1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_261 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
0.13 0.18 0.14 0.12 0.24 0.24 0.14 0.2 0.14 0.13 0.11 0.09 0.17 0.28 0.34 0.16 0.2 0.21 0.15 0.16 0.15 0.15 1.0 0.2 0.16 0.1 0.14 0.14 0.13 0.15 0.14
Bra001490 (MRP3)
 0.29 0.27 0.43 0.15 0.52 0.44 0.07 0.07 0.12 0.18 0.14 0.2 0.14 0.28 0.32 0.19 0.17 0.26 0.22 0.2 0.14 0.2 1.0 0.03 0.03 0.04 0.02 0.04 0.04 0.07 0.06
Bra002023 (IDH2)
 0.24 0.32 0.25 0.2 0.49 0.4 0.2 0.18 0.22 0.3 0.22 0.26 0.27 0.37 0.36 0.33 0.29 0.34 0.22 0.21 0.21 0.27 1.0 0.23 0.21 0.22 0.2 0.23 0.21 0.27 0.19
Bra002498 (LecRK-I.8)
 0.03 0.23 0.13 0.07 0.3 0.23 0.02 0.02 0.03 0.13 0.04 0.11 0.03 0.07 0.1 0.12 0.08 0.09 0.04 0.06 0.03 0.22 1.0 0.08 0.03 0.03 0.05 0.05 0.05 0.08 0.01
Bra003083 (ATL96)
 0.11 0.17 0.1 0.06 0.26 0.12 0.03 0.0 0.05 0.12 0.06 0.07 0.01 0.06 0.15 0.06 0.07 0.03 0.05 0.0 0.02 0.15 1.0 0.03 0.06 0.01 0.05 0.09 0.08 0.07 0.0
Bra003402 (MRP9)
 0.2 0.22 0.15 0.13 0.45 0.63 0.23 0.12 0.23 0.25 0.22 0.26 0.21 0.53 0.54 0.31 0.27 0.23 0.25 0.17 0.21 0.38 1.0 0.25 0.25 0.21 0.23 0.32 0.32 0.22 0.19
Bra003448 (PUB36)
 0.01 0.16 0.08 0.08 0.15 0.33 0.03 0.01 0.03 0.09 0.01 0.06 0.01 0.01 0.1 0.08 0.06 0.2 0.05 0.02 0.03 0.19 1.0 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0
Bra004272 (HSFA8)
 0.42 0.48 0.48 0.22 0.55 0.49 0.21 0.19 0.32 0.17 0.22 0.26 0.1 0.39 0.52 0.33 0.28 0.21 0.3 0.25 0.26 0.26 1.0 0.22 0.22 0.19 0.23 0.3 0.29 0.33 0.19
0.07 0.19 0.28 0.09 0.44 0.61 0.12 0.04 0.19 0.19 0.07 0.16 0.07 0.27 0.47 0.22 0.3 0.27 0.15 0.09 0.14 0.18 1.0 0.18 0.15 0.14 0.23 0.15 0.24 0.41 0.13
Bra008347 (UNE2)
 0.13 0.23 0.22 0.08 0.23 0.23 0.08 0.05 0.13 0.13 0.11 0.12 0.09 0.32 0.34 0.16 0.18 0.21 0.14 0.12 0.1 0.14 1.0 0.1 0.09 0.06 0.09 0.11 0.1 0.1 0.11
Bra010102 (GALT6)
 0.16 0.28 0.17 0.13 0.46 0.45 0.14 0.1 0.15 0.16 0.13 0.18 0.11 0.31 0.39 0.26 0.18 0.18 0.15 0.14 0.12 0.18 1.0 0.15 0.15 0.19 0.14 0.19 0.21 0.15 0.1
