1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_183 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra001130 (LCR18)
 0.67 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.46 1.0 0.22 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra002127 (SAUR23)
 0.28 1.0 0.07 0.96 0.75 0.07 0.18 0.02 0.21 0.5 0.06 0.1 0.04 0.01 0.0 0.15 0.14 0.15 0.08 0.02 0.03 0.04 0.01 0.08 0.1 0.04 0.0 0.07 0.11 0.08 0.02
Bra002968 (TS1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra003749 (SRS5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.61 0.0 0.19 0.64 0.17 0.0 0.46 0.3 0.31 0.21 0.21 0.47 0.35 0.36 0.0 0.63 0.26 0.0 0.25 0.0 0.11 0.65 0.0 1.0 0.47 0.0
0.04 0.73 0.68 1.0 0.54 0.12 0.0 0.01 0.0 0.0 0.44 0.25 0.0 0.04 0.21 0.0 0.0 0.02 0.28 0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Bra005446 (WL2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.66 0.26 0.0 0.0 0.0 0.98 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0
0.49 0.79 1.0 0.66 0.42 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.32 0.15 0.13 0.17 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 1.0 0.0 0.4 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.47 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra008160 (ATY13)
 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0
Bra009817 (CYP71B11)
 0.56 1.0 0.6 0.67 0.8 0.59 0.27 0.36 0.39 0.18 0.47 0.37 0.19 0.36 0.33 0.33 0.36 0.15 0.4 0.26 0.33 0.21 0.5 0.3 0.35 0.47 0.35 0.72 0.66 0.92 0.56
Bra010241 (FLA5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra012061 (PRX72)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.16 0.0 0.0 0.43 0.0 0.76 0.53 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 1.0 0.0 0.16 0.0 0.32 0.0 0.0 0.18 0.0
Bra014122 (CIPK17)
 0.49 0.75 1.0 1.0 0.67 0.89 0.5 0.43 0.04 0.16 0.15 0.09 0.0 0.1 0.34 0.06 0.0 0.0 0.03 0.55 0.14 0.01 0.0 0.04 0.07 0.4 0.33 0.14 0.68 0.12 0.65
Bra015286 (TOM22-I)
 0.0 0.72 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.4 0.0 0.4 0.0 1.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.87 0.0 0.0 0.59 0.09 0.09 0.19 0.22 0.12 0.47 0.23 1.0 0.0 0.2 0.8 0.3 0.36 0.5 0.1 0.1 0.0 0.0 0.12 0.0 0.32 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra016339 (ZCCHC8A)
 0.88 0.23 1.0 0.67 0.17 0.34 0.66 0.11 0.41 0.06 0.12 0.15 0.07 0.0 0.21 0.27 0.88 0.59 0.36 0.29 0.11 0.45 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.45 0.67 0.0 0.46 0.21 0.0 0.07 0.1 0.23 0.0 0.17 0.08 0.16 0.25 0.26 0.14 0.33 0.0 0.07 0.11 0.15 0.94 0.15 0.2 0.1 0.15 0.19 0.26 0.43 0.07
0.27 0.0 0.04 0.25 0.12 0.0 0.29 0.11 0.42 0.24 0.22 0.09 0.23 0.15 0.09 0.15 1.0 0.47 0.05 0.13 0.32 0.04 0.13 0.19 0.12 0.42 0.0 0.05 0.66 0.8 0.28
Bra017500 (GATA27)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.48 0.2 0.0 0.0 0.45 0.0 0.31 0.0 0.6 0.96 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.25 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.02 0.05 0.24 0.02 0.2 0.04 0.01 0.07 0.05 0.02 0.05 1.0 0.01 0.02 0.04 0.02 0.04 0.01 0.05 0.06 0.02 0.04 0.04 0.04 0.06 0.05
Bra020766 (MBD11)
 0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.24 0.0 0.29 0.26 0.0
Bra021052 (MSH4)
 0.17 0.05 0.06 0.1 0.28 0.28 0.09 0.07 0.16 0.18 0.22 0.11 0.25 0.21 0.21 0.19 1.0 0.17 0.19 0.26 0.25 0.16 0.39 0.11 0.07 0.04 0.03 0.06 0.03 0.02 0.03
0.33 1.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.58 0.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra022206 (RAP74)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra024629 (gsl09)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.63 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.22 0.23
Bra025645 (NTRA)
 0.8 1.0 0.31 0.3 0.22 0.34 0.11 0.0 0.03 0.21 0.07 0.14 0.08 0.2 0.1 0.05 0.02 0.2 0.07 0.04 0.02 0.05 0.55 0.34 0.54 0.5 0.75 0.31 0.39 0.62 0.25
0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0
1.0 0.49 0.97 0.07 0.29 0.27 0.05 0.0 0.18 0.06 0.21 0.07 0.12 0.13 0.2 0.33 0.06 0.42 0.06 0.0 0.06 0.15 0.66 0.31 0.27 0.0 0.22 0.34 0.32 0.36 0.13
Bra026661 (CSLB03)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra026934 (CYP71B28)
 0.2 0.38 0.64 1.0 0.09 0.46 0.0 0.18 0.31 0.16 0.07 0.17 0.19 0.08 0.28 0.09 0.25 0.0 0.07 0.0 0.15 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra027287 (RIP1)
 0.41 1.0 0.96 0.17 0.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.37 0.0 0.07 0.21 0.07 0.74 0.63 0.97
Bra027335 (YKT61)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra028071 (DEI1)
 0.0 1.0 0.0 0.82 0.34 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra028329 (NF-YB4)
 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0
Bra028381 (PBL41)
 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0
Bra028795 (PKS4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0
Bra028801 (VFB3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra029270 (GCD1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0
0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.23 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.74 1.0 0.31 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0
Bra031680 (ARL8a)
 0.69 0.39 0.09 0.55 0.17 0.16 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.09 0.08 0.0 1.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.18 0.08 0.0 0.0
Bra033139 (SRO1)
 0.5 0.0 0.08 0.0 0.0 0.19 0.0 0.09 0.09 0.47 0.0 0.18 0.3 0.14 1.0 0.12 0.36 0.54 0.0 0.0 0.33 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra034117 (TPK1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra035340 (CLE40)
 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.6 0.0 0.27 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra035532 (TT2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.16 0.45 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.22 0.0 1.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.38
Bra035538 (PRK1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 1.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra036086 (HR3)
 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra036880 (REM1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.23 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.27 0.0 1.0 0.0 0.23 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.64 0.34 0.42 0.26 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.13 0.0 0.38 0.0 0.0 0.15 0.15 0.0 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Bra040012 (RTNLB8)
 0.22 1.0 0.11 0.18 0.3 0.36 0.07 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.03 0.02 0.11 0.06 0.06 0.04 0.08 0.01 0.19 0.01 0.47 0.46 0.22 0.43 0.34 0.49 0.49 0.37 0.21
Bra040400 (RALFL28)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)