1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_260 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000654 (SAH7)
 0.43 0.36 0.4 0.35 0.6 0.56 0.43 0.49 0.78 0.91 0.86 0.71 0.7 1.0 0.88 0.7 0.72 1.0 0.88 0.94 0.62 0.68 0.33 0.59 0.63 0.53 0.54 0.45 0.45 0.36 0.37
0.74 0.83 0.67 0.8 1.0 0.76 0.6 0.6 0.97 0.92 0.76 0.86 0.81 0.96 0.79 0.88 0.83 0.91 0.61 0.83 0.88 0.74 0.39 0.31 0.38 0.3 0.36 0.39 0.37 0.39 0.38
Bra001636 (RALF23)
 0.38 0.39 0.32 0.62 0.6 0.56 0.41 0.31 0.52 0.64 0.55 0.55 0.48 1.0 0.74 0.57 0.61 0.51 0.6 0.68 0.74 0.68 0.55 0.43 0.46 0.91 0.45 0.44 0.44 0.28 0.23
Bra001642 (PGF5)
 0.41 0.37 0.51 0.62 0.9 0.58 0.58 0.68 0.7 0.83 0.85 0.79 0.48 1.0 0.74 0.73 0.74 0.69 0.78 0.92 0.76 0.69 0.18 0.36 0.37 0.44 0.4 0.32 0.31 0.24 0.15
0.44 0.32 0.4 0.46 0.94 0.78 0.67 0.67 0.65 0.79 0.69 0.58 0.76 0.93 0.88 1.0 0.84 0.86 0.88 0.69 0.6 0.77 0.89 0.61 0.58 0.51 0.65 0.8 0.77 0.58 0.56
0.59 0.63 0.7 0.54 0.68 0.58 0.72 0.82 0.77 0.82 0.79 0.94 0.94 0.74 0.87 1.0 0.98 0.84 0.9 0.99 0.86 0.83 0.42 0.73 0.71 0.41 0.74 0.44 0.46 0.43 0.65
0.29 0.27 0.36 0.74 0.7 0.6 0.56 0.43 0.75 0.7 0.55 0.45 0.72 0.9 1.0 0.96 0.76 0.69 0.6 0.76 0.55 0.52 0.26 0.49 0.58 0.55 0.4 0.36 0.32 0.18 0.16
Bra005136 (AUX1)
 0.45 0.54 0.79 0.56 1.0 0.73 0.39 0.46 0.87 0.73 0.84 0.81 0.41 0.72 0.85 0.61 0.65 0.59 0.39 0.76 0.75 0.66 0.33 0.39 0.42 0.4 0.44 0.44 0.54 0.4 0.36
Bra006136 (COG8)
 0.34 0.37 0.43 0.16 0.43 0.33 0.28 0.31 0.5 0.46 0.41 0.43 0.41 0.81 1.0 0.69 0.46 0.54 0.59 0.47 0.33 0.48 0.39 0.5 0.53 0.33 0.48 0.32 0.34 0.32 0.38
Bra006247 (CXE16)
 0.32 0.48 0.6 0.62 0.58 0.57 0.53 0.61 0.53 0.74 0.66 0.65 0.69 0.92 1.0 0.89 0.78 0.82 0.69 0.94 0.67 0.77 0.58 0.4 0.43 0.78 0.49 0.41 0.49 0.52 0.52
Bra006551 (HHP1)
 0.21 0.12 0.28 0.29 0.69 0.42 0.43 0.51 0.47 0.45 0.36 0.47 0.59 1.0 0.63 0.62 0.64 0.76 0.41 0.35 0.41 0.37 0.22 0.4 0.42 0.68 0.4 0.44 0.4 0.41 0.43
0.64 0.26 0.25 0.55 0.4 0.45 0.64 0.73 0.77 0.7 0.89 0.71 0.69 1.0 0.88 0.69 0.87 0.59 0.8 0.72 0.92 0.84 0.22 0.41 0.49 0.43 0.52 0.36 0.56 0.38 0.53
0.05 0.08 0.06 0.01 0.37 0.35 0.21 0.23 0.43 0.4 0.43 0.43 0.47 0.83 0.61 0.55 0.25 1.0 0.5 0.44 0.32 0.47 0.14 0.12 0.17 0.19 0.11 0.11 0.11 0.01 0.04
0.41 0.36 0.3 0.37 1.0 0.69 0.61 0.64 0.6 0.62 0.59 0.56 0.82 0.78 0.98 0.65 0.62 0.69 0.62 0.63 0.57 0.62 0.91 0.53 0.53 0.37 0.54 0.56 0.49 0.59 0.53
