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Heatmap: Cluster_237 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000547 (Tic55)
 0.76 0.68 0.57 0.74 0.79 1.0 1.0 0.99 0.92 0.9 0.92 0.9 0.86 0.87 0.86 0.88 0.83 0.5 0.83 0.94 0.86 0.84 0.46 0.73 0.75 0.7 0.78 0.81 0.79 0.66 0.85
Bra000708 (LHCB5)
 0.83 0.75 0.73 0.89 0.48 0.61 0.99 0.96 0.94 0.79 0.87 0.85 0.69 0.51 0.45 0.7 0.7 0.27 0.62 0.71 0.79 0.71 0.14 0.8 0.81 0.77 0.75 0.97 1.0 0.85 0.72
Bra000802 (ATPC1)
 0.74 0.65 0.66 0.78 0.62 0.71 0.9 0.92 0.76 0.91 0.88 0.89 0.77 0.58 0.56 0.94 0.96 0.62 0.94 0.94 0.95 0.92 0.31 0.96 1.0 0.95 0.98 0.86 0.83 0.89 0.94
0.82 0.84 1.0 0.89 0.84 0.8 0.78 0.92 0.74 0.76 0.78 0.84 0.87 0.67 0.61 0.69 0.7 0.55 0.61 0.78 0.7 0.72 0.36 0.71 0.62 0.63 0.7 0.66 0.73 0.75 0.99
Bra001809 (PSBTN)
 0.82 0.8 0.87 0.96 0.56 0.59 0.87 0.88 0.93 0.97 0.97 1.0 0.82 0.54 0.43 0.89 0.93 0.51 0.84 0.94 0.99 0.9 0.2 0.96 0.97 0.93 1.0 0.96 0.97 0.98 0.83
0.49 0.36 0.25 0.53 0.67 1.0 0.85 0.58 0.83 0.73 0.71 0.47 0.52 0.88 0.85 0.64 0.57 0.32 0.75 0.81 0.6 0.7 0.35 0.63 0.62 0.51 0.61 0.79 0.69 0.39 0.46
Bra003187 (LNK2)
 0.67 0.5 0.59 0.75 0.43 0.75 0.99 0.85 0.88 0.72 0.9 0.87 0.72 0.69 0.59 0.73 0.78 0.46 0.75 0.92 0.78 0.73 0.24 0.98 1.0 0.95 0.99 0.86 0.97 0.63 0.88
Bra003198 (LHCA1)
 0.78 0.61 0.64 0.61 0.56 0.58 0.89 0.91 0.95 0.87 0.96 1.0 0.57 0.49 0.44 0.53 0.65 0.4 0.76 0.75 0.74 0.74 0.1 0.71 0.7 0.64 0.69 0.76 0.79 0.8 0.7
Bra003375 (GUN4)
 0.7 0.56 0.6 0.75 0.63 0.79 0.76 0.81 1.0 0.8 0.84 0.8 0.62 0.92 0.76 0.8 0.7 0.48 0.76 0.68 0.79 0.72 0.22 0.82 0.79 0.72 0.72 0.97 0.98 0.73 0.65
0.65 0.5 0.54 0.68 0.65 0.89 0.96 0.77 1.0 0.82 0.86 0.84 0.75 0.83 0.75 0.85 0.74 0.27 0.76 0.9 0.92 0.91 0.36 0.87 0.84 0.73 0.76 0.82 0.82 0.62 0.62
Bra003950 (TAP1)
 0.72 0.51 0.39 0.66 0.65 0.96 0.97 0.83 1.0 0.8 0.89 0.86 0.71 0.88 0.8 0.87 0.87 0.45 0.8 0.95 0.86 0.85 0.17 0.81 0.79 0.7 0.74 0.91 0.86 0.56 0.74
Bra004075 (PSBY)
 0.51 0.45 0.42 0.58 0.47 0.58 0.76 0.75 0.83 0.88 0.88 0.9 0.62 0.51 0.51 0.78 0.84 0.36 0.77 0.8 0.86 0.74 0.12 0.83 0.89 0.82 1.0 0.9 0.91 0.97 0.89
Bra004252 (PSBY)
