Heatmap: Cluster_44 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.11 0.25 0.16 0.06 0.14 0.13 0.26 0.16 0.17 0.3 0.24 1.0 0.24 0.08 0.06 0.1 0.07 0.24 0.15 0.14 0.12 0.21 0.28 0.15 0.12 0.17 0.08 0.08 0.09 0.06 0.09 0.09
Mp1g28940.1 (FTSH8)
0.02 0.12 0.01 0.01 0.03 0.02 0.15 0.06 0.12 0.32 0.01 1.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.01 0.06 0.0 0.02 0.02 0.01 0.06 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0
Mp2g00600.1 (AMT2)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.07 0.01 0.0 0.02 0.03 1.0 0.03 0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.01 0.0 0.06 0.02 0.07 0.01 0.0 0.41 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.07 0.02 0.05 0.28 0.01 1.0 0.01 0.05 0.01 0.04 0.01 0.12 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g03800.1 (LBD7)
0.0 0.15 0.01 0.03 0.01 0.01 0.09 0.03 0.04 0.22 0.1 1.0 0.12 0.01 0.05 0.15 0.04 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g08470.1 (NTF2)
0.01 0.11 0.01 0.03 0.01 0.01 0.03 0.01 0.14 0.3 0.03 1.0 0.06 0.02 0.02 0.1 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.01 0.09 0.01 0.03 0.02 0.02 0.24 0.03 0.13 0.19 0.02 1.0 0.03 0.08 0.03 0.2 0.02 0.07 0.03 0.04 0.05 0.04 0.12 0.0 0.01 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
Mp2g19180.1 (AGP7)
0.08 0.28 0.01 0.07 0.08 0.1 0.21 0.05 0.04 0.13 0.28 1.0 0.26 0.01 0.03 0.08 0.06 0.15 0.01 0.1 0.15 0.01 0.27 0.02 0.06 0.19 0.07 0.04 0.07 0.06 0.02 0.03
Mp2g26360.1 (cPT8)
0.02 0.2 0.0 0.01 0.02 0.04 0.11 0.08 0.01 0.1 0.17 1.0 0.3 0.0 0.03 0.01 0.03 0.1 0.01 0.05 0.04 0.01 0.05 0.0 0.07 0.07 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01
Mp3g01290.1 (UBP7)
0.02 0.14 0.05 0.01 0.01 0.05 0.1 0.03 0.01 0.18 0.17 1.0 0.08 0.03 0.01 0.02 0.02 0.01 0.05 0.02 0.04 0.09 0.1 0.07 0.03 0.18 0.02 0.01 0.03 0.01 0.02 0.01
Mp3g09800.1 (CTL18)
0.09 0.24 0.03 0.06 0.1 0.12 0.28 0.12 0.19 0.27 0.17 1.0 0.2 0.02 0.12 0.14 0.08 0.17 0.04 0.13 0.13 0.05 0.15 0.02 0.16 0.12 0.04 0.05 0.04 0.05 0.03 0.03
Mp3g17660.1 (WRKY31)
0.01 0.03 0.0 0.0 0.03 0.02 0.22 0.05 0.01 0.26 0.01 1.0 0.02 0.0 0.01 0.08 0.0 0.06 0.0 0.04 0.03 0.02 0.13 0.0 0.02 0.05 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0
Mp3g22470.1 (CYP702A8)
0.04 0.33 0.0 0.01 0.0 0.02 0.08 0.05 0.0 0.01 0.19 1.0 0.3 0.0 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.07 0.02 0.01 0.2 0.0 0.02 0.23 0.03 0.05 0.05 0.0 0.01 0.0
Mp4g03590.1 (PAL4)
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.01 1.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.21 0.0 0.01 0.0 0.01 0.1 0.19 0.05 0.14 0.04 1.0 0.15 0.0 0.02 0.1 0.04 0.15 0.0 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.03 0.39 0.01 0.03 0.1 0.07 0.2 0.1 0.03 0.23 0.2 1.0 0.26 0.0 0.03 0.04 0.03 0.14 0.0 0.09 0.06 0.01 0.19 0.0 0.08 0.1 0.07 0.03 0.03 0.01 0.01 0.01
