1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_279 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000400 (TRM6)
 0.53 0.68 0.57 0.52 0.82 0.73 0.73 0.8 0.36 0.44 0.45 0.51 0.74 0.83 1.0 0.74 0.67 0.77 0.59 0.53 0.56 0.59 0.98 0.42 0.43 0.46 0.41 0.39 0.4 0.43 0.6
0.42 0.58 0.67 0.57 0.71 0.81 0.69 0.86 0.44 0.7 0.49 0.49 0.99 0.89 1.0 0.81 0.84 0.92 0.7 0.72 0.7 0.73 0.58 0.37 0.38 0.35 0.46 0.37 0.26 0.23 0.5
0.37 0.48 0.55 0.51 0.71 0.69 0.51 0.89 0.38 0.37 0.29 0.41 0.63 0.7 1.0 0.54 0.5 0.54 0.41 0.58 0.47 0.48 0.83 0.34 0.38 0.37 0.35 0.35 0.31 0.29 0.46
Bra002734 (ZIP11)
 0.53 0.72 0.63 0.59 0.81 0.82 0.63 0.84 0.46 0.32 0.36 0.41 1.0 0.83 0.9 0.69 0.62 0.6 0.41 0.63 0.56 0.53 0.9 0.28 0.29 0.25 0.26 0.27 0.22 0.23 0.37
0.49 0.68 0.5 0.36 1.0 0.79 0.61 0.64 0.39 0.5 0.47 0.41 0.87 0.61 0.79 0.65 0.6 0.67 0.53 0.53 0.42 0.41 0.98 0.43 0.42 0.29 0.57 0.41 0.34 0.3 0.46
Bra004926 (SAP18)
 0.63 0.66 0.6 0.6 0.93 0.78 0.63 0.66 0.41 0.48 0.42 0.41 0.94 0.64 0.69 0.6 0.55 0.72 0.5 0.45 0.52 0.53 1.0 0.53 0.55 0.46 0.57 0.6 0.55 0.48 0.53
0.78 0.54 0.54 0.4 1.0 0.65 0.2 0.17 0.29 0.36 0.21 0.25 0.33 0.32 0.58 0.2 0.35 0.32 0.3 0.14 0.16 0.29 0.05 0.02 0.11 0.05 0.1 0.11 0.13 0.05 0.1
0.62 0.58 0.65 0.38 1.0 0.8 0.29 0.08 0.29 0.4 0.24 0.22 0.26 0.16 0.41 0.27 0.13 0.44 0.27 0.23 0.18 0.35 0.3 0.16 0.19 0.16 0.24 0.24 0.33 0.24 0.31
Bra005760 (TPR1)
 0.28 0.28 0.42 0.34 0.5 0.75 0.06 0.04 0.04 0.05 0.0 0.05 0.13 0.92 1.0 0.08 0.03 0.24 0.05 0.12 0.01 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Bra006264 (PBAC3)
 0.58 0.59 0.62 0.59 0.93 0.77 0.48 0.75 0.3 0.47 0.35 0.48 0.8 0.59 0.91 0.73 0.49 1.0 0.66 0.42 0.57 0.38 0.44 0.22 0.18 0.23 0.24 0.24 0.22 0.22 0.41
0.8 0.72 0.69 0.61 0.89 0.78 0.38 0.45 0.54 0.61 0.53 0.54 0.52 0.9 1.0 0.58 0.62 0.58 0.66 0.48 0.44 0.48 0.68 0.29 0.27 0.23 0.22 0.27 0.3 0.24 0.34
