Heatmap: Cluster_94 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
Mp1g00960.1 (PEX4)
0.13 -0.27 -0.3 0.03 0.41 0.18 0.31 0.06 -0.09 -0.34 0.06 0.01 0.05 0.09 -0.09 0.29 -0.01 0.32 -0.25 0.19 0.13 -0.25 0.32 -0.23 0.05 0.24 0.01 0.11 0.17 -0.45 -0.88 -1.01
0.1 -0.66 -0.51 0.29 0.1 0.1 0.47 0.27 -0.99 -0.98 -0.48 -0.31 -0.26 -0.19 0.32 0.4 0.34 0.28 -0.25 0.13 0.18 -0.12 0.54 -0.39 0.13 0.34 0.08 0.22 0.1 -0.18 -0.28 -0.38
Mp1g15760.1 (GLYI2)
0.12 -0.7 -0.78 0.46 0.38 0.12 0.37 0.14 -0.52 -0.72 -0.28 -0.14 -0.29 -0.11 0.39 0.55 0.4 0.62 -0.65 0.26 0.08 -0.41 0.54 -0.72 0.19 0.3 -0.11 0.28 0.29 -0.51 -0.95 -1.01
Mp1g16540.1 (UMAMIT11)
-0.06 -0.45 -0.42 0.22 -0.06 -0.05 -0.03 -0.16 0.3 -0.15 -0.11 0.31 -0.09 0.24 0.38 0.38 0.33 0.37 -0.51 -0.0 0.18 -0.13 0.34 -0.45 0.15 0.34 -0.19 0.02 0.04 -0.52 -0.54 -0.71
Mp1g21820.1 (VLN5)
0.09 -0.47 -0.41 0.26 0.38 0.24 -0.16 0.31 -0.09 -0.59 0.08 -0.68 -0.1 -0.47 0.41 -0.01 0.46 0.48 -0.22 0.35 -0.03 -0.49 0.26 -0.3 0.26 0.08 0.17 0.2 0.28 -0.47 -0.52 -0.72
0.12 -0.33 -0.38 0.22 0.16 0.26 -0.08 0.1 -0.06 -0.5 0.09 -0.42 -0.16 -0.32 0.15 0.11 0.16 0.2 -0.23 0.3 0.12 -0.38 0.26 -0.36 0.15 0.26 0.18 0.35 0.36 -0.28 -0.36 -0.53
-0.73 -2.17 -0.39 1.27 0.96 -1.18 0.42 -0.69 -0.18 -1.11 -1.72 -0.88 -1.36 0.31 0.84 1.61 1.05 0.24 -0.03 0.11 -0.79 0.26 1.35 -0.24 -0.92 -0.48 -1.55 -1.19 -1.01 -0.48 -0.67 -0.63
Mp2g07620.1 (ATL49)
-0.05 -0.14 -0.13 0.3 -0.27 -0.03 -0.05 -0.13 0.23 -0.38 0.25 0.14 -0.02 0.07 0.14 0.28 0.28 0.26 -0.29 0.04 0.06 -0.1 0.22 -0.17 -0.04 0.3 -0.14 0.08 0.17 -0.45 -0.53 -0.53
Mp2g09190.1 (TASH3)
0.15 -0.33 -0.1 0.27 -0.06 0.06 0.29 -0.04 -0.23 -0.29 -0.07 -0.09 -0.17 -0.06 0.23 0.38 0.26 0.1 -0.15 -0.01 -0.13 -0.08 0.27 -0.43 0.01 0.18 -0.18 0.13 0.25 0.12 -0.22 -0.63
Mp2g17400.1 (PFD4)
-0.1 -0.53 -0.69 0.1 -0.03 -0.03 0.23 0.0 -0.74 -0.73 0.2 0.14 -0.03 -0.34 0.21 0.61 0.04 0.47 0.13 0.24 0.29 -0.25 0.42 0.04 0.31 0.29 -0.36 -0.38 -0.11 -0.05 -0.18 -0.47