Bra009667 (TCP7)
 0.5 0.51 0.45 0.48 0.77 0.56 0.56 0.71 0.8 0.82 0.9 0.78 0.97 1.0 0.88 0.89 0.76 0.93 0.79 0.77 0.83 0.73 0.24 0.59 0.65 0.8 0.7 0.46 0.52 0.49 0.54
0.08 0.02 0.13 0.09 0.26 0.19 0.45 0.42 0.62 0.65 0.46 0.73 0.54 0.99 1.0 0.52 0.71 0.39 0.63 0.82 0.96 0.29 0.08 0.0 0.12 0.13 0.0 0.2 0.12 0.1 0.15
Bra011049 (TYDC)
 0.09 0.03 0.07 0.07 0.74 0.49 0.45 0.19 0.36 0.53 0.61 0.81 0.26 0.68 0.62 1.0 0.52 0.21 0.42 0.61 0.53 0.45 0.09 0.38 0.37 0.25 0.34 0.21 0.21 0.17 0.24
Bra011470 (G7)
 0.26 0.2 0.22 0.35 1.0 0.47 0.56 0.43 0.72 0.84 0.77 0.57 0.39 0.81 0.66 0.63 0.67 0.14 0.49 0.59 0.49 0.43 0.05 0.37 0.39 0.48 0.31 0.37 0.26 0.18 0.11
Bra011538 (CAP1)
 0.55 0.52 0.49 0.57 0.81 0.81 0.81 0.73 0.52 0.74 0.68 0.58 0.93 0.73 0.81 1.0 0.95 0.66 0.65 0.87 0.8 0.78 0.43 0.54 0.57 0.51 0.63 0.49 0.47 0.66 0.75
0.15 0.19 0.16 0.11 0.46 0.42 0.38 0.46 0.38 0.64 0.39 0.36 0.74 0.6 0.58 0.56 0.38 1.0 0.45 0.39 0.34 0.57 0.19 0.25 0.21 0.21 0.16 0.25 0.22 0.2 0.19
Bra011829 (TRAPPC12)
 0.25 0.24 0.58 0.26 0.42 0.38 0.57 0.46 0.76 0.84 0.65 0.81 0.65 1.0 1.0 0.69 0.74 0.37 0.81 0.86 0.91 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0
Bra012794 (BIA1)
 0.01 0.03 0.01 0.01 0.14 0.21 0.11 0.22 0.65 0.94 0.87 0.46 0.69 1.0 0.81 0.47 0.51 0.8 0.66 0.47 0.4 0.72 0.3 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.03 0.0 0.0
Bra013556 (ATML1)
 0.39 0.5 0.6 0.34 0.66 0.74 0.69 0.8 0.77 0.73 0.88 0.76 0.61 0.68 0.72 0.81 0.86 1.0 0.8 0.9 0.66 0.75 0.2 0.33 0.31 0.37 0.31 0.35 0.42 0.26 0.19
0.27 0.18 0.14 0.12 0.22 0.3 0.56 0.42 0.7 0.82 0.74 0.5 0.5 0.76 1.0 0.51 0.59 0.41 0.75 0.7 0.39 0.54 0.13 0.19 0.21 0.12 0.16 0.06 0.09 0.15 0.11
Bra015457 (ELP)
 0.51 0.6 0.71 0.58 0.8 0.54 0.51 0.56 0.86 0.95 0.86 0.88 0.53 0.89 0.96 0.92 0.84 1.0 0.84 0.75 0.63 0.63 0.22 0.44 0.45 0.49 0.43 0.45 0.36 0.37 0.38
0.08 0.02 0.13 0.09 0.26 0.19 0.45 0.42 0.62 0.65 0.46 0.73 0.54 0.99 1.0 0.52 0.71 0.39 0.63 0.82 0.96 0.29 0.08 0.0 0.12 0.13 0.0 0.2 0.12 0.1 0.15
Bra017439 (PICALM1a)
 0.35 0.4 0.5 0.49 0.48 0.56 0.5 0.55 0.48 0.4 0.57 0.48 0.76 0.83 1.0 0.8 0.66 0.59 0.53 0.62 0.54 0.51 0.55 0.32 0.33 0.5 0.32 0.29 0.33 0.28 0.34
0.19 0.35 0.25 0.24 0.45 0.9 0.51 0.32 0.65 0.65 0.61 0.48 0.54 0.98 1.0 0.84 0.52 0.63 0.58 0.92 0.56 0.68 0.57 0.41 0.32 0.36 0.31 0.32 0.37 0.31 0.28