Mp4g14110.1 (PAL1)
0.01 0.04 0.0 0.0 0.04 0.02 0.16 0.03 0.03 0.2 0.01 1.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.04 0.02 0.0 0.12 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.03 0.0 0.0 0.06 0.01 0.17 0.03 0.03 0.18 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.03 0.01 0.01 0.13 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g14130.1 (PAL1)
0.03 0.07 0.0 0.01 0.07 0.04 0.19 0.06 0.03 0.14 0.03 1.0 0.03 0.0 0.02 0.06 0.01 0.07 0.01 0.06 0.05 0.02 0.14 0.01 0.04 0.07 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01
Mp4g14140.1 (PAL1)
0.02 0.07 0.01 0.02 0.08 0.03 0.2 0.05 0.03 0.19 0.04 1.0 0.05 0.0 0.02 0.07 0.02 0.11 0.01 0.07 0.03 0.01 0.19 0.0 0.04 0.06 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01
0.02 0.12 0.01 0.0 0.06 0.02 0.15 0.04 0.17 0.21 0.05 1.0 0.1 0.0 0.0 0.05 0.0 0.06 0.01 0.04 0.02 0.02 0.13 0.01 0.02 0.05 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01
Mp4g14160.1 (PAL1)
0.03 0.15 0.01 0.01 0.08 0.05 0.27 0.07 0.06 0.13 0.08 1.0 0.09 0.0 0.01 0.05 0.01 0.12 0.01 0.08 0.05 0.02 0.24 0.01 0.06 0.1 0.04 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0
Mp4g14170.1 (PAL1)
0.03 0.12 0.01 0.01 0.07 0.04 0.24 0.05 0.06 0.14 0.08 1.0 0.1 0.0 0.01 0.05 0.01 0.13 0.01 0.07 0.05 0.02 0.24 0.01 0.06 0.1 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
0.01 0.06 0.0 0.0 0.06 0.02 0.21 0.03 0.03 0.1 0.02 1.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.08 0.0 0.05 0.03 0.01 0.2 0.0 0.04 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.02 0.0 0.04 0.0 1.0 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.29 0.05 0.09 0.12 0.14 0.23 0.17 0.12 0.31 0.32 1.0 0.35 0.03 0.11 0.12 0.13 0.19 0.04 0.18 0.13 0.05 0.25 0.03 0.18 0.18 0.1 0.09 0.1 0.05 0.06 0.06
Mp5g01200.1 (4CL1)
0.1 0.32 0.05 0.09 0.11 0.13 0.21 0.15 0.1 0.26 0.26 1.0 0.33 0.03 0.1 0.12 0.1 0.19 0.05 0.16 0.14 0.05 0.23 0.03 0.16 0.17 0.08 0.08 0.08 0.05 0.05 0.05
0.04 0.17 0.01 0.04 0.03 0.04 0.14 0.05 0.03 0.29 0.07 1.0 0.12 0.01 0.03 0.14 0.03 0.08 0.01 0.04 0.05 0.03 0.1 0.01 0.06 0.08 0.03 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.19 0.0 1.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.08 0.02 0.08 0.06 0.05 0.17 0.15 0.03 0.17 0.05 1.0 0.13 0.0 0.08 0.13 0.07 0.23 0.01 0.07 0.05 0.02 0.17 0.01 0.06 0.07 0.04 0.03 0.03 0.03 0.04 0.02
Mp5g13190.1 (MRP10)
0.07 0.13 0.06 0.09 0.09 0.08 0.25 0.11 0.1 0.22 0.09 1.0 0.1 0.07 0.07 0.16 0.08 0.17 0.08 0.12 0.1 0.09 0.26 0.07 0.1 0.15 0.04 0.05 0.06 0.05 0.06 0.05
Mp5g14900.1 (HLP1)
0.05 0.17 0.02 0.01 0.04 0.03 0.17 0.08 0.24 0.14 0.13 1.0 0.2 0.01 0.0 0.02 0.0 0.16 0.01 0.03 0.04 0.12 0.1 0.01 0.03 0.04 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01
