Heatmap: Cluster_170 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.42 0.68 0.04 0.32 0.18 0.56 0.58 0.46 0.13 0.49 0.95 0.83 1.0 0.07 0.34 0.46 0.34 0.35 0.15 0.38 0.56 0.06 0.45 0.06 0.64 0.61 0.37 0.38 0.35 0.34 0.38 0.42
0.47 0.61 0.04 0.4 0.17 0.53 0.57 0.49 0.12 0.59 1.0 0.85 1.0 0.09 0.44 0.56 0.39 0.35 0.22 0.49 0.66 0.08 0.5 0.04 0.82 0.71 0.4 0.35 0.29 0.4 0.41 0.4
Mp1g03460.1 (APG5)
0.38 0.67 0.06 0.26 0.26 0.55 0.52 0.61 0.18 0.31 0.76 1.0 0.79 0.03 0.3 0.27 0.25 0.55 0.15 0.45 0.5 0.09 0.43 0.05 0.58 0.53 0.35 0.3 0.33 0.41 0.38 0.36
Mp1g14960.1 (FRO7)
0.15 0.45 0.01 0.1 0.15 0.2 0.23 0.23 0.05 0.18 0.67 0.3 1.0 0.02 0.11 0.11 0.13 0.48 0.02 0.35 0.25 0.01 0.29 0.02 0.21 0.25 0.16 0.16 0.17 0.09 0.1 0.12
Mp1g15800.1 (SDG35)
0.25 0.7 0.11 0.31 0.2 0.42 0.45 0.34 0.12 0.43 1.0 0.9 0.99 0.1 0.36 0.36 0.34 0.5 0.14 0.47 0.46 0.15 0.39 0.1 0.54 0.49 0.26 0.24 0.22 0.2 0.19 0.15
0.43 0.58 0.27 0.34 0.25 0.57 0.6 0.55 0.35 0.4 0.8 1.0 0.81 0.1 0.4 0.43 0.36 0.55 0.36 0.48 0.6 0.36 0.52 0.32 0.65 0.63 0.48 0.37 0.38 0.41 0.48 0.47
0.17 0.35 0.04 0.1 0.05 0.32 0.55 0.31 0.03 0.12 0.43 1.0 0.47 0.01 0.36 0.35 0.31 0.18 0.07 0.18 0.55 0.05 0.2 0.12 0.33 0.51 0.11 0.1 0.13 0.16 0.11 0.1
Mp1g23480.1 (UGE5)
0.25 0.84 0.04 0.27 0.17 0.29 0.52 0.28 0.17 0.32 0.79 1.0 0.99 0.08 0.28 0.48 0.31 0.28 0.06 0.29 0.32 0.06 0.42 0.05 0.33 0.41 0.4 0.28 0.22 0.11 0.13 0.14
0.13 0.48 0.07 0.15 0.08 0.24 0.31 0.31 0.06 0.17 0.74 1.0 0.87 0.03 0.32 0.14 0.39 0.23 0.04 0.3 0.37 0.04 0.43 0.04 0.57 0.43 0.2 0.1 0.15 0.11 0.07 0.06
Mp2g03770.1 (SHM4)
0.23 0.6 0.07 0.3 0.07 0.56 0.5 0.35 0.06 0.13 0.85 1.0 0.72 0.09 0.43 0.49 0.36 0.29 0.1 0.36 0.54 0.07 0.29 0.08 0.57 0.45 0.17 0.23 0.34 0.21 0.17 0.09
Mp2g06730.1 (PYR6)
0.3 0.71 0.05 0.29 0.21 0.43 0.51 0.4 0.11 0.4 0.66 1.0 0.84 0.04 0.3 0.31 0.3 0.45 0.09 0.43 0.46 0.08 0.44 0.03 0.53 0.49 0.25 0.23 0.31 0.25 0.17 0.13
0.41 0.79 0.07 0.6 0.24 0.65 0.56 0.61 0.18 0.48 0.98 0.74 1.0 0.09 0.65 0.61 0.68 0.46 0.1 0.55 0.6 0.08 0.43 0.04 0.75 0.61 0.56 0.47 0.48 0.48 0.34 0.26