0.39 0.33 0.41 0.37 0.83 0.83 0.54 0.69 0.58 0.64 0.45 0.5 0.69 0.94 1.0 0.9 0.72 0.81 0.89 0.76 0.59 0.65 0.98 0.6 0.66 0.46 0.57 0.73 0.73 0.51 0.68
0.37 0.49 0.46 0.35 0.81 0.79 0.72 0.71 0.6 0.69 0.58 0.67 0.85 0.79 0.74 0.73 0.77 1.0 0.81 0.68 0.59 0.77 0.6 0.48 0.4 0.37 0.54 0.39 0.42 0.48 0.53
Bra021925 (ABR)
 0.0 0.06 0.01 0.0 0.8 0.46 0.14 0.06 0.36 0.22 0.18 0.45 0.77 0.8 0.74 0.47 0.41 0.8 0.75 0.62 0.43 0.29 1.0 0.19 0.27 0.07 0.27 0.11 0.29 0.15 0.1
Bra022182 (PGF5)
 0.22 0.21 0.32 0.44 0.82 0.51 0.49 0.53 0.57 0.74 0.67 0.59 0.67 1.0 0.83 0.82 0.77 0.82 0.67 0.81 0.68 0.6 0.35 0.32 0.4 0.61 0.42 0.4 0.38 0.42 0.29
Bra022515 (DSA1)
 0.62 0.61 0.62 0.43 0.92 0.63 0.89 0.82 0.66 0.77 0.72 0.69 0.95 0.81 0.84 1.0 0.98 0.88 0.71 0.84 0.78 0.86 0.27 0.6 0.61 0.52 0.62 0.47 0.47 0.56 0.64
0.44 0.39 0.29 0.36 0.68 0.77 0.72 0.73 0.95 1.0 0.93 0.84 0.58 0.61 0.5 0.64 0.65 0.73 0.97 0.84 0.65 0.75 0.54 0.25 0.21 0.1 0.17 0.28 0.21 0.22 0.17
Bra023386 (CALS3)
 0.44 0.34 0.39 0.4 1.0 0.79 0.61 0.67 0.61 0.76 0.67 0.61 0.9 0.81 0.83 0.83 0.85 0.9 0.74 0.71 0.57 0.6 0.36 0.37 0.37 0.39 0.35 0.43 0.33 0.28 0.43
Bra023993 (CSLC5)
 0.28 0.39 0.69 0.24 0.77 0.49 0.46 0.46 0.5 0.48 0.68 0.57 0.77 0.97 0.69 0.85 0.59 1.0 0.75 0.69 0.71 0.57 0.44 0.46 0.49 0.43 0.39 0.43 0.32 0.25 0.28
Bra024734 (LLR1)
 0.59 0.6 0.58 0.63 0.95 0.83 0.79 0.73 0.57 0.64 0.64 0.58 0.94 0.84 0.91 0.83 0.86 1.0 0.68 0.67 0.66 0.65 0.45 0.54 0.55 0.76 0.54 0.54 0.53 0.48 0.48
Bra025124 (SKU6)
 0.3 0.25 0.28 0.28 0.56 0.47 0.38 0.4 0.65 0.78 0.73 0.58 0.88 0.9 1.0 0.78 0.57 0.93 0.58 0.75 0.76 0.81 0.53 0.47 0.46 0.36 0.46 0.37 0.38 0.28 0.29
0.29 0.28 0.23 0.32 0.94 0.63 0.54 0.54 0.38 0.51 0.48 0.41 0.64 1.0 0.63 0.62 0.69 0.76 0.46 0.42 0.45 0.38 0.16 0.26 0.33 0.39 0.31 0.41 0.34 0.26 0.33
0.51 0.47 0.46 0.57 0.68 0.75 0.8 0.74 0.44 0.52 0.44 0.44 0.64 1.0 1.0 0.89 0.76 0.47 0.6 0.73 0.67 0.6 0.52 0.55 0.54 0.58 0.52 0.49 0.49 0.41 0.39
0.23 0.17 0.21 0.5 0.71 0.65 0.39 0.43 0.57 0.49 0.54 0.36 0.36 1.0 0.76 0.81 0.71 0.36 0.76 0.7 0.7 0.62 0.1 0.14 0.15 0.09 0.08 0.16 0.18 0.05 0.11
0.03 0.11 0.14 0.1 0.16 0.08 0.15 0.1 0.3 0.49 0.4 0.38 0.56 1.0 0.74 0.47 0.41 0.88 0.32 0.52 0.39 0.28 0.32 0.3 0.2 0.23 0.13 0.18 0.07 0.01 0.05
Bra032521 (SHY2)
 0.15 0.13 0.27 0.62 0.34 0.45 0.44 0.43 0.44 0.49 0.48 0.38 0.49 0.89 0.78 0.58 0.56 0.57 0.5 0.57 0.49 0.4 0.19 0.25 0.3 1.0 0.25 0.25 0.25 0.18 0.14
