Heatmap: Cluster_299 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra000631 (MES6)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra001723 (PERK6)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra002453 (NRT2.4)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra004403 (FEZ)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra004739 (ATPMEPCRD)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra008454 (WRKY64)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra008852 (EXO70C1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra010026 (MET2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra011601 (DAZ2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra017492 (NUDT8)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra018727 (AGL84)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra019185 (PUB35)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra019465 (EMB1144)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra020285 (SBT5.4)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra020411 (TET15)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra020840 (LTPG34)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra021730 (DOR)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra022636 (SWEET3)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra023016 (ECS2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra024612 (EXT15)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra025130 (LEA11)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra027157 (GolS4)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra027954 (GUX4)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra028530 (OGOX4)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra028800 (WRKY13)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra034310 (JGB)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra034951 (PRK3)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra038001 (sks12)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra039580 (INO)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra040499 (RBL14)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.