1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_169 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
Bra000420 (SPA1)
 0.26 0.15 0.28 0.26 0.45 0.75 0.75 0.73 0.65 0.61 0.67 0.66 0.51 1.0 0.92 0.82 0.73 0.67 0.74 0.75 0.68 0.72 0.42 0.58 0.61 0.42 0.6 0.66 0.73 0.57 0.6
Bra000534 (HGML)
 0.35 0.32 0.27 0.42 0.52 1.0 0.84 0.49 0.56 0.62 0.6 0.51 0.56 0.83 0.88 0.84 0.78 0.55 0.7 0.89 0.78 0.81 0.54 0.61 0.63 0.55 0.61 0.52 0.58 0.36 0.62
Bra001017 (BPL6)
 0.26 0.22 0.34 0.3 0.44 0.58 0.56 0.61 0.66 0.58 0.61 0.75 0.58 0.98 1.0 0.76 0.81 0.65 0.68 0.69 0.52 0.58 0.57 0.7 0.75 0.58 0.62 0.82 0.74 0.55 0.72
0.27 0.25 0.17 0.16 0.4 0.85 1.0 0.9 0.71 0.46 0.47 0.53 0.57 0.7 0.99 0.75 0.69 0.55 0.81 0.76 0.63 0.61 0.31 0.67 0.6 0.39 0.55 0.58 0.68 0.39 0.67
Bra004024 (ClpS1)
 0.31 0.2 0.18 0.36 0.63 1.0 0.86 0.7 0.74 0.64 0.7 0.71 0.57 0.84 0.79 0.69 0.7 0.58 0.75 0.84 0.75 0.8 0.19 0.64 0.62 0.5 0.63 0.66 0.71 0.5 0.8
0.11 0.06 0.09 0.17 0.42 1.0 0.78 0.42 0.67 0.42 0.56 0.42 0.32 0.87 0.91 0.57 0.47 0.54 0.64 0.64 0.7 0.67 0.11 0.95 0.95 0.29 0.81 0.65 0.8 0.37 0.73
Bra004545 (SPA1)
 0.5 0.39 0.37 0.38 0.7 1.0 0.76 0.74 0.65 0.69 0.61 0.67 0.61 0.79 0.83 0.81 0.7 0.72 0.73 0.75 0.68 0.71 0.46 0.59 0.61 0.48 0.63 0.68 0.72 0.6 0.66
0.44 0.4 0.38 0.34 0.91 1.0 0.8 0.69 0.75 0.61 0.66 0.74 0.6 0.93 0.97 0.86 0.75 0.79 0.74 0.83 0.66 0.83 0.4 0.73 0.71 0.55 0.71 0.75 0.8 0.67 0.78
Bra005714 (NAP9)
 0.08 0.03 0.06 0.05 0.58 0.79 1.0 0.67 0.42 0.4 0.38 0.25 0.32 0.82 0.81 0.63 0.81 0.41 0.81 0.63 0.56 0.78 0.26 0.68 0.86 0.24 0.57 0.61 0.53 0.26 0.11
Bra007164 (PBL1)
 0.32 0.36 0.39 0.37 0.67 0.85 0.42 0.35 0.54 0.45 0.56 0.39 0.39 1.0 0.89 0.58 0.65 0.54 0.54 0.59 0.47 0.58 0.46 0.53 0.46 0.52 0.49 0.52 0.69 0.58 0.51
Bra007762 (CID7)
 0.44 0.44 0.45 0.39 0.74 0.95 0.73 0.66 0.55 0.52 0.48 0.52 0.63 0.94 1.0 0.81 0.83 0.71 0.64 0.74 0.63 0.7 0.51 0.74 0.78 0.66 0.81 0.71 0.77 0.68 0.89
Bra008911 (PHGAP1)
 0.45 0.33 0.32 0.44 0.61 0.7 0.62 0.73 0.73 0.72 0.75 0.68 0.7 1.0 0.94 0.81 0.89 0.86 0.69 0.75 0.62 0.78 0.45 0.73 0.75 0.68 0.72 0.84 0.68 0.59 0.72
Bra011174 (AR2)
 0.12 0.12 0.17 0.21 0.38 0.83 0.72 0.44 0.4 0.41 0.39 0.34 0.45 1.0 0.94 0.79 0.61 0.84 0.66 0.68 0.54 0.55 0.5 0.54 0.54 0.36 0.47 0.39 0.43 0.26 0.51
