 0.0 0.2 0.02 0.0 0.02 0.02 1.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0
0.09 0.19 0.04 0.02 0.13 0.17 0.09 0.08 0.05 0.04 0.05 0.04 0.07 0.11 0.1 0.06 0.06 0.3 0.07 0.04 0.06 0.06 1.0 0.07 0.07 0.06 0.06 0.07 0.04 0.06 0.04
0.08 0.18 0.06 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.2 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.41 0.11 0.02 0.16 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.07 0.04 0.03 0.02 0.01 0.25 0.02 0.01 0.02 0.02 1.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02
0.01 0.01 0.0 0.01 0.17 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09 0.07 0.01 0.0 0.15 0.05 0.0 0.01 0.01 1.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0
0.24 0.35 0.21 0.06 0.2 0.09 0.05 0.05 0.06 0.06 0.08 0.05 0.16 0.22 0.16 0.08 0.06 0.16 0.06 0.05 0.05 0.05 1.0 0.04 0.05 0.06 0.05 0.05 0.06 0.06 0.08
0.09 0.18 0.08 0.07 0.15 0.09 0.05 0.04 0.06 0.07 0.08 0.08 0.05 0.09 0.11 0.12 0.09 0.2 0.04 0.05 0.07 0.06 1.0 0.04 0.05 0.06 0.06 0.05 0.09 0.09 0.06
0.07 0.2 0.05 0.01 0.1 0.1 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.02 0.02 0.01 0.23 0.01 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02
0.06 0.08 0.06 0.07 0.13 0.11 0.03 0.06 0.05 0.04 0.05 0.05 0.04 0.16 0.11 0.04 0.04 0.18 0.02 0.04 0.03 0.03 1.0 0.02 0.04 0.04 0.04 0.04 0.03 0.03 0.01
0.04 0.28 0.05 0.05 0.11 0.05 0.02 0.03 0.04 0.02 0.03 0.02 0.06 0.07 0.05 0.03 0.02 0.13 0.03 0.02 0.02 0.03 1.0 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.04 0.04 0.04
0.06 0.05 0.09 0.1 0.06 0.06 0.04 0.03 0.05 0.05 0.06 0.06 0.07 0.2 0.12 0.06 0.05 0.12 0.05 0.04 0.04 0.03 1.0 0.04 0.04 0.04 0.04 0.03 0.07 0.08 0.09
0.11 0.13 0.06 0.03 0.23 0.1 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.02 0.07 0.06 0.05 0.04 0.02 0.17 0.07 0.01 0.02 0.02 1.0 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.01
0.35 0.46 0.21 0.07 0.28 0.4 0.35 0.42 0.18 0.15 0.19 0.15 0.31 0.46 0.37 0.3 0.27 0.5 0.26 0.21 0.25 0.24 1.0 0.24 0.24 0.25 0.23 0.2 0.25 0.24 0.23
0.03 0.02 0.02 0.03 0.05 0.04 0.02 0.02 0.02 0.04 0.03 0.04 0.04 0.15 0.11 0.05 0.04 0.14 0.03 0.04 0.02 0.03 1.0 0.04 0.03 0.04 0.04 0.03 0.06 0.05 0.07
0.2 0.3 0.11 0.04 0.22 0.07 0.02 0.02 0.03 0.03 0.03 0.03 0.08 0.13 0.11 0.05 0.04 0.39 0.04 0.03 0.03 0.03 1.0 0.02 0.03 0.04 0.03 0.04 0.03 0.03 0.01
0.17 0.23 0.2 0.16 0.26 0.24 0.15 0.1 0.16 0.15 0.18 0.15 0.16 0.23 0.2 0.16 0.12 0.35 0.14 0.1 0.12 0.14 1.0 0.11 0.15 0.16 0.14 0.14 0.17 0.17 0.18
0.08 0.08 0.09 0.11 0.14 0.14 0.11 0.11 0.11 0.12 0.11 0.11 0.12 0.16 0.16 0.13 0.11 0.21 0.12 0.11 0.1 0.12 1.0 0.1 0.12 0.11 0.12 0.11 0.13 0.13 0.15
0.07 0.07 0.05 0.03 0.08 0.05 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.06 0.05 0.04 0.02 0.01 0.23 0.02 0.01 0.01 0.01 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.0
0.02 0.01 0.01 0.01 0.29 0.17 0.02 0.01 0.06 0.02 0.03 0.03 0.07 0.02 0.03 0.03 0.01 0.17 0.03 0.05 0.04 0.06 1.0 0.08 0.06 0.04 0.06 0.04 0.03 0.01 0.02
0.03 0.02 0.0 0.01 0.2 0.15 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.08 0.09 0.09 0.02 0.0 0.13 0.03 0.01 0.02 0.02 1.0 0.03 0.02 0.01 0.02 0.03 0.03 0.01 0.01
0.19 0.4 0.17 0.06 0.14 0.1 0.02 0.01 0.03 0.03 0.04 0.04 0.05 0.04 0.03 0.05 0.04 0.18 0.04 0.03 0.03 0.04 1.0 0.04 0.04 0.04 0.04 0.03 0.06 0.05 0.06
0.14 0.19 0.06 0.08 0.12 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.06 0.02 0.03 0.03 0.01 0.32 0.01 0.01 0.02 0.02 1.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)