0.31 0.32 0.33 0.25 0.55 0.37 0.15 0.15 0.25 0.27 0.22 0.28 0.17 0.54 0.53 0.3 0.28 0.26 0.22 0.18 0.18 0.23 1.0 0.11 0.11 0.17 0.12 0.16 0.2 0.18 0.13
Bra013390 (MWL-2)
 0.07 0.28 0.22 0.07 0.25 0.36 0.02 0.0 0.08 0.11 0.05 0.06 0.07 0.25 0.21 0.05 0.01 0.07 0.09 0.07 0.07 0.07 1.0 0.08 0.07 0.08 0.05 0.04 0.03 0.06 0.08
Bra013445 (VSR7)
 0.08 0.25 0.12 0.05 0.29 0.36 0.05 0.02 0.14 0.15 0.08 0.14 0.03 0.17 0.34 0.11 0.11 0.19 0.11 0.06 0.07 0.2 1.0 0.08 0.05 0.03 0.06 0.08 0.09 0.13 0.02
0.17 0.11 0.16 0.17 0.37 0.31 0.09 0.23 0.2 0.22 0.14 0.19 0.15 0.38 0.62 0.17 0.23 0.22 0.19 0.19 0.21 0.21 1.0 0.2 0.2 0.18 0.18 0.21 0.22 0.18 0.2
0.2 0.31 0.31 0.21 0.41 0.45 0.21 0.17 0.22 0.3 0.23 0.31 0.1 0.36 0.46 0.25 0.3 0.24 0.25 0.25 0.22 0.37 1.0 0.19 0.18 0.31 0.21 0.23 0.26 0.26 0.15
Bra017502 (BI1)
 0.2 0.25 0.22 0.18 0.32 0.31 0.11 0.13 0.19 0.2 0.17 0.2 0.15 0.26 0.37 0.22 0.21 0.31 0.17 0.14 0.14 0.22 1.0 0.13 0.12 0.13 0.14 0.15 0.15 0.22 0.17
0.39 0.34 0.63 0.37 0.64 0.58 0.31 0.35 0.38 0.4 0.35 0.37 0.38 0.6 0.56 0.46 0.38 0.62 0.37 0.46 0.3 0.46 1.0 0.34 0.38 0.3 0.36 0.35 0.42 0.41 0.4
Bra019317 (CRK11)
 0.03 0.09 0.06 0.01 0.02 0.28 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.07 0.0 0.07 0.05 0.07 0.32 0.01 0.0 0.02 0.1 1.0 0.1 0.0 0.05 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0
0.14 0.13 0.21 0.11 0.28 0.15 0.04 0.08 0.09 0.09 0.08 0.07 0.09 0.31 0.32 0.09 0.05 0.34 0.14 0.08 0.05 0.11 1.0 0.08 0.08 0.05 0.07 0.11 0.13 0.18 0.1
Bra022870 (EVR)
 0.13 0.28 0.24 0.09 0.39 0.44 0.09 0.05 0.18 0.2 0.14 0.19 0.05 0.24 0.41 0.19 0.2 0.11 0.11 0.09 0.1 0.21 1.0 0.11 0.09 0.16 0.11 0.13 0.19 0.23 0.06
Bra023845 (POP2)
 0.12 0.17 0.19 0.13 0.3 0.21 0.05 0.06 0.16 0.12 0.13 0.11 0.08 0.31 0.31 0.1 0.1 0.15 0.17 0.11 0.1 0.12 1.0 0.11 0.1 0.09 0.09 0.16 0.16 0.12 0.11
Bra024638 (AT3-MMP)
 0.12 0.28 0.33 0.19 0.41 0.3 0.05 0.06 0.2 0.13 0.12 0.22 0.02 0.22 0.24 0.08 0.12 0.25 0.16 0.11 0.08 0.18 1.0 0.12 0.1 0.21 0.13 0.3 0.31 0.55 0.07
0.14 0.16 0.22 0.08 0.25 0.2 0.06 0.05 0.17 0.12 0.13 0.16 0.1 0.3 0.24 0.12 0.09 0.26 0.19 0.15 0.12 0.13 1.0 0.13 0.12 0.21 0.13 0.13 0.15 0.16 0.14
