1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_120 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000066 (CIPK22)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.34 0.67 0.0 0.27 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra003952 (AKR2B)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.27 1.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra004597 (EEL)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra004682 (ZRK6)
 0.03 0.07 0.43 0.0 0.0 0.51 0.53 0.3 0.91 0.25 0.46 0.4 0.06 0.33 0.29 0.22 0.28 0.21 0.02 0.22 0.21 1.0 0.39 0.07 0.0 0.49 0.19 0.18 0.09 0.47 0.18
Bra005642 (ARI10)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.33 0.16 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.16 0.0 0.0 0.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.18 0.0
Bra005718 (AtRabE1b)
 0.03 0.05 0.02 0.04 0.06 0.47 0.27 0.51 1.0 0.57 0.47 0.71 0.24 0.5 0.68 0.3 0.45 0.56 0.44 0.19 0.05 0.22 0.04 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 0.01 0.0 0.02
Bra005720 (MT2B)
 0.4 0.4 0.26 0.31 0.73 1.0 0.37 0.41 0.91 0.66 0.57 0.49 0.57 0.73 0.85 0.44 0.51 0.45 0.95 0.51 0.6 0.57 0.35 0.7 0.64 0.5 0.6 0.51 0.41 0.26 0.27
0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.04 0.13 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.13 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.53 0.27 0.85 0.61 0.55 0.55 1.0 0.66 0.66
0.1 0.0 0.0 0.23 0.09 0.52 0.08 0.33 0.96 0.17 0.21 0.25 0.0 0.91 1.0 0.31 0.46 0.88 0.04 0.25 0.63 0.64 0.34 0.59 0.32 0.15 0.28 0.04 0.41 0.3 0.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.72 0.0 0.69 0.33 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.0 0.07 0.23 1.0 0.2 0.2 0.0 0.2 0.13 0.0 0.14 0.0 0.06 0.0 0.25 0.08 0.11 0.27 0.0 0.09 0.26 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra008361 (EXP21)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.43 0.0 0.0 0.72 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.22 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.25 0.0 0.0
Bra009830 (KNS2)
 0.08 0.11 0.07 0.05 0.18 0.15 0.45 0.24 0.71 0.14 0.44 0.37 0.99 0.82 0.24 0.52 0.84 0.49 1.0 0.46 0.43 0.86 0.28 0.08 0.12 0.09 0.11 0.06 0.12 0.17 0.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.51 1.0 0.32 0.15 0.0 0.67 0.11 0.2 0.0 0.36 0.24 0.0 0.09 0.09 0.16 0.09 0.31 0.0 0.08 0.08 0.0 0.0 0.09 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.96 0.0 0.59 0.0 0.0 0.85 0.28 0.26 0.24 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.26
Bra011730 (PLP1)
 0.04 0.0 0.17 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.1 0.03 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03
Bra012561 (COILIN)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra013290 (PUP6)
 0.0 0.12 0.35 1.0 0.04 0.0 0.04 0.04 0.79 0.28 0.0 0.23 0.67 0.0 0.1 0.05 0.05 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra014145 (CAR5)
 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.16 1.0 0.12 0.0 0.13 0.31 0.0 0.65 0.15 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.64 0.0 0.0 0.26 0.0 0.14 0.53 0.0
Bra014287 (TGG4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.22 0.16 0.35 1.0 0.15 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.24 0.0 0.88 0.11 0.0 0.1 0.0 0.43 0.0 0.14 0.13 0.0 0.0
Bra014364 (ALA6)
 0.06 0.06 0.27 0.06 0.23 0.43 0.18 0.26 1.0 0.21 0.19 0.13 0.34 0.31 0.42 0.0 0.15 0.45 0.04 0.18 0.58 0.04 0.22 0.13 0.13 0.13 0.13 0.36 0.15 0.24 0.35
Bra014545 (PFN3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra015440 (MRF3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.11 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.12 0.0 0.0 0.21 0.94 0.29 0.55 0.29 0.53 1.0 0.67
Bra015982 (NMT)
 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.2 0.0 0.77 0.24 0.22 0.24 0.27 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.29 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.49 0.0 0.0
Bra016518 (ERF17)
 0.16 0.1 0.1 0.24 0.08 0.13 0.23 0.53 1.0 0.46 0.78 0.31 0.66 0.85 0.13 0.17 0.15 0.58 0.79 0.76 0.78 0.61 0.11 0.36 0.36 0.45 0.51 0.19 0.48 0.28 0.28