0.47 0.21 0.31 0.13 1.0 0.6 0.07 0.15 0.2 0.27 0.16 0.28 0.17 0.6 0.66 0.11 0.09 0.3 0.29 0.07 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.45 0.25 0.23 0.33 1.0 0.7 0.23 0.53 0.17 0.2 0.21 0.29 0.6 0.6 0.76 0.3 0.23 0.43 0.42 0.17 0.24 0.2 0.1 0.02 0.02 0.02 0.03 0.03 0.02 0.03 0.06
0.71 0.41 0.45 0.23 1.0 0.41 0.09 0.22 0.35 0.34 0.26 0.4 0.24 0.35 0.85 0.21 0.17 0.19 0.38 0.24 0.12 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.52 0.52 0.37 0.45 1.0 0.49 0.1 0.22 0.05 0.09 0.07 0.17 0.35 0.34 0.41 0.07 0.05 0.39 0.36 0.08 0.03 0.04 0.05 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01
Bra007151 (SDRd)
 0.64 0.74 0.64 0.57 0.95 0.82 0.51 0.61 0.19 0.33 0.34 0.29 0.93 0.72 0.65 0.51 0.52 0.75 0.42 0.37 0.36 0.32 1.0 0.17 0.23 0.21 0.19 0.18 0.15 0.17 0.32
0.21 0.17 0.11 0.11 0.32 0.33 0.06 0.12 0.15 0.03 0.06 0.1 0.29 0.45 0.72 0.43 0.27 1.0 0.12 0.2 0.47 0.18 0.42 0.15 0.05 0.01 0.01 0.09 0.04 0.01 0.15
Bra008458 (TUA3)
 0.52 0.39 0.49 0.39 0.67 0.75 0.44 0.59 0.25 0.21 0.23 0.18 0.6 0.58 0.62 0.36 0.41 0.61 0.31 0.4 0.34 0.41 1.0 0.38 0.45 0.47 0.34 0.47 0.38 0.37 0.54
0.56 0.56 0.59 0.6 0.61 0.75 0.32 0.37 0.35 0.2 0.18 0.18 0.27 0.86 1.0 0.19 0.16 0.38 0.33 0.23 0.22 0.21 0.37 0.1 0.11 0.07 0.07 0.08 0.22 0.08 0.16
0.51 0.84 0.48 0.45 0.69 0.77 0.53 0.84 0.22 0.26 0.33 0.25 0.93 0.77 0.81 0.46 0.58 0.86 0.36 0.37 0.35 0.41 1.0 0.38 0.31 0.29 0.25 0.34 0.22 0.19 0.39
0.46 0.47 0.59 0.54 0.3 0.62 0.39 0.41 0.33 0.18 0.33 0.27 0.45 0.86 0.9 0.58 0.44 1.0 0.36 0.48 0.57 0.4 0.92 0.23 0.22 0.2 0.22 0.25 0.17 0.14 0.41
0.39 0.72 0.54 0.74 0.68 0.61 0.55 0.69 0.24 0.24 0.37 0.26 1.0 0.47 0.67 0.58 0.57 0.54 0.36 0.37 0.42 0.32 0.91 0.2 0.21 0.24 0.24 0.16 0.1 0.13 0.38
0.76 0.87 1.0 0.79 0.97 0.77 0.58 0.74 0.36 0.52 0.46 0.46 0.94 0.95 0.95 0.7 0.8 0.79 0.46 0.57 0.65 0.74 0.6 0.32 0.35 0.23 0.25 0.24 0.21 0.17 0.45
0.65 0.46 0.35 0.5 0.9 0.77 0.58 0.64 0.52 0.51 0.54 0.45 0.71 0.83 1.0 0.68 0.45 0.73 0.53 0.65 0.54 0.47 0.61 0.3 0.36 0.16 0.33 0.35 0.27 0.2 0.28
Bra011240 (NKS1)