0.51 0.89 0.14 0.63 0.4 0.52 0.53 0.51 0.16 0.6 0.75 0.71 1.0 0.09 0.7 0.52 0.7 0.45 0.14 0.67 0.51 0.11 0.39 0.08 0.59 0.53 0.45 0.53 0.5 0.3 0.21 0.14
0.38 0.87 0.21 0.51 0.41 0.45 0.55 0.46 0.34 0.48 0.93 0.81 1.0 0.27 0.53 0.65 0.52 0.59 0.29 0.59 0.48 0.27 0.65 0.22 0.52 0.56 0.52 0.37 0.3 0.25 0.33 0.35
Mp2g21450.1 (CIP4)
0.0 0.29 0.0 0.01 0.0 0.04 0.17 0.05 0.0 0.15 0.39 1.0 0.76 0.0 0.05 0.01 0.02 0.01 0.0 0.05 0.13 0.0 0.05 0.0 0.12 0.62 0.02 0.02 0.01 0.04 0.0 0.0
0.27 0.3 0.06 0.21 0.06 0.34 0.63 0.11 0.07 0.29 0.47 1.0 0.32 0.01 0.25 0.33 0.27 0.15 0.1 0.14 0.44 0.08 0.39 0.02 0.23 0.69 0.25 0.17 0.2 0.2 0.2 0.21
Mp3g00710.1 (RAB1C)
0.71 0.73 0.45 0.51 0.56 0.74 0.77 0.65 0.62 0.64 0.9 1.0 0.94 0.37 0.48 0.61 0.49 0.7 0.54 0.65 0.7 0.54 0.76 0.57 0.73 0.81 0.67 0.66 0.66 0.53 0.55 0.58
0.19 0.41 0.05 0.12 0.12 0.37 0.25 0.46 0.31 0.21 0.84 0.67 1.0 0.02 0.23 0.12 0.33 0.98 0.19 0.39 0.49 0.12 0.35 0.11 0.42 0.44 0.28 0.18 0.14 0.1 0.13 0.09
0.49 0.6 0.27 0.39 0.21 0.6 1.0 0.48 0.27 0.53 0.95 0.91 0.85 0.04 0.79 0.48 0.5 0.33 0.05 0.39 0.72 0.13 0.52 0.01 0.83 0.83 0.43 0.44 0.42 0.48 0.32 0.23
0.28 0.59 0.18 0.32 0.19 0.39 0.6 0.34 0.26 0.36 0.68 1.0 0.74 0.26 0.37 0.4 0.33 0.33 0.23 0.42 0.49 0.26 0.51 0.15 0.52 0.51 0.27 0.28 0.28 0.18 0.15 0.12
Mp3g13670.1 (STL2)
0.39 0.83 0.15 0.37 0.23 0.45 0.52 0.43 0.43 0.34 0.83 0.9 1.0 0.09 0.45 0.5 0.45 0.49 0.15 0.42 0.42 0.19 0.46 0.11 0.49 0.52 0.47 0.38 0.35 0.29 0.3 0.33
0.13 0.44 0.03 0.19 0.09 0.25 0.57 0.28 0.03 0.44 0.91 1.0 0.81 0.0 0.56 0.23 0.36 0.21 0.06 0.33 0.49 0.07 0.4 0.01 0.71 0.58 0.16 0.16 0.1 0.09 0.09 0.06
0.22 0.76 0.03 0.3 0.2 0.35 0.38 0.34 0.03 0.34 0.61 0.97 1.0 0.01 0.22 0.31 0.3 0.37 0.05 0.45 0.28 0.04 0.42 0.04 0.49 0.36 0.28 0.27 0.21 0.15 0.14 0.11
Mp3g22920.1 (RAD51)
0.39 0.64 0.01 0.39 0.07 0.65 0.52 0.62 0.02 0.6 0.89 0.83 1.0 0.17 0.46 0.52 0.4 0.34 0.04 0.4 0.6 0.04 0.24 0.04 0.8 0.59 0.3 0.44 0.58 0.42 0.23 0.16
Mp4g07590.1 (WAV3)
0.05 0.43 0.0 0.02 0.19 0.16 0.21 0.17 0.02 0.07 0.66 0.37 1.0 0.0 0.05 0.05 0.06 0.53 0.01 0.42 0.19 0.01 0.49 0.0 0.21 0.2 0.05 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02
Mp4g10080.1 (ADL5)