 0.58 0.5 0.47 0.6 0.51 0.6 0.7 0.54 1.0 0.75 0.94 1.0 0.55 0.55 0.54 0.59 0.64 0.45 0.83 0.73 0.73 0.68 0.11 0.76 0.76 0.69 0.81 0.9 1.0 0.87 0.7
Bra004504 (PSAP)
 0.72 0.53 0.4 0.63 0.5 0.74 0.86 0.78 0.97 0.87 0.98 0.83 0.55 0.51 0.53 0.76 0.75 0.35 1.0 0.93 0.72 0.81 0.16 0.93 0.98 0.79 0.93 0.74 0.91 0.81 0.82
Bra006208 (CCH)
 0.66 0.53 0.49 0.73 0.58 0.77 0.96 0.86 0.79 0.82 0.79 0.81 0.78 0.7 0.64 0.84 0.82 0.59 0.84 0.81 0.77 0.74 0.31 0.82 0.89 0.86 0.88 1.0 0.85 0.82 0.92
Bra006525 (FBN6)
 0.9 0.86 0.9 0.88 0.58 0.72 0.86 0.94 0.83 0.82 0.82 0.95 0.7 0.53 0.49 0.63 0.74 0.51 0.77 0.75 0.77 0.74 0.15 0.58 0.6 0.57 0.61 0.54 0.63 0.83 1.0
Bra007041 (HCEF1)
 0.85 0.72 0.78 0.88 0.58 0.79 0.87 0.89 0.79 0.89 0.97 0.8 0.62 0.55 0.56 0.77 0.74 0.4 0.8 0.81 0.8 0.79 0.23 0.87 0.89 0.83 0.9 1.0 0.85 0.77 0.85
Bra007284 (CRD1)
 0.81 0.74 0.7 0.86 0.5 0.78 0.97 0.96 0.94 0.86 0.95 0.96 0.76 0.62 0.62 0.77 0.82 0.57 1.0 0.87 0.91 0.82 0.18 0.9 0.92 0.86 0.85 0.93 0.91 0.81 0.87
Bra010350 (PSAE-1)
 0.65 0.69 0.72 0.78 0.51 0.51 0.77 0.75 0.9 0.96 0.98 1.0 0.71 0.55 0.48 0.73 0.81 0.44 0.78 0.86 0.86 0.82 0.18 0.88 0.87 0.82 0.93 0.79 0.8 0.93 0.78
0.6 0.37 0.31 0.57 0.55 0.6 0.77 0.78 0.82 0.73 0.77 0.71 0.7 0.47 0.43 0.65 0.65 0.34 0.58 0.73 0.72 0.57 0.23 0.67 0.64 0.71 0.65 1.0 0.9 0.6 0.6
Bra010774 (PSAK)
 0.76 0.71 0.72 0.77 0.52 0.56 0.92 0.93 0.86 0.87 0.96 0.88 0.8 0.47 0.35 0.69 0.78 0.46 0.83 0.89 0.92 0.81 0.19 1.0 0.99 0.88 0.93 0.99 0.94 0.83 0.79
Bra011057 (PSAE-1)
 0.8 0.83 0.94 0.91 0.62 0.62 0.8 0.8 0.99 0.89 0.97 1.0 0.75 0.64 0.56 0.72 0.77 0.53 0.82 0.83 0.83 0.84 0.22 0.9 0.89 0.91 0.95 0.81 0.88 0.91 0.74
Bra011329 (PDE334)
 0.61 0.55 0.63 0.66 0.61 0.62 0.72 0.63 0.77 0.7 0.73 0.68 0.58 0.5 0.48 0.68 0.67 0.45 0.67 0.69 0.69 0.67 0.31 0.86 0.84 0.86 0.85 1.0 0.89 0.78 0.75
0.65 0.47 0.45 0.73 0.6 0.82 1.0 0.83 0.74 0.8 0.8 0.79 0.61 0.54 0.54 0.69 0.66 0.41 0.68 0.82 0.76 0.74 0.23 0.6 0.6 0.56 0.6 0.82 0.74 0.53 0.68
Bra011839 (PnsL4)
 0.54 0.45 0.45 0.53 0.63 0.61 0.63 0.62 0.7 0.79 0.87 0.86 0.57 0.42 0.41 0.77 0.8 0.32 0.61 0.83 0.74 0.84 0.21 0.78 0.74 0.76 0.8 0.77 0.75 0.79 1.0
