Heatmap: Cluster_287 (Brassica rapa (Bra) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light: 268 uE m-2 s-1
Light: 202.5 uE m-2 s-1 (Control)
Light: 135 uE m-2 s-1
Light: 67.5 uE m-2 s-1
Photoperiod: L24
Photoperiod: L20D4 (Control)
Photoperiod: L12D12
Photoperiod: L8D16
RBW: 4:1:1 (Control)
RBW: 4:1:0
RBW: 3:1:1
RBW: 3:1:0
Nitrogen: 0%
Nitrogen: 25%
Nitrogen: 50%
Nitrogen: 100% (Control)
Nitrogen: 150%
Phosphorous: 0%
Phosphorous: 25%
Phosphorous: 50%
Phosphorous: 100% (Control)
Phosphorous: 150%
Potassium: 0%
Potassium: 25%
Potassium: 50%
Potassium: 100% (Control)
Potassium: 150%
Temperature: 20°C
Temperature: 25°C (Control)
Temperature: 30°C
Temperature: 35°C
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra001556 (AtGGPS9)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra002847 (MS188)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra003258 (PIP5K5)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra004433 (BGLU2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra004535 (LGT2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra006396 (GAD)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra006508 (MSL9)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra006977 (MYB27)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra007536 (DUO1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra009546 (LUL1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra010679 (CYP96A8)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra013897 (SLK3)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra014454 (AGL13)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra014830 (PRPL17)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra015360 (MyoB15)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra015769 (IME)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra016272 (AtBBE4)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra018650 (CHX6A)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra020431 (AtDOA16)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra020976 (ML3)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra021112 (ISTL11)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra021198 (BGAL15)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra023123 (AtBBE9)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra024803 (ARPN)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra025930 (MFT)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra029571 (NAC023)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra031357 (DD46)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra032476 (PRX2)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra032964 (CDG1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra033334 (MEA)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra034151 (XCD1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra035879 (AtVEX1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra037329 (FRD1)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95
Bra041121 (FIE)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.95

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.