0.5 0.8 0.26 0.38 0.36 0.5 0.6 0.52 0.35 0.52 0.87 0.89 1.0 0.16 0.42 0.48 0.42 0.65 0.25 0.53 0.52 0.27 0.59 0.19 0.58 0.64 0.46 0.43 0.47 0.4 0.34 0.33
0.05 0.39 0.0 0.0 0.0 0.26 0.35 0.07 0.0 0.0 0.47 1.0 0.29 0.0 0.0 0.01 0.0 0.06 0.0 0.04 0.47 0.0 0.19 0.0 0.25 0.33 0.04 0.04 0.02 0.02 0.0 0.0
Mp4g14920.1 (PERK10)
0.22 0.33 0.12 0.11 0.2 0.33 0.54 0.34 0.12 0.23 0.45 1.0 0.53 0.04 0.18 0.2 0.15 0.36 0.14 0.33 0.35 0.14 0.44 0.14 0.34 0.37 0.22 0.19 0.22 0.26 0.26 0.21
Mp4g17510.1 (KDTA)
0.46 0.75 0.11 0.57 0.24 0.64 0.6 0.47 0.21 0.44 1.0 0.9 0.84 0.1 0.68 0.53 0.6 0.36 0.2 0.45 0.62 0.17 0.46 0.14 0.71 0.64 0.44 0.46 0.57 0.36 0.3 0.22
Mp4g18180.1 (BIO2)
0.42 0.71 0.2 0.43 0.44 0.62 0.6 0.67 0.41 0.39 0.88 1.0 0.85 0.14 0.53 0.51 0.49 0.76 0.33 0.66 0.61 0.27 0.58 0.28 0.73 0.61 0.62 0.49 0.52 0.46 0.42 0.34
0.24 0.59 0.1 0.19 0.28 0.37 0.4 0.36 0.16 0.3 0.84 0.77 1.0 0.07 0.24 0.29 0.24 0.51 0.14 0.45 0.42 0.13 0.52 0.13 0.45 0.46 0.41 0.28 0.24 0.12 0.12 0.16
Mp5g02380.1 (EDA5)
0.56 1.0 0.4 0.51 0.44 0.58 0.75 0.52 0.52 0.55 0.91 0.88 0.91 0.29 0.54 0.62 0.57 0.58 0.4 0.64 0.58 0.41 0.67 0.27 0.72 0.73 0.51 0.52 0.5 0.48 0.41 0.44
Mp5g06230.1 (LWD1)
0.45 0.7 0.09 0.49 0.17 0.59 0.61 0.43 0.22 0.53 1.0 0.88 0.8 0.07 0.62 0.56 0.52 0.29 0.22 0.44 0.72 0.12 0.44 0.07 0.76 0.67 0.37 0.35 0.43 0.38 0.41 0.28
0.42 0.89 0.17 0.45 0.26 0.59 0.71 0.48 0.55 0.44 0.91 1.0 0.88 0.16 0.52 0.7 0.44 0.48 0.29 0.64 0.64 0.24 0.48 0.16 0.69 0.65 0.48 0.47 0.55 0.48 0.39 0.26
0.26 0.51 0.4 0.24 0.24 0.44 0.5 0.38 0.26 0.38 0.76 1.0 0.86 0.16 0.36 0.25 0.32 0.35 0.33 0.47 0.52 0.36 0.47 0.23 0.61 0.59 0.3 0.21 0.2 0.28 0.39 0.3
Mp5g11490.1 (PFK5)
0.29 0.87 0.08 0.36 0.26 0.54 0.77 0.4 0.17 0.51 0.95 0.77 1.0 0.09 0.49 0.47 0.4 0.42 0.09 0.48 0.63 0.09 0.61 0.07 0.58 0.71 0.42 0.31 0.29 0.2 0.15 0.11
0.5 0.81 0.35 0.6 0.48 0.64 0.72 0.57 0.51 0.64 1.0 0.87 0.99 0.22 0.62 0.72 0.57 0.63 0.51 0.72 0.69 0.38 0.66 0.38 0.73 0.67 0.5 0.51 0.57 0.52 0.42 0.35
Mp5g17950.1 (ABCG5)
0.19 0.76 0.03 0.35 0.16 0.38 0.35 0.31 0.09 0.28 1.0 0.57 0.95 0.05 0.34 0.33 0.35 0.27 0.05 0.34 0.4 0.03 0.32 0.04 0.45 0.38 0.23 0.14 0.13 0.14 0.14 0.1