Bra012963 (RPE)
 0.78 0.68 0.74 0.79 0.56 0.58 0.81 0.86 0.85 0.94 0.91 1.0 0.74 0.46 0.44 0.75 0.82 0.77 0.91 0.76 0.77 0.71 0.31 0.65 0.66 0.64 0.72 0.72 0.61 0.81 0.87
Bra013741 (NdhS)
 0.57 0.45 0.46 0.51 0.55 0.63 0.52 0.54 0.77 0.7 0.71 0.66 0.41 0.51 0.45 0.43 0.44 0.27 0.64 0.67 0.62 0.62 0.1 0.79 0.73 0.61 0.63 0.9 1.0 0.71 0.56
Bra014024 (CP22)
 0.75 0.49 0.45 0.68 0.63 0.75 0.96 0.84 0.98 0.84 0.96 0.91 0.68 0.71 0.65 0.69 0.69 0.59 0.82 0.84 0.76 0.73 0.27 0.81 0.79 0.76 0.78 1.0 0.94 0.74 0.93
Bra014593 (PGL34)
 0.75 0.54 0.53 0.68 0.67 0.66 0.69 0.68 0.82 0.81 0.8 0.86 0.56 0.79 0.78 0.66 0.66 0.44 0.75 0.68 0.66 0.74 0.33 0.83 0.86 0.85 0.86 1.0 0.98 0.83 0.85
Bra015520 (OE23)
 0.64 0.6 0.61 0.7 0.44 0.52 0.64 0.6 1.0 0.8 0.98 0.86 0.45 0.44 0.44 0.61 0.6 0.31 0.68 0.68 0.62 0.58 0.1 0.61 0.65 0.63 0.65 0.69 0.84 0.78 0.6
Bra015530 (PSBW)
 0.67 0.54 0.53 0.65 0.61 0.66 0.79 0.62 1.0 0.86 0.95 0.89 0.69 0.59 0.48 0.72 0.7 0.35 0.7 0.81 0.79 0.9 0.13 0.76 0.78 0.64 0.73 0.78 0.77 0.69 0.6
Bra016020 (LPA3)
 0.86 0.78 0.78 0.87 0.72 0.74 0.79 0.73 0.83 0.85 0.95 0.99 0.8 0.48 0.53 0.77 0.78 0.53 0.76 0.86 0.74 0.83 0.32 0.86 0.86 0.87 0.9 1.0 0.82 0.85 0.93
Bra017055 (RCA)
 0.92 0.86 0.84 0.99 0.61 0.69 0.85 0.88 0.83 0.91 1.0 0.96 0.6 0.47 0.44 0.73 0.76 0.28 0.71 0.82 0.83 0.79 0.17 0.77 0.8 0.78 0.83 0.89 0.78 0.74 0.7
Bra018370 (ANTR1)
 0.71 0.53 0.42 0.63 0.83 0.76 0.74 0.75 0.86 0.65 0.72 0.83 0.49 0.62 0.57 0.46 0.44 0.39 0.68 0.6 0.58 0.56 0.17 0.69 0.68 0.61 0.75 1.0 0.92 0.82 0.85
Bra018503 (ATPC1)
 0.56 0.5 0.48 0.57 0.47 0.53 0.78 0.85 0.74 0.83 0.77 0.83 0.57 0.4 0.4 0.73 0.78 0.64 0.94 0.82 0.77 0.74 0.14 0.89 0.95 0.89 0.95 0.91 0.9 1.0 0.91
0.81 0.63 0.59 0.83 0.44 0.51 0.76 0.74 0.87 0.9 0.95 1.0 0.64 0.34 0.33 0.75 0.76 0.24 0.55 0.84 0.8 0.87 0.11 0.74 0.81 0.79 0.81 0.78 0.81 0.81 0.72
Bra020448 (AtOxR)
 0.97 0.87 0.75 0.82 0.62 0.66 0.92 0.89 0.87 0.8 0.82 0.95 0.63 0.44 0.47 0.55 0.65 0.53 0.87 0.77 0.7 0.76 0.31 0.84 0.79 0.74 0.83 0.77 0.87 1.0 0.99