Bra011921 (ADCS)
 0.43 0.35 0.39 0.37 0.7 1.0 0.81 0.61 0.52 0.58 0.52 0.46 0.54 0.75 0.78 0.87 0.76 0.44 0.6 0.78 0.68 0.7 0.4 0.59 0.65 0.48 0.57 0.57 0.64 0.44 0.59
Bra012241 (NLP4)
 0.18 0.11 0.19 0.16 0.47 1.0 0.5 0.47 0.56 0.37 0.41 0.43 0.29 0.81 0.82 0.51 0.36 0.43 0.53 0.37 0.45 0.43 0.3 0.38 0.41 0.17 0.4 0.4 0.65 0.36 0.55
Bra013085 (PDV2)
 0.34 0.18 0.19 0.42 0.57 1.0 0.94 0.66 0.78 0.64 0.75 0.67 0.61 0.98 0.92 0.77 0.91 0.42 0.76 0.78 0.75 0.57 0.19 0.7 0.71 0.45 0.63 0.63 0.86 0.56 0.89
0.07 0.07 0.04 0.1 0.27 1.0 0.65 0.36 0.6 0.5 0.6 0.51 0.33 0.7 0.86 0.66 0.68 0.21 0.65 0.86 0.79 0.61 0.12 0.53 0.53 0.08 0.47 0.36 0.56 0.21 0.52
0.3 0.17 0.13 0.2 0.46 1.0 0.79 0.53 0.65 0.53 0.64 0.49 0.43 0.71 0.83 0.77 0.69 0.32 0.74 0.84 0.72 0.8 0.14 0.53 0.5 0.31 0.46 0.44 0.46 0.26 0.36
0.31 0.4 0.27 0.34 0.33 0.82 1.0 0.71 0.53 0.41 0.52 0.47 0.37 0.71 0.8 0.68 0.52 0.2 0.62 0.76 0.8 0.87 0.26 0.55 0.62 0.36 0.54 0.46 0.5 0.24 0.4
0.24 0.15 0.15 0.21 0.46 0.89 0.64 0.56 0.56 0.5 0.46 0.46 0.51 1.0 0.9 0.61 0.59 0.41 0.56 0.7 0.56 0.64 0.36 0.41 0.39 0.26 0.41 0.48 0.51 0.3 0.41
Bra015544 (SLP1)
 0.32 0.25 0.22 0.35 0.51 1.0 0.59 0.38 0.48 0.43 0.48 0.38 0.49 0.94 0.8 0.74 0.69 0.43 0.66 0.7 0.64 0.59 0.25 0.42 0.41 0.32 0.38 0.4 0.4 0.18 0.49
Bra015716 (DF1)
 0.51 0.4 0.46 0.33 0.85 0.89 0.72 0.79 0.59 0.58 0.59 0.62 0.9 0.91 0.93 1.0 0.73 0.83 0.65 0.72 0.64 0.78 0.84 0.65 0.64 0.57 0.63 0.52 0.65 0.79 0.94
0.53 0.38 0.46 0.45 1.0 0.98 0.91 0.99 0.81 0.82 0.92 0.78 0.75 0.94 0.93 0.99 0.86 0.74 0.77 0.9 0.78 0.82 0.69 0.69 0.66 0.58 0.67 0.83 0.8 0.76 0.78
Bra017693 (CAT2)
 0.46 0.41 0.35 0.46 0.55 1.0 0.81 0.57 0.62 0.61 0.66 0.54 0.61 0.8 0.83 0.79 0.74 0.54 0.72 0.74 0.74 0.67 0.37 0.53 0.59 0.5 0.58 0.45 0.64 0.45 0.72
Bra018816 (QWRF2)
 0.36 0.34 0.28 0.33 0.7 0.69 0.5 0.43 0.56 0.52 0.56 0.53 0.57 0.84 1.0 0.75 0.71 0.76 0.53 0.59 0.55 0.65 0.41 0.59 0.62 0.57 0.58 0.64 0.66 0.53 0.59
Bra019082 (GGP)
 0.13 0.12 0.08 0.08 0.36 0.68 1.0 0.62 0.88 0.58 0.6 0.54 0.47 0.53 0.64 0.58 0.43 0.54 0.79 0.51 0.51 0.58 0.22 0.57 0.48 0.3 0.45 0.67 0.74 0.6 0.7
Bra020354 (cPT4)
 0.06 0.08 0.05 0.07 0.29 1.0 0.44 0.24 0.36 0.26 0.25 0.19 0.27 0.62 0.62 0.54 0.55 0.25 0.61 0.62 0.34 0.39 0.04 0.25 0.23 0.11 0.22 0.1 0.24 0.1 0.26