0.43 0.73 0.22 0.47 0.27 0.48 0.57 0.4 0.42 0.45 0.91 1.0 0.88 0.5 0.6 0.61 0.51 0.46 0.31 0.55 0.56 0.43 0.67 0.21 0.61 0.62 0.32 0.35 0.37 0.34 0.33 0.32
0.11 0.49 0.04 0.17 0.32 0.24 0.17 0.41 0.18 0.37 0.77 0.84 1.0 0.0 0.35 0.23 0.39 0.98 0.04 0.48 0.27 0.02 0.38 0.03 0.31 0.27 0.29 0.11 0.08 0.04 0.08 0.09
Mp5g23330.1 (AT-IE)
0.54 0.85 0.37 0.57 0.55 0.67 0.69 0.67 0.59 0.58 0.94 0.81 1.0 0.37 0.62 0.69 0.62 0.76 0.48 0.72 0.68 0.41 0.71 0.44 0.76 0.67 0.67 0.64 0.67 0.58 0.58 0.44
Mp6g00990.1 (CYP91A2)
0.32 0.61 0.09 0.12 0.21 0.48 0.58 0.44 0.17 0.33 0.69 1.0 0.64 0.1 0.22 0.21 0.17 0.88 0.14 0.45 0.42 0.1 0.48 0.1 0.47 0.47 0.36 0.3 0.35 0.31 0.32 0.26
Mp6g01440.1 (RAD7b)
0.13 0.55 0.03 0.19 0.13 0.26 0.15 0.37 0.08 0.13 0.73 0.53 1.0 0.01 0.26 0.14 0.24 0.63 0.09 0.57 0.2 0.03 0.3 0.05 0.39 0.26 0.28 0.19 0.19 0.11 0.1 0.1
0.22 0.46 0.02 0.07 0.19 0.45 0.29 0.31 0.04 0.13 0.76 0.56 1.0 0.0 0.14 0.07 0.12 0.72 0.04 0.47 0.3 0.05 0.29 0.01 0.35 0.29 0.35 0.14 0.11 0.08 0.12 0.11
0.45 0.68 0.29 0.55 0.38 0.58 0.75 0.52 0.5 0.67 0.94 1.0 0.84 0.41 0.65 0.74 0.59 0.55 0.49 0.62 0.68 0.43 0.72 0.36 0.73 0.75 0.47 0.47 0.48 0.42 0.36 0.33
Mp8g00280.1 (HSC70-7)
0.46 0.45 0.24 0.43 0.31 0.43 0.62 0.38 0.31 0.44 0.72 1.0 0.59 0.19 0.29 0.33 0.29 0.41 0.22 0.33 0.5 0.26 0.5 0.19 0.49 0.8 0.37 0.48 0.44 0.28 0.33 0.25
Mp8g10100.1 (RH11)
0.31 0.39 0.15 0.21 0.17 0.48 0.51 0.37 0.2 0.5 0.8 1.0 0.62 0.16 0.41 0.37 0.32 0.3 0.2 0.45 0.57 0.19 0.51 0.13 0.64 0.61 0.24 0.29 0.18 0.24 0.18 0.15
0.24 0.43 0.1 0.14 0.1 0.44 0.41 0.32 0.04 0.38 0.65 1.0 0.44 0.09 0.21 0.34 0.16 0.24 0.2 0.49 0.42 0.2 0.27 0.14 0.46 0.39 0.18 0.28 0.23 0.17 0.18 0.1
0.41 0.74 0.06 0.37 0.1 0.7 0.42 0.5 0.06 0.47 1.0 0.97 0.83 0.22 0.51 0.73 0.32 0.41 0.05 0.51 0.59 0.06 0.51 0.02 0.7 0.5 0.22 0.17 0.15 0.24 0.18 0.1
Mp8g17430.1 (AGK2)
0.31 0.73 0.16 0.38 0.28 0.37 0.67 0.35 0.13 0.34 0.74 0.81 1.0 0.11 0.36 0.5 0.34 0.4 0.3 0.36 0.43 0.22 0.46 0.25 0.4 0.49 0.27 0.32 0.37 0.24 0.2 0.16

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)