0.7 0.48 0.42 0.65 0.73 1.0 0.86 0.73 0.93 0.76 0.79 0.75 0.58 0.91 0.89 0.65 0.74 0.45 0.7 0.86 0.83 0.8 0.23 0.79 0.74 0.62 0.67 0.92 0.86 0.58 0.55
Bra022019 (TPT)
 0.6 0.52 0.58 0.53 0.6 0.54 0.79 0.81 0.78 0.81 0.79 0.86 0.63 0.58 0.47 0.53 0.63 0.46 0.62 0.55 0.64 0.59 0.36 0.85 0.85 0.85 0.85 1.0 0.95 0.94 0.92
0.98 0.94 0.95 0.93 0.62 0.77 0.87 0.83 0.96 0.91 1.0 1.0 0.66 0.61 0.55 0.84 0.82 0.38 0.75 0.93 0.81 0.83 0.17 0.73 0.81 0.8 0.84 0.81 0.87 0.87 0.97
Bra022976 (DEG11)
 0.55 0.46 0.5 0.61 0.21 0.3 0.65 0.6 0.5 0.52 0.59 0.56 0.39 0.41 0.29 0.32 0.41 0.31 0.43 0.42 0.45 0.36 0.17 0.9 0.9 0.92 0.9 1.0 0.92 0.94 0.64
Bra023235 (PRK)
 0.66 0.53 0.52 0.72 0.43 0.69 0.94 0.87 0.78 0.93 0.9 0.89 0.75 0.53 0.51 1.0 1.0 0.51 0.92 0.94 0.94 0.92 0.18 0.81 0.85 0.79 0.86 0.74 0.72 0.71 0.82
0.84 0.86 0.76 0.71 0.36 0.68 0.96 0.89 0.92 0.92 0.98 0.95 0.65 0.43 0.48 0.78 0.78 0.42 0.79 0.95 0.82 0.83 0.29 0.91 0.94 0.92 0.93 1.0 0.83 0.63 0.86
0.76 0.63 0.63 0.7 0.77 0.87 0.93 0.88 1.0 0.76 0.96 0.91 0.84 0.81 0.7 0.84 0.83 0.5 0.79 0.9 0.79 0.75 0.3 0.63 0.69 0.63 0.71 0.81 0.78 0.71 0.9
Bra024580 (GGT1)
 0.77 0.56 0.48 0.66 0.61 1.0 0.86 0.68 0.85 0.72 0.81 0.71 0.52 0.62 0.72 0.78 0.67 0.28 0.7 0.67 0.75 0.72 0.13 0.71 0.73 0.6 0.69 0.73 0.85 0.56 0.59
Bra026099 (CP24)
 0.58 0.48 0.52 0.66 0.44 0.48 0.6 0.54 0.93 0.77 0.77 1.0 0.4 0.52 0.36 0.48 0.59 0.26 0.6 0.61 0.66 0.57 0.08 0.64 0.61 0.59 0.62 0.73 0.83 0.79 0.58
Bra026982 (TL20.3)
 0.73 0.79 0.75 0.82 0.54 0.64 0.74 0.72 0.59 0.68 0.79 0.8 0.71 0.47 0.42 0.72 0.75 0.32 0.6 0.81 0.74 0.71 0.22 0.65 0.68 0.7 0.73 0.52 0.59 0.77 1.0
Bra027932 (SOQ1)
 0.79 0.59 0.63 0.61 0.67 0.79 0.79 0.88 0.78 0.92 0.9 0.88 0.83 0.6 0.7 0.92 0.93 0.46 0.79 0.88 0.9 0.84 0.31 0.77 0.82 0.83 0.86 0.86 0.88 0.89 1.0
Bra029511 (ATPC1)
 0.54 0.52 0.49 0.58 0.54 0.65 0.96 0.92 0.61 0.76 0.71 0.79 0.64 0.47 0.49 0.82 0.85 0.57 0.8 0.78 0.81 0.79 0.29 0.94 1.0 0.86 0.94 0.89 0.86 0.86 0.89
Bra030522 (FZL)
 0.76 0.62 0.56 0.65 0.75 0.84 0.88 0.84 1.0 0.88 0.83 0.9 0.65 0.68 0.67 0.74 0.76 0.46 0.78 0.78 0.71 0.71 0.17 0.56 0.58 0.51 0.58 0.57 0.69 0.68 0.95
Bra030540 (PORC)