0.34 0.42 0.37 0.34 0.91 0.78 0.56 0.55 0.54 0.41 0.57 0.43 0.72 0.89 1.0 0.7 0.68 0.59 0.67 0.64 0.54 0.48 0.51 0.67 0.65 0.38 0.53 0.75 0.65 0.65 0.69
Bra021796 (CSLB03)
 0.1 0.06 0.09 0.05 0.29 1.0 0.64 0.53 0.49 0.35 0.41 0.41 0.33 0.56 0.54 0.54 0.54 0.34 0.5 0.43 0.46 0.42 0.14 0.3 0.27 0.11 0.27 0.17 0.34 0.19 0.52
0.48 0.47 0.57 0.43 0.86 0.84 0.65 0.94 0.51 0.56 0.55 0.44 0.69 0.83 1.0 0.66 0.69 0.65 0.56 0.52 0.47 0.51 0.43 0.79 0.71 0.57 0.65 0.84 0.72 0.51 0.66
0.53 0.43 0.36 0.27 0.76 0.8 0.57 0.65 0.61 0.51 0.51 0.37 0.66 1.0 1.0 0.64 0.6 0.66 0.69 0.51 0.45 0.45 0.51 0.75 0.73 0.59 0.75 0.81 0.75 0.66 0.79
Bra023978 (GPX7)
 0.39 0.29 0.18 0.29 0.41 1.0 0.94 0.57 0.52 0.34 0.43 0.36 0.56 0.72 0.84 0.54 0.53 0.57 0.66 0.63 0.6 0.49 0.21 0.47 0.45 0.36 0.39 0.45 0.48 0.25 0.68
0.42 0.58 0.46 0.47 0.47 1.0 0.77 0.61 0.58 0.41 0.6 0.5 0.45 0.65 0.68 0.63 0.55 0.36 0.63 0.72 0.64 0.62 0.24 0.5 0.55 0.23 0.42 0.51 0.65 0.29 0.45
0.25 0.15 0.22 0.23 0.4 0.81 0.79 0.42 0.46 0.35 0.72 0.34 0.33 0.71 1.0 0.65 0.79 0.27 0.67 0.9 0.59 0.56 0.2 0.88 0.82 0.59 0.75 0.61 0.7 0.34 0.66
0.35 0.27 0.25 0.37 0.52 0.97 0.79 0.63 0.69 0.68 0.69 0.74 0.58 0.96 0.87 0.88 0.86 0.67 0.97 1.0 0.93 0.89 0.51 0.68 0.69 0.46 0.66 0.53 0.54 0.44 0.68
Bra026072 (B4)
 0.44 0.38 0.33 0.28 0.62 0.68 0.59 0.48 0.65 0.63 0.63 0.62 0.71 1.0 0.91 0.82 0.7 0.71 0.68 0.68 0.66 0.75 0.46 0.55 0.59 0.43 0.61 0.55 0.52 0.53 0.7
0.16 0.13 0.13 0.25 0.57 1.0 0.78 0.43 0.54 0.57 0.45 0.4 0.6 0.86 0.97 0.78 0.67 0.32 0.79 0.67 0.67 0.6 0.37 0.49 0.4 0.27 0.4 0.42 0.47 0.18 0.31
Bra027080 (PFA4)
 0.38 0.26 0.29 0.22 0.65 0.96 0.66 0.6 0.61 0.48 0.64 0.54 0.48 0.84 1.0 0.78 0.43 0.72 0.79 0.72 0.59 0.72 0.43 0.64 0.6 0.42 0.54 0.48 0.58 0.54 0.61
Bra027259 (SPA3)
 0.21 0.15 0.21 0.33 0.56 1.0 0.75 0.56 0.44 0.49 0.52 0.39 0.69 0.94 0.96 0.89 0.86 0.72 0.68 0.84 0.72 0.68 0.35 0.61 0.6 0.47 0.58 0.52 0.54 0.29 0.62
Bra027317 (MPK19)
 0.11 0.06 0.05 0.1 0.19 0.63 0.51 0.54 0.34 0.33 0.47 0.39 0.43 0.98 1.0 0.75 0.65 0.52 0.68 0.49 0.56 0.49 0.26 0.31 0.25 0.12 0.23 0.25 0.3 0.14 0.26
0.34 0.32 0.37 0.31 0.6 0.66 0.69 0.83 0.57 0.63 0.47 0.61 1.0 0.77 0.79 0.8 0.7 0.75 0.68 0.7 0.69 0.61 0.77 0.66 0.74 0.38 0.6 0.53 0.7 0.6 0.95