Mp5g15980.1 (ACLB-2)
0.09 0.26 0.03 0.06 0.1 0.15 0.31 0.15 0.09 0.23 0.22 1.0 0.24 0.02 0.08 0.09 0.07 0.2 0.05 0.17 0.16 0.04 0.28 0.03 0.16 0.18 0.1 0.07 0.07 0.06 0.05 0.05
Mp5g16900.1 (PRX56)
0.01 0.13 0.0 0.0 0.05 0.03 0.16 0.07 0.08 0.24 0.03 1.0 0.08 0.0 0.0 0.06 0.0 0.08 0.0 0.03 0.03 0.0 0.1 0.0 0.03 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp5g21210.1 (ACLA-3)
0.09 0.21 0.02 0.05 0.09 0.14 0.38 0.17 0.06 0.2 0.21 1.0 0.21 0.01 0.05 0.06 0.05 0.17 0.02 0.14 0.16 0.02 0.27 0.01 0.16 0.19 0.11 0.08 0.08 0.06 0.04 0.03
0.07 0.16 0.02 0.03 0.09 0.12 0.33 0.16 0.07 0.21 0.13 1.0 0.16 0.01 0.03 0.04 0.03 0.14 0.03 0.12 0.13 0.03 0.21 0.02 0.15 0.17 0.07 0.06 0.07 0.06 0.04 0.03
Mp6g08240.1 (CDR1)
0.06 0.29 0.04 0.04 0.06 0.09 0.2 0.1 0.02 0.26 0.32 1.0 0.26 0.03 0.05 0.12 0.04 0.11 0.02 0.09 0.09 0.05 0.22 0.01 0.1 0.18 0.05 0.03 0.03 0.03 0.04 0.01
0.01 0.26 0.0 0.01 0.01 0.02 0.08 0.03 0.03 0.19 0.2 1.0 0.2 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.0 0.02 0.02 0.01 0.04 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g11940.1 (OPT3)
0.05 0.25 0.02 0.02 0.11 0.08 0.3 0.14 0.05 0.3 0.09 1.0 0.16 0.0 0.03 0.06 0.02 0.12 0.01 0.08 0.06 0.02 0.2 0.01 0.06 0.08 0.06 0.03 0.03 0.03 0.03 0.03
Mp7g04240.1 (CAK2AT)
0.02 0.05 0.0 0.02 0.08 0.02 0.12 0.03 0.01 0.31 0.01 1.0 0.02 0.0 0.01 0.03 0.01 0.1 0.0 0.03 0.02 0.0 0.09 0.0 0.03 0.03 0.03 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01
0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.11 0.01 1.0 0.07 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.18 0.01 0.0 0.06 0.05 0.2 0.12 0.13 0.33 0.06 1.0 0.12 0.0 0.0 0.02 0.01 0.18 0.0 0.04 0.04 0.0 0.15 0.0 0.06 0.11 0.06 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01
0.2 0.14 0.12 0.05 0.19 0.1 0.15 0.06 0.19 0.26 0.13 1.0 0.21 0.1 0.01 0.04 0.02 0.11 0.11 0.1 0.09 0.21 0.19 0.11 0.06 0.13 0.07 0.14 0.17 0.06 0.03 0.03
0.01 0.12 0.03 0.0 0.05 0.03 0.14 0.04 0.02 0.22 0.12 1.0 0.2 0.0 0.0 0.01 0.0 0.08 0.02 0.06 0.04 0.02 0.15 0.02 0.04 0.06 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0
Mp8g09770.1 (UGT76E12)
0.03 0.15 0.0 0.0 0.01 0.02 0.16 0.03 0.0 0.16 0.02 1.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.02 0.03 0.0 0.05 0.0 0.02 0.04 0.03 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01
Mp8g10910.1 (UGT73B2)
0.03 0.41 0.01 0.01 0.0 0.02 0.17 0.02 0.01 0.01 0.2 1.0 0.31 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.06 0.01 0.14 0.0 0.03 0.15 0.02 0.02 0.04 0.04 0.02 0.01
Mp8g12130.1 (ABCG15)
0.16 0.15 0.06 0.06 0.09 0.06 0.27 0.06 0.18 0.22 0.04 1.0 0.04 0.11 0.04 0.12 0.04 0.04 0.02 0.05 0.06 0.07 0.14 0.02 0.05 0.11 0.07 0.04 0.04 0.03 0.09 0.1

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)