Heatmap: Cluster_43 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp1g11970.1 (GLT1)
0.03 0.0 0.04 0.0 0.03 0.06 0.0 0.06 0.03 0.21 0.11 0.2 0.0 0.25 0.05 0.2 0.12 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.08 0.0 0.1 0.1 0.08 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0
Mp1g13530.1 (CPUORF47)
0.16 0.0 0.07 0.15 0.0 0.11 0.07 0.03 0.08 0.07 0.08 0.08 0.07 0.31 0.15 0.09 0.09 0.02 0.23 0.16 0.04 0.02 0.1 0.1 0.11 0.09 0.03 0.1 0.06 0.06 0.11 0.06
Mp1g19810.1 (MYB58)
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g05110.1 (CCZ1b)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01
0.18 0.17 0.06 0.41 0.52 0.22 0.0 0.04 0.29 0.45 0.31 0.22 0.24 0.71 0.18 0.36 0.18 0.2 0.27 0.29 0.1 0.04 0.12 0.25 0.22 0.15 0.12 0.25 0.05 0.26 0.28 0.15
0.01 0.01 0.0 0.07 0.03 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.02 0.14 0.07 0.21 0.07 0.07 0.04 0.03 0.04 0.01 0.02 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
Mp2g12770.1 (PPD5)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.54 0.0 1.82 0.0 1.14 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g21410.1 (SDJ2)
0.0 0.39 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.3 0.75 1.44 0.5 0.0 0.5 1.0 0.19 0.64 0.0 0.22 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0
0.16 0.19 0.3 0.19 0.3 0.15 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.44 0.81 1.9 0.63 0.29 0.13 0.13 0.0 0.0 0.36 0.57 0.0 0.06 0.64 0.0 0.1 0.0 0.19 0.18
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.01 0.04 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01
Mp3g00770.1 (TUB1)
0.02 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.21 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.07 0.02 0.02 0.03 0.02 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.11 0.0 0.28 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.0 0.15 0.0
Mp3g05440.1 (RMI1)
0.0 0.04 0.08 0.07 0.0 0.03 0.0 0.03 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.08 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
Mp3g05680.1 (NLM4)
0.0 0.0 0.0 0.13 0.03 0.03 0.05 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.12 0.0 0.06 0.03 0.03 0.03 0.08 0.02 0.03 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.29 0.0 1.31 0.98 1.56 1.33 0.41 0.65 1.38 0.64 1.24 0.21 9.36 0.66 3.4 0.53 0.4 0.42 0.18 0.34 0.21 0.21 0.0 1.29 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.05 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g19360.1 (AFL1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g03190.1 (CLPX)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Mp4g03200.1 (CLPX)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g06740.1 (TRM28)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g07660.1 (MYB63)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.06 0.38 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g09500.1 (VAMP714)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g11100.1 (UBP1)
0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 1.55 0.0 0.21 0.0 0.62 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.04 0.03 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.03 0.03 0.0 0.03 0.19 0.16 0.12 0.13 0.02 0.01 0.05 0.03 0.0 0.37 0.06 0.01 0.03 0.01 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0
Mp4g18880.1 (MEE57)
0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.07 0.12 0.1 0.0 0.0 0.28 0.0 0.03 0.06 0.06 0.0 0.03 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.03 0.13 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0
Mp4g20250.1 (TOM3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g20970.1 (PDI5)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g20980.1 (CIPK26)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g21290.1 (NAT12)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g21940.1 (TPR9)
1.1 0.83 0.57 4.29 0.9 1.33 1.49 0.57 0.2 1.29 1.94 1.94 1.63 4.65 3.97 9.3 4.66 0.52 0.59 1.89 0.77 0.61 1.48 0.98 1.02 0.85 1.62 0.58 0.74 0.21 0.19 0.9
0.05 0.0 0.16 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.56 0.0 0.22 0.2 0.84 0.09 0.53 0.17 0.29 0.28 0.09 0.61 0.38 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.1 0.13 0.02 0.0 0.0 0.14 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp5g08470.1 (LNK1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.07 0.0 0.04 0.35 0.06 0.04 0.0 0.18 0.02 0.04 0.0 0.02 0.02 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp5g18830.1 (WEB2)
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp5g18890.1 (PRLIP6)
0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.19 0.0 0.0 0.0 0.57 0.15 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.14 0.07 0.08 0.0 0.05 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.05 0.1 0.7 0.65 0.75 0.32 0.0 0.18 0.04 0.08 0.19 0.04 0.18 0.04 0.05 0.0 0.0 0.31 0.18 0.0 0.06
0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.33 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.15 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.35 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g01760.1 (BRT1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g04530.1 (AUXILIN-LIKE3)
0.0 0.0 0.28 0.16 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.08 0.0 0.08 0.09 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.07 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g08850.1 (TCX7)
1.9 1.87 1.75 3.52 3.02 2.14 1.07 1.02 8.71 3.09 2.54 2.74 1.4 7.08 3.46 3.44 1.97 1.04 2.66 2.2 2.75 5.27 1.54 2.73 0.75 1.44 1.49 2.37 2.74 3.32 2.43 1.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g12250.1 (LIG6)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.21 0.18 0.62 0.22 0.13 0.11 0.0 0.25 0.19 0.12 0.08 0.04 1.6 0.45 1.36 0.62 0.31 0.14 0.07 0.16 0.0 0.27 0.04 0.14 0.0 0.05 0.04 0.04 0.37 0.14 0.09
Mp6g16170.1 (MYB3R-5)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g16620.1 (NDHA)
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g19890.1 (PDI6)
0.0 0.39 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.75 0.0 0.26 0.0 0.88 0.0 0.52 0.23 0.27 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp7g03100.1 (PHO1;H1)
0.05 0.08 0.04 0.05 0.03 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.07 0.02 0.0 0.08 0.11 0.08 0.0 0.11 0.06 0.0 0.0 0.11 0.09 0.03 0.0 0.1 0.0 0.11
Mp7g07100.1 (ALX8)
0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.09 0.06 0.18 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Mp7g12240.1 (AGL54)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.05 0.0
Mp7g12390.1 (ASPG1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp7g14810.1 (LBD25)
0.05 0.0 0.0 0.07 0.3 0.0 0.05 0.0 0.04 0.07 0.12 0.04 0.04 0.6 0.1 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.07 0.0 0.04 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.05
0.18 0.09 0.15 0.33 0.08 0.04 0.0 0.08 0.18 0.16 0.1 0.07 0.07 0.6 0.09 0.51 0.06 0.1 0.0 0.19 0.08 0.2 0.27 0.0 0.03 0.13 0.0 0.0 0.04 0.0 0.5 0.34
Mp7g15740.1 (ECD2)
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Mp8g01120.1 (NET1B)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g01800.1 (YUC4)
0.0 0.01 0.04 0.06 0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.05 0.02 0.01 0.04 0.09 0.04 0.14 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
0.11 0.41 0.0 0.41 0.62 0.0 0.79 0.0 0.0 0.22 0.0 0.12 0.11 0.86 0.2 1.02 0.0 0.22 0.23 0.0 0.09 0.11 0.11 0.0 0.1 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g12320.1 (MYB103)
0.0 0.22 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.19 0.2 0.19 0.0 0.6 0.0 0.35 0.16 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.22 0.0 0.24

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)