0.33 0.27 0.24 0.21 0.57 0.82 0.48 0.48 0.78 0.65 0.6 0.36 0.61 0.77 0.73 0.9 0.72 0.58 0.86 1.0 0.55 0.65 0.49 0.33 0.29 0.22 0.29 0.32 0.37 0.27 0.32
0.43 0.35 0.38 0.44 0.62 0.39 0.4 0.4 1.0 0.82 0.86 0.66 0.55 0.75 0.58 0.56 0.52 0.44 0.54 0.83 0.67 0.64 0.08 0.22 0.22 0.25 0.24 0.26 0.38 0.26 0.23
Bra033083 (PME31)
 0.27 0.4 0.6 0.17 0.39 0.28 0.29 0.18 0.45 0.47 0.59 0.4 0.28 0.86 1.0 0.63 0.38 0.54 0.77 0.59 0.4 0.5 0.21 0.27 0.29 0.59 0.25 0.22 0.19 0.19 0.12
0.33 0.49 0.61 0.41 0.87 0.84 0.43 0.42 0.69 0.63 0.53 0.49 0.81 0.82 0.8 0.75 0.75 1.0 0.7 0.65 0.65 0.67 0.35 0.53 0.42 0.62 0.53 0.55 0.51 0.44 0.39
0.06 0.14 0.11 0.12 0.94 0.55 0.59 0.37 0.58 0.68 0.47 0.48 0.81 0.88 0.59 0.92 1.0 0.61 0.51 0.57 0.38 0.49 0.3 0.3 0.29 0.28 0.32 0.33 0.41 0.32 0.53
Bra035101 (ST1)
 0.38 0.35 0.61 0.58 0.35 0.48 0.69 0.64 0.92 0.91 0.8 0.82 0.82 0.81 1.0 0.72 0.71 0.51 0.64 0.7 0.77 0.84 0.36 0.41 0.42 0.48 0.4 0.57 0.52 0.45 0.37
0.65 0.65 0.79 0.55 1.0 0.81 0.6 0.61 0.81 0.8 0.77 0.72 0.6 0.91 0.94 0.8 0.71 0.7 0.71 0.72 0.75 0.74 0.52 0.57 0.69 0.45 0.58 0.7 0.72 0.68 0.69
0.6 0.55 0.62 0.48 1.0 0.56 0.46 0.54 0.76 0.81 0.76 0.68 0.79 0.75 0.66 0.91 0.68 0.81 0.53 0.62 0.58 0.58 0.49 0.31 0.32 0.49 0.31 0.33 0.24 0.3 0.28
Bra037988 (LTPG6)
 0.39 0.32 0.53 0.39 1.0 0.76 0.48 0.42 0.56 0.65 0.81 0.41 0.85 0.94 0.68 0.87 0.93 0.56 0.6 0.51 0.64 0.6 0.24 0.47 0.43 0.34 0.55 0.55 0.61 0.48 0.53
Bra038093 (LigB)
 0.21 0.28 0.23 0.2 0.52 0.57 0.28 0.31 0.6 0.57 0.67 0.45 0.71 1.0 0.94 0.83 0.71 0.47 0.61 0.45 0.39 0.49 0.24 0.35 0.44 0.4 0.26 0.23 0.29 0.19 0.18
0.47 0.44 0.46 0.41 1.0 0.7 0.52 0.52 0.6 0.73 0.62 0.59 0.79 0.87 0.88 0.73 0.65 0.79 0.74 0.62 0.55 0.58 0.9 0.61 0.58 0.54 0.59 0.6 0.53 0.48 0.48
Bra038451 (AtHMP35)
 0.32 0.43 0.55 0.64 0.62 0.56 0.6 0.56 0.48 0.54 0.56 0.53 0.81 1.0 0.94 0.66 0.61 0.37 0.48 0.6 0.57 0.52 0.5 0.32 0.39 0.39 0.39 0.29 0.45 0.32 0.36
Bra038795 (TUB9)
 0.12 0.15 0.23 0.29 0.43 0.31 0.2 0.27 0.53 0.64 0.69 0.49 0.84 1.0 0.69 0.82 0.38 0.77 0.63 0.72 0.45 0.48 0.25 0.31 0.31 0.3 0.18 0.3 0.21 0.08 0.12
Bra039226 (QWRF4)
 0.09 0.07 0.17 0.13 0.34 0.3 0.22 0.35 0.64 0.66 0.89 0.49 0.54 1.0 0.66 0.74 0.5 0.9 0.58 0.53 0.44 0.49 0.28 0.36 0.37 0.36 0.32 0.33 0.37 0.36 0.49

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)