-0.21 -0.5 -0.7 0.23 0.06 -0.01 0.12 0.05 -0.63 -0.07 0.34 -0.1 0.34 -0.27 0.23 0.59 0.15 0.47 -0.1 0.44 0.16 -0.52 0.3 -0.25 0.29 0.2 -0.04 -0.17 -0.14 -0.27 -0.63 -0.65
-0.07 -0.73 -0.55 0.21 0.19 0.41 0.34 0.21 -1.08 -0.83 -0.4 -0.25 -0.35 -0.24 0.39 0.54 0.46 0.53 -0.56 0.43 0.39 -0.37 0.51 -0.37 0.23 0.34 -0.22 -0.14 0.05 -0.13 -0.36 -0.65
Mp3g02910.1 (CLT1)
-0.03 -0.61 -0.54 0.12 0.09 0.12 0.2 0.07 -0.5 -0.65 -0.34 -0.06 -0.39 -0.05 0.44 0.49 0.41 0.41 -0.45 0.27 0.2 -0.42 0.55 -0.38 0.17 0.22 -0.3 -0.18 0.06 0.06 -0.07 -0.16
-0.11 -0.8 -0.46 0.29 0.03 0.18 0.33 0.11 -0.4 -0.49 -0.17 -0.58 -0.15 -0.31 0.31 0.58 0.38 0.31 -0.25 0.29 0.25 -0.22 0.49 -0.36 0.35 0.38 0.12 -0.03 -0.01 -0.28 -0.58 -0.67
0.09 -0.33 -0.91 0.49 0.5 0.19 -0.28 0.07 0.21 -0.6 0.1 -0.97 0.21 -0.33 0.55 0.1 0.47 0.38 -0.52 0.53 0.07 -0.78 0.15 -0.64 0.24 0.04 0.33 0.26 0.21 -0.76 -0.69 -0.62
Mp3g19880.1 (AtSEC23A)
0.55 -0.07 -1.25 0.32 0.58 0.42 0.07 0.26 -1.28 -0.98 -0.03 -0.76 -0.46 -0.02 0.58 0.25 0.63 0.5 -0.73 0.53 -0.02 -1.18 0.39 -1.34 0.21 0.2 0.48 0.07 0.26 -0.59 -0.64 -0.91
0.06 -0.63 -0.86 0.56 0.19 -0.01 -0.08 -0.07 0.02 -0.25 -0.29 -0.49 -0.26 -0.39 0.53 0.48 0.69 0.28 -0.39 0.25 -0.05 -0.39 0.24 -0.42 -0.01 0.08 0.1 0.52 0.27 -0.18 -0.56 -0.57
0.03 -0.92 -0.69 0.42 -0.11 -0.24 0.11 -0.28 -0.1 -0.18 -0.03 -0.16 -0.27 -0.25 0.3 0.47 0.55 0.49 -0.33 0.2 0.14 -0.16 0.67 -0.52 0.11 0.55 -0.09 0.11 0.09 -0.41 -0.56 -0.59
Mp4g03720.1 (HCAR)
-0.03 -0.84 -0.59 0.11 0.22 0.19 0.34 0.26 -0.91 -1.13 -0.37 -0.56 -0.36 -0.23 0.37 0.51 0.26 0.47 -0.08 0.41 0.23 -0.19 0.51 -0.34 0.34 0.33 -0.07 -0.07 -0.01 0.04 -0.18 -0.49
-0.16 -1.35 -0.62 0.28 0.2 0.18 0.4 0.11 -0.89 -1.01 -1.02 -0.62 -0.96 -0.13 0.39 0.68 0.52 0.64 -0.15 0.57 0.33 -0.26 0.68 -0.29 0.41 0.46 -0.13 -0.06 0.01 -0.27 -0.49 -0.67
Mp4g07000.1 (PATROL1)