Bra018494 (MRP1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra018676 (DWA2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
Bra019535 (HTA12)
 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.25 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra020525 (PHE1)
 0.75 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.16 0.14 0.17 0.77 0.62 0.23 0.13 1.0 0.21 0.54 0.57 0.08 0.05 0.52 0.0 0.28 0.02 0.47 0.69 0.69 0.26 0.03 0.41 0.41 0.34 0.43 0.46 0.4 0.2 0.17
Bra022349 (IDL4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.2 0.74 0.12 0.4 0.26 0.0 0.0 0.0 0.18 0.23 0.22 0.0 0.45 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0
Bra023571 (RGP5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.19 0.0 0.0 0.64 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0
Bra026225 (SBT5.4)
 0.05 0.03 0.03 0.0 0.12 0.44 0.08 0.42 0.78 0.66 0.62 0.59 0.29 0.33 0.24 0.03 0.21 0.18 0.13 0.84 0.65 0.49 0.29 0.55 0.64 0.23 0.28 0.28 0.22 0.73 1.0
Bra027348 (CREF3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.2 0.15 1.0 0.13 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.5 0.88 0.57 0.0 0.33 0.69 0.41 0.91 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.17 0.5 0.33 0.0
0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 1.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.18 0.36 0.0 0.0 0.0 0.27 0.34 0.14 1.0 0.0 0.67 0.12 0.0 0.0 0.33 0.32 0.73 0.0 0.0 0.71 0.14 0.0 0.14 0.25 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.37 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra029694 (MAN1)
 0.13 0.01 0.02 0.01 0.24 0.35 0.14 0.03 1.0 0.26 0.13 0.51 0.04 0.02 0.03 0.09 0.73 0.02 0.06 0.08 0.15 0.09 0.01 0.14 0.19 0.13 0.1 0.25 0.24 0.34 0.22
Bra030081 (RALF4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54
Bra032694 (PBL24)
 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra033087 (KIN11)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.89 0.0 0.88 0.81 0.0
Bra033739 (AtBBE25)
 0.9 0.0 0.0 0.0 0.38 0.7 0.0 0.32 1.0 0.0 0.0 0.33 0.13 0.29 0.46 0.14 0.0 0.28 0.26 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.13
Bra033933 (IPT1)
 0.1 0.05 0.0 0.0 0.08 0.3 0.07 0.04 0.16 0.15 0.04 0.11 0.0 0.0 0.22 0.0 0.16 0.19 0.08 0.0 0.08 0.0 0.08 0.28 0.47 0.6 0.42 0.37 1.0 0.8 0.53
Bra034577 (MEE45)
 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.08 0.0 0.0 1.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra035127 (SMB)
 0.3 0.48 0.07 0.42 0.48 0.64 0.33 0.08 1.0 0.34 0.44 0.51 0.2 0.51 0.4 0.24 0.19 0.06 0.11 0.27 0.38 0.85 0.24 0.23 0.11 0.04 0.1 0.21 0.15 0.17 0.05
Bra035308 (STP7)
 0.4 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra036097 (CLM)
 0.99 0.61 0.55 0.46 0.48 0.63 0.48 0.44 0.89 0.28 0.51 0.76 0.68 1.0 0.87 0.43 0.63 0.46 0.98 0.83 0.87 0.98 0.1 0.28 0.38 0.53 0.62 0.4 0.36 0.45 0.15
Bra036331 (ARF18)
 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.3 0.0 1.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.25 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0
Bra037850 (OPL1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38
Bra038003 (EBS7)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.08 0.27 0.71 0.29 0.24 0.0 0.3 0.0 0.3 1.0 0.11 0.13 0.51 0.0 0.31 0.07 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0
Bra038133 (LRX8)
 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.09 0.07 0.36 0.75 0.04 0.0 0.1 0.36 0.3 1.0 0.1 0.0 0.09 0.08 0.0 0.0 0.09 0.28 0.0 0.0 0.22 0.19 0.05 0.14 0.52 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.2 0.71 0.0 0.0 0.28 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra039207 (RTNLB13)
 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 1.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.75 0.68 0.43 0.69 0.59 0.58 0.18 0.48 0.75 0.48 0.94 0.54 0.94 0.72 0.01 0.0 0.01 0.31 0.4 0.39 0.81 1.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 1.0 0.39 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra040536 (FBP)
 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.08 0.39 0.8 0.26 0.94 0.69 0.53 0.52 0.46 0.56 0.44 1.0 0.32 0.35 0.68 0.57 0.12 0.14 0.31 0.66 0.23 0.11 0.2 0.28 0.86

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)