0.2 0.3 0.16 0.21 0.53 0.43 0.28 0.58 0.31 0.36 0.37 0.42 0.61 1.0 0.7 0.46 0.26 0.5 0.56 0.48 0.21 0.31 0.37 0.88 0.58 0.35 0.42 0.48 0.55 0.41 0.6
0.42 0.35 0.36 0.35 0.5 1.0 0.64 0.55 0.45 0.39 0.41 0.4 0.36 0.68 0.78 0.71 0.62 0.27 0.63 0.62 0.62 0.66 0.28 0.57 0.46 0.2 0.47 0.44 0.58 0.4 0.47
0.42 0.25 0.24 0.23 1.0 0.86 0.92 0.92 0.67 0.7 0.56 0.64 0.81 1.0 0.81 0.84 0.81 0.51 0.78 0.85 0.68 0.83 0.5 0.68 0.88 0.45 0.61 0.69 0.64 0.6 0.49
Bra029396 (SOS3)
 0.24 0.18 0.18 0.06 0.43 1.0 0.5 0.46 0.43 0.38 0.34 0.28 0.41 0.82 0.89 0.57 0.58 0.46 0.49 0.7 0.5 0.56 0.17 0.52 0.5 0.33 0.41 0.34 0.45 0.28 0.41
0.09 0.04 0.03 0.13 0.41 0.93 0.81 0.51 0.43 0.51 0.47 0.3 0.6 0.86 0.96 0.99 0.83 0.46 0.85 1.0 0.75 0.68 0.35 0.53 0.54 0.34 0.37 0.34 0.26 0.1 0.24
0.3 0.2 0.2 0.2 0.64 1.0 0.53 0.46 0.68 0.51 0.49 0.55 0.49 0.62 0.66 0.52 0.46 0.42 0.59 0.52 0.67 0.52 0.22 0.38 0.34 0.25 0.34 0.33 0.55 0.39 0.48
0.28 0.25 0.32 0.34 0.63 0.56 0.59 0.66 0.45 0.51 0.47 0.55 0.79 0.72 0.67 0.58 0.6 0.49 0.47 0.55 0.45 0.51 0.78 0.4 0.35 0.35 0.35 0.34 0.32 0.64 1.0
Bra031181 (FBA1)
 0.09 0.07 0.05 0.08 0.29 0.94 0.82 0.41 0.44 0.42 0.39 0.26 0.5 0.84 1.0 0.66 0.86 0.63 0.97 0.69 0.63 0.58 0.15 0.47 0.35 0.17 0.31 0.23 0.26 0.1 0.25
Bra031711 (ALA3)
 0.32 0.2 0.18 0.25 0.55 0.99 1.0 0.85 0.75 0.61 0.66 0.71 0.5 0.73 0.8 0.76 0.73 0.5 0.72 0.75 0.66 0.65 0.28 0.69 0.71 0.55 0.73 0.67 0.71 0.59 0.73
Bra031898 (ABCF5)
 0.47 0.35 0.32 0.41 0.48 1.0 0.61 0.54 0.6 0.54 0.63 0.6 0.47 0.78 0.74 0.67 0.59 0.54 0.74 0.64 0.65 0.59 0.26 0.61 0.63 0.53 0.59 0.62 0.68 0.48 0.78
0.12 0.1 0.11 0.2 0.35 1.0 0.59 0.34 0.37 0.48 0.57 0.28 0.38 0.95 0.86 0.78 0.66 0.4 0.64 0.63 0.81 0.66 0.23 0.37 0.38 0.21 0.38 0.19 0.34 0.14 0.38
Bra033801 (CRR2)
 0.47 0.46 0.48 0.44 0.71 0.86 0.63 0.54 0.6 0.55 0.56 0.55 0.61 0.89 1.0 0.9 0.78 0.71 0.66 0.8 0.7 0.74 0.53 0.57 0.51 0.36 0.5 0.57 0.65 0.43 0.63
Bra034181 (AOP)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.37 0.15 0.34 0.28 0.13 0.38 0.23 0.3 1.0 0.74 0.38 0.2 0.32 0.14 0.33 0.11 0.45 0.2 0.47 0.61 0.42 0.13 0.16 0.53 0.1 0.4
0.3 0.34 0.31 0.31 0.51 0.86 0.56 0.53 0.77 0.55 0.63 0.65 0.45 0.89 1.0 0.64 0.66 0.65 0.72 0.71 0.71 0.76 0.39 0.73 0.76 0.55 0.76 0.63 0.84 0.67 0.81