0.19 -0.03 -0.39 0.23 -0.29 0.13 0.18 0.1 -0.76 -0.66 0.04 -0.19 0.04 -0.19 0.22 0.34 0.3 0.17 -0.24 0.18 -0.01 -0.25 0.21 -0.49 0.03 0.19 0.22 0.12 0.28 -0.02 -0.11 -0.35
0.31 -1.32 -0.86 0.74 0.02 -0.35 0.57 -0.04 -0.64 -0.8 -0.6 -0.3 -0.58 -0.03 0.22 0.8 0.59 0.29 -0.04 0.1 0.05 -0.19 0.83 -0.36 -0.34 0.53 -0.19 0.16 0.3 -0.45 -0.5 -1.05
0.28 -0.82 -0.24 0.49 0.15 0.01 1.04 -0.28 -1.23 -0.64 -0.92 -0.49 -0.93 -0.09 0.12 0.93 0.57 0.3 -0.16 -0.04 -0.16 -0.44 0.95 -0.51 -0.23 0.43 0.03 0.16 0.31 -0.23 -1.01 -1.26
-0.12 -1.03 -0.52 0.52 -0.19 -0.64 0.63 -0.3 0.01 -0.13 -0.48 0.15 -0.52 0.12 0.26 0.76 0.53 0.32 0.13 -0.02 -0.17 -0.17 0.72 -0.22 -0.4 0.39 -0.45 -0.06 -0.0 -0.23 -0.23 -0.65
0.08 -0.79 -0.29 0.47 -0.13 -0.42 0.9 -0.08 -0.22 -0.27 -1.02 -0.25 -0.65 0.21 0.12 0.64 0.47 0.11 0.25 -0.25 -0.17 -0.18 0.5 -0.16 -0.63 0.2 -0.44 0.14 0.09 0.13 0.02 -0.24
-0.17 -0.77 -0.35 0.81 -0.06 -0.59 0.52 -0.23 0.03 -0.68 -0.51 -0.25 -0.7 0.2 0.49 0.82 0.59 0.27 0.09 0.04 -0.36 -0.25 0.62 0.03 -0.62 -0.11 -0.62 -0.11 0.23 0.01 -0.05 -0.58
Mp4g15510.1 (OPT2)
0.04 -0.51 -2.34 0.78 -0.76 0.08 0.43 -0.01 -1.47 -1.15 -0.03 -0.17 -0.13 -0.5 0.44 0.68 0.78 -0.07 -1.24 0.26 0.34 -1.72 0.79 -1.67 0.21 0.65 0.02 0.71 0.62 -0.18 -0.51 -0.49
Mp4g21570.1 (PERK11)
-0.3 -0.71 -0.64 0.25 -0.17 0.07 0.23 -0.06 -0.37 -0.95 -0.08 -0.14 -0.13 -0.37 0.42 0.61 0.32 0.57 -0.15 0.41 0.48 -0.18 0.46 -0.18 0.47 0.42 -0.26 -0.23 -0.1 -0.28 -0.49 -0.73
-0.09 -0.51 -0.47 0.12 0.13 0.17 0.25 0.18 -0.4 -0.42 -0.1 -0.09 0.01 -0.14 0.15 0.6 0.2 0.48 -0.08 0.35 0.22 -0.19 0.39 -0.21 0.29 0.18 -0.23 -0.26 -0.08 -0.26 -0.47 -0.81
Mp5g05950.1 (RSZ33)
-0.34 -0.32 -0.39 0.32 0.09 0.06 0.16 -0.1 -0.12 -0.2 0.07 0.08 -0.14 0.1 0.34 0.59 0.33 0.58 -0.47 0.45 0.31 -0.22 0.53 -0.48 0.34 0.4 -0.97 -0.61 -0.34 -0.41 -0.71 -0.77
0.15 -0.53 -0.96 0.37 0.04 0.29 0.5 0.19 -0.74 -0.9 -0.18 -0.13 -0.43 -0.16 0.29 0.64 0.27 0.04 -0.19 0.32 -0.01 -0.36 0.45 -0.62 0.04 0.19 0.06 0.38 0.19 -0.17 -0.3 -0.45