 0.34 0.44 0.34 0.43 0.66 0.59 0.42 0.5 0.55 0.51 0.57 0.42 0.78 0.94 0.85 0.64 0.58 1.0 0.6 0.46 0.53 0.47 0.48 0.32 0.35 0.34 0.29 0.25 0.26 0.16 0.22
0.47 0.33 0.39 0.31 0.67 0.68 0.38 0.35 0.47 0.61 0.48 0.41 0.63 0.73 1.0 0.65 0.69 0.79 0.55 0.51 0.6 0.4 0.42 0.25 0.2 0.13 0.22 0.26 0.28 0.24 0.34
1.0 0.69 0.8 0.68 0.88 0.84 0.42 0.49 0.62 0.61 0.44 0.64 0.5 0.67 0.98 0.62 0.64 0.56 0.64 0.61 0.59 0.48 0.66 0.46 0.45 0.43 0.42 0.41 0.59 0.54 0.52
Bra012763 (HSBP)
 0.8 0.84 0.97 0.71 0.76 0.6 0.48 0.61 0.4 0.5 0.5 0.59 1.0 0.87 0.84 0.62 0.7 0.71 0.48 0.49 0.71 0.7 0.67 0.41 0.42 0.52 0.41 0.42 0.44 0.41 0.51
Bra013142 (SLO2)
 0.25 0.23 0.23 0.31 0.29 0.51 0.22 0.33 0.25 0.2 0.19 0.26 0.57 0.46 0.53 0.6 0.62 1.0 0.26 0.41 0.52 0.23 0.53 0.12 0.17 0.06 0.13 0.15 0.06 0.1 0.43
Bra013764 (YSL1)
 0.44 0.4 0.27 0.24 0.46 0.7 0.24 0.24 0.25 0.17 0.22 0.2 0.39 0.33 0.37 0.29 0.2 0.19 0.23 0.25 0.33 0.24 1.0 0.34 0.33 0.22 0.31 0.49 0.37 0.27 0.23
0.6 0.81 0.68 0.43 1.0 0.98 0.69 0.56 0.57 0.52 0.59 0.49 0.54 0.8 0.97 0.75 0.67 0.75 0.58 0.81 0.54 0.62 0.95 0.55 0.52 0.44 0.5 0.53 0.52 0.47 0.66
Bra016507 (RRA3)
 0.3 0.19 0.41 0.32 0.63 0.47 0.26 0.33 0.33 0.29 0.32 0.29 0.48 0.48 0.46 0.33 0.38 0.87 0.4 0.41 0.41 0.38 1.0 0.17 0.21 0.22 0.19 0.26 0.24 0.26 0.22
0.16 0.41 0.34 0.55 0.45 0.54 0.6 0.73 0.18 0.25 0.17 0.22 0.57 0.55 1.0 0.78 0.58 0.74 0.17 0.3 0.45 0.29 0.68 0.11 0.12 0.11 0.12 0.15 0.07 0.08 0.19
0.19 0.22 0.19 0.15 1.0 0.63 0.07 0.03 0.07 0.09 0.08 0.07 0.05 0.78 0.82 0.05 0.03 0.05 0.11 0.08 0.08 0.04 0.2 0.07 0.11 0.0 0.01 0.13 0.07 0.08 0.03
Bra018048 (NSE2)
 0.64 0.73 0.96 0.53 1.0 0.49 0.65 0.77 0.5 0.51 0.69 0.64 0.66 0.88 0.83 0.62 0.49 0.52 0.45 0.51 0.51 0.52 0.36 0.2 0.25 0.16 0.16 0.11 0.17 0.16 0.21
0.49 0.65 0.6 0.56 0.4 0.73 0.57 0.62 0.46 0.48 0.37 0.54 0.97 0.75 0.98 0.92 0.98 1.0 0.52 0.79 0.56 0.63 0.82 0.18 0.1 0.11 0.12 0.17 0.04 0.09 0.46