0.15 0.22 0.34 0.16 0.26 0.2 0.08 0.07 0.2 0.17 0.14 0.11 0.14 0.3 0.24 0.14 0.12 0.21 0.19 0.14 0.17 0.17 1.0 0.11 0.09 0.09 0.11 0.14 0.11 0.12 0.14
0.12 0.21 0.22 0.1 0.25 0.29 0.06 0.03 0.11 0.08 0.06 0.08 0.03 0.28 0.21 0.09 0.06 0.13 0.12 0.07 0.09 0.11 1.0 0.09 0.09 0.05 0.08 0.12 0.13 0.12 0.03
Bra031153 (pEARLI4)
 0.04 0.19 0.25 0.18 0.17 0.24 0.06 0.03 0.03 0.04 0.04 0.05 0.02 0.15 0.21 0.03 0.06 0.17 0.06 0.03 0.07 0.05 1.0 0.03 0.05 0.05 0.04 0.07 0.1 0.05 0.01
Bra031452 (FRG4)
 0.28 0.33 0.34 0.28 0.43 0.46 0.18 0.17 0.24 0.23 0.2 0.21 0.18 0.42 0.38 0.27 0.23 0.3 0.25 0.25 0.23 0.23 1.0 0.2 0.2 0.23 0.19 0.23 0.25 0.22 0.19
Bra033431 (PAD4)
 0.06 0.14 0.15 0.04 0.23 0.22 0.05 0.02 0.07 0.08 0.08 0.08 0.1 0.24 0.26 0.13 0.1 0.15 0.1 0.1 0.09 0.14 1.0 0.09 0.06 0.07 0.06 0.07 0.07 0.06 0.05
0.05 0.29 0.18 0.06 0.15 0.16 0.02 0.0 0.01 0.09 0.03 0.02 0.04 0.05 0.05 0.07 0.11 0.3 0.01 0.14 0.07 0.26 1.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0
Bra034120 (AIF)
 0.09 0.13 0.14 0.08 0.18 0.18 0.05 0.07 0.12 0.11 0.06 0.12 0.08 0.27 0.31 0.16 0.11 0.23 0.12 0.1 0.1 0.12 1.0 0.09 0.08 0.08 0.08 0.13 0.13 0.11 0.08
Bra034296 (TRM140a)
 0.49 0.42 0.58 0.38 0.58 0.5 0.34 0.36 0.35 0.4 0.34 0.4 0.5 0.52 0.55 0.42 0.48 0.52 0.39 0.41 0.37 0.41 1.0 0.36 0.4 0.36 0.43 0.35 0.41 0.39 0.46
Bra035424 (CW9)
 0.27 0.32 0.34 0.25 0.48 0.38 0.19 0.16 0.3 0.33 0.27 0.3 0.19 0.39 0.44 0.28 0.19 0.29 0.27 0.18 0.22 0.24 1.0 0.25 0.25 0.27 0.23 0.29 0.3 0.25 0.11
0.04 0.22 0.21 0.07 0.22 0.33 0.1 0.06 0.06 0.08 0.04 0.05 0.04 0.16 0.08 0.1 0.25 0.09 0.1 0.06 0.05 0.22 1.0 0.03 0.01 0.05 0.1 0.01 0.02 0.06 0.0
Bra036192 (CCR4)
 0.06 0.25 0.23 0.08 0.35 0.33 0.04 0.01 0.17 0.18 0.09 0.26 0.03 0.27 0.38 0.24 0.13 0.16 0.15 0.08 0.08 0.28 1.0 0.06 0.05 0.1 0.03 0.1 0.12 0.12 0.03
Bra036315 (WRKY47)
 0.19 0.24 0.17 0.16 0.48 0.5 0.15 0.11 0.19 0.19 0.16 0.18 0.12 0.38 0.63 0.22 0.18 0.24 0.24 0.2 0.18 0.25 1.0 0.22 0.2 0.16 0.24 0.37 0.33 0.24 0.17
Bra036344 (CYP71B23)