0.05 -0.72 -0.65 0.23 0.17 0.07 0.24 -0.06 -0.92 -0.82 -0.02 -0.47 -0.19 0.17 0.31 0.41 0.22 0.19 -0.04 0.25 0.19 -0.07 0.54 -0.26 0.08 0.26 0.05 0.03 0.23 -0.2 -0.21 -0.36
-0.23 -0.43 -0.33 0.01 -0.14 0.12 0.04 -0.13 -0.37 -0.41 0.08 0.12 -0.14 -0.06 0.43 0.42 0.27 0.34 -0.19 0.36 0.3 -0.19 0.41 -0.03 0.34 0.35 -0.66 -0.4 -0.26 -0.15 -0.09 -0.33
Mp5g13440.1 (GGH2)
0.44 -1.39 -2.25 0.77 -0.11 -0.31 0.55 -0.28 -3.51 -1.81 -3.06 -0.93 -2.71 0.29 0.52 1.11 0.92 0.49 -0.74 0.1 0.1 -0.34 1.5 -1.1 -0.57 0.95 -0.35 0.12 -0.0 -0.13 0.13 -0.47
Mp5g18590.1 (PBAC2)
-0.07 -0.64 -0.48 0.13 -0.2 0.33 0.38 0.17 -0.49 -0.67 -0.02 -0.11 -0.09 -0.14 0.28 0.6 0.2 0.34 -0.37 0.33 0.32 -0.29 0.39 -0.24 0.46 0.35 -0.22 -0.18 -0.15 -0.24 -0.36 -0.71
Mp5g19950.1 (BGAL8)
-0.28 -0.74 -0.93 1.4 0.96 -0.76 0.77 -1.1 -3.32 -1.66 -2.75 -0.33 -1.72 0.21 0.42 1.59 0.94 -0.02 -0.52 0.15 0.16 0.43 1.25 -0.66 -1.24 0.03 -0.41 -1.01 -0.96 -1.26 -0.45 -0.01
-0.09 -1.6 -0.78 0.35 -0.05 -0.06 0.31 -0.0 -1.09 -0.77 -1.07 -0.64 -1.1 0.08 0.43 0.38 0.45 0.79 -0.51 0.41 0.51 -0.23 0.82 -0.45 0.4 0.65 -0.14 0.16 0.19 -0.19 -0.36 -0.39
-0.07 -0.69 0.05 0.77 0.47 -0.51 0.22 -0.53 -0.2 -0.45 -0.93 -0.38 -0.81 0.51 0.33 0.8 0.44 0.17 0.32 -0.11 -0.47 0.48 0.77 0.21 -0.71 -0.15 -0.18 -0.19 -0.23 -0.6 -0.44 -0.48
Mp6g14180.1 (ATB2)
0.49 -0.35 -0.7 0.97 0.57 0.5 -0.12 0.5 -2.15 -1.23 -0.2 -1.68 -0.58 -0.63 0.57 0.15 0.66 0.33 -0.47 0.21 0.08 -1.4 0.14 -0.61 0.13 0.01 0.2 0.47 0.33 -0.07 -0.32 -0.5
Mp6g21020.1 (CASP)
-0.02 -0.95 -0.34 0.41 0.05 -0.03 0.45 0.01 -0.34 -0.59 -0.41 -0.25 -0.46 -0.49 0.37 0.73 0.5 0.36 -0.23 0.19 0.15 -0.1 0.62 -0.36 0.13 0.38 -0.08 -0.05 -0.03 -0.27 -0.42 -0.68
Mp7g03180.1 (DJC82)
-0.11 -0.71 -0.44 0.24 0.3 -0.12 0.09 0.02 -0.07 -0.21 -0.22 -0.25 -0.01 0.18 0.15 0.27 0.31 0.42 -0.14 0.24 0.12 -0.21 0.66 -0.03 0.08 0.34 -0.05 0.19 0.01 -0.64 -0.77 -0.91