0.43 0.41 0.41 0.42 0.88 0.66 0.37 0.37 0.44 0.43 0.39 0.35 0.58 0.68 1.0 0.43 0.47 0.65 0.43 0.47 0.48 0.31 0.62 0.31 0.12 0.19 0.19 0.24 0.31 0.28 0.25
0.54 0.81 0.79 0.72 0.65 0.58 0.53 0.65 0.49 0.46 0.53 0.47 1.0 0.68 0.79 0.58 0.54 0.67 0.44 0.44 0.54 0.56 0.72 0.43 0.44 0.37 0.39 0.36 0.31 0.41 0.75
Bra018912 (Y14)
 0.69 0.88 0.74 0.68 0.62 0.5 0.58 0.89 0.36 0.48 0.47 0.46 1.0 0.65 0.7 0.56 0.63 0.73 0.52 0.48 0.55 0.5 0.59 0.43 0.4 0.41 0.44 0.4 0.34 0.48 0.64
Bra020172 (EMB2758)
 0.5 0.51 0.5 0.43 0.77 0.74 0.47 0.81 0.37 0.41 0.35 0.4 0.66 0.59 1.0 0.59 0.68 0.58 0.4 0.57 0.4 0.48 0.84 0.37 0.37 0.3 0.46 0.35 0.36 0.4 0.4
0.5 0.62 0.52 0.55 0.88 0.75 0.58 0.58 0.67 0.71 0.58 0.63 0.81 1.0 0.98 0.74 0.75 1.0 0.73 0.63 0.6 0.67 0.94 0.5 0.53 0.52 0.57 0.48 0.47 0.47 0.47
Bra021777 (DOR)
 0.52 0.69 0.75 0.41 0.5 0.78 0.76 0.84 0.48 0.43 0.4 0.32 1.0 0.73 0.79 0.64 0.59 0.88 0.67 0.81 0.65 0.5 0.82 0.11 0.13 0.16 0.15 0.11 0.19 0.21 0.39
Bra022292 (CCT4)
 0.46 0.56 0.54 0.37 0.76 0.69 0.43 0.6 0.41 0.38 0.31 0.26 0.98 0.73 1.0 0.62 0.46 0.7 0.51 0.33 0.48 0.45 0.9 0.21 0.21 0.2 0.21 0.29 0.25 0.22 0.3
0.41 0.45 0.33 0.37 0.49 0.35 0.33 0.31 0.3 0.46 0.33 0.28 0.59 0.41 0.43 0.4 0.46 0.6 0.35 0.38 0.46 0.59 1.0 0.37 0.38 0.44 0.4 0.29 0.27 0.27 0.28
0.51 0.45 0.47 0.41 0.83 0.57 0.45 0.63 0.52 0.5 0.55 0.38 0.7 0.81 0.86 0.61 0.54 1.0 0.51 0.55 0.51 0.42 0.38 0.27 0.28 0.32 0.38 0.3 0.31 0.31 0.33
0.62 0.75 0.62 0.56 0.58 0.47 0.61 1.0 0.32 0.31 0.33 0.33 0.76 0.77 0.57 0.57 0.61 0.62 0.47 0.41 0.54 0.49 0.85 0.35 0.48 0.33 0.33 0.31 0.26 0.3 0.48
Bra025830 (SMD3B)
 0.54 0.58 0.61 0.58 0.8 0.84 0.63 0.71 0.5 0.61 0.61 0.61 1.0 0.93 0.96 0.81 0.73 0.74 0.68 0.64 0.7 0.68 0.74 0.62 0.57 0.52 0.6 0.54 0.5 0.46 0.63
Bra026408 (FIM1)
 0.82 0.81 0.63 0.47 1.0 0.75 0.46 0.37 0.38 0.45 0.31 0.31 0.42 0.79 0.67 0.34 0.36 0.32 0.39 0.37 0.3 0.4 0.22 0.27 0.28 0.24 0.29 0.24 0.28 0.31 0.61
Bra027070 (mTERF31)