 0.16 0.31 0.41 0.12 0.4 0.49 0.07 0.04 0.18 0.17 0.13 0.19 0.06 0.2 0.23 0.12 0.13 0.3 0.16 0.16 0.14 0.2 1.0 0.12 0.15 0.15 0.14 0.2 0.29 0.34 0.12
Bra036750 (STOP1)
 0.29 0.34 0.41 0.29 0.41 0.4 0.21 0.2 0.29 0.27 0.22 0.26 0.17 0.38 0.55 0.3 0.26 0.25 0.25 0.26 0.26 0.26 1.0 0.32 0.33 0.3 0.31 0.32 0.35 0.32 0.25
0.14 0.26 0.23 0.08 0.3 0.3 0.1 0.04 0.21 0.16 0.16 0.19 0.06 0.27 0.32 0.22 0.21 0.2 0.17 0.19 0.13 0.21 1.0 0.13 0.11 0.06 0.09 0.1 0.14 0.15 0.12
Bra037117 (PUB2)
 0.15 0.24 0.18 0.2 0.28 0.27 0.09 0.05 0.17 0.18 0.15 0.11 0.06 0.22 0.29 0.21 0.12 0.31 0.14 0.09 0.12 0.22 1.0 0.1 0.1 0.1 0.1 0.12 0.14 0.14 0.03
Bra038057 (FAHD1a)
 0.14 0.27 0.43 0.09 0.23 0.3 0.08 0.07 0.15 0.21 0.15 0.17 0.07 0.32 0.48 0.17 0.19 0.1 0.15 0.11 0.09 0.3 1.0 0.17 0.14 0.12 0.1 0.13 0.2 0.16 0.11
Bra038610 (PAP29)
 0.05 0.2 0.34 0.15 0.23 0.21 0.07 0.03 0.1 0.2 0.05 0.12 0.02 0.19 0.26 0.29 0.29 0.05 0.1 0.05 0.06 0.34 1.0 0.09 0.04 0.04 0.08 0.05 0.04 0.1 0.03
Bra038611 (PAP29)
 0.08 0.29 0.29 0.12 0.23 0.28 0.08 0.03 0.07 0.23 0.07 0.12 0.03 0.16 0.24 0.28 0.31 0.14 0.14 0.08 0.1 0.33 1.0 0.07 0.05 0.06 0.07 0.05 0.05 0.12 0.03
Bra039385 (CAX2)
 0.08 0.11 0.18 0.05 0.17 0.2 0.04 0.02 0.06 0.08 0.04 0.07 0.07 0.22 0.23 0.09 0.1 0.26 0.06 0.07 0.07 0.06 1.0 0.1 0.13 0.18 0.11 0.16 0.14 0.11 0.07
Bra039424 (AUN1)
 0.14 0.24 0.24 0.29 0.31 0.35 0.14 0.09 0.16 0.21 0.15 0.15 0.1 0.32 0.35 0.17 0.13 0.3 0.18 0.12 0.12 0.18 1.0 0.15 0.18 0.31 0.14 0.14 0.14 0.09 0.11
Bra040549 (LHT6)
 0.11 0.28 0.16 0.05 0.26 0.3 0.07 0.02 0.11 0.17 0.1 0.12 0.03 0.12 0.22 0.1 0.18 0.05 0.1 0.09 0.11 0.21 1.0 0.08 0.07 0.04 0.1 0.07 0.09 0.13 0.05
0.01 0.08 0.13 0.01 0.08 0.19 0.02 0.02 0.02 0.17 0.01 0.07 0.06 0.03 0.06 0.09 0.1 0.36 0.04 0.02 0.01 0.15 1.0 0.04 0.03 0.01 0.03 0.02 0.03 0.03 0.01
Bra040642 (ATL6)
 0.27 0.41 0.38 0.28 0.35 0.26 0.12 0.11 0.1 0.19 0.11 0.16 0.05 0.29 0.28 0.14 0.11 0.2 0.16 0.21 0.1 0.18 1.0 0.16 0.13 0.22 0.18 0.22 0.34 0.58 0.16

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)