Mp7g09720.1 (PFU2)
0.18 -0.28 -0.32 0.26 0.14 0.19 0.28 0.02 -0.07 -0.23 -0.07 -0.18 -0.31 -0.23 0.12 0.27 0.21 0.23 -0.2 0.21 0.08 -0.25 0.38 -0.37 0.07 0.31 -0.02 0.16 0.24 -0.39 -0.51 -0.69
Mp7g14540.1 (AtCDC48C)
0.18 -0.64 -1.24 0.83 -0.43 0.33 0.14 0.01 0.04 -0.2 -0.44 -0.97 -0.67 -0.2 0.43 0.62 0.69 0.01 -1.04 0.23 0.2 -1.08 0.39 -1.39 0.53 0.32 0.43 0.57 0.75 -1.03 -0.74 -1.03
-0.03 -0.63 -0.78 0.27 0.05 -0.0 0.2 -0.12 0.07 -0.36 -0.05 0.07 -0.08 -0.09 0.53 0.59 0.35 0.55 -0.51 0.25 0.23 -0.21 0.62 -0.41 0.2 0.32 -0.16 -0.0 0.0 -0.78 -0.99 -1.13
-0.01 -1.23 -0.77 0.65 0.15 -0.24 0.54 -0.19 -0.91 -0.75 -0.74 -0.09 -0.74 -0.22 0.4 0.88 0.53 0.62 -0.25 0.39 0.19 -0.3 1.03 -0.5 -0.25 0.52 -0.62 0.05 0.16 -0.45 -0.57 -0.86
Mp8g04920.1 (KCS8)
0.13 -1.08 -0.06 0.58 0.26 -0.39 0.46 -0.13 -0.49 -0.74 -0.57 -0.09 -0.75 -0.11 0.26 0.77 0.45 0.41 -0.05 0.07 -0.05 -0.25 0.76 -0.27 -0.43 0.55 -0.46 -0.04 0.19 -0.15 -0.29 -0.76
0.23 -0.04 -0.19 0.52 0.01 0.13 0.58 0.22 -1.37 -0.92 -0.36 -0.3 -0.02 -1.07 0.1 0.65 0.34 0.15 -0.56 0.11 0.12 -0.55 0.63 -1.06 0.09 0.34 0.1 0.41 0.32 0.01 -0.63 -0.73
0.13 -0.44 -0.35 0.12 0.45 0.09 0.36 0.09 -0.44 -0.35 0.12 -0.3 0.04 0.21 -0.09 0.16 0.0 0.3 -0.41 0.2 0.02 -0.24 0.48 -0.6 0.15 0.16 0.19 0.2 0.13 -0.34 -0.49 -0.53
-0.31 -0.81 -0.56 0.18 0.11 0.23 0.31 0.03 -0.68 -0.91 -0.09 -0.25 -0.25 -0.24 0.44 0.55 0.33 0.38 0.0 0.56 0.29 -0.33 0.42 -0.03 0.4 0.27 -0.34 -0.11 -0.08 -0.29 -0.33 -0.59
Mp8g18200.1 (HIT1)
0.05 -0.64 -0.5 0.34 -0.12 0.08 0.34 0.01 -0.39 -0.66 0.03 -0.16 -0.12 -0.28 0.27 0.55 0.31 0.33 -0.13 0.24 0.21 -0.06 0.43 -0.43 0.22 0.41 -0.3 -0.11 -0.04 -0.18 -0.32 -0.52
-0.27 -0.82 -0.13 0.95 -0.38 -0.55 0.82 -0.43 -0.23 -0.88 -0.52 -0.77 -0.37 -0.7 0.72 0.78 0.86 0.03 0.26 -0.12 -0.31 -0.06 0.47 -0.2 -0.5 0.08 -0.54 0.1 0.24 -0.05 -0.09 -0.37

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.