 0.78 0.73 0.57 0.36 0.88 1.0 0.55 0.64 0.39 0.45 0.35 0.35 0.8 0.78 0.91 0.61 0.73 0.76 0.54 0.38 0.44 0.39 0.83 0.37 0.29 0.19 0.24 0.32 0.26 0.22 0.41
Bra027434 (TBP1)
 0.84 0.78 0.84 0.75 0.98 0.78 0.58 0.72 0.52 0.47 0.51 0.5 0.86 0.78 0.65 0.51 0.6 0.68 0.46 0.58 0.46 0.5 1.0 0.56 0.47 0.48 0.46 0.47 0.52 0.48 0.44
Bra027439 (AP2S)
 0.46 0.61 0.59 0.52 0.87 0.66 0.5 0.55 0.47 0.47 0.45 0.44 0.76 0.58 0.6 0.54 0.53 0.87 0.51 0.54 0.51 0.59 1.0 0.61 0.42 0.46 0.48 0.48 0.42 0.38 0.44
Bra029127 (SHOC1)
 0.21 0.25 0.23 0.11 0.6 0.49 0.24 0.25 0.41 0.31 0.25 0.36 0.58 0.55 1.0 0.33 0.33 0.33 0.31 0.22 0.2 0.34 0.21 0.07 0.12 0.09 0.1 0.05 0.08 0.11 0.11
Bra030819 (CYP59)
 0.69 0.88 0.8 0.74 0.93 1.0 0.71 0.79 0.57 0.6 0.61 0.57 0.88 0.9 0.96 0.79 0.76 0.96 0.84 0.64 0.52 0.64 0.94 0.62 0.6 0.5 0.61 0.61 0.56 0.52 0.8
0.54 0.71 0.47 0.42 1.0 0.75 0.47 0.3 0.42 0.27 0.53 0.27 0.26 0.28 0.72 0.28 0.19 0.28 0.35 0.25 0.22 0.33 0.28 0.14 0.08 0.07 0.14 0.11 0.19 0.23 0.19
0.58 0.73 0.87 0.73 0.75 0.75 0.6 0.63 0.65 0.73 0.73 0.73 0.81 0.98 1.0 0.82 0.86 0.93 0.67 0.84 0.68 0.74 0.64 0.49 0.46 0.45 0.51 0.35 0.35 0.46 0.6
0.48 0.6 0.44 0.37 1.0 0.78 0.31 0.57 0.16 0.31 0.27 0.28 0.36 0.29 0.76 0.27 0.77 0.84 0.39 0.28 0.34 0.43 0.39 0.09 0.14 0.03 0.1 0.04 0.08 0.03 0.23
Bra031683 (U2A')
 0.46 0.35 0.33 0.34 0.56 0.54 0.49 0.44 0.45 0.43 0.52 0.46 0.7 0.53 1.0 0.7 0.57 0.6 0.47 0.52 0.53 0.49 0.61 0.3 0.28 0.25 0.28 0.31 0.27 0.29 0.38
Bra033442 (ATPQ)
 0.59 0.6 0.62 0.55 0.86 0.82 0.7 0.69 0.54 0.54 0.61 0.57 1.0 0.67 0.93 0.67 0.74 0.9 0.67 0.67 0.63 0.71 0.72 0.42 0.43 0.39 0.42 0.41 0.38 0.4 0.48
Bra033949 (AE7)
 0.48 0.43 0.47 0.43 0.74 0.7 0.43 0.49 0.34 0.29 0.35 0.41 0.61 0.51 0.62 0.5 0.38 0.49 0.42 0.37 0.42 0.28 1.0 0.47 0.44 0.38 0.49 0.5 0.41 0.38 0.41
Bra034668 (bZIP19)
 0.58 0.67 0.54 0.55 1.0 1.0 0.78 0.71 0.52 0.58 0.6 0.52 0.89 0.84 0.84 0.89 0.78 0.64 0.57 0.63 0.71 0.57 0.98 0.6 0.69 0.55 0.69 0.53 0.66 0.59 0.83
