Heatmap: Cluster_101 (Marchantia polymorpha (Mpo) Coexpression Clusters (HCCA Algorithm))

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Control
Cold (3°C)
Dark (3 days)
Heat (33°C)
Light (435 uEm-2s-1)
Osmotic (100 mM mannitol)
Nitrogen deficiency (0 mM KNO3)
Salt (40 mM NaCl)
Cold-Dark
Cold-Light
Cold-Mannitol
Cold-Nitrogen deficiency
Cold-Salt
Heat-Dark
Heat-Mannitol
Heat-Nitrogen deficiency
Heat-Salt
Light-Salt
Mannitol-Dark
Mannitol-Light
Mannitol-Nitrogen deficiency
Nitrogen deficiency-Dark
Nitrogen deficiency-Light
Salt-Dark
Salt-Mannitol
Salt-Nitrogen deficiency
ZT2 (2 hours after light)
ZT6 (6 hours after light)
ZT10 (10 hours after light)
ZT14 (2 hours after dark)
ZT18 (6 hours after dark)
ZT22 (10 hours after dark)
Mp1g05010.1 (RSW7)
0.0 0.01 0.0 0.03 0.02 0.0 0.01 0.01 0.09 0.32 0.01 0.12 0.01 0.12 0.01 0.15 0.01 0.02 0.01 0.04 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp1g07950.1 (PMEI7)
0.52 0.25 2.85 1.25 0.33 0.66 0.4 0.35 0.56 1.66 0.53 0.35 0.18 5.37 0.43 1.21 1.95 0.0 1.22 0.47 0.0 1.82 0.17 0.37 0.31 0.0 0.47 0.18 0.0 1.18 0.78 1.09
0.05 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.1 0.16 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12
Mp1g12940.1 (RPF7)
0.0 0.14 0.0 0.09 0.12 0.05 0.08 0.0 0.0 0.0 0.19 0.28 0.0 0.21 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.1 0.3 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.16 0.19 0.05 0.03 0.19 0.0 0.05 0.03 0.0 0.05 0.03 0.21 0.14 0.02 0.02 0.05 0.0 0.0 0.1 0.04 0.13 0.05 0.06 0.02 0.15 0.06 0.02 0.03 0.16 0.21 0.13
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp1g24110.1 (AtHMP09)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.05 0.0 0.12 0.01 0.15 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.17 0.09 0.1 0.18 0.06 0.94 0.0 0.35 1.17 0.21 0.77 0.0 0.95 0.29 1.55 0.44 0.06 0.48 0.05 0.05 0.4 0.8 0.59 0.1 0.22 0.06 0.11 0.0 0.16 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g09280.1 (NRPA2)
0.0 0.0 0.1 0.03 0.0 0.0 0.08 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.07 0.41 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g17620.1 (ANAC087)
0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.08 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp2g18010.1 (BCM2)
0.02 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.26 0.11 0.07 0.48 0.0 0.0 0.0 0.1 0.08 0.32 0.03 0.06 0.17 0.0 0.02 0.03 0.03 0.1 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp3g18820.1 (SCC2)
0.03 0.13 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.05 0.14 0.52 0.0 0.11 0.0 0.34 0.0 0.38 0.09 0.09 0.0 0.0 0.0 0.09 0.18 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.06 0.0 0.16 0.05
Mp4g05550.1 (GSL5)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g06520.1 (TT10)
0.03 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.13 0.0 0.11 0.8 0.11 0.06 0.0 0.28 0.0 0.1 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g06920.1 (SHB1)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.1 0.0 0.01 0.0 0.08 0.02 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g11280.1 (PLT7)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g15060.1 (AHL19)
0.17 0.0 0.0 0.87 0.0 0.31 0.65 0.0 0.25 1.73 0.29 0.25 0.93 1.24 0.45 1.36 0.51 0.0 0.0 0.5 0.0 0.63 0.46 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp4g23020.1 (FAB1C)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.06 0.01 0.03 0.01 0.02 0.02 0.06 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Mp5g03490.1 (WNK8)
0.35 0.49 0.43 0.45 0.28 0.04 0.38 0.43 2.38 0.89 0.56 0.24 0.22 2.38 0.3 0.57 0.15 0.46 0.28 0.35 0.14 0.43 0.34 0.56 0.19 0.2 0.26 0.0 0.11 0.11 0.24 0.16
0.05 0.0 0.03 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.12 0.03 0.03 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0
Mp5g08330.1 (ROG2)