Bra035042 (SPS1)
 0.27 0.2 0.18 0.29 0.46 1.0 0.79 0.55 0.35 0.38 0.38 0.28 0.44 0.58 0.64 0.7 0.62 0.34 0.51 0.68 0.62 0.58 0.22 0.46 0.45 0.3 0.42 0.4 0.42 0.21 0.33
Bra035994 (ARD4)
 0.09 0.04 0.02 0.07 0.26 0.74 0.62 0.41 0.42 0.31 0.38 0.33 0.3 0.56 1.0 0.52 0.5 0.21 0.58 0.38 0.41 0.43 0.05 0.27 0.28 0.19 0.27 0.21 0.27 0.15 0.36
Bra036015 (GLK2)
 0.25 0.19 0.16 0.15 0.47 0.91 0.77 0.67 0.64 0.55 0.56 0.56 0.59 1.0 0.93 0.68 0.85 0.56 0.68 0.64 0.7 0.61 0.21 0.57 0.52 0.1 0.44 0.43 0.51 0.34 0.75
Bra036342 (CYP71B4)
 0.29 0.27 0.21 0.16 0.58 1.0 0.62 0.56 0.5 0.47 0.44 0.4 0.52 0.87 0.93 0.72 0.62 0.56 0.71 0.64 0.57 0.63 0.18 0.51 0.48 0.22 0.46 0.37 0.52 0.44 0.66
Bra036606 (EGR2)
 0.21 0.11 0.2 0.21 0.69 1.0 0.6 0.5 0.32 0.4 0.4 0.36 0.48 0.87 0.87 0.66 0.55 0.64 0.44 0.66 0.51 0.51 0.67 0.52 0.54 0.44 0.48 0.37 0.45 0.68 0.81
Bra036760 (FBH1)
 0.38 0.36 0.32 0.37 0.65 1.0 0.68 0.54 0.55 0.46 0.51 0.54 0.65 0.79 0.9 0.81 0.78 0.73 0.72 0.79 0.65 0.6 0.39 0.61 0.63 0.41 0.59 0.52 0.68 0.51 0.82
0.3 0.28 0.16 0.15 0.98 0.99 0.7 0.62 0.37 0.47 0.51 0.44 0.62 1.0 0.96 0.95 0.74 0.48 0.64 0.54 0.52 0.58 0.37 0.52 0.53 0.2 0.51 0.62 0.65 0.75 1.0
0.34 0.27 0.49 0.37 0.77 0.95 0.52 0.4 0.44 0.54 0.46 0.44 0.43 0.98 1.0 0.7 0.72 0.64 0.52 0.57 0.5 0.51 0.36 0.49 0.56 0.67 0.49 0.4 0.6 0.61 0.75
Bra037942 (DCC1)
 0.26 0.2 0.16 0.3 0.51 1.0 0.93 0.62 0.48 0.48 0.51 0.45 0.58 0.86 0.89 0.74 0.71 0.76 0.76 0.8 0.73 0.69 0.43 0.7 0.65 0.46 0.59 0.5 0.51 0.34 0.48
Bra038381 (NdhT)
 0.23 0.17 0.15 0.27 0.32 0.85 0.53 0.4 0.53 0.48 0.55 0.53 0.45 0.83 1.0 0.66 0.71 0.38 0.62 0.74 0.73 0.69 0.22 0.55 0.56 0.37 0.51 0.47 0.55 0.27 0.6
Bra038934 (RXW8)
 0.24 0.19 0.27 0.36 0.43 1.0 0.78 0.59 0.58 0.43 0.56 0.46 0.63 0.96 0.84 0.88 0.77 0.58 0.66 0.73 0.67 0.68 0.21 0.45 0.44 0.49 0.45 0.43 0.5 0.36 0.47
0.42 0.34 0.38 0.33 0.67 1.0 0.63 0.46 0.5 0.45 0.5 0.47 0.37 0.77 0.91 0.78 0.6 0.51 0.6 0.56 0.54 0.59 0.41 0.58 0.5 0.36 0.5 0.59 0.69 0.47 0.74
Bra040519 (HAT5)
 0.04 0.02 0.03 0.03 0.2 0.53 0.45 0.24 0.27 0.24 0.28 0.22 0.33 1.0 0.97 0.75 0.39 0.56 0.55 0.51 0.36 0.36 0.07 0.34 0.28 0.09 0.2 0.12 0.17 0.08 0.16

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)