1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_23 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000414 (LEA27)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0
Bra002572 (SMR113)
 0.34 0.5 0.88 0.14 1.06 0.53 0.99 1.62 2.08 0.62 1.73 1.98 1.86 1.23 1.25 0.72 1.35 1.12 1.42 0.94 0.53 1.33 0.6 1.3 1.63 0.64 1.19 1.19 1.18 1.13 2.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0
Bra008328 (SINAT1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.22 0.1 0.0 0.08 0.09 0.18 0.0 0.0 0.46 0.11 0.51 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.09 0.1
Bra008546 (UMAMIT31)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.09 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.04
0.1 0.06 0.03 0.12 0.35 0.43 0.14 0.1 1.35 0.19 0.05 0.15 0.15 0.32 0.85 0.42 0.64 0.15 0.13 0.15 0.09 0.17 0.09 0.24 0.1 0.07 0.11 0.13 0.11 0.12 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.02 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68
Bra013496 (DOF4.4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.46 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra015250 (PAKRP1)
 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra015517 (RAD17)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.09 1.2 0.6 0.73 1.24 1.61 1.2 0.89 0.74 0.24 0.46 1.92 0.24 0.0 0.91 0.46 0.33 0.0 0.86 0.5 0.67 0.43 0.2 1.89
Bra017756 (BGAL3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
Bra018098 (HSS)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 0.1 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
Bra019186 (OLE1)
 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.68 1.5 1.12 0.57 1.6 1.96 0.57 0.11 5.4 0.96 1.28 0.97 0.11 2.39 9.04 0.35 1.8 0.72 4.71 0.83 0.58 1.15 0.2 0.55 0.42 0.14 0.38 0.53 0.38 0.43 0.15
Bra020561 (ZRK11)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra020909 (GA3OX3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
Bra022317 (EMB1865)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.09 0.78 0.0 0.35 0.68 0.57 0.73 0.87 0.87 0.17 1.09 0.4 0.08 0.4 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra024878 (PAPS1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra026685 (RBSK)
 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra027117 (SOT18)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.14 0.0 0.45 0.11 0.04 0.0 0.0 0.0 1.15 0.33 0.2 0.4 0.0 0.24 0.5 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra027995 (WIP4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
Bra028067 (TT1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra029977 (WIH3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
0.06 0.07 0.04 0.04 0.1 0.09 0.08 0.13 0.5 0.04 0.04 0.08 0.1 0.06 0.12 0.01 0.11 0.2 0.53 0.0 0.06 0.05 0.25 0.06 0.17 0.15 0.06 0.1 0.11 0.09 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
Bra031346 (JAZ13)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.11 0.07 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0
Bra032239 (PMEI1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.05 0.12 0.12 0.09 0.06 0.0 0.71 0.07 0.17 0.07 0.15 0.55 0.08 0.23 0.03 0.84 0.03 0.14 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra033469 (AST12)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.15 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra033937 (LBD22)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 2.89 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 3.6 0.0 0.01 0.04 2.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra034230 (SKIP19)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.21 0.0 0.14 0.0 0.03 0.0 0.16 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.05 0.0
Bra034463 (UIF1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
Bra036025 (bZIP5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03
Bra036455 (PEG2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
Bra037092 (PUB58)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.31 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra037708 (NLP8)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.04 0.01 0.04 0.03 0.06
Bra037768 (AOX2)
 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.03 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01
Bra037958 (ESR)
 18.12 7.89 6.16 1.25 177.06 67.07 9.98 23.09 323.22 58.61 15.1 25.77 31.04 162.21 246.94 26.92 17.01 23.36 63.56 12.54 51.03 51.37 27.0 122.7 74.11 53.84 55.0 22.37 50.71 137.02 229.12
Bra038006 (MINI3)
 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.19 0.0 0.6 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.35 0.0 0.0
Bra039191 (UGT84B2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.03 0.03 0.06 0.05 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
Bra039525 (GSO2)
 0.01 0.0 0.02 0.0 0.03 0.01 0.04 0.06 0.1 0.07 0.05 0.13 0.12 0.0 0.02 0.03 0.04 0.03 0.03 0.01 0.05 0.04 0.05 0.04 0.06 0.01 0.02 0.03 0.05 0.05 0.16
Bra039572 (HSP70)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra040842 (AGC1-9)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)