0.08 0.14 0.07 0.26 0.39 0.0 0.14 0.0 0.36 0.0 0.0 0.06 0.05 0.83 0.35 0.13 0.3 0.15 0.42 0.0 0.04 0.15 0.09 0.1 0.14 0.05 0.0 0.05 0.3 0.25 0.06 0.06
Mp5g12210.1 (ARAB-1)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Mp5g13960.1 (TRM8b)
0.0 0.0 0.75 0.15 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.08 0.34 0.0 0.82 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.17 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.09 0.1
0.02 0.22 0.0 0.13 0.12 0.02 0.04 0.01 0.07 0.26 0.03 0.21 0.06 0.47 0.0 0.06 0.05 0.02 0.03 0.01 0.04 0.02 0.08 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0
0.14 0.2 0.11 0.08 0.09 0.27 0.55 0.0 0.0 0.0 0.42 0.48 0.08 0.09 0.51 0.95 0.29 0.08 0.16 0.0 0.56 0.17 0.65 0.0 0.0 0.08 0.16 0.15 0.34 0.0 0.11 0.0
Mp6g08950.1 (PGP1)
0.05 0.0 0.21 0.0 0.03 0.0 0.11 0.04 0.03 0.82 0.0 0.0 0.0 0.32 0.03 0.21 0.03 0.0 0.29 0.03 0.02 0.19 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.23 0.0 0.16 0.09 0.1 0.0 0.0 0.11 0.0 2.43 0.1 0.0 0.0 1.41 1.5 2.0 1.97 0.3 0.0 0.0 0.0 0.21 0.1 0.22 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0
Mp6g17630.1 (DEG11)
0.0 0.0 0.0 0.13 0.08 0.0 0.21 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 1.43 0.07 0.48 0.13 0.0 0.0 0.07 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g20420.1 (UFD2)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp6g21270.1 (CLCF)
0.94 0.31 0.0 2.35 0.54 0.9 3.89 1.13 0.8 8.91 1.54 5.59 0.78 0.99 4.47 11.72 2.51 0.88 1.93 1.41 1.29 3.58 3.62 0.95 1.7 1.2 0.71 1.2 0.67 0.65 1.7 0.9
Mp7g00580.1 (ACT1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.16 0.19 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.04 0.02 0.06 0.04 0.02 0.07 0.01 0.0 0.52 0.04 0.13 0.05 0.4 0.08 0.21 0.05 0.05 0.1 0.09 0.02 0.05 0.03 0.03 0.04 0.01 0.04 0.01 0.0 0.02 0.0 0.02
Mp7g03430.1 (PLP3b)
0.07 0.61 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.15 0.44 2.92 0.0 0.88 0.14 2.64 0.0 0.69 0.37 0.0 0.54 0.5 0.11 0.27 0.95 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0
Mp7g09110.1 (LSM8)
0.05 0.03 0.14 0.16 0.0 0.01 0.03 0.07 0.09 0.34 0.02 0.09 0.06 0.29 0.1 0.39 0.11 0.0 0.0 0.1 0.04 0.11 0.1 0.19 0.0 0.02 0.04 0.08 0.08 0.05 0.0 0.05
0.15 0.07 0.3 0.19 0.06 0.08 0.06 0.08 0.38 0.54 0.05 0.01 0.07 0.28 0.32 0.58 0.37 0.04 0.32 0.12 0.03 0.24 0.12 0.25 0.03 0.04 0.04 0.03 0.01 0.15 0.21 0.09
0.06 0.0 0.16 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.11 0.0 0.0 0.36 0.09 0.23 0.2 0.0 0.0 0.1 0.1 0.22 0.11 0.12 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp7g18760.1 (SDG15)
0.01 0.01 0.0 0.04 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.06 0.08 0.08 0.02 0.07 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.04 0.02 0.0 0.04 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.07 0.0 0.11 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.17 0.0 0.34 0.13 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g02550.1 (RAD5B)
0.0 0.0 0.0 0.05 0.12 0.0 0.0 0.0 0.13 0.06 0.0 0.0 0.0 0.73 0.15 0.46 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.06 0.23 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
Mp8g03880.1 (CEL3)
0.09 0.11 0.0 0.15 0.01 0.1 0.11 0.05 0.02 0.25 0.11 0.12 0.16 0.26 0.19 0.25 0.18 0.07 0.03 0.07 0.16 0.0 0.11 0.0 0.08 0.05 0.0 0.07 0.07 0.07 0.02 0.07
Mp8g05240.1 (BGLU22)
0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.22 0.24 1.09 0.0 0.0 0.0 1.32 0.19 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.42 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.52 0.15 0.27 0.53 0.29 0.11 0.8 0.05 0.17 1.63 0.15 1.34 0.1 1.43 1.06 1.52 0.5 0.0 0.47 0.28 0.18 0.2 0.58 0.0 0.0 0.14 0.41 0.15 0.0 0.0 0.31 0.07
0.0 0.0 0.0 0.16 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.79 0.07 0.59 0.09 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)