0.57 0.67 0.56 0.44 0.59 0.58 0.38 0.7 0.29 0.36 0.33 0.34 0.71 0.83 0.88 0.6 0.67 1.0 0.45 0.33 0.38 0.48 0.5 0.2 0.19 0.2 0.24 0.22 0.19 0.18 0.24
Bra035551 (E2-OGDH2)
 0.42 0.55 0.43 0.45 0.61 0.8 0.47 0.55 0.47 0.42 0.38 0.42 0.63 0.87 0.89 0.62 0.48 1.0 0.64 0.55 0.56 0.63 0.5 0.24 0.2 0.18 0.22 0.25 0.24 0.18 0.22
Bra035794 (EHD1)
 0.41 0.57 0.5 0.45 0.61 0.56 0.55 0.74 0.6 0.61 0.64 0.56 0.76 0.84 1.0 0.74 0.74 0.7 0.57 0.57 0.65 0.55 0.84 0.42 0.34 0.37 0.38 0.44 0.4 0.35 0.37
Bra036674 (TIM44-2)
 0.3 0.23 0.54 0.26 0.78 0.62 0.55 0.65 0.44 0.58 0.43 0.43 0.48 1.0 0.96 0.79 0.72 0.82 0.55 0.51 0.53 0.41 0.72 0.15 0.1 0.1 0.09 0.1 0.09 0.08 0.3
0.66 0.73 0.65 0.62 0.82 0.74 0.55 0.57 0.49 0.53 0.43 0.46 0.69 0.66 0.63 0.57 0.56 0.68 0.51 0.52 0.47 0.46 1.0 0.46 0.5 0.52 0.5 0.46 0.48 0.4 0.49
Bra037096 (RPPR3a)
 0.26 0.27 0.21 0.31 0.2 0.51 0.23 0.47 0.13 0.21 0.17 0.15 0.56 0.59 0.95 0.54 0.54 1.0 0.25 0.35 0.48 0.32 0.31 0.03 0.05 0.03 0.04 0.02 0.02 0.04 0.13
Bra038231 (RH2)
 0.68 0.76 0.74 0.63 0.84 0.81 0.74 0.86 0.49 0.55 0.48 0.69 1.0 0.69 0.84 0.83 0.84 0.95 0.56 0.65 0.53 0.55 0.98 0.42 0.41 0.47 0.51 0.42 0.45 0.5 0.58
0.36 0.35 0.47 0.43 0.82 1.0 0.58 0.38 0.23 0.23 0.21 0.16 0.52 0.47 0.8 0.53 0.45 0.75 0.38 0.51 0.33 0.3 0.64 0.32 0.18 0.18 0.21 0.21 0.16 0.2 0.35
0.58 0.63 0.57 0.43 0.9 0.66 0.62 0.8 0.3 0.35 0.38 0.3 0.68 0.65 0.95 0.54 0.62 0.62 0.48 0.51 0.44 0.47 1.0 0.29 0.37 0.24 0.35 0.37 0.33 0.39 0.42
Bra040197 (SDG31)
 0.32 0.5 0.4 0.46 0.42 0.64 0.64 0.8 0.33 0.43 0.45 0.33 1.0 0.99 0.92 0.93 0.56 0.6 0.45 0.44 0.7 0.61 0.55 0.25 0.23 0.2 0.19 0.25 0.24 0.22 0.26
0.48 0.53 0.43 0.46 0.59 0.58 0.39 0.48 0.34 0.49 0.3 0.37 0.84 0.59 1.0 0.63 0.48 0.76 0.52 0.41 0.39 0.42 0.75 0.26 0.31 0.28 0.35 0.27 0.24 0.28 0.36
0.83 0.83 1.0 0.51 0.83 0.63 0.45 0.42 0.44 0.59 0.48 0.64 0.47 0.84 0.83 0.7 0.55 0.4 0.35 0.5 0.58 0.73 0.36 0.27 0.35 0.36 0.29 0.3 0.4 0.26 0.38

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)