Heatmap: Cluster_57 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
Mp1g16000.1 (ERH1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp1g22830.1 (URGT5)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp1g26660.1 (OPT5)
0.05 0.13 0.0 0.0 0.05 0.0 0.11 0.05 0.05 0.0 0.05 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19
Mp1g29180.1 (SPK1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g00340.1 (PERK9)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g02130.1 (NdhO)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g03410.1 (NPF5.13)
0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g04770.1 (ATOEP16-2)
0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.44 0.0 0.36 0.0 0.15 0.49 0.28 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.08 0.0 0.15 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.14 0.03 0.14 0.04 0.1 0.05 0.05 0.02 0.01 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.01 0.06 0.03 0.0
Mp2g24540.1 (RH46)
0.07 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g07310.1 (MYB3R-5)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g09670.1 (GLP10)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
Mp3g09680.1 (GLP10)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
0.09 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.24 0.0 0.39 6.71 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.25 0.0 0.39 0.11 0.23 0.0 0.0 0.0 1.2 0.0 0.0 0.0 0.23 0.46 0.11 0.09 0.0 0.0 0.1 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g03270.1 (TPS9)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g04980.1 (SAW1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g04990.1 (APG6)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.19 0.05 0.1 0.09 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.17 0.08 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0
Mp4g07720.1 (AT59)
0.47 0.32 0.04 0.28 0.18 0.36 0.42 0.32 0.0 0.32 0.39 0.6 0.18 0.04 0.25 0.45 0.09 0.29 0.0 0.15 0.43 0.02 0.26 0.02 0.43 0.97 0.2 0.33 0.04 0.17 0.08 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.95 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.4 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29
0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.33 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.02 0.01
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.09 0.12 0.6 0.0 0.0 0.08 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.04 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.04 0.0
5.43 7.57 5.63 7.69 2.29 6.15 4.47 8.55 3.96 3.36 2.2 5.5 5.14 4.12 7.88 7.09 6.95 6.51 0.9 2.88 3.78 6.34 4.0 1.61 5.05 11.02 4.28 2.44 2.58 6.05 5.6 5.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp5g12840.1 (DEG4)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.03 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.1 0.04 0.0 0.03 0.09 0.12 0.2 0.03 0.33 0.08 0.12 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.05 0.0 0.1 0.09 0.0 0.29 0.0 0.05 0.15 0.14 0.08 0.08 0.06 0.0 0.03
0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.04 0.03 0.0 0.02 0.05 0.03
Mp5g19100.1 (BTL13)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp5g22530.1 (PIF7)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g00530.1 (SAUR19)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.17 0.07 0.16 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.09 0.0 0.03 0.0 0.15 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.28 0.09 0.07 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.05 0.0 0.12 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0 0.1 0.0
Mp6g03640.1 (TCX5)
0.11 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g13340.1 (PHO2)
0.05 0.24 0.12 0.22 0.09 0.0 0.1 0.0 0.0 2.31 0.4 0.0 0.17 0.0 0.15 0.08 0.0 0.33 0.25 0.0 0.07 0.08 0.08 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g14790.1 (BLH4)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g16680.1 (LETM1)
0.54 0.79 0.0 0.91 0.25 0.0 0.67 0.23 0.0 0.48 0.0 0.0 0.81 0.0 1.31 0.97 0.45 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.25 0.3 0.0 0.7 0.0 0.0 0.3 0.54 0.35 0.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g02960.1 (IPT9)
0.17 0.27 0.0 0.03 0.07 0.07 0.13 0.07 0.01 1.49 0.09 0.09 0.05 0.01 0.03 0.06 0.03 0.03 0.0 0.02 0.05 0.0 0.04 0.0 0.08 0.27 0.1 0.07 0.12 0.04 0.04 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g09780.1 (IPGAL2)
0.05 0.02 0.03 0.04 0.04 0.03 0.08 0.04 0.0 0.01 0.03 0.04 0.03 0.0 0.14 0.1 0.05 0.02 0.0 0.03 0.08 0.02 0.05 0.01 0.04 0.14 0.13 0.05 0.04 0.02 0.11 0.04
0.03 0.0 0.0 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.03 0.06 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g10850.1 (ULI3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.13 0.0 0.11 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.01 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.06 0.0 0.01 0.02 0.02 0.06 0.01 0.04 0.01 0.0 0.03 0.04 0.06 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)