 0.69 0.7 0.74 0.82 0.67 0.71 0.82 0.85 0.88 1.0 0.95 0.98 0.86 0.62 0.55 0.86 0.89 0.63 0.83 0.88 0.86 0.87 0.33 0.88 0.92 0.93 0.92 0.91 0.9 0.88 0.97
0.64 0.6 0.56 0.58 0.74 0.71 0.7 0.67 0.74 0.81 0.82 0.89 0.76 0.65 0.66 0.68 0.73 0.5 0.65 0.71 0.68 0.7 0.49 0.8 0.8 0.76 0.78 1.0 0.9 0.83 0.86
Bra031534 (OE23)
 0.65 0.53 0.54 0.73 0.52 0.56 0.89 0.85 0.98 0.95 0.99 0.99 0.64 0.46 0.42 0.75 0.78 0.44 0.86 0.87 0.84 0.8 0.14 0.96 1.0 0.94 0.99 1.0 0.96 0.99 0.88
0.62 0.45 0.42 0.27 0.14 0.16 0.41 0.56 0.51 0.41 0.56 0.7 0.24 0.05 0.08 0.21 0.16 0.08 0.36 0.44 0.39 0.54 0.01 0.5 0.53 0.44 0.47 0.77 0.8 1.0 0.63
Bra032672 (PSAL)
 0.73 0.7 0.72 0.85 0.47 0.53 0.78 0.73 0.76 0.82 0.87 0.86 0.57 0.46 0.45 0.66 0.68 0.37 0.7 0.78 0.77 0.69 0.21 0.95 0.98 0.94 1.0 0.87 0.82 0.9 0.73
Bra033317 (PPO1)
 0.77 0.76 0.81 0.83 0.55 0.52 0.73 0.75 0.61 0.71 0.66 0.77 0.7 0.45 0.43 0.57 0.63 0.38 0.47 0.57 0.58 0.56 0.31 0.52 0.54 0.58 0.59 0.57 0.53 0.78 1.0
Bra033493 (NAIP1)
 0.7 0.57 0.62 0.64 0.72 0.75 0.78 0.86 0.95 0.77 0.86 0.88 0.61 0.63 0.58 0.68 0.64 0.48 0.7 0.75 0.73 0.72 0.27 0.8 0.82 0.82 0.8 0.88 1.0 0.89 0.86
Bra033642 (NDF2)
 0.73 0.63 0.61 0.76 0.63 0.77 0.87 0.71 0.81 0.94 0.99 0.92 0.73 0.65 0.55 0.87 0.89 0.37 0.76 1.0 0.92 0.87 0.2 0.9 0.93 0.87 0.87 0.92 0.89 0.69 0.99
Bra035916 (OR)
 1.0 0.95 0.78 0.73 0.36 0.43 0.6 0.5 0.78 0.64 0.75 0.78 0.32 0.29 0.34 0.47 0.47 0.32 0.72 0.6 0.53 0.62 0.15 0.63 0.65 0.62 0.69 0.54 0.66 0.83 0.71
Bra037531 (HBP5)
 0.88 0.78 0.66 0.92 0.67 0.93 1.0 0.96 0.83 0.86 0.88 0.88 0.74 0.62 0.63 0.79 0.77 0.39 0.78 0.91 0.9 0.82 0.41 0.83 0.88 0.78 0.87 0.95 0.81 0.59 0.73
0.81 0.7 0.58 0.81 0.72 0.97 0.86 0.76 0.89 0.7 0.88 0.83 0.55 0.72 0.7 0.76 0.68 0.49 0.75 0.83 0.7 0.74 0.25 0.83 0.83 0.77 0.82 1.0 0.97 0.72 0.8
Bra039683 (MSRB1)
 0.57 0.6 0.52 0.62 0.52 0.79 1.0 0.88 0.76 0.62 0.75 0.73 0.62 0.75 0.61 0.52 0.56 0.44 0.69 0.81 0.75 0.71 0.27 0.63 0.62 0.55 0.61 0.64 0.7 0.45 0.58
0.85 0.74 0.72 0.84 0.68 0.67 0.75 0.77 0.75 0.87 0.83 0.86 0.8 0.49 0.5 0.71 0.79 0.49 0.61 0.77 0.76 0.76 0.23 0.8 0.84 0.77 0.86 0.94 0.7 0.8 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)